MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Mexico A chromosome

Total Repeats: 24024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8502	NC_018722	AAT	2	6	406835	406840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502258
8503	NC_018722	GC	3	6	406863	406868	0 %	0 %	50 %	50 %	408502258
8504	NC_018722	ACC	2	6	406881	406886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502258
8505	NC_018722	GTACTG	2	12	406946	406957	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	408502258
8506	NC_018722	CGCAC	2	10	406990	406999	20 %	0 %	20 %	60 %	408502258
8507	NC_018722	TCT	2	6	407091	407096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502258
8508	NC_018722	CGT	2	6	407124	407129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502258
8509	NC_018722	ACC	2	6	407130	407135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502258
8510	NC_018722	AAT	2	6	407192	407197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502258
8511	NC_018722	GATG	2	8	407330	407337	25 %	25 %	50 %	0 %	408502258
8512	NC_018722	T	6	6	407353	407358	0 %	100 %	0 %	0 %	408502258
8513	NC_018722	CA	3	6	407359	407364	50 %	0 %	0 %	50 %	408502258
8514	NC_018722	TG	3	6	407505	407510	0 %	50 %	50 %	0 %	408502258
8515	NC_018722	CGA	2	6	407518	407523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502258
8516	NC_018722	GCT	2	6	407532	407537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502258
8517	NC_018722	ACA	2	6	407585	407590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502258
8518	NC_018722	AGG	3	9	407606	407614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502258
8519	NC_018722	GA	3	6	407626	407631	50 %	0 %	50 %	0 %	408502258
8520	NC_018722	TCA	2	6	407676	407681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502258
8521	NC_018722	GC	3	6	407810	407815	0 %	0 %	50 %	50 %	408502258
8522	NC_018722	GGC	2	6	407891	407896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502258
8523	NC_018722	TG	3	6	407911	407916	0 %	50 %	50 %	0 %	408502258
8524	NC_018722	CGT	2	6	407951	407956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502258
8525	NC_018722	ATC	2	6	408063	408068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502258
8526	NC_018722	GAGT	2	8	408112	408119	25 %	25 %	50 %	0 %	408502258
8527	NC_018722	TGC	2	6	408182	408187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502258
8528	NC_018722	GAT	2	6	408236	408241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502258
8529	NC_018722	GC	3	6	408318	408323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8530	NC_018722	CCA	2	6	408331	408336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8531	NC_018722	AGC	2	6	408400	408405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502259
8532	NC_018722	TTC	2	6	408425	408430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502259
8533	NC_018722	TTGGC	2	10	408435	408444	0 %	40 %	40 %	20 %	408502259
8534	NC_018722	GTAG	2	8	408452	408459	25 %	25 %	50 %	0 %	408502259
8535	NC_018722	CAG	2	6	408495	408500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502259
8536	NC_018722	A	7	7	408510	408516	100 %	0 %	0 %	0 %	408502259
8537	NC_018722	TGC	2	6	408603	408608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502259
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8539	NC_018722	CAG	2	6	408804	408809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502259
8540	NC_018722	CGG	2	6	408826	408831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502259
8541	NC_018722	TGA	2	6	408833	408838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502259
8542	NC_018722	CA	3	6	408923	408928	50 %	0 %	0 %	50 %	408502259
8543	NC_018722	A	7	7	408946	408952	100 %	0 %	0 %	0 %	408502259
8544	NC_018722	CG	4	8	408966	408973	0 %	0 %	50 %	50 %	408502259
8545	NC_018722	AGC	2	6	408991	408996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502259
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8549	NC_018722	C	11	11	409129	409139	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8550	NC_018722	AAG	2	6	409219	409224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8551	NC_018722	AGGG	2	8	409237	409244	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8552	NC_018722	ATGT	2	8	409246	409253	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8553	NC_018722	GGA	2	6	409315	409320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8554	NC_018722	GGA	2	6	409355	409360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502260
8555	NC_018722	GC	3	6	409422	409427	0 %	0 %	50 %	50 %	408502260
8556	NC_018722	CCTG	2	8	409480	409487	0 %	25 %	25 %	50 %	408502260
8557	NC_018722	TTC	2	6	409520	409525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502260
8558	NC_018722	TGC	2	6	409573	409578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502260
8559	NC_018722	AGG	2	6	409600	409605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502260
8560	NC_018722	CG	3	6	409617	409622	0 %	0 %	50 %	50 %	408502260
8561	NC_018722	CCTT	2	8	409641	409648	0 %	50 %	0 %	50 %	408502260
8562	NC_018722	GCC	2	6	409659	409664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502260
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8564	NC_018722	CA	3	6	409820	409825	50 %	0 %	0 %	50 %	408502261
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8568	NC_018722	GGGGCG	2	12	409970	409981	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	408502261
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8570	NC_018722	AC	4	8	410014	410021	50 %	0 %	0 %	50 %	408502261
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8574	NC_018722	GCAG	2	8	410251	410258	25 %	0 %	50 %	25 %	408502261
8575	NC_018722	T	6	6	410281	410286	0 %	100 %	0 %	0 %	408502261
8576	NC_018722	G	6	6	410295	410300	0 %	0 %	100 %	0 %	408502261
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8581	NC_018722	GC	3	6	410472	410477	0 %	0 %	50 %	50 %	408502261
8582	NC_018722	GC	4	8	410504	410511	0 %	0 %	50 %	50 %	408502261
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8595	NC_018722	AGC	2	6	410979	410984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502262
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8603	NC_018722	GC	3	6	411375	411380	0 %	0 %	50 %	50 %	408502263
8604	NC_018722	GTG	2	6	411445	411450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502263
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8607	NC_018722	TTA	2	6	411649	411654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408502263
8608	NC_018722	CG	3	6	411705	411710	0 %	0 %	50 %	50 %	408502263
8609	NC_018722	GGT	2	6	411731	411736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502263
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8611	NC_018722	GTGC	2	8	411792	411799	0 %	25 %	50 %	25 %	408502263
8612	NC_018722	TCG	2	6	411836	411841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502263
8613	NC_018722	G	6	6	411841	411846	0 %	0 %	100 %	0 %	408502263
8614	NC_018722	CGCT	2	8	411856	411863	0 %	25 %	25 %	50 %	408502263
8615	NC_018722	GCA	2	6	411932	411937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502263
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8621	NC_018722	GT	3	6	412284	412289	0 %	50 %	50 %	0 %	408502263
8622	NC_018722	GCG	2	6	412344	412349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502263
8623	NC_018722	TG	3	6	412357	412362	0 %	50 %	50 %	0 %	408502263
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8876	NC_018722	GTT	2	6	424558	424563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502276
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8879	NC_018722	GCA	2	6	424739	424744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502276
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8881	NC_018722	GCG	2	6	424845	424850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502276
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8896	NC_018722	GAAG	2	8	425658	425665	50 %	0 %	50 %	0 %	408502276
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8984	NC_018722	GCGCA	2	10	429238	429247	20 %	0 %	40 %	40 %	408502279
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8996	NC_018722	CTTT	2	8	429860	429867	0 %	75 %	0 %	25 %	408502280
8997	NC_018722	ACGCGC	2	12	429894	429905	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	408502280
8998	NC_018722	GAA	2	6	429935	429940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502280
8999	NC_018722	AGC	2	6	429963	429968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502280
9000	NC_018722	GC	3	6	429973	429978	0 %	0 %	50 %	50 %	408502280

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