MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Turneriella parva DSM 21527 chromosome

Total Repeats: 87555

< Previous12...3031323334353637383940...175176Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_018020	CA	3	6	858092	858097	50 %	0 %	0 %	50 %	392402382
17002	NC_018020	CAC	2	6	858112	858117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392402382
17003	NC_018020	CAA	2	6	858255	858260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392402383
17004	NC_018020	CGATT	2	10	858303	858312	20 %	40 %	20 %	20 %	392402383
17005	NC_018020	CGGC	2	8	858433	858440	0 %	0 %	50 %	50 %	392402383
17006	NC_018020	A	6	6	858478	858483	100 %	0 %	0 %	0 %	392402383
17007	NC_018020	CTGC	2	8	858624	858631	0 %	25 %	25 %	50 %	392402383
17008	NC_018020	GCC	2	6	858684	858689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392402383
17009	NC_018020	CAA	2	6	858716	858721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392402383
17010	NC_018020	CAG	2	6	858779	858784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392402383
17011	NC_018020	GA	3	6	858792	858797	50 %	0 %	50 %	0 %	392402383
17012	NC_018020	GCA	2	6	858838	858843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392402383
17013	NC_018020	TGA	2	6	858880	858885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392402383
17014	NC_018020	CAGG	2	8	858952	858959	25 %	0 %	50 %	25 %	392402383
17015	NC_018020	CA	3	6	858986	858991	50 %	0 %	0 %	50 %	392402383
17016	NC_018020	CTG	2	6	859002	859007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392402383
17017	NC_018020	GAC	2	6	859104	859109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392402384
17018	NC_018020	A	6	6	859125	859130	100 %	0 %	0 %	0 %	392402384
17019	NC_018020	CGATGC	2	12	859257	859268	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	392402384
17020	NC_018020	CATT	2	8	859296	859303	25 %	50 %	0 %	25 %	392402384
17021	NC_018020	GCACC	2	10	859333	859342	20 %	0 %	20 %	60 %	392402384
17022	NC_018020	CGT	2	6	859353	859358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392402384
17023	NC_018020	GAG	2	6	859371	859376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392402384
17024	NC_018020	GCC	2	6	859423	859428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392402384
17025	NC_018020	CG	3	6	859465	859470	0 %	0 %	50 %	50 %	392402384
17026	NC_018020	TTC	2	6	859486	859491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392402384
17027	NC_018020	CTG	2	6	859579	859584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392402384
17028	NC_018020	GCC	2	6	859655	859660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392402384
17029	NC_018020	GCC	2	6	859705	859710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392402384
17030	NC_018020	ATG	2	6	859754	859759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392402384
17031	NC_018020	TGA	2	6	859794	859799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392402384
17032	NC_018020	A	6	6	859848	859853	100 %	0 %	0 %	0 %	392402385
17033	NC_018020	GCG	2	6	859858	859863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392402385
17034	NC_018020	AAGC	2	8	860120	860127	50 %	0 %	25 %	25 %	392402385
17035	NC_018020	GT	3	6	860157	860162	0 %	50 %	50 %	0 %	392402385
17036	NC_018020	GA	3	6	860164	860169	50 %	0 %	50 %	0 %	392402385
17037	NC_018020	GCC	2	6	860188	860193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392402385
17038	NC_018020	ATA	2	6	860197	860202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392402385
17039	NC_018020	TC	4	8	860291	860298	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17040	NC_018020	TCGC	2	8	860425	860432	0 %	25 %	25 %	50 %	392402386
17041	NC_018020	GGT	2	6	860539	860544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392402386
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17043	NC_018020	TG	3	6	860643	860648	0 %	50 %	50 %	0 %	392402386
17044	NC_018020	ACC	2	6	860877	860882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392402387
17045	NC_018020	A	7	7	860890	860896	100 %	0 %	0 %	0 %	392402387
17046	NC_018020	TGC	2	6	860925	860930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392402387
17047	NC_018020	TTTC	2	8	860937	860944	0 %	75 %	0 %	25 %	392402387
17048	NC_018020	ACC	2	6	860973	860978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392402387
17049	NC_018020	ACC	2	6	861270	861275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392402387
17050	NC_018020	GAC	2	6	861277	861282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392402387
17051	NC_018020	GCGG	2	8	861403	861410	0 %	0 %	75 %	25 %	392402387
17052	NC_018020	CAC	2	6	861471	861476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392402387
