MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermacetogenium phaeum DSM 12270 chromosome

Total Repeats: 63765

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018870	CAA	2	6	62	67	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018870	ATA	2	6	86	91	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018870	TGA	2	6	175	180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410666387
4	NC_018870	ACT	2	6	186	191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410666387
5	NC_018870	GCG	2	6	206	211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410666387
6	NC_018870	CAG	2	6	364	369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410666387
7	NC_018870	G	6	6	393	398	0 %	0 %	100 %	0 %	410666387
8	NC_018870	TGT	2	6	442	447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410666387
9	NC_018870	GCAACA	2	12	450	461	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	410666387
10	NC_018870	CAT	2	6	578	583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410666387
11	NC_018870	AAC	2	6	593	598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410666387
12	NC_018870	GTC	2	6	611	616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410666387
13	NC_018870	TCA	2	6	623	628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410666387
14	NC_018870	CAA	2	6	688	693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410666387
15	NC_018870	GAT	2	6	722	727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410666387
16	NC_018870	AGG	2	6	759	764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410666387
17	NC_018870	ATC	2	6	809	814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410666387
18	NC_018870	GGA	2	6	853	858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410666387
19	NC_018870	CCT	2	6	886	891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410666387
20	NC_018870	GA	3	6	922	927	50 %	0 %	50 %	0 %	410666387
21	NC_018870	A	7	7	940	946	100 %	0 %	0 %	0 %	410666387
22	NC_018870	GTT	2	6	965	970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410666387
23	NC_018870	AAAAT	2	10	1001	1010	80 %	20 %	0 %	0 %	410666387
24	NC_018870	TC	3	6	1090	1095	0 %	50 %	0 %	50 %	410666387
25	NC_018870	AGG	2	6	1098	1103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410666387
26	NC_018870	GCAG	2	8	1121	1128	25 %	0 %	50 %	25 %	410666387
27	NC_018870	AGA	2	6	1195	1200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410666387
28	NC_018870	AGA	2	6	1276	1281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410666387
29	NC_018870	CGG	2	6	1309	1314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410666387
30	NC_018870	CAC	2	6	1324	1329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410666387
31	NC_018870	CAA	2	6	1367	1372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410666387
32	NC_018870	CAA	2	6	1396	1401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410666387
33	NC_018870	CAT	2	6	1422	1427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410666387
34	NC_018870	T	7	7	1435	1441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018870	CA	4	8	1457	1464	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_018870	AG	3	6	1533	1538	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018870	CTC	4	12	1579	1590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_018870	AT	3	6	1608	1613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018870	GAG	2	6	1670	1675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018870	GC	3	6	1761	1766	0 %	0 %	50 %	50 %	410666388
41	NC_018870	CGA	2	6	1795	1800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410666388
42	NC_018870	GTC	2	6	1811	1816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410666388
43	NC_018870	AGTC	2	8	1834	1841	25 %	25 %	25 %	25 %	410666388
44	NC_018870	GAG	3	9	1868	1876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410666388
45	NC_018870	GTC	3	9	1883	1891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410666388
46	NC_018870	CCGT	2	8	1893	1900	0 %	25 %	25 %	50 %	410666388
47	NC_018870	CTG	2	6	1913	1918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410666388
48	NC_018870	CGG	2	6	1919	1924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410666388
49	NC_018870	GAG	2	6	1934	1939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410666388
50	NC_018870	GAG	2	6	1958	1963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410666388
51	NC_018870	TCG	2	6	1991	1996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410666388
52	NC_018870	GAT	2	6	2024	2029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410666388
53	NC_018870	CT	3	6	2109	2114	0 %	50 %	0 %	50 %	410666388
54	NC_018870	TC	3	6	2121	2126	0 %	50 %	0 %	50 %	410666388
55	NC_018870	GAA	2	6	2177	2182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410666388
56	NC_018870	TGG	2	6	2301	2306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410666388
57	NC_018870	TCA	2	6	2325	2330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410666388
58	NC_018870	AGCT	2	8	2362	2369	25 %	25 %	25 %	25 %	410666388
59	NC_018870	GAC	2	6	2377	2382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410666388
60	NC_018870	GCT	2	6	2467	2472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410666388
61	NC_018870	GA	3	6	2483	2488	50 %	0 %	50 %	0 %	410666388
62	NC_018870	GGA	2	6	2611	2616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410666388
63	NC_018870	CTG	2	6	2660	2665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410666388
64	NC_018870	CT	3	6	2702	2707	0 %	50 %	0 %	50 %	410666388
65	NC_018870	AGG	3	9	2739	2747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410666388
66	NC_018870	GAT	2	6	2750	2755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410666388
67	NC_018870	TG	3	6	2782	2787	0 %	50 %	50 %	0 %	410666388
68	NC_018870	TA	3	6	2825	2830	50 %	50 %	0 %	0 %	410666389
69	NC_018870	AG	3	6	2855	2860	50 %	0 %	50 %	0 %	410666389
70	NC_018870	TCG	2	6	2889	2894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410666389
71	NC_018870	G	6	6	3000	3005	0 %	0 %	100 %	0 %	410666389
