MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Turneriella parva DSM 21527 chromosome

Total Repeats: 87555

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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64002	NC_018020	CCG	2	6	3194601	3194606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392404592
64003	NC_018020	GCG	2	6	3194651	3194656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392404592
64004	NC_018020	CGA	2	6	3194738	3194743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392404592
64005	NC_018020	GCC	2	6	3194769	3194774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392404592
64006	NC_018020	TGC	2	6	3194789	3194794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392404592
64007	NC_018020	GCCTT	2	10	3194864	3194873	0 %	40 %	20 %	40 %	392404593
64008	NC_018020	GAT	2	6	3194878	3194883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392404593
64009	NC_018020	T	6	6	3194974	3194979	0 %	100 %	0 %	0 %	392404593
64010	NC_018020	TGC	2	6	3195072	3195077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392404593
64011	NC_018020	CCG	2	6	3195101	3195106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392404593
64012	NC_018020	TTC	2	6	3195188	3195193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392404593
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64014	NC_018020	TGC	3	9	3195300	3195308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392404593
64015	NC_018020	T	6	6	3195319	3195324	0 %	100 %	0 %	0 %	392404593
64016	NC_018020	TCT	2	6	3195419	3195424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392404593
64017	NC_018020	CG	3	6	3195466	3195471	0 %	0 %	50 %	50 %	392404593
64018	NC_018020	GAT	2	6	3195478	3195483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392404593
64019	NC_018020	GTT	2	6	3195505	3195510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392404593
64020	NC_018020	T	6	6	3195509	3195514	0 %	100 %	0 %	0 %	392404593
64021	NC_018020	GC	3	6	3195614	3195619	0 %	0 %	50 %	50 %	392404593
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64031	NC_018020	GTT	2	6	3195870	3195875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392404594
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64033	NC_018020	A	8	8	3195920	3195927	100 %	0 %	0 %	0 %	392404594
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64044	NC_018020	GC	3	6	3196523	3196528	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64045	NC_018020	ATAAA	2	10	3196529	3196538	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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64118	NC_018020	CG	3	6	3200399	3200404	0 %	0 %	50 %	50 %	392404598
64119	NC_018020	AGC	2	6	3200424	3200429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392404598
64120	NC_018020	ATG	2	6	3200432	3200437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392404598
64121	NC_018020	GAA	2	6	3200447	3200452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392404598
64122	NC_018020	GTGC	2	8	3200476	3200483	0 %	25 %	50 %	25 %	392404598
64123	NC_018020	ATC	2	6	3200514	3200519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392404598
64124	NC_018020	GGC	2	6	3200560	3200565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392404598
64125	NC_018020	ATCC	2	8	3200616	3200623	25 %	25 %	0 %	50 %	392404598
64126	NC_018020	AGC	2	6	3200694	3200699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392404598
64127	NC_018020	GCC	2	6	3200747	3200752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392404598
64128	NC_018020	CGG	3	9	3200895	3200903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392404598
64129	NC_018020	AATCG	2	10	3200918	3200927	40 %	20 %	20 %	20 %	392404598
64130	NC_018020	CGT	2	6	3200941	3200946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392404598
64131	NC_018020	GC	3	6	3200947	3200952	0 %	0 %	50 %	50 %	392404598
64132	NC_018020	AGC	2	6	3200975	3200980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392404598
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64134	NC_018020	TCG	2	6	3201081	3201086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392404599
64135	NC_018020	CG	3	6	3201138	3201143	0 %	0 %	50 %	50 %	392404599
64136	NC_018020	ATCG	2	8	3201151	3201158	25 %	25 %	25 %	25 %	392404599
64137	NC_018020	CTGC	2	8	3201200	3201207	0 %	25 %	25 %	50 %	392404599
64138	NC_018020	T	6	6	3201271	3201276	0 %	100 %	0 %	0 %	392404599
64139	NC_018020	CTGC	2	8	3201285	3201292	0 %	25 %	25 %	50 %	392404599
64140	NC_018020	CGA	2	6	3201507	3201512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392404599
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64145	NC_018020	GCC	2	6	3201769	3201774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392404599
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64147	NC_018020	TGC	2	6	3201800	3201805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392404599
64148	NC_018020	CGC	2	6	3201876	3201881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392404599
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64150	NC_018020	AGAA	2	8	3201922	3201929	75 %	0 %	25 %	0 %	392404599
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64153	NC_018020	TGC	2	6	3202002	3202007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392404599
64154	NC_018020	GAT	2	6	3202013	3202018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392404599
64155	NC_018020	GCG	2	6	3202059	3202064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392404599
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64162	NC_018020	GCG	2	6	3202511	3202516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392404600
