MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Mexico A chromosome

Total Repeats: 24024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_018722	TCG	2	6	76454	76459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408501974
1502	NC_018722	AT	3	6	76473	76478	50 %	50 %	0 %	0 %	408501974
1503	NC_018722	TCA	2	6	76508	76513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408501974
1504	NC_018722	AAG	2	6	76516	76521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408501974
1505	NC_018722	CGT	2	6	76538	76543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408501974
1506	NC_018722	C	6	6	76562	76567	0 %	0 %	0 %	100 %	408501974
1507	NC_018722	GC	3	6	76593	76598	0 %	0 %	50 %	50 %	408501974
1508	NC_018722	GAAAA	2	10	76672	76681	80 %	0 %	20 %	0 %	408501974
1509	NC_018722	ACGT	2	8	76689	76696	25 %	25 %	25 %	25 %	408501974
1510	NC_018722	TTA	2	6	76778	76783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408501974
1511	NC_018722	CGA	2	6	76784	76789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408501974
1512	NC_018722	CAT	2	6	76885	76890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408501974
1513	NC_018722	AAT	2	6	76921	76926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408501974
1514	NC_018722	CA	3	6	76944	76949	50 %	0 %	0 %	50 %	408501974
1515	NC_018722	T	6	6	76984	76989	0 %	100 %	0 %	0 %	408501974
1516	NC_018722	AAG	2	6	77005	77010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408501974
1517	NC_018722	T	9	9	77016	77024	0 %	100 %	0 %	0 %	408501974
1518	NC_018722	CTC	2	6	77119	77124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408501974
1519	NC_018722	GCG	2	6	77131	77136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408501974
1520	NC_018722	TCC	2	6	77148	77153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408501974
1521	NC_018722	GCA	2	6	77183	77188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408501974
1522	NC_018722	CTTT	2	8	77255	77262	0 %	75 %	0 %	25 %	408501974
1523	NC_018722	GA	3	6	77266	77271	50 %	0 %	50 %	0 %	408501974
1524	NC_018722	GGC	2	6	77352	77357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408501974
1525	NC_018722	TGC	2	6	77359	77364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408501974
1526	NC_018722	CCA	2	6	77370	77375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408501974
1527	NC_018722	TGC	2	6	77434	77439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408501974
1528	NC_018722	TCC	2	6	77519	77524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408501974
1529	NC_018722	GCG	2	6	77557	77562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408501974
1530	NC_018722	AT	3	6	77585	77590	50 %	50 %	0 %	0 %	408501974
1531	NC_018722	CG	3	6	77637	77642	0 %	0 %	50 %	50 %	408501974
1532	NC_018722	GT	3	6	77708	77713	0 %	50 %	50 %	0 %	408501974
1533	NC_018722	TCA	2	6	77717	77722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408501974
1534	NC_018722	AATAA	2	10	77726	77735	80 %	20 %	0 %	0 %	408501974
1535	NC_018722	TTC	2	6	77782	77787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408501974
1536	NC_018722	T	6	6	77954	77959	0 %	100 %	0 %	0 %	408501974
1537	NC_018722	ACG	2	6	77962	77967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408501974
1538	NC_018722	TCA	2	6	77999	78004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408501974
1539	NC_018722	T	6	6	78024	78029	0 %	100 %	0 %	0 %	408501974
1540	NC_018722	GTA	2	6	78044	78049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408501974
1541	NC_018722	TGC	2	6	78114	78119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408501974
1542	NC_018722	GGC	2	6	78136	78141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408501974
1543	NC_018722	GGC	2	6	78316	78321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408501974
1544	NC_018722	GCG	2	6	78343	78348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408501974
1545	NC_018722	T	6	6	78396	78401	0 %	100 %	0 %	0 %	408501974
1546	NC_018722	GA	3	6	78411	78416	50 %	0 %	50 %	0 %	408501974
1547	NC_018722	TCC	2	6	78458	78463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408501974
1548	NC_018722	GCTT	2	8	78520	78527	0 %	50 %	25 %	25 %	408501974
1549	NC_018722	CTGT	2	8	78539	78546	0 %	50 %	25 %	25 %	408501974
1550	NC_018722	T	6	6	78579	78584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_018722	T	6	6	78600	78605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_018722	AGT	2	6	78631	78636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_018722	A	6	6	78760	78765	100 %	0 %	0 %	0 %	408501975
1554	NC_018722	GAA	2	6	78872	78877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408501975
1555	NC_018722	T	6	6	78887	78892	0 %	100 %	0 %	0 %	408501975
1556	NC_018722	TGA	2	6	78920	78925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408501975
1557	NC_018722	GAA	2	6	78929	78934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408501975
