MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Turneriella parva DSM 21527 chromosome

Total Repeats: 87555

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
64501	NC_018020	GGC	2	6	3218399	3218404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392404614
64502	NC_018020	CTA	2	6	3218422	3218427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392404614
64503	NC_018020	TGG	2	6	3218447	3218452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392404614
64504	NC_018020	ATG	2	6	3218453	3218458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392404614
64505	NC_018020	CTT	2	6	3218467	3218472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392404614
64506	NC_018020	GCG	2	6	3218497	3218502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392404614
64507	NC_018020	GTG	2	6	3218510	3218515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392404614
64508	NC_018020	GTGC	2	8	3218522	3218529	0 %	25 %	50 %	25 %	392404614
64509	NC_018020	CA	3	6	3218542	3218547	50 %	0 %	0 %	50 %	392404614
64510	NC_018020	GGT	2	6	3218624	3218629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392404614
64511	NC_018020	GCAG	2	8	3218684	3218691	25 %	0 %	50 %	25 %	392404614
64512	NC_018020	CGG	2	6	3218704	3218709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392404614
64513	NC_018020	TTC	2	6	3218780	3218785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392404614
64514	NC_018020	CGA	2	6	3218832	3218837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392404614
64515	NC_018020	CGG	2	6	3218841	3218846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392404614
64516	NC_018020	CAAT	2	8	3218850	3218857	50 %	25 %	0 %	25 %	392404614
64517	NC_018020	GCG	2	6	3218870	3218875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392404614
64518	NC_018020	GCA	2	6	3218881	3218886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392404614
64519	NC_018020	ACT	2	6	3218901	3218906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392404614
64520	NC_018020	AT	3	6	3218963	3218968	50 %	50 %	0 %	0 %	392404614
64521	NC_018020	GGTT	2	8	3219002	3219009	0 %	50 %	50 %	0 %	392404614
64522	NC_018020	CCG	2	6	3219061	3219066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392404614
64523	NC_018020	CGC	2	6	3219090	3219095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392404615
64524	NC_018020	CG	3	6	3219107	3219112	0 %	0 %	50 %	50 %	392404615
64525	NC_018020	CT	3	6	3219120	3219125	0 %	50 %	0 %	50 %	392404615
64526	NC_018020	AAAG	2	8	3219173	3219180	75 %	0 %	25 %	0 %	392404615
64527	NC_018020	AGC	2	6	3219216	3219221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392404615
64528	NC_018020	CAC	2	6	3219349	3219354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392404615
64529	NC_018020	TCA	2	6	3219385	3219390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392404615
64530	NC_018020	CGC	2	6	3219413	3219418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392404615
64531	NC_018020	AAGA	2	8	3219432	3219439	75 %	0 %	25 %	0 %	392404615
64532	NC_018020	GCG	2	6	3219469	3219474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392404615
64533	NC_018020	CAG	2	6	3219529	3219534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392404615
64534	NC_018020	GCC	2	6	3219559	3219564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392404615
64535	NC_018020	TTTCTC	2	12	3219565	3219576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392404615
64536	NC_018020	GC	3	6	3219609	3219614	0 %	0 %	50 %	50 %	392404615
64537	NC_018020	G	6	6	3219638	3219643	0 %	0 %	100 %	0 %	392404615
64538	NC_018020	CTT	2	6	3219650	3219655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392404615
64539	NC_018020	CGC	2	6	3219669	3219674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392404615
64540	NC_018020	GCC	2	6	3219724	3219729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392404615
64541	NC_018020	ACT	2	6	3219779	3219784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392404615
64542	NC_018020	AG	3	6	3219786	3219791	50 %	0 %	50 %	0 %	392404615
64543	NC_018020	ATCG	2	8	3219812	3219819	25 %	25 %	25 %	25 %	392404615
64544	NC_018020	TGC	2	6	3219926	3219931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392404615
64545	NC_018020	CTT	2	6	3220000	3220005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392404616
64546	NC_018020	AC	3	6	3220030	3220035	50 %	0 %	0 %	50 %	392404616
64547	NC_018020	GTG	2	6	3220117	3220122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392404616
64548	NC_018020	CGC	2	6	3220126	3220131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392404616
64549	NC_018020	GC	4	8	3220186	3220193	0 %	0 %	50 %	50 %	392404616
64550	NC_018020	TTCGG	2	10	3220204	3220213	0 %	40 %	40 %	20 %	392404616
64551	NC_018020	TTG	2	6	3220252	3220257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392404616
