MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus oshimai JL-2 plasmid pTHEOS02

Total Repeats: 1456

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019388	CTC	2	6	18154	18159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731228
502	NC_019388	TGA	2	6	18192	18197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410731228
503	NC_019388	AGA	2	6	18272	18277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410731228
504	NC_019388	CAAA	2	8	18297	18304	75 %	0 %	0 %	25 %	410731228
505	NC_019388	GAA	2	6	18352	18357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410731228
506	NC_019388	GTA	2	6	18471	18476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410731228
507	NC_019388	A	7	7	18484	18490	100 %	0 %	0 %	0 %	410731228
508	NC_019388	AAC	2	6	18494	18499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410731228
509	NC_019388	AAAG	2	8	18510	18517	75 %	0 %	25 %	0 %	410731228
510	NC_019388	C	7	7	18537	18543	0 %	0 %	0 %	100 %	410731228
511	NC_019388	AGA	2	6	18646	18651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_019388	AGC	2	6	18660	18665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_019388	AGCA	2	8	18669	18676	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
514	NC_019388	TCA	2	6	18712	18717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_019388	CCA	2	6	18812	18817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_019388	GGGCCA	2	12	18818	18829	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_019388	CCT	2	6	18861	18866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
518	NC_019388	C	9	9	18905	18913	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
519	NC_019388	C	6	6	18971	18976	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
520	NC_019388	A	6	6	18985	18990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_019388	CTAC	2	8	19060	19067	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
522	NC_019388	TCG	2	6	19096	19101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_019388	AAAAGC	2	12	19123	19134	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
524	NC_019388	TCC	3	9	19177	19185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_019388	AGC	2	6	19208	19213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_019388	CTCC	2	8	19276	19283	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
527	NC_019388	TCC	2	6	19308	19313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_019388	GCT	2	6	19327	19332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_019388	GGT	2	6	19378	19383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
530	NC_019388	CT	4	8	19430	19437	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
531	NC_019388	GGTGGG	2	12	19450	19461	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_019388	TGA	2	6	19500	19505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_019388	CTT	2	6	19519	19524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_019388	CTT	2	6	19535	19540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_019388	GGT	2	6	19687	19692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
536	NC_019388	GA	3	6	19705	19710	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
537	NC_019388	CTG	2	6	19832	19837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_019388	G	6	6	19881	19886	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
539	NC_019388	C	7	7	19970	19976	0 %	0 %	0 %	100 %	410731229
540	NC_019388	GGT	2	6	19996	20001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410731229
541	NC_019388	GTA	2	6	20003	20008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410731229
542	NC_019388	TCG	2	6	20076	20081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410731229
543	NC_019388	GCA	2	6	20137	20142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410731229
544	NC_019388	C	6	6	20201	20206	0 %	0 %	0 %	100 %	410731229
545	NC_019388	CGC	2	6	20267	20272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410731229
546	NC_019388	ACC	2	6	20349	20354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410731229
547	NC_019388	GGC	2	6	20498	20503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410731229
548	NC_019388	GCTC	2	8	20560	20567	0 %	25 %	25 %	50 %	410731229
549	NC_019388	TCCT	2	8	20580	20587	0 %	50 %	0 %	50 %	410731229
550	NC_019388	TCCT	2	8	20628	20635	0 %	50 %	0 %	50 %	410731229
551	NC_019388	CAG	2	6	20654	20659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410731229
552	NC_019388	TCC	3	9	20677	20685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731229
553	NC_019388	CTC	2	6	20914	20919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731229
554	NC_019388	G	6	6	20956	20961	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
555	NC_019388	CCT	2	6	20962	20967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_019388	CCCAG	2	10	20994	21003	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
557	NC_019388	AGG	2	6	21061	21066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
558	NC_019388	CCT	2	6	21123	21128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731230
559	NC_019388	CCTGGC	2	12	21141	21152	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	410731230
560	NC_019388	CAG	2	6	21175	21180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410731230
561	NC_019388	CTC	2	6	21184	21189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731230
562	NC_019388	CTT	2	6	21216	21221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410731230
563	NC_019388	AGG	2	6	21260	21265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731230
564	NC_019388	CCT	2	6	21273	21278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731230
565	NC_019388	GCC	2	6	21308	21313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410731230
566	NC_019388	TCC	2	6	21383	21388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731230
567	NC_019388	GAC	2	6	21418	21423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410731230
568	NC_019388	CCT	3	9	21426	21434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731230
569	NC_019388	GGGAGG	2	12	21500	21511	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	410731230
