MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Turneriella parva DSM 21527 chromosome

Total Repeats: 87555

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_018020	CGC	2	6	313028	313033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392401879
6002	NC_018020	TCT	2	6	313077	313082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392401879
6003	NC_018020	GAA	2	6	313084	313089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392401879
6004	NC_018020	CG	3	6	313097	313102	0 %	0 %	50 %	50 %	392401879
6005	NC_018020	CTA	2	6	313168	313173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392401879
6006	NC_018020	TGC	2	6	313209	313214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401879
6007	NC_018020	GCA	2	6	313229	313234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401879
6008	NC_018020	TTC	3	9	313235	313243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392401879
6009	NC_018020	GGC	3	9	313324	313332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392401879
6010	NC_018020	A	6	6	313337	313342	100 %	0 %	0 %	0 %	392401879
6011	NC_018020	CTG	2	6	313400	313405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401879
6012	NC_018020	AG	3	6	313421	313426	50 %	0 %	50 %	0 %	392401879
6013	NC_018020	TGG	2	6	313433	313438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392401879
6014	NC_018020	CAC	2	6	313465	313470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392401879
6015	NC_018020	ATC	2	6	313490	313495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392401879
6016	NC_018020	TACG	2	8	313520	313527	25 %	25 %	25 %	25 %	392401879
6017	NC_018020	GAG	2	6	313627	313632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392401879
6018	NC_018020	AGCC	2	8	313747	313754	25 %	0 %	25 %	50 %	392401879
6019	NC_018020	TC	3	6	313764	313769	0 %	50 %	0 %	50 %	392401879
6020	NC_018020	AG	4	8	313778	313785	50 %	0 %	50 %	0 %	392401879
6021	NC_018020	AGA	2	6	313820	313825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392401879
6022	NC_018020	GCT	3	9	314033	314041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401879
6023	NC_018020	GGC	2	6	314114	314119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392401879
6024	NC_018020	GA	3	6	314219	314224	50 %	0 %	50 %	0 %	392401879
6025	NC_018020	AAGC	2	8	314227	314234	50 %	0 %	25 %	25 %	392401879
6026	NC_018020	AGT	2	6	314244	314249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_018020	TCA	2	6	314518	314523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392401880
6028	NC_018020	TCCTTT	2	12	314525	314536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392401880
6029	NC_018020	TTC	2	6	314547	314552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392401880
6030	NC_018020	ATC	2	6	314581	314586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392401880
6031	NC_018020	CAAC	2	8	314636	314643	50 %	0 %	0 %	50 %	392401880
6032	NC_018020	TCA	2	6	314836	314841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392401880
6033	NC_018020	ACA	2	6	314971	314976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392401880
6034	NC_018020	A	7	7	315008	315014	100 %	0 %	0 %	0 %	392401880
6035	NC_018020	CGC	2	6	315100	315105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392401881
6036	NC_018020	A	7	7	315131	315137	100 %	0 %	0 %	0 %	392401881
6037	NC_018020	AAAC	2	8	315157	315164	75 %	0 %	0 %	25 %	392401881
6038	NC_018020	CGAC	2	8	315170	315177	25 %	0 %	25 %	50 %	392401881
6039	NC_018020	ATGCG	2	10	315197	315206	20 %	20 %	40 %	20 %	392401881
6040	NC_018020	T	6	6	315241	315246	0 %	100 %	0 %	0 %	392401881
6041	NC_018020	GAA	2	6	315363	315368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392401881
6042	NC_018020	GAC	2	6	315382	315387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401881
6043	NC_018020	GCA	3	9	315403	315411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401882
6044	NC_018020	CCGG	2	8	315465	315472	0 %	0 %	50 %	50 %	392401882
6045	NC_018020	ACC	2	6	315486	315491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392401882
6046	NC_018020	GTT	2	6	315502	315507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392401882
6047	NC_018020	GCT	2	6	315607	315612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401882
6048	NC_018020	GA	3	6	315666	315671	50 %	0 %	50 %	0 %	392401882
6049	NC_018020	CG	3	6	315702	315707	0 %	0 %	50 %	50 %	392401882
6050	NC_018020	GCG	2	6	315753	315758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392401882
6051	NC_018020	GC	3	6	315828	315833	0 %	0 %	50 %	50 %	392401882
6052	NC_018020	CA	3	6	315877	315882	50 %	0 %	0 %	50 %	392401882
6053	NC_018020	CCG	2	6	316068	316073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392401882
6054	NC_018020	GGC	2	6	316082	316087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392401882
6055	NC_018020	GTC	2	6	316145	316150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401882
6056	NC_018020	TTC	2	6	316265	316270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392401882
