MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Mexico A chromosome

Total Repeats: 24024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15502	NC_018722	TAGA	2	8	732566	732573	50 %	25 %	25 %	0 %	408502528
15503	NC_018722	GCAC	2	8	732586	732593	25 %	0 %	25 %	50 %	408502529
15504	NC_018722	TGC	2	6	732633	732638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502529
15505	NC_018722	ACGT	2	8	732684	732691	25 %	25 %	25 %	25 %	408502529
15506	NC_018722	CATG	2	8	732703	732710	25 %	25 %	25 %	25 %	408502529
15507	NC_018722	GAA	2	6	732712	732717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502529
15508	NC_018722	CCT	2	6	732732	732737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502529
15509	NC_018722	TC	3	6	732850	732855	0 %	50 %	0 %	50 %	408502529
15510	NC_018722	CCAG	2	8	732882	732889	25 %	0 %	25 %	50 %	408502529
15511	NC_018722	CCA	2	6	732982	732987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502529
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15513	NC_018722	GC	3	6	733015	733020	0 %	0 %	50 %	50 %	408502529
15514	NC_018722	CTC	2	6	733025	733030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502529
15515	NC_018722	CACAG	2	10	733032	733041	40 %	0 %	20 %	40 %	408502529
15516	NC_018722	TATT	2	8	733155	733162	25 %	75 %	0 %	0 %	408502529
15517	NC_018722	TCA	2	6	733230	733235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502529
15518	NC_018722	ATA	2	6	733253	733258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502529
15519	NC_018722	TC	3	6	733286	733291	0 %	50 %	0 %	50 %	408502529
15520	NC_018722	TTC	2	6	733304	733309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502529
15521	NC_018722	GCTT	2	8	733364	733371	0 %	50 %	25 %	25 %	408502529
15522	NC_018722	T	6	6	733392	733397	0 %	100 %	0 %	0 %	408502529
15523	NC_018722	TCG	2	6	733419	733424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502529
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15529	NC_018722	AATT	2	8	733750	733757	50 %	50 %	0 %	0 %	408502529
15530	NC_018722	CGG	2	6	733786	733791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502529
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15534	NC_018722	TATTT	2	10	734124	734133	20 %	80 %	0 %	0 %	408502529
15535	NC_018722	AT	3	6	734157	734162	50 %	50 %	0 %	0 %	408502529
15536	NC_018722	AATG	2	8	734168	734175	50 %	25 %	25 %	0 %	408502529
15537	NC_018722	TCC	2	6	734217	734222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502529
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15540	NC_018722	CGT	2	6	734379	734384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502529
15541	NC_018722	CTG	2	6	734560	734565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502529
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15552	NC_018722	TAA	2	6	735049	735054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502529
15553	NC_018722	CAA	2	6	735079	735084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502529
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15555	NC_018722	TTC	2	6	735134	735139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502529
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15596	NC_018722	CAA	2	6	736927	736932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502530
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15603	NC_018722	AC	3	6	737213	737218	50 %	0 %	0 %	50 %	408502530
15604	NC_018722	ACG	2	6	737309	737314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502530
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15606	NC_018722	GC	3	6	737357	737362	0 %	0 %	50 %	50 %	408502530
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15611	NC_018722	TCCC	2	8	737628	737635	0 %	25 %	0 %	75 %	408502531
15612	NC_018722	TA	3	6	737700	737705	50 %	50 %	0 %	0 %	408502531
15613	NC_018722	AGAA	2	8	737746	737753	75 %	0 %	25 %	0 %	408502531
15614	NC_018722	A	7	7	737770	737776	100 %	0 %	0 %	0 %	408502531
15615	NC_018722	A	6	6	737819	737824	100 %	0 %	0 %	0 %	408502531
15616	NC_018722	AC	3	6	737826	737831	50 %	0 %	0 %	50 %	408502531
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15623	NC_018722	AGC	2	6	738295	738300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502531
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15871	NC_018722	TGA	2	6	749633	749638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502543
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15880	NC_018722	GGCAC	2	10	750010	750019	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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15883	NC_018722	CG	3	6	750137	750142	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15884	NC_018722	GC	3	6	750174	750179	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15885	NC_018722	CG	3	6	750189	750194	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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15994	NC_018722	CAT	2	6	756239	756244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502547
15995	NC_018722	GAT	2	6	756296	756301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502547
15996	NC_018722	TGC	2	6	756360	756365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502547
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15999	NC_018722	ACT	2	6	756468	756473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502547
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