17053	NC_018020	CAG	2	6	861493	861498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392402387
17054	NC_018020	GC	3	6	861564	861569	0 %	0 %	50 %	50 %	392402387
17055	NC_018020	GTC	2	6	861592	861597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392402387
17056	NC_018020	TAA	2	6	861608	861613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392402387
17057	NC_018020	ATTGC	2	10	861646	861655	20 %	40 %	20 %	20 %	392402387
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17059	NC_018020	GCCTT	2	10	861731	861740	0 %	40 %	20 %	40 %	392402387
17060	NC_018020	GGGT	2	8	861761	861768	0 %	25 %	75 %	0 %	392402387
17061	NC_018020	TCG	2	6	861791	861796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392402387
17062	NC_018020	AAG	2	6	861842	861847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392402387
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17064	NC_018020	AGA	2	6	861960	861965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392402387
17065	NC_018020	GGC	2	6	861997	862002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392402387
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17069	NC_018020	AGC	3	9	862133	862141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392402387
17070	NC_018020	GT	3	6	862297	862302	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17071	NC_018020	CCCG	2	8	862361	862368	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
17072	NC_018020	GCA	2	6	862398	862403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17073	NC_018020	CAGC	2	8	862480	862487	25 %	0 %	25 %	50 %	392402388
17074	NC_018020	GTA	2	6	862541	862546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392402388
17075	NC_018020	GC	4	8	862561	862568	0 %	0 %	50 %	50 %	392402388
17076	NC_018020	TGA	2	6	862600	862605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392402388
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17082	NC_018020	TCT	2	6	862836	862841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392402388
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17087	NC_018020	AGG	2	6	863098	863103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17088	NC_018020	CAA	2	6	863112	863117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392402389
17089	NC_018020	A	8	8	863130	863137	100 %	0 %	0 %	0 %	392402389
17090	NC_018020	GC	3	6	863214	863219	0 %	0 %	50 %	50 %	392402389
17091	NC_018020	CGACCT	2	12	863222	863233	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	392402389
17092	NC_018020	CAT	2	6	863237	863242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392402389
17093	NC_018020	CTGC	2	8	863386	863393	0 %	25 %	25 %	50 %	392402389
17094	NC_018020	ACG	2	6	863418	863423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392402389
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17101	NC_018020	T	6	6	863910	863915	0 %	100 %	0 %	0 %	392402389
17102	NC_018020	ACA	2	6	863917	863922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392402389
17103	NC_018020	CGCA	2	8	863979	863986	25 %	0 %	25 %	50 %	392402389
17104	NC_018020	GC	3	6	863988	863993	0 %	0 %	50 %	50 %	392402389
17105	NC_018020	CGC	2	6	864023	864028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392402389
17106	NC_018020	A	6	6	864030	864035	100 %	0 %	0 %	0 %	392402389
17107	NC_018020	CG	4	8	864044	864051	0 %	0 %	50 %	50 %	392402389
17108	NC_018020	TCG	2	6	864064	864069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392402389
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17110	NC_018020	TGG	2	6	864115	864120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392402389
17111	NC_018020	G	6	6	864124	864129	0 %	0 %	100 %	0 %	392402389
17112	NC_018020	ATCAA	2	10	864211	864220	60 %	20 %	0 %	20 %	392402390
17113	NC_018020	AGCC	2	8	864329	864336	25 %	0 %	25 %	50 %	392402390
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17117	NC_018020	A	6	6	864782	864787	100 %	0 %	0 %	0 %	392402390
17118	NC_018020	CCG	2	6	864793	864798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392402390
17119	NC_018020	GA	3	6	864807	864812	50 %	0 %	50 %	0 %	392402390
17120	NC_018020	TTC	3	9	864846	864854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392402390
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17122	NC_018020	TCT	2	6	864937	864942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392402391
17123	NC_018020	TGG	2	6	864964	864969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392402391
17124	NC_018020	TCT	2	6	864980	864985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392402391
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17225	NC_018020	CCG	2	6	871067	871072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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17227	NC_018020	GC	3	6	871195	871200	0 %	0 %	50 %	50 %	392402400
