MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoanaerobacterium phage THSA-485A

Total Repeats: 978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018264	TAT	2	6	34	39	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018264	A	7	7	70	76	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018264	TAA	2	6	100	105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397912606
4	NC_018264	TA	3	6	164	169	50 %	50 %	0 %	0 %	397912606
5	NC_018264	T	8	8	181	188	0 %	100 %	0 %	0 %	397912606
6	NC_018264	CGC	2	6	208	213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397912606
7	NC_018264	TTC	2	6	278	283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397912606
8	NC_018264	ATT	2	6	293	298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397912606
9	NC_018264	T	6	6	359	364	0 %	100 %	0 %	0 %	397912606
10	NC_018264	TTC	3	9	368	376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397912606
11	NC_018264	T	6	6	384	389	0 %	100 %	0 %	0 %	397912606
12	NC_018264	CCT	2	6	440	445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_018264	TC	3	6	502	507	0 %	50 %	0 %	50 %	397912607
14	NC_018264	CAA	2	6	589	594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397912607
15	NC_018264	TA	4	8	631	638	50 %	50 %	0 %	0 %	397912607
16	NC_018264	T	7	7	671	677	0 %	100 %	0 %	0 %	397912607
17	NC_018264	TC	3	6	725	730	0 %	50 %	0 %	50 %	397912607
18	NC_018264	GGAG	2	8	750	757	25 %	0 %	75 %	0 %	397912607
19	NC_018264	TCT	2	6	766	771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397912607
20	NC_018264	CTAT	2	8	780	787	25 %	50 %	0 %	25 %	397912607
21	NC_018264	TCC	2	6	871	876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_018264	TTTAT	2	10	877	886	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018264	TA	3	6	894	899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018264	T	6	6	910	915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018264	TAT	2	6	917	922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018264	GAA	2	6	929	934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018264	TTA	2	6	992	997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397912608
28	NC_018264	AG	3	6	1003	1008	50 %	0 %	50 %	0 %	397912608
29	NC_018264	TAC	2	6	1011	1016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397912608
30	NC_018264	GAA	2	6	1073	1078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397912608
31	NC_018264	CATA	2	8	1131	1138	50 %	25 %	0 %	25 %	397912608
32	NC_018264	GAA	2	6	1170	1175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397912608
33	NC_018264	ATG	2	6	1195	1200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397912608
34	NC_018264	TCATA	2	10	1214	1223	40 %	40 %	0 %	20 %	397912608
35	NC_018264	TCC	2	6	1346	1351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_018264	AAT	2	6	1410	1415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397912609
37	NC_018264	AT	3	6	1465	1470	50 %	50 %	0 %	0 %	397912609
38	NC_018264	TCT	3	9	1517	1525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397912609
39	NC_018264	A	7	7	1540	1546	100 %	0 %	0 %	0 %	397912609
40	NC_018264	TCA	2	6	1547	1552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397912609
41	NC_018264	TA	3	6	1592	1597	50 %	50 %	0 %	0 %	397912609
42	NC_018264	TA	3	6	1629	1634	50 %	50 %	0 %	0 %	397912609
43	NC_018264	TGGTT	2	10	1669	1678	0 %	60 %	40 %	0 %	397912609
44	NC_018264	AT	3	6	1704	1709	50 %	50 %	0 %	0 %	397912609
45	NC_018264	TTC	2	6	1741	1746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397912609
46	NC_018264	AGA	2	6	1757	1762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397912609
47	NC_018264	CAT	2	6	1782	1787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397912609
48	NC_018264	TCTATT	2	12	1799	1810	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	397912609
49	NC_018264	T	6	6	1839	1844	0 %	100 %	0 %	0 %	397912609
50	NC_018264	ATG	2	6	1897	1902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397912609
51	NC_018264	TC	3	6	2046	2051	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_018264	TTATT	2	10	2057	2066	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018264	CTG	2	6	2118	2123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397912610
54	NC_018264	CTTC	2	8	2135	2142	0 %	50 %	0 %	50 %	397912610
55	NC_018264	CGA	2	6	2169	2174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397912610
56	NC_018264	GA	3	6	2176	2181	50 %	0 %	50 %	0 %	397912610
57	NC_018264	TAC	2	6	2248	2253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397912610
58	NC_018264	CCT	2	6	2316	2321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397912610
59	NC_018264	CTATGT	2	12	2322	2333	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	397912610
60	NC_018264	TCC	2	6	2393	2398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_018264	TTTA	2	8	2400	2407	25 %	75 %	0 %	0 %	397912611
