MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Mexico A chromosome

Total Repeats: 24024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_018722	GTCA	2	8	338259	338266	25 %	25 %	25 %	25 %	408502204
7003	NC_018722	GCT	2	6	338269	338274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502204
7004	NC_018722	GTG	2	6	338370	338375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502204
7005	NC_018722	CGG	2	6	338396	338401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502204
7006	NC_018722	CG	3	6	338462	338467	0 %	0 %	50 %	50 %	408502204
7007	NC_018722	GCG	2	6	338476	338481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502204
7008	NC_018722	GCA	2	6	338509	338514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502204
7009	NC_018722	A	6	6	338531	338536	100 %	0 %	0 %	0 %	408502204
7010	NC_018722	AGG	2	6	338590	338595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502204
7011	NC_018722	GC	3	6	338618	338623	0 %	0 %	50 %	50 %	408502204
7012	NC_018722	CG	3	6	338667	338672	0 %	0 %	50 %	50 %	408502204
7013	NC_018722	G	7	7	338730	338736	0 %	0 %	100 %	0 %	408502204
7014	NC_018722	CTC	2	6	338744	338749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502204
7015	NC_018722	GA	3	6	338811	338816	50 %	0 %	50 %	0 %	408502204
7016	NC_018722	A	6	6	338885	338890	100 %	0 %	0 %	0 %	408502204
7017	NC_018722	A	7	7	338903	338909	100 %	0 %	0 %	0 %	408502204
7018	NC_018722	GCT	2	6	338970	338975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502205
7019	NC_018722	GGT	2	6	339018	339023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502205
7020	NC_018722	GTG	2	6	339151	339156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502205
7021	NC_018722	GT	4	8	339265	339272	0 %	50 %	50 %	0 %	408502205
7022	NC_018722	CTTT	3	12	339295	339306	0 %	75 %	0 %	25 %	408502205
7023	NC_018722	GCG	2	6	339316	339321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502205
7024	NC_018722	GGA	2	6	339343	339348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502205
7025	NC_018722	GC	3	6	339375	339380	0 %	0 %	50 %	50 %	408502205
7026	NC_018722	GGT	3	9	339399	339407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502205
7027	NC_018722	TC	3	6	339528	339533	0 %	50 %	0 %	50 %	408502205
7028	NC_018722	AAC	2	6	339618	339623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502205
7029	NC_018722	GGC	2	6	339692	339697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502205
7030	NC_018722	GTAT	2	8	339725	339732	25 %	50 %	25 %	0 %	408502205
7031	NC_018722	GT	3	6	339746	339751	0 %	50 %	50 %	0 %	408502205
7032	NC_018722	CGGG	2	8	339777	339784	0 %	0 %	75 %	25 %	408502205
7033	NC_018722	TGG	2	6	339833	339838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502205
7034	NC_018722	GT	4	8	339858	339865	0 %	50 %	50 %	0 %	408502205
7035	NC_018722	CGG	2	6	339867	339872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502205
7036	NC_018722	GCT	2	6	339876	339881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502205
7037	NC_018722	GC	3	6	339891	339896	0 %	0 %	50 %	50 %	408502205
7038	NC_018722	AGG	2	6	339932	339937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502205
7039	NC_018722	ATT	2	6	339961	339966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408502205
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7041	NC_018722	TGG	2	6	340054	340059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502206
7042	NC_018722	G	7	7	340103	340109	0 %	0 %	100 %	0 %	408502206
7043	NC_018722	GAGCG	2	10	340119	340128	20 %	0 %	60 %	20 %	408502206
7044	NC_018722	TGA	2	6	340156	340161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502206
7045	NC_018722	GCT	2	6	340218	340223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502206
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7047	NC_018722	GTT	2	6	340271	340276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502206
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7049	NC_018722	TG	3	6	340339	340344	0 %	50 %	50 %	0 %	408502206
7050	NC_018722	T	7	7	340360	340366	0 %	100 %	0 %	0 %	408502206
7051	NC_018722	GCA	2	6	340385	340390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502206
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7053	NC_018722	T	6	6	340436	340441	0 %	100 %	0 %	0 %	408502206
7054	NC_018722	TAG	2	6	340513	340518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502206
7055	NC_018722	GTAC	2	8	340529	340536	25 %	25 %	25 %	25 %	408502206
7056	NC_018722	CGTG	2	8	340562	340569	0 %	25 %	50 %	25 %	408502206
7057	NC_018722	GT	3	6	340612	340617	0 %	50 %	50 %	0 %	408502206
7058	NC_018722	GCG	2	6	340632	340637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502206
7059	NC_018722	GGC	2	6	340668	340673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502206
7060	NC_018722	GTT	2	6	340847	340852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502206
7061	NC_018722	GC	3	6	340879	340884	0 %	0 %	50 %	50 %	408502206
7062	NC_018722	TGC	2	6	340909	340914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502206
7063	NC_018722	GGC	2	6	340923	340928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502206
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7065	NC_018722	T	6	6	341066	341071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7093	NC_018722	CT	4	8	343019	343026	0 %	50 %	0 %	50 %	408502207
7094	NC_018722	TCA	2	6	343092	343097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502207
