MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Mexico A chromosome

Total Repeats: 24024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7502	NC_018722	TTG	2	6	362174	362179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502219
7503	NC_018722	TGCAG	2	10	362226	362235	20 %	20 %	40 %	20 %	408502220
7504	NC_018722	T	9	9	362323	362331	0 %	100 %	0 %	0 %	408502220
7505	NC_018722	CGTG	2	8	362357	362364	0 %	25 %	50 %	25 %	408502220
7506	NC_018722	TG	4	8	362368	362375	0 %	50 %	50 %	0 %	408502220
7507	NC_018722	AT	3	6	362473	362478	50 %	50 %	0 %	0 %	408502220
7508	NC_018722	ATT	2	6	362508	362513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408502220
7509	NC_018722	T	6	6	362660	362665	0 %	100 %	0 %	0 %	408502220
7510	NC_018722	CTC	2	6	362721	362726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502220
7511	NC_018722	CATG	2	8	362738	362745	25 %	25 %	25 %	25 %	408502220
7512	NC_018722	CGTT	2	8	362763	362770	0 %	50 %	25 %	25 %	408502220
7513	NC_018722	A	7	7	362772	362778	100 %	0 %	0 %	0 %	408502220
7514	NC_018722	ACA	2	6	362847	362852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502220
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7516	NC_018722	ACGC	2	8	362873	362880	25 %	0 %	25 %	50 %	408502220
7517	NC_018722	TTG	2	6	362884	362889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502220
7518	NC_018722	TGA	2	6	362938	362943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502220
7519	NC_018722	CG	3	6	363014	363019	0 %	0 %	50 %	50 %	408502220
7520	NC_018722	TTC	2	6	363121	363126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502220
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7522	NC_018722	TAGG	2	8	363203	363210	25 %	25 %	50 %	0 %	408502220
7523	NC_018722	GTGC	2	8	363220	363227	0 %	25 %	50 %	25 %	408502221
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7526	NC_018722	AAT	2	6	363318	363323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502221
7527	NC_018722	A	6	6	363344	363349	100 %	0 %	0 %	0 %	408502221
7528	NC_018722	T	6	6	363392	363397	0 %	100 %	0 %	0 %	408502221
7529	NC_018722	A	7	7	363433	363439	100 %	0 %	0 %	0 %	408502221
7530	NC_018722	GGC	2	6	363447	363452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502221
7531	NC_018722	A	6	6	363458	363463	100 %	0 %	0 %	0 %	408502221
7532	NC_018722	G	6	6	363466	363471	0 %	0 %	100 %	0 %	408502221
7533	NC_018722	CCG	2	6	363491	363496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502221
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7537	NC_018722	AAAT	2	8	363687	363694	75 %	25 %	0 %	0 %	408502221
7538	NC_018722	CGCA	2	8	363704	363711	25 %	0 %	25 %	50 %	408502221
7539	NC_018722	TGC	2	6	363717	363722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502221
7540	NC_018722	T	6	6	363724	363729	0 %	100 %	0 %	0 %	408502221
7541	NC_018722	AAT	2	6	363778	363783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502221
7542	NC_018722	GCG	2	6	363799	363804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502221
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7544	NC_018722	TG	3	6	363856	363861	0 %	50 %	50 %	0 %	408502221
7545	NC_018722	GTAA	2	8	363872	363879	50 %	25 %	25 %	0 %	408502221
7546	NC_018722	AAG	2	6	363880	363885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502221
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7548	NC_018722	TCT	2	6	363931	363936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502221
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7550	NC_018722	A	6	6	363950	363955	100 %	0 %	0 %	0 %	408502221
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7553	NC_018722	GT	3	6	364027	364032	0 %	50 %	50 %	0 %	408502221
7554	NC_018722	ATG	2	6	364072	364077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502221
7555	NC_018722	TTG	2	6	364079	364084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502221
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7558	NC_018722	T	7	7	364214	364220	0 %	100 %	0 %	0 %	408502221
7559	NC_018722	GT	3	6	364236	364241	0 %	50 %	50 %	0 %	408502221
7560	NC_018722	A	7	7	364268	364274	100 %	0 %	0 %	0 %	408502221
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7565	NC_018722	GC	3	6	364445	364450	0 %	0 %	50 %	50 %	408502221
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7569	NC_018722	GT	3	6	364798	364803	0 %	50 %	50 %	0 %	408502222
7570	NC_018722	GAA	2	6	364941	364946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502222
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7578	NC_018722	T	6	6	365184	365189	0 %	100 %	0 %	0 %	408502222
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7582	NC_018722	TTATT	2	10	365352	365361	20 %	80 %	0 %	0 %	408502222
7583	NC_018722	CGTG	2	8	365445	365452	0 %	25 %	50 %	25 %	408502222
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7589	NC_018722	CTC	2	6	365847	365852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502222
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7592	NC_018722	GCAG	2	8	366011	366018	25 %	0 %	50 %	25 %	408502222
7593	NC_018722	T	6	6	366023	366028	0 %	100 %	0 %	0 %	408502222
7594	NC_018722	GTT	2	6	366101	366106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502222
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7596	NC_018722	AGG	2	6	366121	366126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502222
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7598	NC_018722	TGG	2	6	366180	366185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7599	NC_018722	ATGG	2	8	366214	366221	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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7602	NC_018722	TC	3	6	366412	366417	0 %	50 %	0 %	50 %	408502223
7603	NC_018722	CGGA	2	8	366441	366448	25 %	0 %	50 %	25 %	408502223
7604	NC_018722	TTC	2	6	366500	366505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502223
7605	NC_018722	TGGT	2	8	366534	366541	0 %	50 %	50 %	0 %	408502223
7606	NC_018722	AGGG	3	12	366609	366620	25 %	0 %	75 %	0 %	408502223
7607	NC_018722	GTG	2	6	366762	366767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502223
7608	NC_018722	TAT	3	9	366770	366778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408502223
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7612	NC_018722	CTT	2	6	367005	367010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502224
7613	NC_018722	TGCG	2	8	367021	367028	0 %	25 %	50 %	25 %	408502224
7614	NC_018722	TGGAT	2	10	367055	367064	20 %	40 %	40 %	0 %	408502224
7615	NC_018722	ACA	2	6	367071	367076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502224
7616	NC_018722	GC	3	6	367078	367083	0 %	0 %	50 %	50 %	408502224
7617	NC_018722	T	6	6	367087	367092	0 %	100 %	0 %	0 %	408502224
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7622	NC_018722	TTGC	2	8	367200	367207	0 %	50 %	25 %	25 %	408502224
7623	NC_018722	AAAC	2	8	367239	367246	75 %	0 %	0 %	25 %	408502224
7624	NC_018722	TTTC	2	8	367270	367277	0 %	75 %	0 %	25 %	408502224
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