MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus oshimai JL-2 plasmid pTHEOS02

Total Repeats: 1456

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019388	GAG	2	6	11	16	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019388	AG	3	6	15	20	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019388	GATGAG	2	12	21	32	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	410731196
4	NC_019388	CTC	2	6	58	63	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731196
5	NC_019388	TGG	2	6	86	91	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410731196
6	NC_019388	GTG	2	6	103	108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410731196
7	NC_019388	CCTG	2	8	182	189	0 %	25 %	25 %	50 %	410731196
8	NC_019388	GCCCTG	2	12	204	215	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	410731196
9	NC_019388	GGCG	2	8	221	228	0 %	0 %	75 %	25 %	410731196
10	NC_019388	GCGGGA	2	12	279	290	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	410731196
11	NC_019388	CGGG	2	8	297	304	0 %	0 %	75 %	25 %	410731196
12	NC_019388	GCTG	2	8	344	351	0 %	25 %	50 %	25 %	410731196
13	NC_019388	GGGCT	2	10	360	369	0 %	20 %	60 %	20 %	410731196
14	NC_019388	CCAGGC	2	12	417	428	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	410731196
15	NC_019388	C	6	6	463	468	0 %	0 %	0 %	100 %	410731196
16	NC_019388	GGCGG	2	10	531	540	0 %	0 %	80 %	20 %	410731196
17	NC_019388	TCC	2	6	570	575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731196
18	NC_019388	TCC	2	6	626	631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731196
19	NC_019388	C	6	6	630	635	0 %	0 %	0 %	100 %	410731196
20	NC_019388	GGGACG	2	12	656	667	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	410731196
21	NC_019388	AGGA	2	8	711	718	50 %	0 %	50 %	0 %	410731197
22	NC_019388	ACC	2	6	727	732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410731197
23	NC_019388	GAG	2	6	747	752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731197
24	NC_019388	TGG	2	6	766	771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410731197
25	NC_019388	GGA	3	9	806	814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731197
26	NC_019388	CCT	2	6	821	826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731197
27	NC_019388	GAG	2	6	885	890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731197
28	NC_019388	CCG	2	6	896	901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410731197
29	NC_019388	AGG	2	6	928	933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731197
30	NC_019388	CGG	2	6	943	948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410731197
31	NC_019388	AGGGC	2	10	964	973	20 %	0 %	60 %	20 %	410731197
32	NC_019388	CCA	2	6	1000	1005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410731198
33	NC_019388	C	6	6	1043	1048	0 %	0 %	0 %	100 %	410731198
34	NC_019388	GGGGCC	2	12	1050	1061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410731198
35	NC_019388	GCG	2	6	1070	1075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410731198
36	NC_019388	GAG	2	6	1076	1081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731198
37	NC_019388	GGA	2	6	1087	1092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731198
38	NC_019388	CAC	2	6	1133	1138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410731198
39	NC_019388	AGG	3	9	1182	1190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731198
40	NC_019388	GAG	2	6	1235	1240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731198
41	NC_019388	CCGT	2	8	1281	1288	0 %	25 %	25 %	50 %	410731198
42	NC_019388	GGA	2	6	1297	1302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731198
43	NC_019388	CCTT	2	8	1329	1336	0 %	50 %	0 %	50 %	410731198
44	NC_019388	CGC	2	6	1397	1402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410731198
45	NC_019388	G	6	6	1411	1416	0 %	0 %	100 %	0 %	410731198
46	NC_019388	ACC	2	6	1425	1430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410731198
47	NC_019388	C	6	6	1429	1434	0 %	0 %	0 %	100 %	410731198
48	NC_019388	GTC	2	6	1462	1467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410731199
49	NC_019388	GGCG	2	8	1473	1480	0 %	0 %	75 %	25 %	410731199
50	NC_019388	ACC	2	6	1496	1501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410731199
51	NC_019388	GGC	2	6	1503	1508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410731199
52	NC_019388	G	6	6	1555	1560	0 %	0 %	100 %	0 %	410731199
53	NC_019388	AGG	2	6	1571	1576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731199
54	NC_019388	G	6	6	1581	1586	0 %	0 %	100 %	0 %	410731199
55	NC_019388	AGG	2	6	1589	1594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731199
56	NC_019388	CTC	2	6	1660	1665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731199
57	NC_019388	CGG	2	6	1674	1679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410731199
58	NC_019388	GGC	2	6	1683	1688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410731199
59	NC_019388	CGTC	2	8	1776	1783	0 %	25 %	25 %	50 %	410731199
60	NC_019388	GTA	2	6	1885	1890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410731199
61	NC_019388	CTT	3	9	1909	1917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410731199
62	NC_019388	GCG	2	6	1955	1960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410731199
63	NC_019388	TAG	2	6	1961	1966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410731199
64	NC_019388	CCT	2	6	1971	1976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731199
65	NC_019388	CCA	2	6	2089	2094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410731200
