MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Mexico A chromosome

Total Repeats: 24024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_018722	ATG	2	6	293254	293259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502169
6002	NC_018722	CG	3	6	293306	293311	0 %	0 %	50 %	50 %	408502169
6003	NC_018722	GGA	2	6	293384	293389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502169
6004	NC_018722	GTAT	2	8	293401	293408	25 %	50 %	25 %	0 %	408502169
6005	NC_018722	TAC	2	6	293421	293426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502169
6006	NC_018722	CCG	2	6	293536	293541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502169
6007	NC_018722	ATA	2	6	293575	293580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502169
6008	NC_018722	GC	3	6	293593	293598	0 %	0 %	50 %	50 %	408502169
6009	NC_018722	ACA	2	6	293612	293617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502169
6010	NC_018722	TC	3	6	293633	293638	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6011	NC_018722	AGT	2	6	293664	293669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_018722	GCG	2	6	293670	293675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6013	NC_018722	GCAC	2	8	293680	293687	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6014	NC_018722	GACC	2	8	293716	293723	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6015	NC_018722	CTT	2	6	293803	293808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502170
6016	NC_018722	T	7	7	293807	293813	0 %	100 %	0 %	0 %	408502170
6017	NC_018722	CCA	2	6	293856	293861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502170
6018	NC_018722	TG	3	6	293876	293881	0 %	50 %	50 %	0 %	408502170
6019	NC_018722	TCA	2	6	293912	293917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502170
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6021	NC_018722	TCTGC	2	10	294060	294069	0 %	40 %	20 %	40 %	408502170
6022	NC_018722	CTT	2	6	294114	294119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502170
6023	NC_018722	CGG	2	6	294157	294162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502170
6024	NC_018722	GTA	2	6	294199	294204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502170
6025	NC_018722	TGC	2	6	294254	294259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502170
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6027	NC_018722	TGA	2	6	294360	294365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502170
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6029	NC_018722	GCG	2	6	294500	294505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502170
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6031	NC_018722	TTG	2	6	294524	294529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502170
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6041	NC_018722	TCG	2	6	295088	295093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502170
6042	NC_018722	GTA	2	6	295096	295101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502170
6043	NC_018722	GGA	2	6	295107	295112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502170
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6045	NC_018722	GAG	2	6	295225	295230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_018722	GAT	2	6	295260	295265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_018722	TTTCC	2	10	295307	295316	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
6048	NC_018722	GGA	2	6	295329	295334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_018722	GC	3	6	295355	295360	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6050	NC_018722	GAG	2	6	295377	295382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_018722	CTT	2	6	295423	295428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502171
6052	NC_018722	G	12	12	295449	295460	0 %	0 %	100 %	0 %	408502171
6053	NC_018722	AG	5	10	295461	295470	50 %	0 %	50 %	0 %	408502171
6054	NC_018722	CGTTG	2	10	295493	295502	0 %	40 %	40 %	20 %	408502171
6055	NC_018722	GTGC	2	8	295505	295512	0 %	25 %	50 %	25 %	408502171
6056	NC_018722	GCCG	2	8	295530	295537	0 %	0 %	50 %	50 %	408502171
6057	NC_018722	ATC	2	6	295550	295555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502171
6058	NC_018722	AGC	2	6	295586	295591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502171
6059	NC_018722	GTC	2	6	295596	295601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502171
6060	NC_018722	GC	3	6	295620	295625	0 %	0 %	50 %	50 %	408502171
6061	NC_018722	TTCT	2	8	295642	295649	0 %	75 %	0 %	25 %	408502171
6062	NC_018722	CGC	2	6	295666	295671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502171
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6064	NC_018722	CAA	2	6	295761	295766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502171
6065	NC_018722	CAT	2	6	295776	295781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502171
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6068	NC_018722	TGA	2	6	295819	295824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502171
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6070	NC_018722	CTG	2	6	295910	295915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502171
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6091	NC_018722	GAG	2	6	296897	296902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502171
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6378	NC_018722	T	6	6	309826	309831	0 %	100 %	0 %	0 %	408502182
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6387	NC_018722	CCT	2	6	310132	310137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502182
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6496	NC_018722	TG	3	6	315070	315075	0 %	50 %	50 %	0 %	408502186
6497	NC_018722	CTCCGT	2	12	315091	315102	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	408502186
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6499	NC_018722	T	6	6	315224	315229	0 %	100 %	0 %	0 %	408502187
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