MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Mexico A chromosome

Total Repeats: 24024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_018722	AC	3	6	1018583	1018588	50 %	0 %	0 %	50 %	408502782
21502	NC_018722	TG	3	6	1018686	1018691	0 %	50 %	50 %	0 %	408502782
21503	NC_018722	AAC	2	6	1018693	1018698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502782
21504	NC_018722	G	6	6	1018754	1018759	0 %	0 %	100 %	0 %	408502782
21505	NC_018722	CG	3	6	1018823	1018828	0 %	0 %	50 %	50 %	408502782
21506	NC_018722	TTCT	2	8	1018839	1018846	0 %	75 %	0 %	25 %	408502782
21507	NC_018722	CTCC	2	8	1018853	1018860	0 %	25 %	0 %	75 %	408502782
21508	NC_018722	GC	3	6	1018912	1018917	0 %	0 %	50 %	50 %	408502782
21509	NC_018722	AC	3	6	1018920	1018925	50 %	0 %	0 %	50 %	408502782
21510	NC_018722	ATA	2	6	1018996	1019001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502782
21511	NC_018722	TCT	2	6	1019018	1019023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502782
21512	NC_018722	CAT	2	6	1019045	1019050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502782
21513	NC_018722	GCA	2	6	1019065	1019070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502782
21514	NC_018722	A	6	6	1019181	1019186	100 %	0 %	0 %	0 %	408502782
21515	NC_018722	CCA	2	6	1019188	1019193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502782
21516	NC_018722	ACA	2	6	1019201	1019206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502782
21517	NC_018722	A	7	7	1019309	1019315	100 %	0 %	0 %	0 %	408502782
21518	NC_018722	TCA	2	6	1019317	1019322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502782
21519	NC_018722	CGCA	2	8	1019328	1019335	25 %	0 %	25 %	50 %	408502782
21520	NC_018722	TCT	2	6	1019369	1019374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502782
21521	NC_018722	T	6	6	1019382	1019387	0 %	100 %	0 %	0 %	408502782
21522	NC_018722	GC	3	6	1019407	1019412	0 %	0 %	50 %	50 %	408502782
21523	NC_018722	CTC	2	6	1019612	1019617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502783
21524	NC_018722	T	6	6	1019636	1019641	0 %	100 %	0 %	0 %	408502783
21525	NC_018722	G	6	6	1019658	1019663	0 %	0 %	100 %	0 %	408502783
21526	NC_018722	CCCT	2	8	1019692	1019699	0 %	25 %	0 %	75 %	408502783
21527	NC_018722	CGAT	2	8	1019756	1019763	25 %	25 %	25 %	25 %	408502783
21528	NC_018722	GT	3	6	1019882	1019887	0 %	50 %	50 %	0 %	408502783
21529	NC_018722	CGT	2	6	1019893	1019898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502783
21530	NC_018722	CATC	2	8	1019938	1019945	25 %	25 %	0 %	50 %	408502783
21531	NC_018722	AACGC	2	10	1020022	1020031	40 %	0 %	20 %	40 %	408502783
21532	NC_018722	TCA	2	6	1020041	1020046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502783
21533	NC_018722	TTA	2	6	1020141	1020146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408502783
21534	NC_018722	GCT	2	6	1020165	1020170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502783
21535	NC_018722	GCC	2	6	1020231	1020236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502783
21536	NC_018722	CA	4	8	1020384	1020391	50 %	0 %	0 %	50 %	408502783
21537	NC_018722	TGC	2	6	1020413	1020418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502783
21538	NC_018722	ATC	2	6	1020422	1020427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502783
21539	NC_018722	GC	4	8	1020449	1020456	0 %	0 %	50 %	50 %	408502783
21540	NC_018722	AC	3	6	1020514	1020519	50 %	0 %	0 %	50 %	408502783
21541	NC_018722	GCA	2	6	1020543	1020548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502783
21542	NC_018722	GCGCGT	2	12	1020554	1020565	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	408502783
21543	NC_018722	A	6	6	1020597	1020602	100 %	0 %	0 %	0 %	408502783
21544	NC_018722	TAA	2	6	1020651	1020656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502783
21545	NC_018722	GC	3	6	1020716	1020721	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21546	NC_018722	AGC	2	6	1020754	1020759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21547	NC_018722	CAAC	2	8	1020824	1020831	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21548	NC_018722	CTAC	2	8	1020851	1020858	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
21549	NC_018722	GCC	2	6	1020906	1020911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502784
21550	NC_018722	CGTG	2	8	1020928	1020935	0 %	25 %	50 %	25 %	408502784
21551	NC_018722	TG	4	8	1020934	1020941	0 %	50 %	50 %	0 %	408502784
21552	NC_018722	TGCG	2	8	1020973	1020980	0 %	25 %	50 %	25 %	408502784
21553	NC_018722	GATT	2	8	1021011	1021018	25 %	50 %	25 %	0 %	408502784
21554	NC_018722	AC	3	6	1021037	1021042	50 %	0 %	0 %	50 %	408502784
21555	NC_018722	TAC	2	6	1021077	1021082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502784
21556	NC_018722	CGT	2	6	1021274	1021279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502784
21557	NC_018722	ACA	2	6	1021296	1021301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502784
21558	NC_018722	AAG	2	6	1021327	1021332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502784
21559	NC_018722	ACC	2	6	1021361	1021366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502784
21560	NC_018722	CAA	2	6	1021408	1021413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502784
21561	NC_018722	CCA	2	6	1021534	1021539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502785
21562	NC_018722	GCAC	2	8	1021597	1021604	25 %	0 %	25 %	50 %	408502785
