MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Mexico A chromosome

Total Repeats: 24024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_018722	GCC	2	6	659773	659778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502470
14002	NC_018722	GCGCT	2	10	659812	659821	0 %	20 %	40 %	40 %	408502470
14003	NC_018722	TGC	2	6	659837	659842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502470
14004	NC_018722	CTT	2	6	659848	659853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502470
14005	NC_018722	CAAA	2	8	659862	659869	75 %	0 %	0 %	25 %	408502470
14006	NC_018722	ATG	2	6	659948	659953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502470
14007	NC_018722	CCTGA	2	10	660007	660016	20 %	20 %	20 %	40 %	408502470
14008	NC_018722	CAC	2	6	660058	660063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502470
14009	NC_018722	TCC	2	6	660075	660080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14010	NC_018722	AG	3	6	660083	660088	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14011	NC_018722	TC	3	6	660107	660112	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14012	NC_018722	CAC	2	6	660116	660121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14013	NC_018722	CA	3	6	660172	660177	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14014	NC_018722	GCA	2	6	660248	660253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14015	NC_018722	CCGC	2	8	660413	660420	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14016	NC_018722	CAG	2	6	660428	660433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14017	NC_018722	GCC	2	6	660441	660446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502471
14018	NC_018722	CAC	2	6	660462	660467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502471
14019	NC_018722	GC	3	6	660473	660478	0 %	0 %	50 %	50 %	408502471
14020	NC_018722	GC	3	6	660481	660486	0 %	0 %	50 %	50 %	408502471
14021	NC_018722	CCA	2	6	660533	660538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502471
14022	NC_018722	GC	3	6	660541	660546	0 %	0 %	50 %	50 %	408502471
14023	NC_018722	GA	3	6	660600	660605	50 %	0 %	50 %	0 %	408502471
14024	NC_018722	CCG	2	6	660704	660709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502471
14025	NC_018722	CAC	2	6	660714	660719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502471
14026	NC_018722	CA	3	6	660737	660742	50 %	0 %	0 %	50 %	408502471
14027	NC_018722	CAG	2	6	660869	660874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502471
14028	NC_018722	CCT	2	6	660893	660898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502471
14029	NC_018722	TCA	2	6	660904	660909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502471
14030	NC_018722	CCT	2	6	660932	660937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502471
14031	NC_018722	CAC	2	6	660999	661004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502471
14032	NC_018722	TCA	2	6	661040	661045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502471
14033	NC_018722	CTG	2	6	661095	661100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502471
14034	NC_018722	CAAAAG	2	12	661118	661129	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	408502471
14035	NC_018722	AAG	3	9	661144	661152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502471
14036	NC_018722	GCT	2	6	661154	661159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502471
14037	NC_018722	TCC	2	6	661172	661177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502471
14038	NC_018722	GCACG	2	10	661221	661230	20 %	0 %	40 %	40 %	408502471
14039	NC_018722	CG	3	6	661229	661234	0 %	0 %	50 %	50 %	408502471
14040	NC_018722	CAC	2	6	661258	661263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502471
14041	NC_018722	AC	3	6	661301	661306	50 %	0 %	0 %	50 %	408502471
14042	NC_018722	CG	3	6	661373	661378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14043	NC_018722	AGA	2	6	661453	661458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14044	NC_018722	CTC	2	6	661473	661478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14045	NC_018722	AG	3	6	661483	661488	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14046	NC_018722	ACG	2	6	661508	661513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14047	NC_018722	GCG	2	6	661547	661552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14048	NC_018722	GCT	2	6	661595	661600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14049	NC_018722	GTGC	2	8	661643	661650	0 %	25 %	50 %	25 %	408502472
14050	NC_018722	C	6	6	661685	661690	0 %	0 %	0 %	100 %	408502472
14051	NC_018722	TCC	2	6	661878	661883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502472