64552	NC_018020	CCTG	2	8	3220263	3220270	0 %	25 %	25 %	50 %	392404616
64553	NC_018020	CG	3	6	3220356	3220361	0 %	0 %	50 %	50 %	392404616
64554	NC_018020	CGG	2	6	3220466	3220471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392404616
64555	NC_018020	TGC	2	6	3220640	3220645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392404616
64556	NC_018020	CGA	2	6	3220707	3220712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392404616
64557	NC_018020	GCA	2	6	3220719	3220724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392404616
64558	NC_018020	CTT	2	6	3220734	3220739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392404616
64559	NC_018020	GCC	2	6	3220807	3220812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392404616
64560	NC_018020	ACC	2	6	3220829	3220834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392404616
64561	NC_018020	GC	3	6	3220858	3220863	0 %	0 %	50 %	50 %	392404616
64562	NC_018020	CG	3	6	3220904	3220909	0 %	0 %	50 %	50 %	392404616
64563	NC_018020	TCG	2	6	3220913	3220918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392404616
64564	NC_018020	T	7	7	3220934	3220940	0 %	100 %	0 %	0 %	392404616
64565	NC_018020	TCT	2	6	3220952	3220957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392404616
64566	NC_018020	CTG	2	6	3220969	3220974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392404616
64567	NC_018020	GCTG	2	8	3221045	3221052	0 %	25 %	50 %	25 %	392404616
64568	NC_018020	TCG	2	6	3221093	3221098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392404616
64569	NC_018020	GGCA	2	8	3221123	3221130	25 %	0 %	50 %	25 %	392404616
64570	NC_018020	GC	3	6	3221167	3221172	0 %	0 %	50 %	50 %	392404616
64571	NC_018020	AGC	2	6	3221195	3221200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392404616
64572	NC_018020	GC	3	6	3221217	3221222	0 %	0 %	50 %	50 %	392404616
64573	NC_018020	CAGG	2	8	3221250	3221257	25 %	0 %	50 %	25 %	392404616
64574	NC_018020	CGA	2	6	3221267	3221272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392404616
64575	NC_018020	GCG	2	6	3221305	3221310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392404616
64576	NC_018020	GCC	2	6	3221314	3221319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392404616
64577	NC_018020	GAAC	2	8	3221325	3221332	50 %	0 %	25 %	25 %	392404616
64578	NC_018020	AACGC	2	10	3221347	3221356	40 %	0 %	20 %	40 %	392404616
64579	NC_018020	AT	3	6	3221477	3221482	50 %	50 %	0 %	0 %	392404616
64580	NC_018020	ACG	2	6	3221591	3221596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392404616
64581	NC_018020	AGGC	2	8	3221614	3221621	25 %	0 %	50 %	25 %	392404616
64582	NC_018020	CAG	2	6	3221644	3221649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392404616
64583	NC_018020	CG	4	8	3221724	3221731	0 %	0 %	50 %	50 %	392404616
64584	NC_018020	CTG	2	6	3221803	3221808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64585	NC_018020	TGC	2	6	3221830	3221835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392404617
64586	NC_018020	CGC	2	6	3221859	3221864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392404617
64587	NC_018020	GCG	2	6	3221867	3221872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392404617
64588	NC_018020	ACA	2	6	3221878	3221883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392404617
64589	NC_018020	GTT	2	6	3221897	3221902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392404617
64590	NC_018020	GCCA	2	8	3221922	3221929	25 %	0 %	25 %	50 %	392404617
64591	NC_018020	CG	3	6	3221988	3221993	0 %	0 %	50 %	50 %	392404617
64592	NC_018020	CGT	2	6	3222001	3222006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392404617
64593	NC_018020	GC	4	8	3222083	3222090	0 %	0 %	50 %	50 %	392404617
64594	NC_018020	TGC	2	6	3222114	3222119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392404617
64595	NC_018020	AGT	2	6	3222190	3222195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392404617
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64597	NC_018020	CGG	2	6	3222283	3222288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392404617
64598	NC_018020	TCG	2	6	3222351	3222356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392404617
64599	NC_018020	AGA	2	6	3222441	3222446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392404617
64600	NC_018020	CG	4	8	3222499	3222506	0 %	0 %	50 %	50 %	392404617
64601	NC_018020	GCT	2	6	3222557	3222562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392404617
64602	NC_018020	GCAG	2	8	3222568	3222575	25 %	0 %	50 %	25 %	392404617
64603	NC_018020	CAA	2	6	3222643	3222648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392404617
64604	NC_018020	ACCTAT	2	12	3222662	3222673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392404617
64605	NC_018020	T	6	6	3222724	3222729	0 %	100 %	0 %	0 %	392404617
64606	NC_018020	CGG	2	6	3222793	3222798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392404617