72	NC_018870	T	8	8	3010	3017	0 %	100 %	0 %	0 %	410666389
73	NC_018870	GGC	2	6	3041	3046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410666389
74	NC_018870	CAG	2	6	3073	3078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410666389
75	NC_018870	GAG	2	6	3085	3090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410666389
76	NC_018870	GTT	2	6	3152	3157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410666389
77	NC_018870	TC	3	6	3175	3180	0 %	50 %	0 %	50 %	410666389
78	NC_018870	G	6	6	3190	3195	0 %	0 %	100 %	0 %	410666389
79	NC_018870	TCG	2	6	3228	3233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410666389
80	NC_018870	GCA	2	6	3247	3252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410666389
81	NC_018870	CCG	2	6	3255	3260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410666389
82	NC_018870	CCT	2	6	3283	3288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410666389
83	NC_018870	CTG	2	6	3335	3340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410666389
84	NC_018870	AGC	2	6	3351	3356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410666389
85	NC_018870	GGC	2	6	3358	3363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410666389
86	NC_018870	GGA	2	6	3381	3386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410666389
87	NC_018870	T	9	9	3414	3422	0 %	100 %	0 %	0 %	410666389
88	NC_018870	CGG	2	6	3490	3495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410666389
89	NC_018870	AGA	2	6	3511	3516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410666389
90	NC_018870	GAA	2	6	3529	3534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410666389
91	NC_018870	AGG	2	6	3572	3577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410666389
92	NC_018870	CGA	2	6	3585	3590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410666389
93	NC_018870	GCT	2	6	3619	3624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410666389
94	NC_018870	TCA	2	6	3653	3658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410666389
95	NC_018870	GCT	2	6	3709	3714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410666389
96	NC_018870	TGC	2	6	3744	3749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410666389
97	NC_018870	CGA	2	6	3751	3756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410666389
98	NC_018870	TCT	2	6	3759	3764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410666389
99	NC_018870	CGA	2	6	3772	3777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410666389
100	NC_018870	GGC	2	6	3812	3817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410666389
101	NC_018870	CGG	2	6	3853	3858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410666389
102	NC_018870	CAG	2	6	3862	3867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410666389
103	NC_018870	AGC	2	6	3873	3878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410666389
104	NC_018870	A	6	6	3941	3946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018870	CGG	2	6	3964	3969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410666390
106	NC_018870	GACGG	2	10	4018	4027	20 %	0 %	60 %	20 %	410666390
107	NC_018870	GGT	2	6	4078	4083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410666390
108	NC_018870	TAC	2	6	4139	4144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410666390
109	NC_018870	CTT	2	6	4228	4233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_018870	TAC	2	6	4261	4266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_018870	GTT	2	6	4312	4317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018870	GAG	2	6	4326	4331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018870	AG	4	8	4355	4362	50 %	0 %	50 %	0 %	410666391
114	NC_018870	ACG	2	6	4383	4388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410666391
115	NC_018870	GCG	2	6	4426	4431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410666391
116	NC_018870	GC	3	6	4463	4468	0 %	0 %	50 %	50 %	410666391
117	NC_018870	GA	3	6	4579	4584	50 %	0 %	50 %	0 %	410666391
118	NC_018870	GGCC	2	8	4629	4636	0 %	0 %	50 %	50 %	410666391
119	NC_018870	GCT	2	6	4643	4648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410666391
120	NC_018870	TGC	2	6	4656	4661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410666391
121	NC_018870	GGC	2	6	4667	4672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410666391
122	NC_018870	CGG	2	6	4678	4683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410666391
123	NC_018870	CGG	2	6	4702	4707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410666391
124	NC_018870	GTCG	2	8	4726	4733	0 %	25 %	50 %	25 %	410666391
125	NC_018870	GCTG	2	8	4749	4756	0 %	25 %	50 %	25 %	410666391
126	NC_018870	CGGA	2	8	4878	4885	25 %	0 %	50 %	25 %	410666391
127	NC_018870	TCT	2	6	4890	4895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410666391
128	NC_018870	GAAA	2	8	4898	4905	75 %	0 %	25 %	0 %	410666391
129	NC_018870	G	6	6	5020	5025	0 %	0 %	100 %	0 %	410666391
130	NC_018870	AACAAA	2	12	5051	5062	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	410666391
131	NC_018870	GTG	2	6	5111	5116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410666391
132	NC_018870	CAA	2	6	5173	5178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410666391
133	NC_018870	AGG	2	6	5190	5195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410666391
134	NC_018870	G	6	6	5194	5199	0 %	0 %	100 %	0 %	410666391
135	NC_018870	ATC	2	6	5237	5242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410666391
136	NC_018870	CCG	2	6	5322	5327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410666391
137	NC_018870	TCG	2	6	5406	5411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410666391
138	NC_018870	GTCG	2	8	5413	5420	0 %	25 %	50 %	25 %	410666391
139	NC_018870	GGA	2	6	5434	5439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410666391
140	NC_018870	GAG	2	6	5447	5452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410666391
141	NC_018870	TCG	2	6	5475	5480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410666391