17228	NC_018020	TTTG	2	8	871289	871296	0 %	75 %	25 %	0 %	392402400
17229	NC_018020	GCAA	2	8	871345	871352	50 %	0 %	25 %	25 %	392402400
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17232	NC_018020	AAAT	2	8	871456	871463	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17233	NC_018020	CCA	2	6	871484	871489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17234	NC_018020	C	7	7	871503	871509	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17235	NC_018020	AG	3	6	871520	871525	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17236	NC_018020	G	6	6	871532	871537	0 %	0 %	100 %	0 %	392402401
17237	NC_018020	CCG	2	6	871557	871562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392402401
17238	NC_018020	GTG	2	6	871579	871584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392402401
17239	NC_018020	T	6	6	871624	871629	0 %	100 %	0 %	0 %	392402401
17240	NC_018020	CAGCT	2	10	871630	871639	20 %	20 %	20 %	40 %	392402401
17241	NC_018020	TAT	2	6	871692	871697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392402401
17242	NC_018020	AGGCG	2	10	871716	871725	20 %	0 %	60 %	20 %	392402401
17243	NC_018020	CGG	3	9	871761	871769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392402401
17244	NC_018020	TCT	2	6	871815	871820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392402401
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17246	NC_018020	GCGA	2	8	871855	871862	25 %	0 %	50 %	25 %	392402401
17247	NC_018020	CGA	3	9	871860	871868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392402401
17248	NC_018020	A	6	6	871868	871873	100 %	0 %	0 %	0 %	392402401
17249	NC_018020	TGCGC	2	10	871875	871884	0 %	20 %	40 %	40 %	392402401
17250	NC_018020	GGTC	2	8	871937	871944	0 %	25 %	50 %	25 %	392402401
17251	NC_018020	CGT	2	6	871947	871952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392402401
17252	NC_018020	GC	3	6	871958	871963	0 %	0 %	50 %	50 %	392402401
17253	NC_018020	TGCC	2	8	872120	872127	0 %	25 %	25 %	50 %	392402401
17254	NC_018020	GCGG	2	8	872128	872135	0 %	0 %	75 %	25 %	392402401
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17314	NC_018020	TGCTCG	2	12	874781	874792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392402402
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17319	NC_018020	CGCT	2	8	874994	875001	0 %	25 %	25 %	50 %	392402403
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17350	NC_018020	GC	4	8	876240	876247	0 %	0 %	50 %	50 %	392402403
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17353	NC_018020	TCG	2	6	876308	876313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392402403
17354	NC_018020	TCGC	2	8	876349	876356	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17355	NC_018020	GCAA	2	8	876368	876375	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17356	NC_018020	AGCC	2	8	876397	876404	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17357	NC_018020	AGC	2	6	876472	876477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17359	NC_018020	GAC	2	6	876604	876609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392402404
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17362	NC_018020	TGT	2	6	876663	876668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392402404
17363	NC_018020	AAC	2	6	876706	876711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392402404
17364	NC_018020	AGAA	2	8	876731	876738	75 %	0 %	25 %	0 %	392402404
17365	NC_018020	CAG	2	6	876748	876753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392402404
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17489	NC_018020	GCG	2	6	882467	882472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392402412
17490	NC_018020	CTT	2	6	882494	882499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392402412
17491	NC_018020	CG	4	8	882604	882611	0 %	0 %	50 %	50 %	392402412
17492	NC_018020	GC	3	6	882631	882636	0 %	0 %	50 %	50 %	392402412
17493	NC_018020	CGCA	2	8	882638	882645	25 %	0 %	25 %	50 %	392402412
17494	NC_018020	AC	3	6	882647	882652	50 %	0 %	0 %	50 %	392402412
17495	NC_018020	CGC	2	6	882915	882920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392402413
17496	NC_018020	CCG	2	6	882930	882935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392402413
17497	NC_018020	A	6	6	882936	882941	100 %	0 %	0 %	0 %	392402413
17498	NC_018020	GTC	2	6	882977	882982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392402413
17499	NC_018020	CG	3	6	883150	883155	0 %	0 %	50 %	50 %	392402413
17500	NC_018020	GCGA	2	8	883164	883171	25 %	0 %	50 %	25 %	392402413

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