MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Mexico A chromosome

Total Repeats: 24024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_018722	CGT	2	6	828462	828467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502618
17502	NC_018722	GC	3	6	828476	828481	0 %	0 %	50 %	50 %	408502618
17503	NC_018722	CGC	2	6	828594	828599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502618
17504	NC_018722	TG	3	6	828653	828658	0 %	50 %	50 %	0 %	408502618
17505	NC_018722	CG	3	6	828666	828671	0 %	0 %	50 %	50 %	408502618
17506	NC_018722	GC	3	6	828732	828737	0 %	0 %	50 %	50 %	408502618
17507	NC_018722	GA	3	6	828832	828837	50 %	0 %	50 %	0 %	408502618
17508	NC_018722	TCC	3	9	828875	828883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502618
17509	NC_018722	A	8	8	828991	828998	100 %	0 %	0 %	0 %	408502618
17510	NC_018722	CG	3	6	829006	829011	0 %	0 %	50 %	50 %	408502618
17511	NC_018722	CAG	3	9	829075	829083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502618
17512	NC_018722	ACT	2	6	829103	829108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502618
17513	NC_018722	CTA	2	6	829170	829175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502618
17514	NC_018722	GCGA	2	8	829181	829188	25 %	0 %	50 %	25 %	408502618
17515	NC_018722	TGA	2	6	829254	829259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502619
17516	NC_018722	T	6	6	829263	829268	0 %	100 %	0 %	0 %	408502619
17517	NC_018722	CAC	2	6	829332	829337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502619
17518	NC_018722	CGG	2	6	829347	829352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502619
17519	NC_018722	TCT	2	6	829363	829368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502619
17520	NC_018722	CTGC	2	8	829390	829397	0 %	25 %	25 %	50 %	408502619
17521	NC_018722	GAA	2	6	829473	829478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502619
17522	NC_018722	CG	4	8	829550	829557	0 %	0 %	50 %	50 %	408502619
17523	NC_018722	A	6	6	829593	829598	100 %	0 %	0 %	0 %	408502619
17524	NC_018722	CCA	2	6	829628	829633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502619
17525	NC_018722	TGT	2	6	829692	829697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502619
17526	NC_018722	GC	3	6	829777	829782	0 %	0 %	50 %	50 %	408502619
17527	NC_018722	TAT	2	6	829854	829859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408502619
17528	NC_018722	GT	4	8	829900	829907	0 %	50 %	50 %	0 %	408502619
17529	NC_018722	GCA	2	6	830020	830025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502619
17530	NC_018722	CGC	2	6	830058	830063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502619
17531	NC_018722	TCG	2	6	830072	830077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502619
17532	NC_018722	CG	4	8	830120	830127	0 %	0 %	50 %	50 %	408502619
17533	NC_018722	GGT	2	6	830196	830201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502619
17534	NC_018722	CGA	2	6	830214	830219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502619
17535	NC_018722	CAT	2	6	830274	830279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502619
17536	NC_018722	CTG	3	9	830394	830402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502620
17537	NC_018722	T	6	6	830413	830418	0 %	100 %	0 %	0 %	408502620
17538	NC_018722	TCG	2	6	830461	830466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502620
17539	NC_018722	T	6	6	830520	830525	0 %	100 %	0 %	0 %	408502620
17540	NC_018722	ACC	2	6	830542	830547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502620
17541	NC_018722	CG	3	6	830570	830575	0 %	0 %	50 %	50 %	408502620
17542	NC_018722	TCA	2	6	830584	830589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502620
17543	NC_018722	CTG	2	6	830595	830600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502620
17544	NC_018722	TG	3	6	830599	830604	0 %	50 %	50 %	0 %	408502620
17545	NC_018722	CG	3	6	830618	830623	0 %	0 %	50 %	50 %	408502620
17546	NC_018722	ATC	2	6	830707	830712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502620
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17549	NC_018722	CTG	2	6	830829	830834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502620
17550	NC_018722	AAT	2	6	830904	830909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502620
17551	NC_018722	AAT	2	6	830982	830987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502620
17552	NC_018722	CTT	2	6	830996	831001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502620
17553	NC_018722	T	7	7	831017	831023	0 %	100 %	0 %	0 %	408502620
17554	NC_018722	CAC	2	6	831120	831125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502620
17555	NC_018722	GC	3	6	831162	831167	0 %	0 %	50 %	50 %	408502620
17556	NC_018722	CT	3	6	831231	831236	0 %	50 %	0 %	50 %	408502620
17557	NC_018722	AGC	2	6	831327	831332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502620
17558	NC_018722	GGT	2	6	831348	831353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502620
17559	NC_018722	CCAT	2	8	831364	831371	25 %	25 %	0 %	50 %	408502620
17560	NC_018722	GGC	2	6	831431	831436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502620
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17562	NC_018722	A	6	6	831570	831575	100 %	0 %	0 %	0 %	408502620
17563	NC_018722	GCAA	2	8	831607	831614	50 %	0 %	25 %	25 %	408502620
17564	NC_018722	GACC	2	8	831635	831642	25 %	0 %	25 %	50 %	408502620
17565	NC_018722	C	6	6	831666	831671	0 %	0 %	0 %	100 %	408502620
17566	NC_018722	ACT	2	6	831709	831714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502620
