MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Mexico A chromosome

Total Repeats: 24024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23502	NC_018722	CG	4	8	1113905	1113912	0 %	0 %	50 %	50 %	408502865
23503	NC_018722	TGCG	2	8	1114016	1114023	0 %	25 %	50 %	25 %	408502866
23504	NC_018722	AC	3	6	1114046	1114051	50 %	0 %	0 %	50 %	408502866
23505	NC_018722	GGA	2	6	1114098	1114103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502866
23506	NC_018722	CG	3	6	1114107	1114112	0 %	0 %	50 %	50 %	408502866
23507	NC_018722	G	6	6	1114171	1114176	0 %	0 %	100 %	0 %	408502866
23508	NC_018722	GAAAG	2	10	1114236	1114245	60 %	0 %	40 %	0 %	408502866
23509	NC_018722	GTT	2	6	1114303	1114308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502866
23510	NC_018722	GC	3	6	1114309	1114314	0 %	0 %	50 %	50 %	408502866
23511	NC_018722	GC	3	6	1114317	1114322	0 %	0 %	50 %	50 %	408502866
23512	NC_018722	GAAC	2	8	1114346	1114353	50 %	0 %	25 %	25 %	408502866
23513	NC_018722	CGG	2	6	1114449	1114454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502866
23514	NC_018722	GCC	2	6	1114462	1114467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502866
23515	NC_018722	GCT	2	6	1114531	1114536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502866
23516	NC_018722	GGT	2	6	1114590	1114595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502866
23517	NC_018722	CTC	2	6	1114605	1114610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502866
23518	NC_018722	T	6	6	1114627	1114632	0 %	100 %	0 %	0 %	408502866
23519	NC_018722	GCCCTC	2	12	1114654	1114665	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	408502866
23520	NC_018722	C	6	6	1114710	1114715	0 %	0 %	0 %	100 %	408502866
23521	NC_018722	TGC	2	6	1114788	1114793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502866
23522	NC_018722	TAG	2	6	1114808	1114813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502866
23523	NC_018722	AGA	2	6	1114893	1114898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502866
23524	NC_018722	GGC	2	6	1114920	1114925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502866
23525	NC_018722	TAT	2	6	1114936	1114941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408502866
23526	NC_018722	GCC	2	6	1114960	1114965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502866
23527	NC_018722	TAC	2	6	1115035	1115040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502866
23528	NC_018722	CCGT	2	8	1115045	1115052	0 %	25 %	25 %	50 %	408502866
23529	NC_018722	ATT	2	6	1115129	1115134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408502866
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23531	NC_018722	TTGT	2	8	1115207	1115214	0 %	75 %	25 %	0 %	408502866
23532	NC_018722	CAC	2	6	1115292	1115297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502866
23533	NC_018722	GAG	2	6	1115431	1115436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502866
23534	NC_018722	AC	3	6	1115496	1115501	50 %	0 %	0 %	50 %	408502867
23535	NC_018722	ATT	2	6	1115528	1115533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408502867
23536	NC_018722	CTGTGC	2	12	1115578	1115589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502867
23537	NC_018722	AGG	2	6	1115599	1115604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502867
23538	NC_018722	GT	4	8	1115619	1115626	0 %	50 %	50 %	0 %	408502867
23539	NC_018722	TG	3	6	1115629	1115634	0 %	50 %	50 %	0 %	408502867
23540	NC_018722	GC	3	6	1115692	1115697	0 %	0 %	50 %	50 %	408502867
23541	NC_018722	ACG	2	6	1115796	1115801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502867
23542	NC_018722	GCG	2	6	1115857	1115862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502867
23543	NC_018722	GGA	3	9	1115887	1115895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502867
23544	NC_018722	TGC	2	6	1115914	1115919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502867
23545	NC_018722	AGG	2	6	1116003	1116008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502867
23546	NC_018722	AGA	2	6	1116073	1116078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502867
23547	NC_018722	TGCGA	2	10	1116087	1116096	20 %	20 %	40 %	20 %	408502867
23548	NC_018722	TCGTA	2	10	1116173	1116182	20 %	40 %	20 %	20 %	408502867
23549	NC_018722	AGA	2	6	1116256	1116261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502867
23550	NC_018722	CACT	2	8	1116329	1116336	25 %	25 %	0 %	50 %	408502867
23551	NC_018722	ACCTG	2	10	1116370	1116379	20 %	20 %	20 %	40 %	408502867
23552	NC_018722	TC	3	6	1116406	1116411	0 %	50 %	0 %	50 %	408502867
23553	NC_018722	GCG	2	6	1116439	1116444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502867
23554	NC_018722	CGA	2	6	1116557	1116562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502867
23555	NC_018722	GTA	2	6	1116596	1116601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502867
23556	NC_018722	GAA	2	6	1116607	1116612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502867
23557	NC_018722	AT	3	6	1116708	1116713	50 %	50 %	0 %	0 %	408502867
23558	NC_018722	GAA	2	6	1116791	1116796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502867
23559	NC_018722	GC	3	6	1116916	1116921	0 %	0 %	50 %	50 %	408502867
23560	NC_018722	CCA	2	6	1116949	1116954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502867
23561	NC_018722	CT	3	6	1116959	1116964	0 %	50 %	0 %	50 %	408502867
23562	NC_018722	GCG	2	6	1116998	1117003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23563	NC_018722	TC	3	6	1117005	1117010	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23564	NC_018722	GCCCG	2	10	1117022	1117031	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
