MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus oshimai JL-2 plasmid pTHEOS01

Total Repeats: 7005

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_019387	GGA	2	6	135446	135451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731065
3502	NC_019387	GAG	2	6	135471	135476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731065
3503	NC_019387	CTC	2	6	135486	135491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731065
3504	NC_019387	CCT	2	6	135500	135505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731065
3505	NC_019387	GGGCC	2	10	135512	135521	0 %	0 %	60 %	40 %	410731065
3506	NC_019387	GAG	2	6	135522	135527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731065
3507	NC_019387	TCC	3	9	135559	135567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731065
3508	NC_019387	GGA	2	6	135581	135586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731065
3509	NC_019387	GGCCCT	2	12	135587	135598	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	410731065
3510	NC_019387	CCGC	2	8	135629	135636	0 %	0 %	25 %	75 %	410731065
3511	NC_019387	ACC	2	6	135643	135648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410731065
3512	NC_019387	GGGA	2	8	135649	135656	25 %	0 %	75 %	0 %	410731065
3513	NC_019387	CTC	2	6	135660	135665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731065
3514	NC_019387	CCT	2	6	135671	135676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731065
3515	NC_019387	GGA	2	6	135698	135703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731065
3516	NC_019387	CCT	2	6	135797	135802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731065
3517	NC_019387	GCC	2	6	135811	135816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410731065
3518	NC_019387	GCC	2	6	135831	135836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410731065
3519	NC_019387	CTC	2	6	135849	135854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731065
3520	NC_019387	G	7	7	135863	135869	0 %	0 %	100 %	0 %	410731065
3521	NC_019387	CCCG	2	8	135870	135877	0 %	0 %	25 %	75 %	410731065
3522	NC_019387	G	7	7	135896	135902	0 %	0 %	100 %	0 %	410731065
3523	NC_019387	GCC	2	6	135906	135911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410731065
3524	NC_019387	GAG	2	6	135918	135923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731065
3525	NC_019387	G	7	7	136020	136026	0 %	0 %	100 %	0 %	410731065
3526	NC_019387	GGA	2	6	136109	136114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731065
3527	NC_019387	CCT	3	9	136115	136123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731065
3528	NC_019387	C	8	8	136159	136166	0 %	0 %	0 %	100 %	410731065
3529	NC_019387	GGC	2	6	136192	136197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410731065
3530	NC_019387	G	6	6	136253	136258	0 %	0 %	100 %	0 %	410731065
3531	NC_019387	CGGG	2	8	136295	136302	0 %	0 %	75 %	25 %	410731065
3532	NC_019387	CCT	3	9	136313	136321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731065
3533	NC_019387	CTC	2	6	136326	136331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731065
3534	NC_019387	AGG	2	6	136351	136356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731065
3535	NC_019387	AGG	2	6	136363	136368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731065
3536	NC_019387	TGG	2	6	136404	136409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410731065
3537	NC_019387	CTC	2	6	136413	136418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731065
3538	NC_019387	CGGC	2	8	136433	136440	0 %	0 %	50 %	50 %	410731065
3539	NC_019387	TCC	2	6	136462	136467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731065
3540	NC_019387	CACC	2	8	136469	136476	25 %	0 %	0 %	75 %	410731065
3541	NC_019387	GGC	2	6	136480	136485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410731065
3542	NC_019387	ACC	2	6	136564	136569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410731065
3543	NC_019387	CCT	2	6	136571	136576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731065
3544	NC_019387	GGGCCC	2	12	136585	136596	0 %	0 %	50 %	50 %	410731065
3545	NC_019387	GGA	2	6	136601	136606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731065
3546	NC_019387	CTC	2	6	136620	136625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731065
3547	NC_019387	GGCCCT	2	12	136655	136666	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	410731065
3548	NC_019387	GAG	2	6	136680	136685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731065
3549	NC_019387	AGA	2	6	136718	136723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410731065
3550	NC_019387	GGA	2	6	136751	136756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731065
3551	NC_019387	C	6	6	136781	136786	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3552	NC_019387	C	6	6	136846	136851	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3553	NC_019387	CGC	2	6	136971	136976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410731066
3554	NC_019387	CCA	2	6	137066	137071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410731066
3555	NC_019387	GCACGA	2	12	137132	137143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410731066
3556	NC_019387	CTGGAG	2	12	137164	137175	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	410731066
3557	NC_019387	C	6	6	137178	137183	0 %	0 %	0 %	100 %	410731066
3558	NC_019387	G	7	7	137317	137323	0 %	0 %	100 %	0 %	410731066
3559	NC_019387	CGG	2	6	137342	137347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410731067
3560	NC_019387	GGT	3	9	137372	137380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410731067
3561	NC_019387	CCT	2	6	137422	137427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731067
3562	NC_019387	G	6	6	137571	137576	0 %	0 %	100 %	0 %	410731067
3563	NC_019387	CGC	2	6	137592	137597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410731067
3564	NC_019387	CCT	2	6	137614	137619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731067
3565	NC_019387	GGA	2	6	137668	137673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731067
