MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Mexico A chromosome

Total Repeats: 24024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22002	NC_018722	CA	3	6	1042372	1042377	50 %	0 %	0 %	50 %	408502805
22003	NC_018722	GTCC	2	8	1042379	1042386	0 %	25 %	25 %	50 %	408502805
22004	NC_018722	GT	3	6	1042451	1042456	0 %	50 %	50 %	0 %	408502805
22005	NC_018722	CTG	2	6	1042490	1042495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502805
22006	NC_018722	GAAG	2	8	1042564	1042571	50 %	0 %	50 %	0 %	408502805
22007	NC_018722	TCG	2	6	1042602	1042607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502805
22008	NC_018722	GCA	2	6	1042628	1042633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502805
22009	NC_018722	TGG	2	6	1042656	1042661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502805
22010	NC_018722	GCA	2	6	1042696	1042701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502805
22011	NC_018722	TCA	2	6	1042709	1042714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502805
22012	NC_018722	CGT	2	6	1042855	1042860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502805
22013	NC_018722	TGA	2	6	1042866	1042871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502805
22014	NC_018722	CCG	2	6	1042895	1042900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502805
22015	NC_018722	CG	3	6	1042959	1042964	0 %	0 %	50 %	50 %	408502805
22016	NC_018722	CTT	2	6	1042975	1042980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502805
22017	NC_018722	CTT	3	9	1043000	1043008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502805
22018	NC_018722	CGC	2	6	1043089	1043094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22019	NC_018722	TGC	2	6	1043100	1043105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22020	NC_018722	CAT	2	6	1043355	1043360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502806
22021	NC_018722	GCA	2	6	1043378	1043383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502806
22022	NC_018722	TGC	2	6	1043387	1043392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502806
22023	NC_018722	GGAA	2	8	1043458	1043465	50 %	0 %	50 %	0 %	408502806
22024	NC_018722	CTG	2	6	1043534	1043539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502807
22025	NC_018722	TGT	2	6	1043549	1043554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502807
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22028	NC_018722	C	7	7	1043739	1043745	0 %	0 %	0 %	100 %	408502807
22029	NC_018722	CTG	2	6	1043747	1043752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502807
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22032	NC_018722	A	6	6	1044003	1044008	100 %	0 %	0 %	0 %	408502807
22033	NC_018722	GT	3	6	1044131	1044136	0 %	50 %	50 %	0 %	408502807
22034	NC_018722	ACA	2	6	1044176	1044181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502807
22035	NC_018722	ATT	2	6	1044237	1044242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408502807
22036	NC_018722	CTG	2	6	1044264	1044269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502807
22037	NC_018722	AGC	2	6	1044285	1044290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502807
22038	NC_018722	CCTC	2	8	1044317	1044324	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
22039	NC_018722	TCT	2	6	1044355	1044360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22040	NC_018722	ACT	2	6	1044386	1044391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502808
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22042	NC_018722	CAT	2	6	1044423	1044428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502808
22043	NC_018722	TCT	2	6	1044433	1044438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502808
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22046	NC_018722	CAA	2	6	1044527	1044532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502808
22047	NC_018722	CTGCA	2	10	1044537	1044546	20 %	20 %	20 %	40 %	408502808
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22050	NC_018722	A	9	9	1044670	1044678	100 %	0 %	0 %	0 %	408502808
22051	NC_018722	CTAT	2	8	1044694	1044701	25 %	50 %	0 %	25 %	408502808
22052	NC_018722	TGAT	2	8	1044727	1044734	25 %	50 %	25 %	0 %	408502808
22053	NC_018722	A	7	7	1044876	1044882	100 %	0 %	0 %	0 %	408502808
22054	NC_018722	GTTT	2	8	1044919	1044926	0 %	75 %	25 %	0 %	408502808
22055	NC_018722	TTCA	2	8	1044957	1044964	25 %	50 %	0 %	25 %	408502808
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22062	NC_018722	GC	3	6	1045160	1045165	0 %	0 %	50 %	50 %	408502808