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7103	NC_018722	GCGT	2	8	343662	343669	0 %	25 %	50 %	25 %	408502207
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7124	NC_018722	G	6	6	344757	344762	0 %	0 %	100 %	0 %	408502207
7125	NC_018722	T	7	7	344767	344773	0 %	100 %	0 %	0 %	408502207
7126	NC_018722	TTTCG	2	10	344849	344858	0 %	60 %	20 %	20 %	408502207
7127	NC_018722	CCG	2	6	344962	344967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502207
7128	NC_018722	GGT	2	6	345003	345008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502207
7129	NC_018722	GGA	2	6	345099	345104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502207
7130	NC_018722	TTTGGA	2	12	345120	345131	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	408502207
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7133	NC_018722	CGT	2	6	345253	345258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502207
7134	NC_018722	GCT	2	6	345285	345290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502207
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7137	NC_018722	T	7	7	345400	345406	0 %	100 %	0 %	0 %	408502207
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7141	NC_018722	T	6	6	345679	345684	0 %	100 %	0 %	0 %	408502208
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7145	NC_018722	GTG	2	6	346041	346046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502208
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7152	NC_018722	CG	3	6	346253	346258	0 %	0 %	50 %	50 %	408502208
7153	NC_018722	A	7	7	346287	346293	100 %	0 %	0 %	0 %	408502208
7154	NC_018722	TGG	2	6	346333	346338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502208
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7164	NC_018722	TGC	2	6	346660	346665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502208
7165	NC_018722	TCG	2	6	346740	346745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502208
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7172	NC_018722	CTTTGA	2	12	347024	347035	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	408502208
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7174	NC_018722	GC	3	6	347185	347190	0 %	0 %	50 %	50 %	408502208
7175	NC_018722	G	7	7	347238	347244	0 %	0 %	100 %	0 %	408502208
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7185	NC_018722	AGTC	2	8	347799	347806	25 %	25 %	25 %	25 %	408502208
7186	NC_018722	CAG	2	6	347828	347833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502208
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7191	NC_018722	AAT	2	6	348012	348017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502208
7192	NC_018722	CCA	2	6	348061	348066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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7226	NC_018722	CTG	2	6	350119	350124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502210
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7234	NC_018722	TCA	2	6	350521	350526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502210
7235	NC_018722	T	6	6	350555	350560	0 %	100 %	0 %	0 %	408502210
7236	NC_018722	T	6	6	350647	350652	0 %	100 %	0 %	0 %	408502210
7237	NC_018722	GC	3	6	350679	350684	0 %	0 %	50 %	50 %	408502210
7238	NC_018722	CTT	2	6	350696	350701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502210
7239	NC_018722	CA	3	6	350722	350727	50 %	0 %	0 %	50 %	408502210
7240	NC_018722	GCA	2	6	350736	350741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502210
7241	NC_018722	GCAG	2	8	350813	350820	25 %	0 %	50 %	25 %	408502210
7242	NC_018722	CAT	2	6	350838	350843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502210
7243	NC_018722	GTGC	2	8	350844	350851	0 %	25 %	50 %	25 %	408502210
7244	NC_018722	A	6	6	350961	350966	100 %	0 %	0 %	0 %	408502210
7245	NC_018722	CG	3	6	351045	351050	0 %	0 %	50 %	50 %	408502210
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7247	NC_018722	CTG	2	6	351103	351108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502210
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7252	NC_018722	GCA	2	6	351320	351325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502210
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7340	NC_018722	CTCTC	2	10	355260	355269	0 %	40 %	0 %	60 %	408502213
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7360	NC_018722	AATGA	2	10	356295	356304	60 %	20 %	20 %	0 %	408502213
7361	NC_018722	GCAT	2	8	356323	356330	25 %	25 %	25 %	25 %	408502213
7362	NC_018722	CTGC	2	8	356431	356438	0 %	25 %	25 %	50 %	408502213
7363	NC_018722	GC	3	6	356527	356532	0 %	0 %	50 %	50 %	408502213
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7366	NC_018722	TC	3	6	356618	356623	0 %	50 %	0 %	50 %	408502213
7367	NC_018722	CCT	2	6	356669	356674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7368	NC_018722	TGCG	2	8	356676	356683	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7369	NC_018722	CTT	2	6	356890	356895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502214
7370	NC_018722	GCT	2	6	356977	356982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502214
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7499	NC_018722	ATT	2	6	361978	361983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408502219
7500	NC_018722	GC	3	6	362019	362024	0 %	0 %	50 %	50 %	408502219

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