570	NC_019388	GCG	2	6	21555	21560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410731230
571	NC_019388	TGCC	2	8	21571	21578	0 %	25 %	25 %	50 %	410731230
572	NC_019388	GGCCC	2	10	21594	21603	0 %	0 %	40 %	60 %	410731230
573	NC_019388	GTG	2	6	21637	21642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410731230
574	NC_019388	GGGA	2	8	21644	21651	25 %	0 %	75 %	0 %	410731230
575	NC_019388	CTC	3	9	21682	21690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731230
576	NC_019388	TGG	2	6	21752	21757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410731230
577	NC_019388	G	6	6	21782	21787	0 %	0 %	100 %	0 %	410731230
578	NC_019388	GAG	2	6	21823	21828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731230
579	NC_019388	C	6	6	21907	21912	0 %	0 %	0 %	100 %	410731231
580	NC_019388	CCG	2	6	21919	21924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410731231
581	NC_019388	CCA	2	6	22018	22023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410731231
582	NC_019388	CTC	2	6	22049	22054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731231
583	NC_019388	CTC	3	9	22079	22087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731231
584	NC_019388	CTC	2	6	22184	22189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731231
585	NC_019388	CTC	2	6	22205	22210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731231
586	NC_019388	GCC	2	6	22257	22262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410731231
587	NC_019388	GCT	2	6	22319	22324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410731231
588	NC_019388	CTCC	2	8	22342	22349	0 %	25 %	0 %	75 %	410731231
589	NC_019388	TGC	2	6	22404	22409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410731231
590	NC_019388	CCT	2	6	22429	22434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731231
591	NC_019388	C	6	6	22591	22596	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
592	NC_019388	GAG	2	6	22634	22639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731232
593	NC_019388	AGG	2	6	22726	22731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731232
594	NC_019388	CTC	2	6	22745	22750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731232
595	NC_019388	CCA	2	6	22801	22806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410731232
596	NC_019388	AGG	2	6	22815	22820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731232
597	NC_019388	TCC	3	9	22842	22850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731232
598	NC_019388	AGG	2	6	22884	22889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731232
599	NC_019388	AGT	2	6	22921	22926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410731232
600	NC_019388	GCC	2	6	22963	22968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410731232
601	NC_019388	CCT	2	6	22978	22983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731233
602	NC_019388	TCC	2	6	23015	23020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731233
603	NC_019388	CTC	2	6	23023	23028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731233
604	NC_019388	GA	3	6	23054	23059	50 %	0 %	50 %	0 %	410731233
605	NC_019388	CTC	2	6	23074	23079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731233
606	NC_019388	G	7	7	23096	23102	0 %	0 %	100 %	0 %	410731233
607	NC_019388	CCA	2	6	23114	23119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410731233
608	NC_019388	C	6	6	23139	23144	0 %	0 %	0 %	100 %	410731233
609	NC_019388	CGG	2	6	23162	23167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410731233
610	NC_019388	CCA	2	6	23232	23237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410731233
611	NC_019388	C	6	6	23250	23255	0 %	0 %	0 %	100 %	410731233
612	NC_019388	GTG	2	6	23263	23268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410731233
613	NC_019388	CCT	2	6	23274	23279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731233
614	NC_019388	C	6	6	23327	23332	0 %	0 %	0 %	100 %	410731233
615	NC_019388	TCC	2	6	23333	23338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731233
616	NC_019388	GCC	2	6	23358	23363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410731233
617	NC_019388	CTC	2	6	23370	23375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731233
618	NC_019388	G	6	6	23394	23399	0 %	0 %	100 %	0 %	410731233
619	NC_019388	AGC	2	6	23447	23452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410731233
620	NC_019388	C	7	7	23467	23473	0 %	0 %	0 %	100 %	410731233
621	NC_019388	CTC	2	6	23599	23604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731233
622	NC_019388	GTG	2	6	23620	23625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410731233
623	NC_019388	GGC	2	6	23662	23667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410731233
624	NC_019388	CCG	2	6	23673	23678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410731233
625	NC_019388	TCC	2	6	23702	23707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731233
626	NC_019388	G	7	7	23740	23746	0 %	0 %	100 %	0 %	410731233
627	NC_019388	A	6	6	23749	23754	100 %	0 %	0 %	0 %	410731233
628	NC_019388	A	6	6	23767	23772	100 %	0 %	0 %	0 %	410731233
629	NC_019388	CGCA	2	8	23789	23796	25 %	0 %	25 %	50 %	410731233
630	NC_019388	CGGG	3	12	23801	23812	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
631	NC_019388	GGGC	2	8	23834	23841	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
632	NC_019388	T	8	8	23847	23854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_019388	C	6	6	23863	23868	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
634	NC_019388	CTGG	2	8	23988	23995	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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942	NC_019388	CCT	2	6	35325	35330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
943	NC_019388	GGT	2	6	35382	35387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
944	NC_019388	TCC	2	6	35420	35425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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964	NC_019388	GGA	2	6	36172	36177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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