3566	NC_019387	TGG	2	6	137738	137743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410731068
3567	NC_019387	GGC	2	6	137853	137858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410731068
3568	NC_019387	CCT	2	6	137865	137870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731068
3569	NC_019387	TCC	2	6	137951	137956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731068
3570	NC_019387	CTG	2	6	137965	137970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410731068
3571	NC_019387	CCGGG	2	10	138006	138015	0 %	0 %	60 %	40 %	410731068
3572	NC_019387	AGC	2	6	138016	138021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410731068
3573	NC_019387	GGACGG	2	12	138081	138092	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	410731068
3574	NC_019387	GAC	2	6	138103	138108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410731068
3575	NC_019387	GGAGG	2	10	138145	138154	20 %	0 %	80 %	0 %	410731068
3576	NC_019387	CAC	2	6	138177	138182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410731068
3577	NC_019387	TTC	2	6	138196	138201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410731068
3578	NC_019387	ACG	2	6	138206	138211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410731068
3579	NC_019387	TGG	2	6	138488	138493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410731068
3580	NC_019387	G	6	6	138511	138516	0 %	0 %	100 %	0 %	410731068
3581	NC_019387	TC	3	6	138558	138563	0 %	50 %	0 %	50 %	410731068
3582	NC_019387	AGG	2	6	138569	138574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731068
3583	NC_019387	TCC	2	6	138617	138622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731069
3584	NC_019387	CTC	2	6	138640	138645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731069
3585	NC_019387	TCACCC	2	12	138656	138667	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	410731069
3586	NC_019387	CAC	2	6	138681	138686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410731069
3587	NC_019387	GGA	2	6	138750	138755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731069
3588	NC_019387	C	7	7	138797	138803	0 %	0 %	0 %	100 %	410731069
3589	NC_019387	G	6	6	138837	138842	0 %	0 %	100 %	0 %	410731069
3590	NC_019387	GCC	2	6	138878	138883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410731069
3591	NC_019387	TGA	2	6	138887	138892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410731069
3592	NC_019387	GTG	2	6	138898	138903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410731069
3593	NC_019387	CAA	2	6	138912	138917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410731069
3594	NC_019387	CCG	2	6	138937	138942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410731069
3595	NC_019387	TCT	2	6	138989	138994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410731069
3596	NC_019387	GGGAC	2	10	139005	139014	20 %	0 %	60 %	20 %	410731069
3597	NC_019387	GTG	2	6	139057	139062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410731069
3598	NC_019387	CAG	2	6	139090	139095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410731069
3599	NC_019387	ACCGC	2	10	139109	139118	20 %	0 %	20 %	60 %	410731069
3600	NC_019387	CCG	2	6	139211	139216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410731069
3601	NC_019387	AGGA	2	8	139218	139225	50 %	0 %	50 %	0 %	410731069
3602	NC_019387	TCC	2	6	139243	139248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731069
3603	NC_019387	GGAT	2	8	139357	139364	25 %	25 %	50 %	0 %	410731069
3604	NC_019387	CCAC	2	8	139381	139388	25 %	0 %	0 %	75 %	410731069
3605	NC_019387	C	7	7	139413	139419	0 %	0 %	0 %	100 %	410731069
3606	NC_019387	CAC	2	6	139485	139490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410731069
3607	NC_019387	CCA	2	6	139493	139498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410731069
3608	NC_019387	CCTGGC	2	12	139524	139535	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	410731069
3609	NC_019387	CTG	2	6	139543	139548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410731069
3610	NC_019387	ACA	2	6	139592	139597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410731069
3611	NC_019387	GAC	2	6	139702	139707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410731069
3612	NC_019387	ACC	2	6	139708	139713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410731069
3613	NC_019387	CGG	2	6	139907	139912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410731069
3614	NC_019387	CAA	2	6	139944	139949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410731069
3615	NC_019387	CCTAC	2	10	139967	139976	20 %	20 %	0 %	60 %	410731069
3616	NC_019387	CCA	2	6	140000	140005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410731069
3617	NC_019387	CCA	2	6	140105	140110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410731069
3618	NC_019387	CGC	2	6	140124	140129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410731069
3619	NC_019387	CCCA	2	8	140155	140162	25 %	0 %	0 %	75 %	410731069
3620	NC_019387	AGG	2	6	140171	140176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731069
3621	NC_019387	ACC	2	6	140227	140232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410731069
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3993	NC_019387	C	6	6	154825	154830	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3994	NC_019387	AGA	2	6	154876	154881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3995	NC_019387	CCCT	2	8	154887	154894	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3996	NC_019387	CTC	2	6	154922	154927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3997	NC_019387	CCG	2	6	154943	154948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3998	NC_019387	CGG	2	6	154963	154968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3999	NC_019387	GCCC	2	8	155007	155014	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4000	NC_019387	AAG	2	6	155015	155020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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