6057	NC_018020	GCC	2	6	316319	316324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392401882
6058	NC_018020	CGG	2	6	316419	316424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392401882
6059	NC_018020	CGCC	2	8	316430	316437	0 %	0 %	25 %	75 %	392401882
6060	NC_018020	GCAG	2	8	316563	316570	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6061	NC_018020	CGG	2	6	316666	316671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_018020	T	7	7	316672	316678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_018020	T	6	6	316685	316690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_018020	GAC	2	6	316732	316737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401883
6065	NC_018020	GAT	2	6	316751	316756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392401883
6066	NC_018020	GGC	2	6	316780	316785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392401883
6067	NC_018020	GCG	2	6	316876	316881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392401883
6068	NC_018020	CAG	2	6	316926	316931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401883
6069	NC_018020	CA	3	6	316979	316984	50 %	0 %	0 %	50 %	392401883
6070	NC_018020	GC	3	6	317027	317032	0 %	0 %	50 %	50 %	392401884
6071	NC_018020	GAA	2	6	317062	317067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392401884
6072	NC_018020	GCT	2	6	317103	317108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401884
6073	NC_018020	GCG	2	6	317111	317116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392401884
6074	NC_018020	T	6	6	317152	317157	0 %	100 %	0 %	0 %	392401884
6075	NC_018020	GAT	2	6	317169	317174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392401884
6076	NC_018020	GCT	2	6	317203	317208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401884
6077	NC_018020	AG	3	6	317227	317232	50 %	0 %	50 %	0 %	392401884
6078	NC_018020	GCA	2	6	317498	317503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401885
6079	NC_018020	TCGT	2	8	317518	317525	0 %	50 %	25 %	25 %	392401885
6080	NC_018020	CT	3	6	317528	317533	0 %	50 %	0 %	50 %	392401885
6081	NC_018020	TGC	2	6	317581	317586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401885
6082	NC_018020	CGTT	2	8	317641	317648	0 %	50 %	25 %	25 %	392401885
6083	NC_018020	CG	3	6	317669	317674	0 %	0 %	50 %	50 %	392401885
6084	NC_018020	CGC	2	6	317715	317720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392401885
6085	NC_018020	CGA	2	6	317744	317749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401885
6086	NC_018020	GCGTC	2	10	317814	317823	0 %	20 %	40 %	40 %	392401885
6087	NC_018020	A	6	6	317853	317858	100 %	0 %	0 %	0 %	392401885
6088	NC_018020	GCG	2	6	317910	317915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392401885
6089	NC_018020	TGCA	2	8	317977	317984	25 %	25 %	25 %	25 %	392401885
6090	NC_018020	CG	3	6	318139	318144	0 %	0 %	50 %	50 %	392401885
6091	NC_018020	TC	3	6	318176	318181	0 %	50 %	0 %	50 %	392401885
6092	NC_018020	TGGC	2	8	318223	318230	0 %	25 %	50 %	25 %	392401885
6093	NC_018020	TCT	2	6	318253	318258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392401885
6094	NC_018020	TCA	2	6	318271	318276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392401885
6095	NC_018020	GAC	2	6	318433	318438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6096	NC_018020	ACA	2	6	318446	318451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6097	NC_018020	TGC	2	6	318490	318495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6098	NC_018020	TGA	2	6	318593	318598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392401886
6099	NC_018020	TGCTGG	2	12	318605	318616	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	392401886
6100	NC_018020	CG	4	8	318648	318655	0 %	0 %	50 %	50 %	392401886
6101	NC_018020	CCG	2	6	318674	318679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392401886
6102	NC_018020	ACG	2	6	318713	318718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401886
6103	NC_018020	GTCTT	2	10	318728	318737	0 %	60 %	20 %	20 %	392401886
6104	NC_018020	GCTC	2	8	318762	318769	0 %	25 %	25 %	50 %	392401886
6105	NC_018020	CT	4	8	318796	318803	0 %	50 %	0 %	50 %	392401886
6106	NC_018020	TC	3	6	318824	318829	0 %	50 %	0 %	50 %	392401886
6107	NC_018020	CCG	2	6	318938	318943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392401886
6108	NC_018020	CGC	2	6	318985	318990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392401886
6109	NC_018020	TGC	2	6	319034	319039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401886
6110	NC_018020	AGC	2	6	319064	319069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401886
6111	NC_018020	CGA	2	6	319080	319085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401886
6112	NC_018020	AAG	2	6	319103	319108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392401886
6113	NC_018020	CGC	2	6	319206	319211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392401887
6114	NC_018020	CAT	2	6	319255	319260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392401887