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64165	NC_018020	CCG	2	6	3202654	3202659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64166	NC_018020	G	6	6	3202721	3202726	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
64167	NC_018020	AAT	2	6	3202738	3202743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392404601
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64172	NC_018020	TCG	2	6	3202902	3202907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392404601
64173	NC_018020	TGC	2	6	3202995	3203000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392404601
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64185	NC_018020	GCT	2	6	3203539	3203544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392404601
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64188	NC_018020	GCCG	2	8	3203697	3203704	0 %	0 %	50 %	50 %	392404601
64189	NC_018020	A	8	8	3203738	3203745	100 %	0 %	0 %	0 %	392404601
64190	NC_018020	GCGCA	2	10	3203746	3203755	20 %	0 %	40 %	40 %	392404601
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64193	NC_018020	CGG	2	6	3203925	3203930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392404602
64194	NC_018020	TCT	2	6	3203982	3203987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392404602
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64199	NC_018020	TGC	3	9	3204086	3204094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392404602
64200	NC_018020	CGCAAA	2	12	3204115	3204126	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	392404602
64201	NC_018020	TTCATC	2	12	3204181	3204192	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64202	NC_018020	TGC	2	6	3204282	3204287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64203	NC_018020	GC	3	6	3204286	3204291	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64204	NC_018020	CAC	2	6	3204339	3204344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64205	NC_018020	GAT	2	6	3204345	3204350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392404603
64206	NC_018020	TGC	2	6	3204429	3204434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392404603
64207	NC_018020	AG	3	6	3204496	3204501	50 %	0 %	50 %	0 %	392404603
64208	NC_018020	GCAG	2	8	3204584	3204591	25 %	0 %	50 %	25 %	392404603
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64210	NC_018020	CG	3	6	3204688	3204693	0 %	0 %	50 %	50 %	392404604
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64212	NC_018020	CT	3	6	3204734	3204739	0 %	50 %	0 %	50 %	392404604
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64215	NC_018020	TCG	2	6	3204806	3204811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392404604
64216	NC_018020	CGAT	2	8	3204815	3204822	25 %	25 %	25 %	25 %	392404604
64217	NC_018020	GC	3	6	3204854	3204859	0 %	0 %	50 %	50 %	392404604
64218	NC_018020	CGT	2	6	3204876	3204881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392404604
64219	NC_018020	GAAA	2	8	3204891	3204898	75 %	0 %	25 %	0 %	392404604
64220	NC_018020	GC	3	6	3204967	3204972	0 %	0 %	50 %	50 %	392404604
64221	NC_018020	CCAGA	2	10	3205042	3205051	40 %	0 %	20 %	40 %	392404604
64222	NC_018020	GAC	2	6	3205128	3205133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392404604
64223	NC_018020	CGA	3	9	3205226	3205234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392404604
64224	NC_018020	GCA	2	6	3205455	3205460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392404604
64225	NC_018020	AGA	3	9	3205521	3205529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392404604
64226	NC_018020	TCTGC	2	10	3205580	3205589	0 %	40 %	20 %	40 %	392404605
64227	NC_018020	GGC	2	6	3205613	3205618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392404605
64228	NC_018020	TGC	2	6	3205747	3205752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392404605
64229	NC_018020	AAG	2	6	3205920	3205925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392404605
64230	NC_018020	ATA	2	6	3205933	3205938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392404605
64231	NC_018020	GGC	2	6	3206009	3206014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392404605
64232	NC_018020	GATG	2	8	3206015	3206022	25 %	25 %	50 %	0 %	392404605
64233	NC_018020	AAG	2	6	3206131	3206136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392404605
64234	NC_018020	CCG	2	6	3206192	3206197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392404605
64235	NC_018020	GCG	2	6	3206274	3206279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392404605
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64338	NC_018020	CG	3	6	3211192	3211197	0 %	0 %	50 %	50 %	392404608
64339	NC_018020	CGA	2	6	3211234	3211239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392404608
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64341	NC_018020	CAT	2	6	3211312	3211317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392404608
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64343	NC_018020	CTG	2	6	3211452	3211457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392404608
64344	NC_018020	GGGC	2	8	3211461	3211468	0 %	0 %	75 %	25 %	392404608
64345	NC_018020	GCCGC	2	10	3211503	3211512	0 %	0 %	40 %	60 %	392404608
64346	NC_018020	ATC	2	6	3211520	3211525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392404608
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64348	NC_018020	GTC	2	6	3211598	3211603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392404608
64349	NC_018020	GGC	2	6	3211661	3211666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392404608
64350	NC_018020	TTC	2	6	3211679	3211684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392404608
