MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Mexico A chromosome

Total Repeats: 24024

< Previous12...37383940414243444546474849Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_018722	GCAGC	2	10	995004	995013	20 %	0 %	40 %	40 %	408502765
21003	NC_018722	GAA	2	6	995069	995074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502765
21004	NC_018722	ATC	2	6	995173	995178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502765
21005	NC_018722	GGA	2	6	995252	995257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502765
21006	NC_018722	AG	3	6	995388	995393	50 %	0 %	50 %	0 %	408502765
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21009	NC_018722	CA	3	6	995589	995594	50 %	0 %	0 %	50 %	408502765
21010	NC_018722	T	7	7	995648	995654	0 %	100 %	0 %	0 %	408502765
21011	NC_018722	AG	3	6	995709	995714	50 %	0 %	50 %	0 %	408502765
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21015	NC_018722	GAAC	2	8	995854	995861	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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21017	NC_018722	CT	3	6	995876	995881	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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21055	NC_018722	CAT	2	6	997268	997273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502766
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21059	NC_018722	GTA	2	6	997341	997346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502766
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21092	NC_018722	AGGCG	2	10	999026	999035	20 %	0 %	60 %	20 %	408502769
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21094	NC_018722	CGAG	2	8	999155	999162	25 %	0 %	50 %	25 %	408502769
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21102	NC_018722	GC	3	6	999562	999567	0 %	0 %	50 %	50 %	408502769
21103	NC_018722	A	6	6	999630	999635	100 %	0 %	0 %	0 %	408502769
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21109	NC_018722	CCT	2	6	999827	999832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502769
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21112	NC_018722	CTTGCA	2	12	999891	999902	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	408502769
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21122	NC_018722	ACG	2	6	1000288	1000293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502769
21123	NC_018722	CTG	2	6	1000297	1000302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502769
21124	NC_018722	CAG	2	6	1000303	1000308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502769
21125	NC_018722	GC	3	6	1000319	1000324	0 %	0 %	50 %	50 %	408502769
21126	NC_018722	T	7	7	1000399	1000405	0 %	100 %	0 %	0 %	408502769
21127	NC_018722	GC	4	8	1000434	1000441	0 %	0 %	50 %	50 %	408502769
21128	NC_018722	GGCT	2	8	1000464	1000471	0 %	25 %	50 %	25 %	408502769
21129	NC_018722	TG	3	6	1000480	1000485	0 %	50 %	50 %	0 %	408502769
21130	NC_018722	CG	4	8	1000539	1000546	0 %	0 %	50 %	50 %	408502769
21131	NC_018722	TA	3	6	1000584	1000589	50 %	50 %	0 %	0 %	408502769
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21143	NC_018722	AGG	2	6	1001244	1001249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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21187	NC_018722	CGC	2	6	1003237	1003242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502771
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21224	NC_018722	AC	3	6	1004634	1004639	50 %	0 %	0 %	50 %	408502772
21225	NC_018722	GCA	2	6	1004648	1004653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502772
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21227	NC_018722	ACA	2	6	1004696	1004701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21228	NC_018722	C	6	6	1004702	1004707	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
21229	NC_018722	CGC	2	6	1004731	1004736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21230	NC_018722	CAG	2	6	1004825	1004830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21231	NC_018722	GC	3	6	1005073	1005078	0 %	0 %	50 %	50 %	408502773
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21233	NC_018722	AAG	2	6	1005128	1005133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502773
21234	NC_018722	GC	3	6	1005154	1005159	0 %	0 %	50 %	50 %	408502773
21235	NC_018722	GGAA	2	8	1005164	1005171	50 %	0 %	50 %	0 %	408502773
21236	NC_018722	CACC	2	8	1005225	1005232	25 %	0 %	0 %	75 %	408502773
21237	NC_018722	AAG	2	6	1005278	1005283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502773
21238	NC_018722	GCA	2	6	1005334	1005339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502773
21239	NC_018722	A	8	8	1005364	1005371	100 %	0 %	0 %	0 %	408502773
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21241	NC_018722	GC	3	6	1005465	1005470	0 %	0 %	50 %	50 %	408502773