64607	NC_018020	GAT	2	6	3222836	3222841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392404617
64608	NC_018020	CGA	3	9	3223014	3223022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392404617
64609	NC_018020	CGG	3	9	3223051	3223059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392404617
64610	NC_018020	CG	3	6	3223060	3223065	0 %	0 %	50 %	50 %	392404617
64611	NC_018020	AGG	2	6	3223084	3223089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64612	NC_018020	GC	3	6	3223130	3223135	0 %	0 %	50 %	50 %	392404618
64613	NC_018020	AGA	2	6	3223161	3223166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392404618
64614	NC_018020	AAC	2	6	3223225	3223230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392404618
64615	NC_018020	GTA	2	6	3223282	3223287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392404618
64616	NC_018020	ACG	2	6	3223312	3223317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392404618
64617	NC_018020	CG	3	6	3223400	3223405	0 %	0 %	50 %	50 %	392404618
64618	NC_018020	AAC	2	6	3223471	3223476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392404618
64619	NC_018020	TAT	2	6	3223477	3223482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392404618
64620	NC_018020	ATGT	2	8	3223580	3223587	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64621	NC_018020	TCC	2	6	3223675	3223680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64622	NC_018020	TCC	2	6	3223694	3223699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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64718	NC_018020	A	7	7	3228003	3228009	100 %	0 %	0 %	0 %	392404621
64719	NC_018020	CTT	2	6	3228021	3228026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392404621
64720	NC_018020	TC	3	6	3228036	3228041	0 %	50 %	0 %	50 %	392404621
64721	NC_018020	TGT	2	6	3228053	3228058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392404621
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64723	NC_018020	TCG	2	6	3228148	3228153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392404621
64724	NC_018020	GGCT	2	8	3228156	3228163	0 %	25 %	50 %	25 %	392404621
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64727	NC_018020	TG	3	6	3228248	3228253	0 %	50 %	50 %	0 %	392404621
64728	NC_018020	A	7	7	3228315	3228321	100 %	0 %	0 %	0 %	392404621
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64730	NC_018020	CTTT	2	8	3228380	3228387	0 %	75 %	0 %	25 %	392404621
64731	NC_018020	CAAGG	2	10	3228425	3228434	40 %	0 %	40 %	20 %	392404621
64732	NC_018020	GAC	2	6	3228445	3228450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392404621
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64734	NC_018020	T	6	6	3228497	3228502	0 %	100 %	0 %	0 %	392404622
64735	NC_018020	TCA	2	6	3228551	3228556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392404623
64736	NC_018020	GAA	2	6	3228594	3228599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392404623
64737	NC_018020	AAG	2	6	3228625	3228630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392404623
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64739	NC_018020	AGAA	2	8	3228737	3228744	75 %	0 %	25 %	0 %	392404623
64740	NC_018020	GCT	2	6	3228747	3228752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392404623
64741	NC_018020	CTG	2	6	3228757	3228762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392404623
64742	NC_018020	GCTG	2	8	3228829	3228836	0 %	25 %	50 %	25 %	392404623
64743	NC_018020	GTG	2	6	3228874	3228879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392404623
64744	NC_018020	AGCAA	2	10	3228889	3228898	60 %	0 %	20 %	20 %	392404623
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64746	NC_018020	CGC	2	6	3228977	3228982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392404623
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64750	NC_018020	CGATG	2	10	3229074	3229083	20 %	20 %	40 %	20 %	392404623
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64754	NC_018020	AGG	2	6	3229484	3229489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392404623
64755	NC_018020	T	6	6	3229502	3229507	0 %	100 %	0 %	0 %	392404624
64756	NC_018020	T	6	6	3229524	3229529	0 %	100 %	0 %	0 %	392404624
64757	NC_018020	GAC	2	6	3229539	3229544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392404624
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64761	NC_018020	CG	3	6	3229622	3229627	0 %	0 %	50 %	50 %	392404624
64762	NC_018020	CGC	2	6	3229647	3229652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392404624
64763	NC_018020	CGA	2	6	3229709	3229714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392404624
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64765	NC_018020	ACCATG	2	12	3229762	3229773	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	392404624