62	NC_018264	TA	3	6	2554	2559	50 %	50 %	0 %	0 %	397912611
63	NC_018264	TTG	2	6	2615	2620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397912611
64	NC_018264	T	6	6	2667	2672	0 %	100 %	0 %	0 %	397912611
65	NC_018264	CTT	2	6	2692	2697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397912611
66	NC_018264	TGT	2	6	2702	2707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397912611
67	NC_018264	AT	3	6	2749	2754	50 %	50 %	0 %	0 %	397912611
68	NC_018264	CT	3	6	2765	2770	0 %	50 %	0 %	50 %	397912611
69	NC_018264	AAC	3	9	2816	2824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397912611
70	NC_018264	TCG	2	6	2826	2831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397912611
71	NC_018264	TAAAT	2	10	2834	2843	60 %	40 %	0 %	0 %	397912611
72	NC_018264	T	6	6	2882	2887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018264	CTG	2	6	3172	3177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397912612
74	NC_018264	AATCTA	2	12	3195	3206	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	397912612
75	NC_018264	TCG	2	6	3252	3257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397912612
76	NC_018264	GAC	2	6	3349	3354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397912612
77	NC_018264	T	7	7	3387	3393	0 %	100 %	0 %	0 %	397912612
78	NC_018264	TTC	2	6	3400	3405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397912612
79	NC_018264	TCA	2	6	3420	3425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_018264	T	6	6	3432	3437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018264	ATTT	2	8	3441	3448	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018264	CTG	2	6	3483	3488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_018264	CTA	2	6	3527	3532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397912613
84	NC_018264	CTG	2	6	3542	3547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397912613
85	NC_018264	GCA	2	6	3553	3558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397912613
86	NC_018264	TTC	3	9	3567	3575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397912613
87	NC_018264	CTAA	2	8	3613	3620	50 %	25 %	0 %	25 %	397912613
88	NC_018264	GTA	2	6	3708	3713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397912613
89	NC_018264	GTT	2	6	3759	3764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397912613
90	NC_018264	TCTT	2	8	3787	3794	0 %	75 %	0 %	25 %	397912613
91	NC_018264	AT	4	8	3805	3812	50 %	50 %	0 %	0 %	397912613
92	NC_018264	GCA	2	6	3821	3826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397912613
93	NC_018264	TTC	3	9	3831	3839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397912613
94	NC_018264	AAC	2	6	3852	3857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397912613
95	NC_018264	TGAC	2	8	3884	3891	25 %	25 %	25 %	25 %	397912613
96	NC_018264	AAT	2	6	3898	3903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397912613
97	NC_018264	TCT	2	6	3925	3930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397912613
98	NC_018264	TCT	2	6	3940	3945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397912613
99	NC_018264	GAG	2	6	3962	3967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397912613
100	NC_018264	TTTTCA	2	12	4001	4012	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	397912613
101	NC_018264	T	6	6	4013	4018	0 %	100 %	0 %	0 %	397912613
102	NC_018264	TCC	2	6	4037	4042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_018264	ATTAT	2	10	4048	4057	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018264	TCT	2	6	4064	4069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_018264	T	7	7	4107	4113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018264	AT	3	6	4114	4119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018264	T	6	6	4166	4171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018264	A	6	6	4172	4177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018264	CTTT	2	8	4267	4274	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_018264	T	7	7	4272	4278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018264	GTTT	2	8	4295	4302	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018264	AT	3	6	4336	4341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018264	A	7	7	4359	4365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018264	ATT	2	6	4386	4391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397912614
115	NC_018264	AGTTGC	2	12	4399	4410	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	397912614
116	NC_018264	TTA	2	6	4421	4426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397912614
117	NC_018264	TGT	2	6	4435	4440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397912614
118	NC_018264	TAG	2	6	4464	4469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397912614
119	NC_018264	GCTG	2	8	4472	4479	0 %	25 %	50 %	25 %	397912614