21242	NC_018722	TCG	2	6	1005482	1005487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502773
21243	NC_018722	CTG	2	6	1005491	1005496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502773
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21272	NC_018722	GTG	2	6	1006972	1006977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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21274	NC_018722	AGGT	2	8	1007078	1007085	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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21330	NC_018722	CG	3	6	1009894	1009899	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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21360	NC_018722	CGT	2	6	1011216	1011221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502777
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21362	NC_018722	CG	3	6	1011333	1011338	0 %	0 %	50 %	50 %	408502777
21363	NC_018722	GCACG	2	10	1011341	1011350	20 %	0 %	40 %	40 %	408502777
21364	NC_018722	CCA	2	6	1011401	1011406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502777
21365	NC_018722	CGG	2	6	1011506	1011511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502777
21366	NC_018722	GCA	2	6	1011601	1011606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502777
21367	NC_018722	CA	3	6	1011626	1011631	50 %	0 %	0 %	50 %	408502777
21368	NC_018722	GAG	2	6	1011670	1011675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502777
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21371	NC_018722	T	7	7	1011856	1011862	0 %	100 %	0 %	0 %	408502777
21372	NC_018722	GTA	2	6	1011922	1011927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502777
21373	NC_018722	CTA	2	6	1011974	1011979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502777
21374	NC_018722	GCT	2	6	1012035	1012040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502777
21375	NC_018722	GCGT	2	8	1012201	1012208	0 %	25 %	50 %	25 %	408502778
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21378	NC_018722	GC	3	6	1012319	1012324	0 %	0 %	50 %	50 %	408502778
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21380	NC_018722	GC	3	6	1012369	1012374	0 %	0 %	50 %	50 %	408502778
21381	NC_018722	CTT	2	6	1012401	1012406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502778
21382	NC_018722	CCT	2	6	1012416	1012421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502778
21383	NC_018722	GCA	2	6	1012475	1012480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502778
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21388	NC_018722	AT	3	6	1012732	1012737	50 %	50 %	0 %	0 %	408502778
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21391	NC_018722	TTA	2	6	1012950	1012955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408502778
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21394	NC_018722	CGT	2	6	1013129	1013134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502778
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21399	NC_018722	CGCA	2	8	1013506	1013513	25 %	0 %	25 %	50 %	408502778
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21402	NC_018722	CA	4	8	1013577	1013584	50 %	0 %	0 %	50 %	408502778
21403	NC_018722	GC	3	6	1013666	1013671	0 %	0 %	50 %	50 %	408502778
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21407	NC_018722	TTTC	2	8	1013840	1013847	0 %	75 %	0 %	25 %	408502778
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21410	NC_018722	GCA	2	6	1013933	1013938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21411	NC_018722	CGA	2	6	1013980	1013985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502779
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21438	NC_018722	TAA	2	6	1015547	1015552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502780
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21467	NC_018722	ACGCA	2	10	1016996	1017005	40 %	0 %	20 %	40 %	408502780
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21473	NC_018722	AGA	2	6	1017198	1017203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21474	NC_018722	CCG	2	6	1017262	1017267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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21477	NC_018722	T	8	8	1017414	1017421	0 %	100 %	0 %	0 %	408502781
21478	NC_018722	TAC	2	6	1017472	1017477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502781
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21481	NC_018722	T	8	8	1017620	1017627	0 %	100 %	0 %	0 %	408502781
21482	NC_018722	AGT	2	6	1017644	1017649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502781
21483	NC_018722	TCT	2	6	1017676	1017681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502781
21484	NC_018722	CT	3	6	1017684	1017689	0 %	50 %	0 %	50 %	408502781
21485	NC_018722	TCG	2	6	1017705	1017710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502781
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