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22086	NC_018722	CCT	2	6	1046564	1046569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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22099	NC_018722	CT	3	6	1047204	1047209	0 %	50 %	0 %	50 %	408502810
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22117	NC_018722	GC	3	6	1047813	1047818	0 %	0 %	50 %	50 %	408502810
22118	NC_018722	A	6	6	1047841	1047846	100 %	0 %	0 %	0 %	408502810
22119	NC_018722	CACC	2	8	1047851	1047858	25 %	0 %	0 %	75 %	408502810
22120	NC_018722	CTA	2	6	1047891	1047896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502811
22121	NC_018722	GA	3	6	1047916	1047921	50 %	0 %	50 %	0 %	408502811
22122	NC_018722	T	6	6	1047979	1047984	0 %	100 %	0 %	0 %	408502811
22123	NC_018722	GC	5	10	1048083	1048092	0 %	0 %	50 %	50 %	408502811
22124	NC_018722	GCT	2	6	1048104	1048109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502811
22125	NC_018722	CCT	2	6	1048115	1048120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502811
22126	NC_018722	GAGC	2	8	1048140	1048147	25 %	0 %	50 %	25 %	408502811
22127	NC_018722	A	6	6	1048268	1048273	100 %	0 %	0 %	0 %	408502811
22128	NC_018722	TGA	2	6	1048372	1048377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502811
22129	NC_018722	TGCA	2	8	1048403	1048410	25 %	25 %	25 %	25 %	408502811
22130	NC_018722	AAAC	2	8	1048446	1048453	75 %	0 %	0 %	25 %	408502811
22131	NC_018722	CCG	2	6	1048455	1048460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502811
22132	NC_018722	CGC	2	6	1048479	1048484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502811
22133	NC_018722	CTTA	2	8	1048522	1048529	25 %	50 %	0 %	25 %	408502811
22134	NC_018722	AAC	2	6	1048543	1048548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502811
22135	NC_018722	ATT	2	6	1048612	1048617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408502812
22136	NC_018722	TCC	2	6	1048747	1048752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502812
22137	NC_018722	CAA	2	6	1048763	1048768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502812
22138	NC_018722	CG	4	8	1048859	1048866	0 %	0 %	50 %	50 %	408502812
22139	NC_018722	CGAT	2	8	1049002	1049009	25 %	25 %	25 %	25 %	408502812
22140	NC_018722	GA	3	6	1049051	1049056	50 %	0 %	50 %	0 %	408502812
22141	NC_018722	CAA	2	6	1049069	1049074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502812
22142	NC_018722	T	6	6	1049114	1049119	0 %	100 %	0 %	0 %	408502812
22143	NC_018722	T	7	7	1049153	1049159	0 %	100 %	0 %	0 %	408502812
22144	NC_018722	TCT	2	6	1049176	1049181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502812
22145	NC_018722	GCT	2	6	1049216	1049221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502812
22146	NC_018722	CTT	2	6	1049256	1049261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502812
22147	NC_018722	CAC	2	6	1049373	1049378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502812
22148	NC_018722	GGC	2	6	1049401	1049406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502812
22149	NC_018722	GAA	2	6	1049438	1049443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502812
22150	NC_018722	AAG	2	6	1049449	1049454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502812
22151	NC_018722	ACC	2	6	1049467	1049472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502812
22152	NC_018722	CTGTG	2	10	1049505	1049514	0 %	40 %	40 %	20 %	408502812
22153	NC_018722	CTTC	2	8	1049524	1049531	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22154	NC_018722	TGA	2	6	1049618	1049623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502813
22155	NC_018722	GC	3	6	1049663	1049668	0 %	0 %	50 %	50 %	408502813
22156	NC_018722	CTC	2	6	1049675	1049680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502813
22157	NC_018722	GCC	2	6	1049740	1049745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502813
22158	NC_018722	CGG	2	6	1049768	1049773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502813
22159	NC_018722	CTG	2	6	1049937	1049942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502813
22160	NC_018722	CCG	2	6	1049974	1049979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502813
22161	NC_018722	TC	3	6	1050009	1050014	0 %	50 %	0 %	50 %	408502813
22162	NC_018722	ACCCC	2	10	1050032	1050041	20 %	0 %	0 %	80 %	408502813
22163	NC_018722	AGA	2	6	1050159	1050164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502813
22164	NC_018722	GC	3	6	1050279	1050284	0 %	0 %	50 %	50 %	408502813