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17569	NC_018722	CTT	2	6	831779	831784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502620
17570	NC_018722	CCG	2	6	831788	831793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502620
17571	NC_018722	GC	3	6	831798	831803	0 %	0 %	50 %	50 %	408502620
17572	NC_018722	A	6	6	831879	831884	100 %	0 %	0 %	0 %	408502620
17573	NC_018722	AGC	2	6	831892	831897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502620
17574	NC_018722	CG	3	6	831938	831943	0 %	0 %	50 %	50 %	408502620
17575	NC_018722	ACC	2	6	831958	831963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502620
17576	NC_018722	TAGG	2	8	832018	832025	25 %	25 %	50 %	0 %	408502620
17577	NC_018722	AG	3	6	832038	832043	50 %	0 %	50 %	0 %	408502620
17578	NC_018722	GC	3	6	832074	832079	0 %	0 %	50 %	50 %	408502620
17579	NC_018722	ACA	2	6	832111	832116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502620
17580	NC_018722	GAT	2	6	832167	832172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502620
17581	NC_018722	AGCA	2	8	832209	832216	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17582	NC_018722	CGAG	2	8	832238	832245	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17583	NC_018722	GAC	2	6	832285	832290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17584	NC_018722	G	6	6	832310	832315	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
17585	NC_018722	A	6	6	832323	832328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17586	NC_018722	GAA	2	6	832342	832347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17587	NC_018722	GC	3	6	832402	832407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17588	NC_018722	AAG	2	6	832434	832439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17589	NC_018722	TG	3	6	832457	832462	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17590	NC_018722	TGC	2	6	832512	832517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17591	NC_018722	A	7	7	832518	832524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17592	NC_018722	CG	4	8	832529	832536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17593	NC_018722	GC	3	6	832555	832560	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17594	NC_018722	ACCT	2	8	832586	832593	25 %	25 %	0 %	50 %	408502621
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17597	NC_018722	GCAC	2	8	832752	832759	25 %	0 %	25 %	50 %	408502621
17598	NC_018722	CGA	2	6	832814	832819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502621
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17600	NC_018722	CCG	2	6	832887	832892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502621
17601	NC_018722	CTCC	2	8	832893	832900	0 %	25 %	0 %	75 %	408502621
17602	NC_018722	GCCC	2	8	832906	832913	0 %	0 %	25 %	75 %	408502621
17603	NC_018722	TTC	3	9	832928	832936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502621
17604	NC_018722	GCT	2	6	833018	833023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502621
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17606	NC_018722	CT	3	6	833167	833172	0 %	50 %	0 %	50 %	408502621
17607	NC_018722	GCA	2	6	833186	833191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502621
17608	NC_018722	GC	3	6	833195	833200	0 %	0 %	50 %	50 %	408502621
17609	NC_018722	TCAT	2	8	833224	833231	25 %	50 %	0 %	25 %	408502621
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17612	NC_018722	GATT	2	8	833285	833292	25 %	50 %	25 %	0 %	408502621
17613	NC_018722	CTCA	2	8	833390	833397	25 %	25 %	0 %	50 %	408502621
17614	NC_018722	GCG	2	6	833407	833412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502621
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17618	NC_018722	GGCG	2	8	833544	833551	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17619	NC_018722	CTG	2	6	833594	833599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17620	NC_018722	GC	3	6	833641	833646	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17621	NC_018722	GAA	2	6	833658	833663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17622	NC_018722	GC	3	6	833713	833718	0 %	0 %	50 %	50 %	408502622
17623	NC_018722	CCAT	2	8	833782	833789	25 %	25 %	0 %	50 %	408502622
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17625	NC_018722	ACA	2	6	833827	833832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502622
17626	NC_018722	AC	3	6	833897	833902	50 %	0 %	0 %	50 %	408502622
17627	NC_018722	CCAGTC	2	12	834011	834022	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	408502622
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17646	NC_018722	AGT	2	6	835454	835459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502622
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17648	NC_018722	GCG	2	6	835535	835540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502622
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17992	NC_018722	AC	3	6	851974	851979	50 %	0 %	0 %	50 %	408502637
17993	NC_018722	CG	4	8	851995	852002	0 %	0 %	50 %	50 %	408502637
17994	NC_018722	AGG	2	6	852007	852012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502637
17995	NC_018722	A	6	6	852041	852046	100 %	0 %	0 %	0 %	408502637
17996	NC_018722	CAG	2	6	852103	852108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502637
17997	NC_018722	GT	3	6	852158	852163	0 %	50 %	50 %	0 %	408502637
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17999	NC_018722	CG	3	6	852290	852295	0 %	0 %	50 %	50 %	408502637
18000	NC_018722	GCT	2	6	852378	852383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502637

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