64766	NC_018020	TGA	2	6	3229778	3229783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392404624
64767	NC_018020	GAC	2	6	3229794	3229799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392404624
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64770	NC_018020	GCT	2	6	3229924	3229929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392404625
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64834	NC_018020	AAC	2	6	3233428	3233433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392404627
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64851	NC_018020	GTG	2	6	3234133	3234138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392404628
64852	NC_018020	TGC	3	9	3234168	3234176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392404628
64853	NC_018020	TG	3	6	3234202	3234207	0 %	50 %	50 %	0 %	392404628
64854	NC_018020	GCG	2	6	3234210	3234215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392404628
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64859	NC_018020	CCG	2	6	3234393	3234398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392404628
64860	NC_018020	TG	3	6	3234457	3234462	0 %	50 %	50 %	0 %	392404628
64861	NC_018020	GCG	2	6	3234495	3234500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392404628
64862	NC_018020	CTG	2	6	3234619	3234624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392404628
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64874	NC_018020	T	6	6	3235059	3235064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64875	NC_018020	AT	3	6	3235074	3235079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64876	NC_018020	T	13	13	3235079	3235091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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64970	NC_018020	TCG	2	6	3239856	3239861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392404634
64971	NC_018020	AGT	2	6	3239884	3239889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392404634
64972	NC_018020	CAG	2	6	3239915	3239920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392404634
64973	NC_018020	TTG	2	6	3239922	3239927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392404634
64974	NC_018020	CG	3	6	3240011	3240016	0 %	0 %	50 %	50 %	392404634
64975	NC_018020	TAG	2	6	3240132	3240137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392404634
64976	NC_018020	ATC	2	6	3240183	3240188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392404634
64977	NC_018020	GTCG	2	8	3240229	3240236	0 %	25 %	50 %	25 %	392404634
64978	NC_018020	TCG	3	9	3240484	3240492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392404634
64979	NC_018020	TCG	2	6	3240496	3240501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392404634
64980	NC_018020	GCA	2	6	3240532	3240537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392404634
64981	NC_018020	GC	3	6	3240599	3240604	0 %	0 %	50 %	50 %	392404634
64982	NC_018020	AAT	2	6	3240617	3240622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392404634
64983	NC_018020	GCG	2	6	3240652	3240657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392404634
64984	NC_018020	GTC	2	6	3240663	3240668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392404634
64985	NC_018020	AAG	2	6	3240720	3240725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392404634
64986	NC_018020	TGAAGT	2	12	3240751	3240762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392404634
64987	NC_018020	AGC	2	6	3240858	3240863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392404634
64988	NC_018020	TTC	2	6	3240872	3240877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392404634
64989	NC_018020	CTT	2	6	3240913	3240918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392404634
64990	NC_018020	GGC	2	6	3240924	3240929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392404634
64991	NC_018020	CAT	2	6	3240994	3240999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392404634
64992	NC_018020	TGT	2	6	3241044	3241049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392404634
64993	NC_018020	ACG	2	6	3241110	3241115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392404634
64994	NC_018020	AAG	2	6	3241134	3241139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392404634
64995	NC_018020	AAGC	2	8	3241196	3241203	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
64996	NC_018020	GC	5	10	3241255	3241264	0 %	0 %	50 %	50 %	392404635
64997	NC_018020	CTT	2	6	3241274	3241279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392404635
64998	NC_018020	CGC	2	6	3241302	3241307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392404635
64999	NC_018020	CTT	2	6	3241334	3241339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392404635
65000	NC_018020	GGC	2	6	3241423	3241428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392404635

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