MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Mexico A chromosome

Total Repeats: 24024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_018722	TCTTGC	2	12	756617	756628	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	408502547
16002	NC_018722	AAC	2	6	756795	756800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502547
16003	NC_018722	CAT	2	6	756895	756900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16004	NC_018722	G	6	6	757008	757013	0 %	0 %	100 %	0 %	408502548
16005	NC_018722	T	6	6	757064	757069	0 %	100 %	0 %	0 %	408502548
16006	NC_018722	ATC	2	6	757156	757161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502548
16007	NC_018722	TCC	2	6	757297	757302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502548
16008	NC_018722	CTC	2	6	757323	757328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502548
16009	NC_018722	TAA	2	6	757356	757361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502548
16010	NC_018722	ATC	2	6	757393	757398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502548
16011	NC_018722	A	8	8	757437	757444	100 %	0 %	0 %	0 %	408502548
16012	NC_018722	A	6	6	757515	757520	100 %	0 %	0 %	0 %	408502548
16013	NC_018722	CA	3	6	757578	757583	50 %	0 %	0 %	50 %	408502548
16014	NC_018722	TGC	2	6	757622	757627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502548
16015	NC_018722	TCC	2	6	757648	757653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502548
16016	NC_018722	ACTTT	2	10	757671	757680	20 %	60 %	0 %	20 %	408502548
16017	NC_018722	T	6	6	757678	757683	0 %	100 %	0 %	0 %	408502548
16018	NC_018722	GCA	2	6	757694	757699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502548
16019	NC_018722	A	6	6	757739	757744	100 %	0 %	0 %	0 %	408502548
16020	NC_018722	TCG	2	6	757748	757753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502548
16021	NC_018722	AATC	2	8	757827	757834	50 %	25 %	0 %	25 %	408502548
16022	NC_018722	TCA	2	6	757871	757876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502548
16023	NC_018722	GAA	2	6	757877	757882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502548
16024	NC_018722	T	6	6	757894	757899	0 %	100 %	0 %	0 %	408502548
16025	NC_018722	GGA	3	9	758123	758131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502549
16026	NC_018722	ACG	2	6	758133	758138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502549
16027	NC_018722	TACA	2	8	758208	758215	50 %	25 %	0 %	25 %	408502549
16028	NC_018722	AG	3	6	758327	758332	50 %	0 %	50 %	0 %	408502549
16029	NC_018722	CTTC	2	8	758336	758343	0 %	50 %	0 %	50 %	408502549
16030	NC_018722	CAA	2	6	758344	758349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502549
16031	NC_018722	TCT	2	6	758409	758414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502549
16032	NC_018722	CGA	2	6	758445	758450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502549
16033	NC_018722	TACAA	2	10	758453	758462	60 %	20 %	0 %	20 %	408502549
16034	NC_018722	AGT	2	6	758502	758507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502549
16035	NC_018722	CCG	2	6	758547	758552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502549
16036	NC_018722	GTA	2	6	758612	758617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502549
16037	NC_018722	CA	3	6	758628	758633	50 %	0 %	0 %	50 %	408502549
16038	NC_018722	TCA	2	6	758664	758669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502549
16039	NC_018722	AAC	2	6	758713	758718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502549
16040	NC_018722	ATC	2	6	758719	758724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502549
16041	NC_018722	ACCGT	2	10	758836	758845	20 %	20 %	20 %	40 %	408502549
16042	NC_018722	CCT	2	6	758862	758867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502549
16043	NC_018722	CTC	2	6	758868	758873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502549
16044	NC_018722	TTA	2	6	758882	758887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408502549
16045	NC_018722	CCT	2	6	758934	758939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502549
16046	NC_018722	TCT	2	6	758942	758947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502549
16047	NC_018722	AAG	2	6	758974	758979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502549
16048	NC_018722	TGT	2	6	759038	759043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502549
16049	NC_018722	T	7	7	759053	759059	0 %	100 %	0 %	0 %	408502549
16050	NC_018722	A	6	6	759063	759068	100 %	0 %	0 %	0 %	408502549
16051	NC_018722	CAA	2	6	759087	759092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502549
16052	NC_018722	TTC	2	6	759124	759129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502549
16053	NC_018722	AAT	2	6	759197	759202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502549
16054	NC_018722	TCC	2	6	759306	759311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502549
16055	NC_018722	GC	3	6	759359	759364	0 %	0 %	50 %	50 %	408502550
16056	NC_018722	TAAA	2	8	759374	759381	75 %	25 %	0 %	0 %	408502550
16057	NC_018722	ATTTA	2	10	759456	759465	40 %	60 %	0 %	0 %	408502550
16058	NC_018722	TC	5	10	759576	759585	0 %	50 %	0 %	50 %	408502550
16059	NC_018722	T	10	10	759605	759614	0 %	100 %	0 %	0 %	408502550
16060	NC_018722	A	6	6	759641	759646	100 %	0 %	0 %	0 %	408502550
16061	NC_018722	AC	3	6	759695	759700	50 %	0 %	0 %	50 %	408502550
16062	NC_018722	AT	3	6	759785	759790	50 %	50 %	0 %	0 %	408502550
16063	NC_018722	TAC	2	6	759798	759803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502550
16064	NC_018722	TC	3	6	759804	759809	0 %	50 %	0 %	50 %	408502550
16065	NC_018722	CGG	3	9	759842	759850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502550
16066	NC_018722	A	6	6	759979	759984	100 %	0 %	0 %	0 %	408502551
16067	NC_018722	GCC	2	6	760019	760024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502551