14052	NC_018722	CGCT	2	8	661893	661900	0 %	25 %	25 %	50 %	408502472
14053	NC_018722	TAC	2	6	661918	661923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502472
14054	NC_018722	TCCCC	2	10	661956	661965	0 %	20 %	0 %	80 %	408502472
14055	NC_018722	GC	3	6	661990	661995	0 %	0 %	50 %	50 %	408502472
14056	NC_018722	CTG	2	6	662025	662030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502472
14057	NC_018722	AGA	2	6	662046	662051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502472
14058	NC_018722	TGCG	2	8	662073	662080	0 %	25 %	50 %	25 %	408502472
14059	NC_018722	GC	5	10	662092	662101	0 %	0 %	50 %	50 %	408502472
14060	NC_018722	CA	3	6	662192	662197	50 %	0 %	0 %	50 %	408502472
14061	NC_018722	ACT	2	6	662249	662254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502472
14062	NC_018722	GC	3	6	662273	662278	0 %	0 %	50 %	50 %	408502472
14063	NC_018722	GGCA	2	8	662299	662306	25 %	0 %	50 %	25 %	408502472
14064	NC_018722	GAC	2	6	662330	662335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502472
14065	NC_018722	T	6	6	662336	662341	0 %	100 %	0 %	0 %	408502472
14066	NC_018722	GC	3	6	662351	662356	0 %	0 %	50 %	50 %	408502472
14067	NC_018722	GCC	2	6	662457	662462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502472
14068	NC_018722	TGG	2	6	662481	662486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502472
14069	NC_018722	ACTG	2	8	662513	662520	25 %	25 %	25 %	25 %	408502472
14070	NC_018722	GCA	2	6	662561	662566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502472
14071	NC_018722	GC	3	6	662577	662582	0 %	0 %	50 %	50 %	408502472
14072	NC_018722	CCTT	2	8	662592	662599	0 %	50 %	0 %	50 %	408502472
14073	NC_018722	GC	3	6	662605	662610	0 %	0 %	50 %	50 %	408502472
14074	NC_018722	GCA	2	6	662614	662619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502472
14075	NC_018722	GC	3	6	662628	662633	0 %	0 %	50 %	50 %	408502472
14076	NC_018722	AC	3	6	662640	662645	50 %	0 %	0 %	50 %	408502472
14077	NC_018722	CG	3	6	662653	662658	0 %	0 %	50 %	50 %	408502472
14078	NC_018722	GC	3	6	662666	662671	0 %	0 %	50 %	50 %	408502472
14079	NC_018722	CG	3	6	662726	662731	0 %	0 %	50 %	50 %	408502472
14080	NC_018722	ACT	2	6	662767	662772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502472
14081	NC_018722	T	6	6	662842	662847	0 %	100 %	0 %	0 %	408502472
14082	NC_018722	AGA	2	6	662851	662856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502472
14083	NC_018722	TGC	2	6	663135	663140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502472
14084	NC_018722	CGC	2	6	663192	663197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502472
14085	NC_018722	CGG	2	6	663287	663292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502473
14086	NC_018722	ACGC	2	8	663295	663302	25 %	0 %	25 %	50 %	408502473
14087	NC_018722	CGG	2	6	663315	663320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502473
14088	NC_018722	CTC	2	6	663328	663333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502473
14089	NC_018722	CAG	2	6	663357	663362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502473
14090	NC_018722	GTCAG	2	10	663371	663380	20 %	20 %	40 %	20 %	408502473
14091	NC_018722	CTC	2	6	663395	663400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502473
14092	NC_018722	GTC	2	6	663406	663411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502473
14093	NC_018722	GCA	2	6	663413	663418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502473
14094	NC_018722	TG	3	6	663423	663428	0 %	50 %	50 %	0 %	408502473
14095	NC_018722	CGC	2	6	663459	663464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502473
14096	NC_018722	CCG	2	6	663527	663532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502473
14097	NC_018722	GCC	2	6	663541	663546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502473
14098	NC_018722	CGA	2	6	663565	663570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502473
14099	NC_018722	AGA	2	6	663625	663630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502473
14100	NC_018722	GC	3	6	663647	663652	0 %	0 %	50 %	50 %	408502473
14101	NC_018722	CA	3	6	663685	663690	50 %	0 %	0 %	50 %	408502473
14102	NC_018722	TG	3	6	663693	663698	0 %	50 %	50 %	0 %	408502473
14103	NC_018722	GTT	2	6	663709	663714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502473
14104	NC_018722	GC	3	6	663736	663741	0 %	0 %	50 %	50 %	408502473
14105	NC_018722	AGA	2	6	663844	663849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502473
14106	NC_018722	AGG	2	6	663972	663977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502473