23565	NC_018722	GAA	2	6	1117045	1117050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23566	NC_018722	CTA	2	6	1117066	1117071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502868
23567	NC_018722	CGCCTT	2	12	1117072	1117083	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	408502868
23568	NC_018722	CAC	2	6	1117120	1117125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502868
23569	NC_018722	AGG	2	6	1117138	1117143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502868
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23571	NC_018722	AT	3	6	1117174	1117179	50 %	50 %	0 %	0 %	408502868
23572	NC_018722	A	6	6	1117470	1117475	100 %	0 %	0 %	0 %	408502868
23573	NC_018722	CG	3	6	1117476	1117481	0 %	0 %	50 %	50 %	408502868
23574	NC_018722	ACT	2	6	1117486	1117491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502868
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23576	NC_018722	CCTG	2	8	1117584	1117591	0 %	25 %	25 %	50 %	408502868
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23579	NC_018722	TCA	2	6	1117664	1117669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502868
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23584	NC_018722	TGAT	2	8	1117871	1117878	25 %	50 %	25 %	0 %	408502868
23585	NC_018722	A	6	6	1117908	1117913	100 %	0 %	0 %	0 %	408502868
23586	NC_018722	GAATC	2	10	1117920	1117929	40 %	20 %	20 %	20 %	408502868
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23589	NC_018722	GC	4	8	1118238	1118245	0 %	0 %	50 %	50 %	408502868
23590	NC_018722	CA	3	6	1118250	1118255	50 %	0 %	0 %	50 %	408502868
23591	NC_018722	GAA	2	6	1118276	1118281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502868
23592	NC_018722	T	6	6	1118288	1118293	0 %	100 %	0 %	0 %	408502868
23593	NC_018722	GGA	2	6	1118311	1118316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502868
23594	NC_018722	AGAA	2	8	1118454	1118461	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23595	NC_018722	CGG	2	6	1118473	1118478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23596	NC_018722	CGA	2	6	1118514	1118519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502869
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23599	NC_018722	CG	3	6	1118757	1118762	0 %	0 %	50 %	50 %	408502869
23600	NC_018722	ATC	2	6	1118771	1118776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502869
23601	NC_018722	GCT	2	6	1118860	1118865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502869
23602	NC_018722	CGAG	2	8	1118883	1118890	25 %	0 %	50 %	25 %	408502869
23603	NC_018722	TCA	2	6	1118955	1118960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502869
23604	NC_018722	CTC	2	6	1118981	1118986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23605	NC_018722	GC	3	6	1119001	1119006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23606	NC_018722	CACC	2	8	1119037	1119044	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
23607	NC_018722	TCC	2	6	1119066	1119071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23608	NC_018722	CTT	2	6	1119153	1119158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502870
23609	NC_018722	GCAC	2	8	1119229	1119236	25 %	0 %	25 %	50 %	408502870
23610	NC_018722	GC	4	8	1119241	1119248	0 %	0 %	50 %	50 %	408502870
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23612	NC_018722	CGC	2	6	1119319	1119324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502870
23613	NC_018722	CCG	2	6	1119371	1119376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502870
23614	NC_018722	AC	3	6	1119438	1119443	50 %	0 %	0 %	50 %	408502870
23615	NC_018722	GCGA	2	8	1119444	1119451	25 %	0 %	50 %	25 %	408502870
23616	NC_018722	TTC	2	6	1119487	1119492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502870
23617	NC_018722	C	6	6	1119690	1119695	0 %	0 %	0 %	100 %	408502871
23618	NC_018722	GTA	2	6	1119714	1119719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502871
23619	NC_018722	CG	4	8	1119845	1119852	0 %	0 %	50 %	50 %	408502871
23620	NC_018722	GA	3	6	1120016	1120021	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23621	NC_018722	CCG	2	6	1120041	1120046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23622	NC_018722	GCA	2	6	1120053	1120058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23623	NC_018722	AGA	2	6	1120122	1120127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23624	NC_018722	CCG	2	6	1120135	1120140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23625	NC_018722	CAG	2	6	1120148	1120153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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23627	NC_018722	CAC	2	6	1120175	1120180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23628	NC_018722	GAA	2	6	1120296	1120301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23629	NC_018722	CTG	2	6	1120307	1120312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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23732	NC_018722	GC	3	6	1125973	1125978	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23733	NC_018722	C	6	6	1125984	1125989	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
23734	NC_018722	GAG	2	6	1125999	1126004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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23736	NC_018722	GCG	2	6	1126017	1126022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23737	NC_018722	CGGG	2	8	1126070	1126077	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
23738	NC_018722	G	11	11	1126075	1126085	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
23739	NC_018722	TGT	2	6	1126086	1126091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23740	NC_018722	GGGA	2	8	1126108	1126115	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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