22165	NC_018722	ACG	2	6	1050285	1050290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502813
22166	NC_018722	CT	4	8	1050296	1050303	0 %	50 %	0 %	50 %	408502813
22167	NC_018722	GCGT	2	8	1050306	1050313	0 %	25 %	50 %	25 %	408502813
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22172	NC_018722	CGC	2	6	1050532	1050537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502813
22173	NC_018722	TGC	2	6	1050550	1050555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502813
22174	NC_018722	CGC	2	6	1050556	1050561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502813
22175	NC_018722	TTGATC	2	12	1050616	1050627	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	408502813
22176	NC_018722	A	8	8	1050666	1050673	100 %	0 %	0 %	0 %	408502813
22177	NC_018722	TGC	2	6	1050856	1050861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502813
22178	NC_018722	GCA	2	6	1050872	1050877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502813
22179	NC_018722	GCT	2	6	1050878	1050883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502813
22180	NC_018722	GCT	2	6	1050974	1050979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502813
22181	NC_018722	AGG	2	6	1051005	1051010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502813
22182	NC_018722	GT	3	6	1051027	1051032	0 %	50 %	50 %	0 %	408502813
22183	NC_018722	GAG	2	6	1051037	1051042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502813
22184	NC_018722	CTG	2	6	1051085	1051090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502813
22185	NC_018722	GGC	2	6	1051098	1051103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502813
22186	NC_018722	CA	3	6	1051112	1051117	50 %	0 %	0 %	50 %	408502813
22187	NC_018722	CAC	2	6	1051125	1051130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502813
22188	NC_018722	ACG	2	6	1051133	1051138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502813
22189	NC_018722	GC	4	8	1051149	1051156	0 %	0 %	50 %	50 %	408502813
22190	NC_018722	TGCG	2	8	1051166	1051173	0 %	25 %	50 %	25 %	408502813
22191	NC_018722	C	6	6	1051183	1051188	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
22192	NC_018722	GCA	2	6	1051197	1051202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22193	NC_018722	CATGTT	2	12	1051220	1051231	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	408502814
22194	NC_018722	AGA	2	6	1051240	1051245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502814
22195	NC_018722	CG	4	8	1051257	1051264	0 %	0 %	50 %	50 %	408502814
22196	NC_018722	TTCGCC	2	12	1051292	1051303	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	408502814
22197	NC_018722	CGTA	2	8	1051319	1051326	25 %	25 %	25 %	25 %	408502814
22198	NC_018722	CG	3	6	1051352	1051357	0 %	0 %	50 %	50 %	408502814
22199	NC_018722	GC	3	6	1051389	1051394	0 %	0 %	50 %	50 %	408502814
22200	NC_018722	CTG	2	6	1051492	1051497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502814
22201	NC_018722	T	6	6	1051550	1051555	0 %	100 %	0 %	0 %	408502814
22202	NC_018722	CTG	2	6	1051773	1051778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502814
22203	NC_018722	CG	3	6	1051784	1051789	0 %	0 %	50 %	50 %	408502814
22204	NC_018722	CAGC	2	8	1051860	1051867	25 %	0 %	25 %	50 %	408502814
22205	NC_018722	CAG	2	6	1051917	1051922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502814
22206	NC_018722	GAT	2	6	1051924	1051929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502814
22207	NC_018722	CCCGCT	2	12	1051986	1051997	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	408502814
22208	NC_018722	GCT	2	6	1052003	1052008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502814
22209	NC_018722	CTT	2	6	1052181	1052186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502814
22210	NC_018722	CGA	2	6	1052245	1052250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502814
22211	NC_018722	TGCC	2	8	1052262	1052269	0 %	25 %	25 %	50 %	408502814
22212	NC_018722	CCT	2	6	1052297	1052302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502814
22213	NC_018722	CTC	2	6	1052307	1052312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502814
22214	NC_018722	CTC	2	6	1052316	1052321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502814
22215	NC_018722	CTC	2	6	1052325	1052330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502814
22216	NC_018722	CGG	2	6	1052334	1052339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502814
22217	NC_018722	GGT	2	6	1052374	1052379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502814