14107	NC_018722	CGG	2	6	664006	664011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502473
14108	NC_018722	CTTT	2	8	664069	664076	0 %	75 %	0 %	25 %	408502473
14109	NC_018722	CTGCTC	2	12	664113	664124	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	408502473
14110	NC_018722	GCG	2	6	664136	664141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502473
14111	NC_018722	GACGC	2	10	664178	664187	20 %	0 %	40 %	40 %	408502473
14112	NC_018722	CAGC	2	8	664233	664240	25 %	0 %	25 %	50 %	408502473
14113	NC_018722	GC	4	8	664323	664330	0 %	0 %	50 %	50 %	408502473
14114	NC_018722	CTC	2	6	664341	664346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502473
14115	NC_018722	GGT	2	6	664360	664365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502473
14116	NC_018722	A	6	6	664443	664448	100 %	0 %	0 %	0 %	408502473
14117	NC_018722	AGTT	2	8	664618	664625	25 %	50 %	25 %	0 %	408502473
14118	NC_018722	CTTG	2	8	664633	664640	0 %	50 %	25 %	25 %	408502473
14119	NC_018722	CAA	2	6	664664	664669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502473
14120	NC_018722	GCG	2	6	664728	664733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502473
14121	NC_018722	CA	4	8	664795	664802	50 %	0 %	0 %	50 %	408502473
14122	NC_018722	CGG	3	9	664807	664815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502473
14123	NC_018722	AC	3	6	664853	664858	50 %	0 %	0 %	50 %	408502473
14124	NC_018722	TAC	2	6	664943	664948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502473
14125	NC_018722	TC	3	6	664950	664955	0 %	50 %	0 %	50 %	408502473
14126	NC_018722	GT	3	6	664962	664967	0 %	50 %	50 %	0 %	408502473
14127	NC_018722	GC	3	6	665018	665023	0 %	0 %	50 %	50 %	408502473
14128	NC_018722	CAC	2	6	665080	665085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502473
14129	NC_018722	CT	3	6	665162	665167	0 %	50 %	0 %	50 %	408502473
14130	NC_018722	TTA	2	6	665235	665240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408502473
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14132	NC_018722	CTC	2	6	665456	665461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502474
14133	NC_018722	ATTT	2	8	665633	665640	25 %	75 %	0 %	0 %	408502474
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14136	NC_018722	CGG	2	6	665684	665689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502474
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14140	NC_018722	TGCG	2	8	665814	665821	0 %	25 %	50 %	25 %	408502474
14141	NC_018722	CG	3	6	665859	665864	0 %	0 %	50 %	50 %	408502474
14142	NC_018722	GA	3	6	665889	665894	50 %	0 %	50 %	0 %	408502474
14143	NC_018722	A	8	8	665894	665901	100 %	0 %	0 %	0 %	408502474
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14165	NC_018722	CG	3	6	667107	667112	0 %	0 %	50 %	50 %	408502475
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14231	NC_018722	AG	3	6	670322	670327	50 %	0 %	50 %	0 %	408502478
14232	NC_018722	ATCGC	2	10	670334	670343	20 %	20 %	20 %	40 %	408502478
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14239	NC_018722	ACG	3	9	670662	670670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502479
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14241	NC_018722	TGC	2	6	670747	670752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502479
14242	NC_018722	CT	4	8	670837	670844	0 %	50 %	0 %	50 %	408502479
14243	NC_018722	ACA	2	6	670897	670902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502479
14244	NC_018722	T	6	6	670909	670914	0 %	100 %	0 %	0 %	408502479
14245	NC_018722	TCA	2	6	670993	670998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502479
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14484	NC_018722	CGGTGT	2	12	681854	681865	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	408502487
14485	NC_018722	ACG	2	6	681901	681906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502487
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14488	NC_018722	GCGCA	2	10	682074	682083	20 %	0 %	40 %	40 %	408502487
14489	NC_018722	TAC	2	6	682127	682132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502487
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14491	NC_018722	TCG	2	6	682196	682201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502487
14492	NC_018722	AGGA	2	8	682330	682337	50 %	0 %	50 %	0 %	408502488
14493	NC_018722	CG	3	6	682355	682360	0 %	0 %	50 %	50 %	408502488
14494	NC_018722	CAC	2	6	682404	682409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502488
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14500	NC_018722	A	6	6	682637	682642	100 %	0 %	0 %	0 %	408502488

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