16068	NC_018722	CA	4	8	760044	760051	50 %	0 %	0 %	50 %	408502551
16069	NC_018722	GCT	2	6	760068	760073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502551
16070	NC_018722	TAA	2	6	760074	760079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502551
16071	NC_018722	AC	3	6	760091	760096	50 %	0 %	0 %	50 %	408502551
16072	NC_018722	CTT	2	6	760152	760157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502551
16073	NC_018722	CTG	2	6	760251	760256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502551
16074	NC_018722	TGC	2	6	760271	760276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502551
16075	NC_018722	T	6	6	760280	760285	0 %	100 %	0 %	0 %	408502551
16076	NC_018722	CAC	2	6	760295	760300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502551
16077	NC_018722	CCA	2	6	760371	760376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502551
16078	NC_018722	ATCTAG	2	12	760408	760419	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	408502551
16079	NC_018722	GAG	2	6	760429	760434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502551
16080	NC_018722	AGA	2	6	760454	760459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502551
16081	NC_018722	TGA	2	6	760587	760592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502551
16082	NC_018722	CAG	2	6	760597	760602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502551
16083	NC_018722	CATC	2	8	760662	760669	25 %	25 %	0 %	50 %	408502551
16084	NC_018722	GGC	2	6	760690	760695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16085	NC_018722	CCT	2	6	760758	760763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502552
16086	NC_018722	ACT	2	6	760771	760776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502552
16087	NC_018722	CGC	2	6	760805	760810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502552
16088	NC_018722	CTC	2	6	760828	760833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502552
16089	NC_018722	AG	5	10	760847	760856	50 %	0 %	50 %	0 %	408502552
16090	NC_018722	CTG	2	6	760951	760956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502552
16091	NC_018722	TCT	2	6	760997	761002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502552
16092	NC_018722	T	8	8	761023	761030	0 %	100 %	0 %	0 %	408502552
16093	NC_018722	G	6	6	761122	761127	0 %	0 %	100 %	0 %	408502552
16094	NC_018722	CCTTA	2	10	761155	761164	20 %	40 %	0 %	40 %	408502552
16095	NC_018722	TCA	2	6	761180	761185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502552
16096	NC_018722	GGA	2	6	761227	761232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502552
16097	NC_018722	GCC	2	6	761251	761256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502552
16098	NC_018722	GTA	2	6	761258	761263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502552
16099	NC_018722	TAA	2	6	761310	761315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502552
16100	NC_018722	TGA	2	6	761340	761345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502552
16101	NC_018722	CG	3	6	761381	761386	0 %	0 %	50 %	50 %	408502552
16102	NC_018722	CCA	2	6	761457	761462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502552
16103	NC_018722	ATA	2	6	761465	761470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502552
16104	NC_018722	GTT	2	6	761666	761671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502552
16105	NC_018722	GAC	2	6	761678	761683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502552
16106	NC_018722	AAT	2	6	761701	761706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502552
16107	NC_018722	CG	3	6	761712	761717	0 %	0 %	50 %	50 %	408502552
16108	NC_018722	CCG	2	6	761723	761728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502552
16109	NC_018722	GC	3	6	761848	761853	0 %	0 %	50 %	50 %	408502552
16110	NC_018722	TTC	2	6	761875	761880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502552
16111	NC_018722	AGA	2	6	761884	761889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502552
16112	NC_018722	ACC	2	6	761973	761978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16113	NC_018722	CA	3	6	761981	761986	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16114	NC_018722	GCT	2	6	762039	762044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16115	NC_018722	CGG	2	6	762071	762076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16116	NC_018722	ACA	2	6	762092	762097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16117	NC_018722	TTC	2	6	762108	762113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16118	NC_018722	CA	3	6	762328	762333	50 %	0 %	0 %	50 %	408502553
16119	NC_018722	CA	3	6	762351	762356	50 %	0 %	0 %	50 %	408502553
16120	NC_018722	C	6	6	762429	762434	0 %	0 %	0 %	100 %	408502553
16121	NC_018722	CG	6	12	762445	762456	0 %	0 %	50 %	50 %	408502553
16122	NC_018722	TACC	2	8	762479	762486	25 %	25 %	0 %	50 %	408502553
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16124	NC_018722	CCTG	2	8	762623	762630	0 %	25 %	25 %	50 %	408502553
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16131	NC_018722	GCA	2	6	763067	763072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502553
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16246	NC_018722	A	6	6	768378	768383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16247	NC_018722	CTGC	2	8	768395	768402	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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16497	NC_018722	CTT	2	6	781507	781512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502569
16498	NC_018722	ATC	2	6	781543	781548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502569
16499	NC_018722	CAA	2	6	781640	781645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502569
16500	NC_018722	CAT	2	6	781649	781654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502569

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