66	NC_019388	AAGG	2	8	2117	2124	50 %	0 %	50 %	0 %	410731200
67	NC_019388	TCC	2	6	2128	2133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731200
68	NC_019388	CCCG	2	8	2164	2171	0 %	0 %	25 %	75 %	410731200
69	NC_019388	GGA	2	6	2182	2187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731200
70	NC_019388	GAG	2	6	2233	2238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731200
71	NC_019388	GCGG	2	8	2285	2292	0 %	0 %	75 %	25 %	410731200
72	NC_019388	C	6	6	2317	2322	0 %	0 %	0 %	100 %	410731200
73	NC_019388	AGGGCC	2	12	2331	2342	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	410731200
74	NC_019388	GGA	2	6	2344	2349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731200
75	NC_019388	C	6	6	2356	2361	0 %	0 %	0 %	100 %	410731200
76	NC_019388	GGC	2	6	2396	2401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410731200
77	NC_019388	C	6	6	2449	2454	0 %	0 %	0 %	100 %	410731200
78	NC_019388	CCCG	2	8	2460	2467	0 %	0 %	25 %	75 %	410731200
79	NC_019388	GCC	2	6	2475	2480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410731200
80	NC_019388	GGC	2	6	2558	2563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410731200
81	NC_019388	CTT	2	6	2608	2613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410731200
82	NC_019388	CTT	2	6	2623	2628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410731200
83	NC_019388	CCT	2	6	2629	2634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731200
84	NC_019388	GGGT	3	12	2641	2652	0 %	25 %	75 %	0 %	410731200
85	NC_019388	TTC	2	6	2672	2677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410731200
86	NC_019388	T	6	6	2688	2693	0 %	100 %	0 %	0 %	410731200
87	NC_019388	CCGCCT	2	12	2736	2747	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	410731200
88	NC_019388	TCCACC	2	12	2838	2849	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	410731200
89	NC_019388	GC	3	6	2882	2887	0 %	0 %	50 %	50 %	410731200
90	NC_019388	AGG	2	6	2907	2912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731200
91	NC_019388	GGCCAG	2	12	2963	2974	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	410731200
92	NC_019388	GGCG	2	8	2983	2990	0 %	0 %	75 %	25 %	410731200
93	NC_019388	CTTC	2	8	3072	3079	0 %	50 %	0 %	50 %	410731200
94	NC_019388	CTC	2	6	3162	3167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_019388	GAG	2	6	3221	3226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019388	C	6	6	3227	3232	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
97	NC_019388	CTC	2	6	3234	3239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_019388	CGC	2	6	3254	3259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_019388	CCT	2	6	3284	3289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_019388	ACT	2	6	3351	3356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_019388	TCT	2	6	3357	3362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_019388	CAC	2	6	3408	3413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410731201
103	NC_019388	CCAG	2	8	3431	3438	25 %	0 %	25 %	50 %	410731201
104	NC_019388	GAGG	2	8	3447	3454	25 %	0 %	75 %	0 %	410731201
105	NC_019388	TCCCC	2	10	3515	3524	0 %	20 %	0 %	80 %	410731201
106	NC_019388	GTG	2	6	3619	3624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410731201
107	NC_019388	ACC	2	6	3626	3631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410731201
108	NC_019388	G	6	6	3675	3680	0 %	0 %	100 %	0 %	410731201
109	NC_019388	TCC	2	6	3715	3720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731201
110	NC_019388	TCG	2	6	3730	3735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410731201
111	NC_019388	GAG	3	9	3753	3761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731201
112	NC_019388	CCTC	2	8	3778	3785	0 %	25 %	0 %	75 %	410731201
113	NC_019388	AGG	2	6	3799	3804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731201
114	NC_019388	CAC	2	6	3840	3845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410731201
115	NC_019388	CGG	2	6	3851	3856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410731201
116	NC_019388	C	6	6	3878	3883	0 %	0 %	0 %	100 %	410731201
117	NC_019388	TGG	2	6	3905	3910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410731201
118	NC_019388	CCA	2	6	3968	3973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410731201
119	NC_019388	G	7	7	3986	3992	0 %	0 %	100 %	0 %	410731201
120	NC_019388	CTT	2	6	4043	4048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_019388	GCAC	2	8	4144	4151	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_019388	C	7	7	4190	4196	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
123	NC_019388	C	6	6	4225	4230	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
124	NC_019388	GCGT	2	8	4232	4239	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_019388	CCG	2	6	4337	4342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_019388	G	7	7	4423	4429	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019388	GGA	2	6	4479	4484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019388	G	7	7	4618	4624	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019388	ACCCC	3	15	4690	4704	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