22218	NC_018722	AAG	2	6	1052391	1052396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502814
22219	NC_018722	GCT	2	6	1052499	1052504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502814
22220	NC_018722	GCC	3	9	1052549	1052557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502814
22221	NC_018722	CAC	2	6	1052581	1052586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502814
22222	NC_018722	GCC	2	6	1052621	1052626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502814
22223	NC_018722	GCC	2	6	1052636	1052641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502814
22224	NC_018722	AGCGC	2	10	1052675	1052684	20 %	0 %	40 %	40 %	408502814
22225	NC_018722	CCCA	2	8	1052692	1052699	25 %	0 %	0 %	75 %	408502814
22226	NC_018722	ATG	2	6	1052707	1052712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502814
22227	NC_018722	AC	3	6	1052733	1052738	50 %	0 %	0 %	50 %	408502814
22228	NC_018722	GCC	2	6	1052744	1052749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502814
22229	NC_018722	ACC	2	6	1052767	1052772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502814
22230	NC_018722	CGC	2	6	1052862	1052867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502815
22231	NC_018722	CG	3	6	1052902	1052907	0 %	0 %	50 %	50 %	408502815
22232	NC_018722	TCC	2	6	1052916	1052921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502815
22233	NC_018722	CG	3	6	1052930	1052935	0 %	0 %	50 %	50 %	408502815
22234	NC_018722	GC	3	6	1052941	1052946	0 %	0 %	50 %	50 %	408502815
22235	NC_018722	CG	3	6	1052978	1052983	0 %	0 %	50 %	50 %	408502815
22236	NC_018722	TGC	2	6	1053003	1053008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502815
22237	NC_018722	TCTTGC	2	12	1053091	1053102	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	408502815
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22339	NC_018722	AC	3	6	1057223	1057228	50 %	0 %	0 %	50 %	408502818
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22341	NC_018722	CA	3	6	1057264	1057269	50 %	0 %	0 %	50 %	408502818
22342	NC_018722	GCC	2	6	1057274	1057279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502818
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22344	NC_018722	ACCG	2	8	1057390	1057397	25 %	0 %	25 %	50 %	408502818
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22349	NC_018722	ATC	2	6	1057555	1057560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502818
22350	NC_018722	GAACA	2	10	1057578	1057587	60 %	0 %	20 %	20 %	408502818
22351	NC_018722	CGCAG	2	10	1057611	1057620	20 %	0 %	40 %	40 %	408502818
22352	NC_018722	CAA	2	6	1057652	1057657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502818
22353	NC_018722	GCA	2	6	1057694	1057699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502818
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22355	NC_018722	GCCC	2	8	1057743	1057750	0 %	0 %	25 %	75 %	408502818
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22454	NC_018722	C	6	6	1062352	1062357	0 %	0 %	0 %	100 %	408502822
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22463	NC_018722	TGC	2	6	1062985	1062990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502823
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22472	NC_018722	TTA	2	6	1063329	1063334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408502823
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22475	NC_018722	AGAA	2	8	1063553	1063560	75 %	0 %	25 %	0 %	408502824
22476	NC_018722	GTT	3	9	1063591	1063599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502824
22477	NC_018722	TTG	2	6	1063618	1063623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502824
22478	NC_018722	GGGA	2	8	1063863	1063870	25 %	0 %	75 %	0 %	408502824
22479	NC_018722	ATCG	2	8	1063882	1063889	25 %	25 %	25 %	25 %	408502824
22480	NC_018722	TCA	2	6	1063988	1063993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502824
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22483	NC_018722	GC	3	6	1064106	1064111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22484	NC_018722	CG	3	6	1064182	1064187	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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22486	NC_018722	CG	3	6	1064195	1064200	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22487	NC_018722	CG	3	6	1064228	1064233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22488	NC_018722	GTA	2	6	1064330	1064335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502825
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