MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Mexico A chromosome

Total Repeats: 24024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_018722	CTG	2	6	926123	926128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502705
19502	NC_018722	GCG	2	6	926189	926194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502705
19503	NC_018722	CCG	2	6	926350	926355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502705
19504	NC_018722	A	7	7	926379	926385	100 %	0 %	0 %	0 %	408502705
19505	NC_018722	ACA	2	6	926419	926424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502705
19506	NC_018722	T	6	6	926439	926444	0 %	100 %	0 %	0 %	408502705
19507	NC_018722	GAA	2	6	926505	926510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502705
19508	NC_018722	A	6	6	926516	926521	100 %	0 %	0 %	0 %	408502705
19509	NC_018722	TGCC	2	8	926542	926549	0 %	25 %	25 %	50 %	408502705
19510	NC_018722	CAC	2	6	926561	926566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502705
19511	NC_018722	CGC	2	6	926607	926612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502705
19512	NC_018722	GCA	2	6	926628	926633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502705
19513	NC_018722	AGA	2	6	926708	926713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502705
19514	NC_018722	CTA	3	9	926803	926811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502705
19515	NC_018722	CTT	2	6	926813	926818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502705
19516	NC_018722	GCAA	2	8	926853	926860	50 %	0 %	25 %	25 %	408502705
19517	NC_018722	CA	3	6	926929	926934	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19518	NC_018722	TCTT	2	8	926968	926975	0 %	75 %	0 %	25 %	408502706
19519	NC_018722	ATC	2	6	926993	926998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502706
19520	NC_018722	GTC	2	6	927005	927010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502706
19521	NC_018722	GC	3	6	927065	927070	0 %	0 %	50 %	50 %	408502706
19522	NC_018722	T	6	6	927119	927124	0 %	100 %	0 %	0 %	408502706
19523	NC_018722	GGTT	2	8	927145	927152	0 %	50 %	50 %	0 %	408502706
19524	NC_018722	TGC	2	6	927325	927330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502706
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19527	NC_018722	ATCA	2	8	927542	927549	50 %	25 %	0 %	25 %	408502706
19528	NC_018722	GCA	2	6	927570	927575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502706
19529	NC_018722	TGC	2	6	927612	927617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502706
19530	NC_018722	ATTAT	2	10	927633	927642	40 %	60 %	0 %	0 %	408502706
19531	NC_018722	CG	3	6	927724	927729	0 %	0 %	50 %	50 %	408502706
19532	NC_018722	GA	3	6	927751	927756	50 %	0 %	50 %	0 %	408502706
19533	NC_018722	AAG	2	6	927804	927809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502706
19534	NC_018722	ATG	2	6	927882	927887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502706
19535	NC_018722	ATC	2	6	927899	927904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502706
19536	NC_018722	AGT	2	6	927922	927927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502706
19537	NC_018722	GC	3	6	927943	927948	0 %	0 %	50 %	50 %	408502706
19538	NC_018722	ATC	2	6	927977	927982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502706
19539	NC_018722	TTTCC	2	10	928051	928060	0 %	60 %	0 %	40 %	408502706
19540	NC_018722	GCC	2	6	928086	928091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502706
19541	NC_018722	TTC	2	6	928123	928128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502706
19542	NC_018722	GAG	2	6	928130	928135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502706
19543	NC_018722	TTC	2	6	928181	928186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502706
19544	NC_018722	T	7	7	928188	928194	0 %	100 %	0 %	0 %	408502706
19545	NC_018722	ATC	2	6	928206	928211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502706
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19547	NC_018722	GTT	2	6	928511	928516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502706
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19549	NC_018722	ATC	2	6	928577	928582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502706
19550	NC_018722	CCT	2	6	928630	928635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502706
19551	NC_018722	TCTT	2	8	928674	928681	0 %	75 %	0 %	25 %	408502706
19552	NC_018722	CTGT	2	8	928685	928692	0 %	50 %	25 %	25 %	408502706
19553	NC_018722	TCC	2	6	928698	928703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502706
19554	NC_018722	CAA	2	6	928735	928740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502706
19555	NC_018722	TTGCC	2	10	928749	928758	0 %	40 %	20 %	40 %	408502706
19556	NC_018722	CA	3	6	928809	928814	50 %	0 %	0 %	50 %	408502706
19557	NC_018722	CTT	2	6	928825	928830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502706
19558	NC_018722	GTT	2	6	928887	928892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502706
19559	NC_018722	CAAGCT	2	12	928909	928920	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	408502706
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19561	NC_018722	GCC	2	6	928950	928955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502706
19562	NC_018722	A	6	6	928987	928992	100 %	0 %	0 %	0 %	408502706
19563	NC_018722	GT	3	6	929120	929125	0 %	50 %	50 %	0 %	408502706
19564	NC_018722	TCTCT	2	10	929147	929156	0 %	60 %	0 %	40 %	408502706
19565	NC_018722	CGA	2	6	929218	929223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502706
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19567	NC_018722	CCA	2	6	929316	929321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502706
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19569	NC_018722	T	7	7	929462	929468	0 %	100 %	0 %	0 %	408502706
19570	NC_018722	CGAT	2	8	929562	929569	25 %	25 %	25 %	25 %	408502706
19571	NC_018722	CTGA	2	8	929576	929583	25 %	25 %	25 %	25 %	408502706
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19574	NC_018722	A	6	6	929699	929704	100 %	0 %	0 %	0 %	408502706
19575	NC_018722	GCTC	2	8	929716	929723	0 %	25 %	25 %	50 %	408502706
19576	NC_018722	TTA	2	6	929778	929783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408502706
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19579	NC_018722	CGTGC	2	10	929813	929822	0 %	20 %	40 %	40 %	408502706
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19581	NC_018722	GCT	2	6	929857	929862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502706
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19589	NC_018722	CGC	2	6	930247	930252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502706
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19592	NC_018722	AGT	2	6	930512	930517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502706
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19594	NC_018722	CA	4	8	930582	930589	50 %	0 %	0 %	50 %	408502706
19595	NC_018722	TGA	2	6	930625	930630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502706
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19599	NC_018722	TCA	2	6	930801	930806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502706
19600	NC_018722	ACAGGC	2	12	930816	930827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502706
19601	NC_018722	CT	3	6	930883	930888	0 %	50 %	0 %	50 %	408502706
19602	NC_018722	CAG	3	9	931073	931081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502706
19603	NC_018722	GT	3	6	931194	931199	0 %	50 %	50 %	0 %	408502706
19604	NC_018722	GCA	2	6	931212	931217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502706
19605	NC_018722	T	6	6	931230	931235	0 %	100 %	0 %	0 %	408502706
19606	NC_018722	GGT	2	6	931270	931275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502706
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19610	NC_018722	A	7	7	931540	931546	100 %	0 %	0 %	0 %	408502706
19611	NC_018722	T	6	6	931583	931588	0 %	100 %	0 %	0 %	408502707
19612	NC_018722	CTG	2	6	931591	931596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502707
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19617	NC_018722	GC	3	6	931691	931696	0 %	0 %	50 %	50 %	408502707
19618	NC_018722	CTG	2	6	931822	931827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502707
19619	NC_018722	CGC	2	6	931846	931851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502707
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19622	NC_018722	CGA	2	6	931894	931899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502707
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19689	NC_018722	GCG	3	9	934839	934847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502707
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19740	NC_018722	GCA	2	6	936958	936963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502710
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19882	NC_018722	CA	3	6	943657	943662	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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20000	NC_018722	A	7	7	949003	949009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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