130	NC_019388	GCC	3	9	4779	4787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_019388	AGGGG	2	10	4826	4835	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019388	TGCCCC	2	12	4847	4858	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_019388	CCG	2	6	4910	4915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_019388	GC	3	6	4989	4994	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_019388	AGA	2	6	5100	5105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019388	GGC	2	6	5125	5130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_019388	CG	3	6	5150	5155	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_019388	GGA	2	6	5165	5170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019388	G	6	6	5180	5185	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019388	TGG	2	6	5224	5229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410731202
141	NC_019388	TGG	2	6	5329	5334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410731202
142	NC_019388	AGG	2	6	5335	5340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731202
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147	NC_019388	GGT	2	6	5456	5461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410731202
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275	NC_019388	GTG	2	6	9721	9726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410731207
276	NC_019388	AGG	2	6	9757	9762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731207
277	NC_019388	G	7	7	9786	9792	0 %	0 %	100 %	0 %	410731207
278	NC_019388	CGC	2	6	9859	9864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
279	NC_019388	AGG	2	6	9931	9936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
280	NC_019388	GGA	2	6	9938	9943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731208
281	NC_019388	TGGCC	2	10	10020	10029	0 %	20 %	40 %	40 %	410731208
282	NC_019388	CTC	2	6	10138	10143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731208
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288	NC_019388	CTC	2	6	10302	10307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731209
289	NC_019388	GTG	2	6	10323	10328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410731209
290	NC_019388	GAG	2	6	10381	10386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731209
291	NC_019388	G	6	6	10391	10396	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
292	NC_019388	AGG	2	6	10427	10432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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297	NC_019388	GGA	2	6	10739	10744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
298	NC_019388	ACC	2	6	10768	10773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410731211
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305	NC_019388	GCTC	2	8	11073	11080	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
306	NC_019388	AGG	2	6	11095	11100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
307	NC_019388	TCA	2	6	11122	11127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410731212
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328	NC_019388	TCCT	2	8	11690	11697	0 %	50 %	0 %	50 %	410731213
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332	NC_019388	AGG	2	6	11891	11896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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352	NC_019388	CCA	2	6	12599	12604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410731215
353	NC_019388	G	7	7	12671	12677	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
354	NC_019388	AGG	2	6	12709	12714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
355	NC_019388	GGCGGA	2	12	12888	12899	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	410731216
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358	NC_019388	AAG	2	6	12973	12978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410731216
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361	NC_019388	GAG	2	6	13063	13068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731216
362	NC_019388	C	6	6	13078	13083	0 %	0 %	0 %	100 %	410731216
363	NC_019388	GCCCT	2	10	13087	13096	0 %	20 %	20 %	60 %	410731216
364	NC_019388	GGA	2	6	13135	13140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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389	NC_019388	GA	3	6	14053	14058	50 %	0 %	50 %	0 %	410731219
390	NC_019388	AGG	2	6	14105	14110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
391	NC_019388	AGGCCC	2	12	14163	14174	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	410731220
392	NC_019388	AGG	2	6	14211	14216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731220
393	NC_019388	GTG	2	6	14225	14230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410731220
394	NC_019388	AGG	2	6	14238	14243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731220
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396	NC_019388	ACCTGC	2	12	14279	14290	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	410731220
397	NC_019388	GGA	2	6	14307	14312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731220
398	NC_019388	CGC	2	6	14335	14340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410731220
399	NC_019388	TCC	2	6	14343	14348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731220
400	NC_019388	GAA	2	6	14362	14367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410731220
401	NC_019388	GAGGGA	2	12	14374	14385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731220
402	NC_019388	GGA	2	6	14436	14441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
403	NC_019388	AGG	2	6	14465	14470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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405	NC_019388	GGC	2	6	14510	14515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410731221
406	NC_019388	GGC	2	6	14615	14620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410731221
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