120	NC_018264	TTA	2	6	4493	4498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397912614
121	NC_018264	GAT	2	6	4503	4508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397912614
122	NC_018264	CTT	2	6	4518	4523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397912614
123	NC_018264	TTC	2	6	4568	4573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397912614
124	NC_018264	CAA	2	6	4581	4586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397912614
125	NC_018264	GCA	2	6	4646	4651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397912614
126	NC_018264	TCCT	2	8	4660	4667	0 %	50 %	0 %	50 %	397912614
127	NC_018264	CAA	2	6	4680	4685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397912614
128	NC_018264	CTG	2	6	4699	4704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397912614
129	NC_018264	TAC	2	6	4705	4710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397912614
130	NC_018264	TGT	2	6	4763	4768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397912614
131	NC_018264	CAA	2	6	4830	4835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397912614
132	NC_018264	ATTT	2	8	4915	4922	25 %	75 %	0 %	0 %	397912615
133	NC_018264	T	6	6	4952	4957	0 %	100 %	0 %	0 %	397912615
134	NC_018264	TTTA	2	8	4960	4967	25 %	75 %	0 %	0 %	397912615
135	NC_018264	ATC	2	6	4969	4974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397912615
136	NC_018264	AT	3	6	4978	4983	50 %	50 %	0 %	0 %	397912615
137	NC_018264	TAA	2	6	5023	5028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397912615
138	NC_018264	GTT	2	6	5131	5136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397912615
139	NC_018264	TGA	2	6	5159	5164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397912615
140	NC_018264	CAA	2	6	5170	5175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397912615
141	NC_018264	AAT	2	6	5235	5240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397912615
142	NC_018264	TAAG	2	8	5321	5328	50 %	25 %	25 %	0 %	397912615
143	NC_018264	TAAG	2	8	5390	5397	50 %	25 %	25 %	0 %	397912615
144	NC_018264	CTT	2	6	5445	5450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397912615
145	NC_018264	TC	3	6	5459	5464	0 %	50 %	0 %	50 %	397912615
146	NC_018264	TA	3	6	5510	5515	50 %	50 %	0 %	0 %	397912615
147	NC_018264	ACTG	2	8	5595	5602	25 %	25 %	25 %	25 %	397912615
148	NC_018264	AGT	2	6	5842	5847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397912616
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150	NC_018264	CTA	2	6	5931	5936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397912616
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154	NC_018264	ATC	2	6	6109	6114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397912616
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157	NC_018264	TAC	2	6	6204	6209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397912616
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159	NC_018264	GTT	2	6	6262	6267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397912616
160	NC_018264	TTC	2	6	6300	6305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397912616
161	NC_018264	TGT	2	6	6356	6361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397912616
162	NC_018264	TGG	2	6	6397	6402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397912616
163	NC_018264	TCA	2	6	6423	6428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397912616
164	NC_018264	CTT	2	6	6447	6452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397912616
165	NC_018264	TAC	2	6	6529	6534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397912616
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168	NC_018264	AAT	2	6	6652	6657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397912616
169	NC_018264	CTT	2	6	6675	6680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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171	NC_018264	TCT	3	9	6794	6802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397912617
172	NC_018264	CTT	2	6	6804	6809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397912617
173	NC_018264	CTGT	2	8	6813	6820	0 %	50 %	25 %	25 %	397912617
174	NC_018264	CTT	2	6	6822	6827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397912617
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179	NC_018264	T	6	6	6998	7003	0 %	100 %	0 %	0 %	397912617
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183	NC_018264	TCT	2	6	7154	7159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397912617
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199	NC_018264	CTTC	2	8	7803	7810	0 %	50 %	0 %	50 %	397912619
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247	NC_018264	TAT	2	6	9641	9646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397912622
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250	NC_018264	TAC	2	6	9777	9782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397912623