142	NC_018870	GGC	2	6	5494	5499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410666391
143	NC_018870	GGC	2	6	5512	5517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410666391
144	NC_018870	TCG	2	6	5628	5633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410666391
145	NC_018870	TGG	2	6	5647	5652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410666391
146	NC_018870	ATC	2	6	5711	5716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410666391
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148	NC_018870	GAG	2	6	5756	5761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410666391
149	NC_018870	CAT	2	6	5770	5775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410666391
150	NC_018870	GC	3	6	5822	5827	0 %	0 %	50 %	50 %	410666391
151	NC_018870	ATC	3	9	5837	5845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410666391
152	NC_018870	CTG	2	6	5885	5890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410666391
153	NC_018870	C	7	7	5954	5960	0 %	0 %	0 %	100 %	410666391
154	NC_018870	GA	3	6	6078	6083	50 %	0 %	50 %	0 %	410666391
155	NC_018870	AGC	2	6	6093	6098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410666391
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158	NC_018870	AGG	2	6	6212	6217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410666391
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160	NC_018870	A	7	7	6295	6301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_018870	G	6	6	6306	6311	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
162	NC_018870	GAG	2	6	6338	6343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
163	NC_018870	CCG	2	6	6430	6435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
164	NC_018870	GAG	2	6	6524	6529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
165	NC_018870	GAA	2	6	6530	6535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
166	NC_018870	GA	3	6	6541	6546	50 %	0 %	50 %	0 %	410666392
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169	NC_018870	AGG	2	6	6715	6720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410666392
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172	NC_018870	GTG	2	6	6804	6809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410666392
173	NC_018870	GGT	2	6	6896	6901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410666392
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175	NC_018870	CTG	2	6	6960	6965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410666392
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210	NC_018870	GGC	2	6	8060	8065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410666392
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240	NC_018870	CTG	2	6	9252	9257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
241	NC_018870	CAG	2	6	9270	9275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
242	NC_018870	GCC	2	6	9281	9286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
243	NC_018870	CG	3	6	9303	9308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
244	NC_018870	AATGT	2	10	9490	9499	40 %	40 %	20 %	0 %	410666393
245	NC_018870	TCA	2	6	9508	9513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410666393
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248	NC_018870	GCA	2	6	9642	9647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410666393
249	NC_018870	GATA	2	8	9659	9666	50 %	25 %	25 %	0 %	410666393
250	NC_018870	CTA	2	6	9710	9715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
251	NC_018870	CCGGCA	2	12	9730	9741	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
252	NC_018870	T	9	9	9799	9807	0 %	100 %	0 %	0 %	410666394
253	NC_018870	CCT	2	6	9824	9829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410666394
254	NC_018870	TGA	2	6	9908	9913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410666394
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256	NC_018870	CAAC	2	8	10108	10115	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
257	NC_018870	TCC	2	6	10207	10212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
258	NC_018870	TAA	2	6	10344	10349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_018870	TCT	2	6	10360	10365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
260	NC_018870	TC	3	6	10376	10381	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
261	NC_018870	GAA	2	6	10432	10437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
262	NC_018870	ACC	2	6	10445	10450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
263	NC_018870	CAG	2	6	10471	10476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
264	NC_018870	GGTAT	2	10	10499	10508	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
265	NC_018870	CAT	2	6	10564	10569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
266	NC_018870	AGC	2	6	10726	10731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
267	NC_018870	TTA	2	6	10748	10753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_018870	TTA	2	6	10785	10790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_018870	T	6	6	10792	10797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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272	NC_018870	GCTA	2	8	10825	10832	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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301	NC_018870	ATA	2	6	11837	11842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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404	NC_018870	GC	3	6	16130	16135	0 %	0 %	50 %	50 %	410666396
405	NC_018870	AGC	2	6	16171	16176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410666396
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433	NC_018870	GAC	2	6	17419	17424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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436	NC_018870	GAG	3	9	17532	17540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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470	NC_018870	AG	3	6	18723	18728	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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