6115	NC_018020	GCA	2	6	319378	319383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401887
6116	NC_018020	CAC	2	6	319483	319488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392401887
6117	NC_018020	CTG	2	6	319539	319544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401887
6118	NC_018020	GC	3	6	319554	319559	0 %	0 %	50 %	50 %	392401887
6119	NC_018020	CGAT	2	8	319576	319583	25 %	25 %	25 %	25 %	392401887
6120	NC_018020	TC	3	6	319610	319615	0 %	50 %	0 %	50 %	392401887
6121	NC_018020	TGC	2	6	319814	319819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401887
6122	NC_018020	GC	3	6	319821	319826	0 %	0 %	50 %	50 %	392401887
6123	NC_018020	AGA	2	6	319896	319901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392401888
6124	NC_018020	GCG	2	6	319978	319983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392401888
6125	NC_018020	CTT	2	6	320035	320040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392401888
6126	NC_018020	GCC	2	6	320051	320056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392401888
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6130	NC_018020	CG	3	6	320235	320240	0 %	0 %	50 %	50 %	392401888
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6143	NC_018020	A	6	6	320651	320656	100 %	0 %	0 %	0 %	392401888
6144	NC_018020	GCC	2	6	320825	320830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392401888
6145	NC_018020	A	8	8	320936	320943	100 %	0 %	0 %	0 %	392401888
6146	NC_018020	GAT	2	6	320951	320956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392401888
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6148	NC_018020	GAC	2	6	321008	321013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401888
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6151	NC_018020	CTCA	2	8	321138	321145	25 %	25 %	0 %	50 %	392401889
6152	NC_018020	GC	3	6	321160	321165	0 %	0 %	50 %	50 %	392401889
6153	NC_018020	TG	3	6	321175	321180	0 %	50 %	50 %	0 %	392401889
6154	NC_018020	GCG	2	6	321242	321247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392401889
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6156	NC_018020	GCTT	2	8	321314	321321	0 %	50 %	25 %	25 %	392401889
6157	NC_018020	CGTCG	2	10	321411	321420	0 %	20 %	40 %	40 %	392401889
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6160	NC_018020	GC	3	6	321535	321540	0 %	0 %	50 %	50 %	392401889
6161	NC_018020	GCT	2	6	321647	321652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401889
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6185	NC_018020	CTG	2	6	322942	322947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401890
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6230	NC_018020	GC	3	6	325771	325776	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6231	NC_018020	CTT	2	6	325985	325990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392401893
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6238	NC_018020	CCCAG	2	10	326413	326422	20 %	0 %	20 %	60 %	392401893
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6243	NC_018020	CAT	2	6	326561	326566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392401893
6244	NC_018020	A	6	6	326667	326672	100 %	0 %	0 %	0 %	392401893
6245	NC_018020	TCG	2	6	326692	326697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401893
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6247	NC_018020	TCG	2	6	326775	326780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401893
6248	NC_018020	CAT	2	6	326798	326803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392401893
6249	NC_018020	GCT	2	6	326870	326875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401893
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6256	NC_018020	ATG	2	6	327227	327232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392401894
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6269	NC_018020	GA	3	6	328146	328151	50 %	0 %	50 %	0 %	392401894
6270	NC_018020	TCG	2	6	328230	328235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401895
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6272	NC_018020	CG	4	8	328282	328289	0 %	0 %	50 %	50 %	392401895
6273	NC_018020	TTTG	2	8	328299	328306	0 %	75 %	25 %	0 %	392401895
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6279	NC_018020	GTTG	2	8	328755	328762	0 %	50 %	50 %	0 %	392401895
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6282	NC_018020	T	6	6	328924	328929	0 %	100 %	0 %	0 %	392401895
6283	NC_018020	GCC	2	6	328930	328935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392401895
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6292	NC_018020	CAC	2	6	329547	329552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392401895
6293	NC_018020	A	7	7	329615	329621	100 %	0 %	0 %	0 %	392401896
6294	NC_018020	TTA	2	6	329627	329632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392401896
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6296	NC_018020	CTTGCA	2	12	329654	329665	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	392401896