21563	NC_018722	CATAG	2	10	1021632	1021641	40 %	20 %	20 %	20 %	408502785
21564	NC_018722	GGA	2	6	1021644	1021649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502785
21565	NC_018722	A	6	6	1021649	1021654	100 %	0 %	0 %	0 %	408502785
21566	NC_018722	CG	3	6	1021732	1021737	0 %	0 %	50 %	50 %	408502785
21567	NC_018722	TGC	2	6	1021764	1021769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502785
21568	NC_018722	TCT	2	6	1021831	1021836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502785
21569	NC_018722	CCTG	2	8	1021867	1021874	0 %	25 %	25 %	50 %	408502785
21570	NC_018722	ACC	2	6	1021956	1021961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502785
21571	NC_018722	CCA	2	6	1022072	1022077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502785
21572	NC_018722	CG	4	8	1022080	1022087	0 %	0 %	50 %	50 %	408502785
21573	NC_018722	T	6	6	1022149	1022154	0 %	100 %	0 %	0 %	408502785
21574	NC_018722	CTG	2	6	1022175	1022180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502785
21575	NC_018722	AGGA	2	8	1022183	1022190	50 %	0 %	50 %	0 %	408502785
21576	NC_018722	GA	3	6	1022189	1022194	50 %	0 %	50 %	0 %	408502785
21577	NC_018722	GA	3	6	1022247	1022252	50 %	0 %	50 %	0 %	408502785
21578	NC_018722	AC	3	6	1022259	1022264	50 %	0 %	0 %	50 %	408502785
21579	NC_018722	CG	3	6	1022275	1022280	0 %	0 %	50 %	50 %	408502785
21580	NC_018722	TTCA	2	8	1022320	1022327	25 %	50 %	0 %	25 %	408502785
21581	NC_018722	CTC	2	6	1022352	1022357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21582	NC_018722	GC	3	6	1022376	1022381	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21583	NC_018722	ACGG	2	8	1022394	1022401	25 %	0 %	50 %	25 %	408502786
21584	NC_018722	CTTCT	2	10	1022440	1022449	0 %	60 %	0 %	40 %	408502786
21585	NC_018722	GC	3	6	1022450	1022455	0 %	0 %	50 %	50 %	408502786
21586	NC_018722	AGC	2	6	1022459	1022464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502786
21587	NC_018722	GCTC	2	8	1022471	1022478	0 %	25 %	25 %	50 %	408502786
21588	NC_018722	CTT	2	6	1022511	1022516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502786
21589	NC_018722	T	6	6	1022573	1022578	0 %	100 %	0 %	0 %	408502786
21590	NC_018722	CAT	2	6	1022718	1022723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502786
21591	NC_018722	CT	3	6	1022734	1022739	0 %	50 %	0 %	50 %	408502786
21592	NC_018722	CGC	2	6	1022851	1022856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502786
21593	NC_018722	ACC	2	6	1022902	1022907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502786
21594	NC_018722	ACC	2	6	1022980	1022985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502786
21595	NC_018722	GGT	2	6	1023045	1023050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502786
21596	NC_018722	GA	3	6	1023055	1023060	50 %	0 %	50 %	0 %	408502786
21597	NC_018722	GCT	2	6	1023129	1023134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502786
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21602	NC_018722	CGT	2	6	1023337	1023342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502786
21603	NC_018722	AT	3	6	1023370	1023375	50 %	50 %	0 %	0 %	408502786
21604	NC_018722	GAA	2	6	1023377	1023382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502786
21605	NC_018722	CAA	2	6	1023417	1023422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502786
21606	NC_018722	TCA	2	6	1023429	1023434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502786
21607	NC_018722	GGCA	2	8	1023465	1023472	25 %	0 %	50 %	25 %	408502786
21608	NC_018722	CTT	2	6	1023532	1023537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502786
21609	NC_018722	AAG	2	6	1023563	1023568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502786
21610	NC_018722	T	6	6	1023647	1023652	0 %	100 %	0 %	0 %	408502786
21611	NC_018722	TGC	2	6	1023662	1023667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502786
21612	NC_018722	AC	3	6	1023826	1023831	50 %	0 %	0 %	50 %	408502786
21613	NC_018722	GAC	2	6	1024038	1024043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502786
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21615	NC_018722	AGCG	2	8	1024093	1024100	25 %	0 %	50 %	25 %	408502786
21616	NC_018722	GTG	2	6	1024112	1024117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502786
21617	NC_018722	A	6	6	1024223	1024228	100 %	0 %	0 %	0 %	408502786
21618	NC_018722	CAC	2	6	1024240	1024245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502786
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21620	NC_018722	TCT	2	6	1024500	1024505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502786
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21622	NC_018722	CTT	2	6	1024546	1024551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502786
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21659	NC_018722	A	7	7	1026121	1026127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21852	NC_018722	CA	3	6	1035763	1035768	50 %	0 %	0 %	50 %	408502799
21853	NC_018722	CGC	3	9	1035793	1035801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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21981	NC_018722	CT	3	6	1041467	1041472	0 %	50 %	0 %	50 %	408502805
21982	NC_018722	GCTT	2	8	1041500	1041507	0 %	50 %	25 %	25 %	408502805
21983	NC_018722	T	6	6	1041506	1041511	0 %	100 %	0 %	0 %	408502805
21984	NC_018722	TCG	2	6	1041528	1041533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502805
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