1558	NC_018722	ACG	2	6	78970	78975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408501975
1559	NC_018722	GT	3	6	79043	79048	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_018722	GTC	2	6	79062	79067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_018722	GCT	2	6	79122	79127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408501976
1562	NC_018722	GCT	2	6	79154	79159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408501976
1563	NC_018722	GAA	2	6	79176	79181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408501976
1564	NC_018722	GAG	2	6	79185	79190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408501976
1565	NC_018722	GCGCC	2	10	79361	79370	0 %	0 %	40 %	60 %	408501976
1566	NC_018722	ATG	2	6	79396	79401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408501976
1567	NC_018722	TGA	2	6	79454	79459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408501976
1568	NC_018722	AGG	2	6	79507	79512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408501976
1569	NC_018722	GCT	2	6	79607	79612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408501976
1570	NC_018722	TCG	2	6	79621	79626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408501976
1571	NC_018722	GCA	2	6	79634	79639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408501976
1572	NC_018722	ACA	2	6	79661	79666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408501976
1573	NC_018722	AAC	2	6	79718	79723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408501976
1574	NC_018722	GC	3	6	79740	79745	0 %	0 %	50 %	50 %	408501976
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1589	NC_018722	CG	3	6	80626	80631	0 %	0 %	50 %	50 %	408501976
1590	NC_018722	TTG	2	6	80689	80694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1592	NC_018722	GCGT	2	8	80863	80870	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1593	NC_018722	TGGTG	2	10	80875	80884	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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1598	NC_018722	CGTGT	2	10	81017	81026	0 %	40 %	40 %	20 %	408501977
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1601	NC_018722	GT	3	6	81130	81135	0 %	50 %	50 %	0 %	408501977
1602	NC_018722	CTT	2	6	81149	81154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408501977
1603	NC_018722	GC	3	6	81232	81237	0 %	0 %	50 %	50 %	408501977
1604	NC_018722	GTG	2	6	81275	81280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408501977
1605	NC_018722	CG	3	6	81329	81334	0 %	0 %	50 %	50 %	408501977
1606	NC_018722	T	6	6	81358	81363	0 %	100 %	0 %	0 %	408501977
1607	NC_018722	ATG	2	6	81572	81577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408501977
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1609	NC_018722	CAG	2	6	81652	81657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408501977
1610	NC_018722	TAC	2	6	81674	81679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408501977
1611	NC_018722	CGC	2	6	81681	81686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408501977
1612	NC_018722	GTGC	2	8	81958	81965	0 %	25 %	50 %	25 %	408501977
1613	NC_018722	GGC	2	6	81976	81981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408501977
1614	NC_018722	CA	3	6	81998	82003	50 %	0 %	0 %	50 %	408501977
1615	NC_018722	TGC	2	6	82008	82013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408501977
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1618	NC_018722	G	6	6	82211	82216	0 %	0 %	100 %	0 %	408501977
1619	NC_018722	GTGA	2	8	82264	82271	25 %	25 %	50 %	0 %	408501977
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1622	NC_018722	CGT	2	6	82321	82326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408501977
1623	NC_018722	CGCA	2	8	82331	82338	25 %	0 %	25 %	50 %	408501977
1624	NC_018722	TCT	3	9	82360	82368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_018722	AG	3	6	82376	82381	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_018722	T	7	7	82591	82597	0 %	100 %	0 %	0 %	408501978
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1628	NC_018722	GTG	3	9	82721	82729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408501978
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1662	NC_018722	GCA	2	6	84256	84261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1663	NC_018722	GCG	2	6	84269	84274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408501980
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1743	NC_018722	ATGG	2	8	88076	88083	25 %	25 %	50 %	0 %	408501982
1744	NC_018722	AT	3	6	88145	88150	50 %	50 %	0 %	0 %	408501982
1745	NC_018722	TG	3	6	88226	88231	0 %	50 %	50 %	0 %	408501982
1746	NC_018722	AGGA	2	8	88232	88239	50 %	0 %	50 %	0 %	408501982
1747	NC_018722	TCG	2	6	88245	88250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408501982
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1752	NC_018722	AGT	2	6	88519	88524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408501982
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