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6299	NC_018020	AAG	2	6	329837	329842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392401896
6300	NC_018020	ACGA	2	8	329877	329884	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6301	NC_018020	TCA	2	6	329980	329985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392401897
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6303	NC_018020	TTGCA	2	10	330040	330049	20 %	40 %	20 %	20 %	392401897
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6305	NC_018020	TGC	2	6	330223	330228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401897
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6308	NC_018020	A	6	6	330361	330366	100 %	0 %	0 %	0 %	392401897
6309	NC_018020	GCT	3	9	330377	330385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401897
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6319	NC_018020	AC	3	6	330981	330986	50 %	0 %	0 %	50 %	392401897
6320	NC_018020	AAT	2	6	331008	331013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392401897
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6322	NC_018020	TCT	2	6	331130	331135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392401897
6323	NC_018020	A	6	6	331140	331145	100 %	0 %	0 %	0 %	392401897
6324	NC_018020	GTGC	2	8	331200	331207	0 %	25 %	50 %	25 %	392401897
6325	NC_018020	GCCG	2	8	331226	331233	0 %	0 %	50 %	50 %	392401897
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6331	NC_018020	ACG	3	9	331515	331523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401898
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6333	NC_018020	GGTC	2	8	331586	331593	0 %	25 %	50 %	25 %	392401898
6334	NC_018020	CGAA	2	8	331597	331604	50 %	0 %	25 %	25 %	392401898
6335	NC_018020	CG	3	6	331659	331664	0 %	0 %	50 %	50 %	392401898
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6343	NC_018020	CAG	2	6	332208	332213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401899
6344	NC_018020	TCGCT	2	10	332244	332253	0 %	40 %	20 %	40 %	392401900
6345	NC_018020	T	8	8	332369	332376	0 %	100 %	0 %	0 %	392401900
6346	NC_018020	TGC	2	6	332417	332422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401900
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6348	NC_018020	GTTG	2	8	332470	332477	0 %	50 %	50 %	0 %	392401900
6349	NC_018020	GCTCAT	2	12	332486	332497	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	392401900
6350	NC_018020	TGGC	2	8	332509	332516	0 %	25 %	50 %	25 %	392401900
6351	NC_018020	TGC	3	9	332545	332553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401900
6352	NC_018020	GCA	2	6	332562	332567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401900
6353	NC_018020	CTG	2	6	332589	332594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401900
6354	NC_018020	CGC	2	6	332615	332620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392401900
6355	NC_018020	GCT	2	6	332633	332638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401900
6356	NC_018020	CAA	2	6	332674	332679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392401900
6357	NC_018020	GCA	2	6	332691	332696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401900
6358	NC_018020	TGC	2	6	332732	332737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401900
6359	NC_018020	TGCA	2	8	332752	332759	25 %	25 %	25 %	25 %	392401900
6360	NC_018020	TGA	2	6	332870	332875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392401900
6361	NC_018020	TCG	2	6	332944	332949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401900
6362	NC_018020	TCG	2	6	333106	333111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401900
6363	NC_018020	AGA	3	9	333137	333145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392401900
6364	NC_018020	GC	3	6	333159	333164	0 %	0 %	50 %	50 %	392401900
6365	NC_018020	CG	3	6	333176	333181	0 %	0 %	50 %	50 %	392401900
6366	NC_018020	AAG	2	6	333183	333188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392401900
6367	NC_018020	ATT	2	6	333207	333212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392401900
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6369	NC_018020	AGCC	2	8	333229	333236	25 %	0 %	25 %	50 %	392401900
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6493	NC_018020	TGC	2	6	339573	339578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6494	NC_018020	TTG	2	6	339692	339697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6495	NC_018020	GCC	2	6	339701	339706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6496	NC_018020	TGT	2	6	339750	339755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6497	NC_018020	GCC	2	6	339770	339775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6498	NC_018020	CCG	2	6	339813	339818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6499	NC_018020	TTTC	2	8	339868	339875	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6500	NC_018020	TGA	2	6	339924	339929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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