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256	NC_018264	TAT	2	6	10113	10118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397912623
257	NC_018264	TAT	2	6	10121	10126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397912623
258	NC_018264	AAG	2	6	10137	10142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397912623
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262	NC_018264	ATC	2	6	10349	10354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397912624
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264	NC_018264	TG	3	6	10416	10421	0 %	50 %	50 %	0 %	397912624
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267	NC_018264	CGT	2	6	10498	10503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397912624
268	NC_018264	ATA	2	6	10514	10519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397912624
269	NC_018264	AT	3	6	10543	10548	50 %	50 %	0 %	0 %	397912624
270	NC_018264	TAT	2	6	10567	10572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397912624
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394	NC_018264	TCC	2	6	16091	16096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
395	NC_018264	ATA	3	9	16111	16119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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397	NC_018264	T	6	6	16176	16181	0 %	100 %	0 %	0 %	397912628
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399	NC_018264	CTG	2	6	16284	16289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397912628
400	NC_018264	GTTTT	2	10	16290	16299	0 %	80 %	20 %	0 %	397912628
401	NC_018264	ATA	2	6	16319	16324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397912628
402	NC_018264	TA	3	6	16352	16357	50 %	50 %	0 %	0 %	397912628
403	NC_018264	T	7	7	16368	16374	0 %	100 %	0 %	0 %	397912628
404	NC_018264	TAATT	2	10	16389	16398	40 %	60 %	0 %	0 %	397912628
405	NC_018264	ATT	2	6	16410	16415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397912628
406	NC_018264	TATTTT	2	12	16431	16442	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	397912628
407	NC_018264	T	6	6	16461	16466	0 %	100 %	0 %	0 %	397912628
408	NC_018264	ATA	2	6	16508	16513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397912628
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412	NC_018264	CTA	2	6	16568	16573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397912628
413	NC_018264	CTA	2	6	16586	16591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397912628
414	NC_018264	AT	3	6	16605	16610	50 %	50 %	0 %	0 %	397912628
415	NC_018264	CTT	2	6	16616	16621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397912628
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423	NC_018264	ATA	2	6	16969	16974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397912628
424	NC_018264	T	7	7	16987	16993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
425	NC_018264	TAT	2	6	17025	17030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
426	NC_018264	TA	3	6	17100	17105	50 %	50 %	0 %	0 %	397912629
427	NC_018264	TAGT	2	8	17201	17208	25 %	50 %	25 %	0 %	397912629
428	NC_018264	AT	3	6	17226	17231	50 %	50 %	0 %	0 %	397912629
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440	NC_018264	AT	3	6	17882	17887	50 %	50 %	0 %	0 %	397912629
441	NC_018264	GTT	2	6	17915	17920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397912629
442	NC_018264	GA	3	6	17951	17956	50 %	0 %	50 %	0 %	397912629
443	NC_018264	ATT	2	6	17963	17968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397912629
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446	NC_018264	TTGCT	2	10	17998	18007	0 %	60 %	20 %	20 %	397912630
447	NC_018264	CCT	2	6	18147	18152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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452	NC_018264	TAT	2	6	18316	18321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397912631
453	NC_018264	TAG	2	6	18342	18347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397912631
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459	NC_018264	CT	3	6	18601	18606	0 %	50 %	0 %	50 %	397912632
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487	NC_018264	CTT	2	6	19620	19625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397912633
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496	NC_018264	T	6	6	20034	20039	0 %	100 %	0 %	0 %	397912634
497	NC_018264	CTT	2	6	20094	20099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397912635
498	NC_018264	ATC	2	6	20286	20291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
499	NC_018264	AGG	2	6	20308	20313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
500	NC_018264	TAT	2	6	20319	20324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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