MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Mexico A chromosome

Total Repeats: 24024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16502	NC_018722	TTC	2	6	781681	781686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502569
16503	NC_018722	ATA	2	6	781708	781713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502569
16504	NC_018722	CTT	2	6	781766	781771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502569
16505	NC_018722	GAT	3	9	781839	781847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502569
16506	NC_018722	TCT	2	6	781859	781864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502569
16507	NC_018722	AAC	2	6	781899	781904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502569
16508	NC_018722	ACC	2	6	781954	781959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502569
16509	NC_018722	ACA	2	6	782044	782049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502569
16510	NC_018722	TGA	2	6	782062	782067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502569
16511	NC_018722	T	7	7	782089	782095	0 %	100 %	0 %	0 %	408502569
16512	NC_018722	TC	3	6	782143	782148	0 %	50 %	0 %	50 %	408502569
16513	NC_018722	AAG	2	6	782191	782196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502570
16514	NC_018722	AGT	2	6	782219	782224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502570
16515	NC_018722	CTCA	2	8	782299	782306	25 %	25 %	0 %	50 %	408502570
16516	NC_018722	TTG	2	6	782331	782336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502570
16517	NC_018722	TCA	2	6	782339	782344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502570
16518	NC_018722	T	6	6	782459	782464	0 %	100 %	0 %	0 %	408502570
16519	NC_018722	CCA	2	6	782481	782486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502570
16520	NC_018722	CTC	2	6	782516	782521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502570
16521	NC_018722	CTG	2	6	782554	782559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502570
16522	NC_018722	AC	3	6	782603	782608	50 %	0 %	0 %	50 %	408502570
16523	NC_018722	CTA	2	6	782784	782789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502570
16524	NC_018722	AAG	2	6	782971	782976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502570
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16526	NC_018722	TCT	2	6	783036	783041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502570
16527	NC_018722	TGAG	2	8	783062	783069	25 %	25 %	50 %	0 %	408502570
16528	NC_018722	TCT	2	6	783111	783116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502570
16529	NC_018722	CTG	2	6	783145	783150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502570
16530	NC_018722	T	6	6	783195	783200	0 %	100 %	0 %	0 %	408502570
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16532	NC_018722	AC	3	6	783231	783236	50 %	0 %	0 %	50 %	408502570
16533	NC_018722	TGA	2	6	783271	783276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502570
16534	NC_018722	A	9	9	783297	783305	100 %	0 %	0 %	0 %	408502570
16535	NC_018722	A	6	6	783334	783339	100 %	0 %	0 %	0 %	408502570
16536	NC_018722	TAT	2	6	783348	783353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408502570
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16541	NC_018722	TAC	2	6	783533	783538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502571
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16543	NC_018722	A	7	7	783610	783616	100 %	0 %	0 %	0 %	408502571
16544	NC_018722	CGT	2	6	783647	783652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502571
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16547	NC_018722	GAG	2	6	783804	783809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502571
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16552	NC_018722	GAT	2	6	784157	784162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502571
16553	NC_018722	TTC	2	6	784214	784219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502571
16554	NC_018722	CA	3	6	784227	784232	50 %	0 %	0 %	50 %	408502571
16555	NC_018722	CCT	2	6	784276	784281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502571
16556	NC_018722	AAT	2	6	784397	784402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502571
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16560	NC_018722	AC	3	6	784679	784684	50 %	0 %	0 %	50 %	408502571
16561	NC_018722	A	6	6	784691	784696	100 %	0 %	0 %	0 %	408502571
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16580	NC_018722	AAGAT	2	10	785478	785487	60 %	20 %	20 %	0 %	408502571
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16588	NC_018722	CT	3	6	785932	785937	0 %	50 %	0 %	50 %	408502572
16589	NC_018722	CTC	2	6	786004	786009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502572
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16594	NC_018722	ATGTA	2	10	786132	786141	40 %	40 %	20 %	0 %	408502572
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16599	NC_018722	A	6	6	786296	786301	100 %	0 %	0 %	0 %	408502572
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16602	NC_018722	TGGA	2	8	786476	786483	25 %	25 %	50 %	0 %	408502572
16603	NC_018722	GTA	2	6	786488	786493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502572
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16605	NC_018722	GCAA	2	8	786548	786555	50 %	0 %	25 %	25 %	408502572
16606	NC_018722	CTT	2	6	786624	786629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502572
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16612	NC_018722	AAAC	2	8	786854	786861	75 %	0 %	0 %	25 %	408502573
16613	NC_018722	AG	3	6	786891	786896	50 %	0 %	50 %	0 %	408502573
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