64351	NC_018020	GACA	2	8	3211690	3211697	50 %	0 %	25 %	25 %	392404608
64352	NC_018020	CT	4	8	3211758	3211765	0 %	50 %	0 %	50 %	392404608
64353	NC_018020	TGC	2	6	3211773	3211778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392404608
64354	NC_018020	GTC	2	6	3211832	3211837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392404608
64355	NC_018020	TA	3	6	3211877	3211882	50 %	50 %	0 %	0 %	392404608
64356	NC_018020	GC	3	6	3211929	3211934	0 %	0 %	50 %	50 %	392404609
64357	NC_018020	GCT	3	9	3212034	3212042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392404609
64358	NC_018020	ACTGCT	2	12	3212055	3212066	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	392404609
64359	NC_018020	CGCT	2	8	3212110	3212117	0 %	25 %	25 %	50 %	392404609
64360	NC_018020	CTA	2	6	3212175	3212180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392404609
64361	NC_018020	AT	3	6	3212192	3212197	50 %	50 %	0 %	0 %	392404609
64362	NC_018020	GCT	2	6	3212205	3212210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392404609
64363	NC_018020	CT	3	6	3212213	3212218	0 %	50 %	0 %	50 %	392404609
64364	NC_018020	CTT	2	6	3212253	3212258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392404609
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64367	NC_018020	A	6	6	3212444	3212449	100 %	0 %	0 %	0 %	392404610
64368	NC_018020	GCA	2	6	3212489	3212494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392404610
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64372	NC_018020	CTT	2	6	3212778	3212783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392404610
64373	NC_018020	GCT	2	6	3212943	3212948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392404610
64374	NC_018020	TCG	2	6	3213035	3213040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392404610
64375	NC_018020	GCC	2	6	3213108	3213113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392404610
64376	NC_018020	GCA	2	6	3213135	3213140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392404610
64377	NC_018020	CTG	2	6	3213160	3213165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392404610
64378	NC_018020	TTA	2	6	3213192	3213197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392404610
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64381	NC_018020	T	8	8	3213297	3213304	0 %	100 %	0 %	0 %	392404611
64382	NC_018020	CGG	2	6	3213315	3213320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392404611
64383	NC_018020	TCT	2	6	3213326	3213331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392404611
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64385	NC_018020	CG	3	6	3213392	3213397	0 %	0 %	50 %	50 %	392404611
64386	NC_018020	GTG	2	6	3213475	3213480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392404611
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64412	NC_018020	CGC	2	6	3214460	3214465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392404612
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64415	NC_018020	GCA	2	6	3214559	3214564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392404612
64416	NC_018020	GCG	2	6	3214606	3214611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392404612
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64421	NC_018020	GTTT	2	8	3214747	3214754	0 %	75 %	25 %	0 %	392404612
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64423	NC_018020	CAT	2	6	3214857	3214862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392404612
64424	NC_018020	GA	3	6	3214871	3214876	50 %	0 %	50 %	0 %	392404612
64425	NC_018020	GCC	2	6	3214890	3214895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392404612
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64428	NC_018020	CGC	2	6	3214950	3214955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392404612
64429	NC_018020	A	6	6	3214992	3214997	100 %	0 %	0 %	0 %	392404612
64430	NC_018020	ACC	2	6	3215053	3215058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392404612
64431	NC_018020	GTTT	2	8	3215068	3215075	0 %	75 %	25 %	0 %	392404612
64432	NC_018020	TG	3	6	3215147	3215152	0 %	50 %	50 %	0 %	392404612
64433	NC_018020	GCC	2	6	3215178	3215183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392404612
64434	NC_018020	GA	3	6	3215184	3215189	50 %	0 %	50 %	0 %	392404612
64435	NC_018020	CCGATG	2	12	3215197	3215208	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	392404612
64436	NC_018020	GCC	2	6	3215245	3215250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392404612
64437	NC_018020	CGGC	2	8	3215303	3215310	0 %	0 %	50 %	50 %	392404612
64438	NC_018020	TTG	2	6	3215386	3215391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392404612
64439	NC_018020	AG	3	6	3215424	3215429	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64440	NC_018020	TGC	2	6	3215494	3215499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392404613
64441	NC_018020	ATT	2	6	3215538	3215543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392404613
64442	NC_018020	A	6	6	3215567	3215572	100 %	0 %	0 %	0 %	392404613
64443	NC_018020	CGC	3	9	3215585	3215593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392404613
64444	NC_018020	ACG	2	6	3215623	3215628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392404613
64445	NC_018020	CG	3	6	3215627	3215632	0 %	0 %	50 %	50 %	392404613
64446	NC_018020	CAC	2	6	3215649	3215654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392404613
64447	NC_018020	AGC	2	6	3215710	3215715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392404613
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64449	NC_018020	CGC	2	6	3215824	3215829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392404613
64450	NC_018020	CGA	2	6	3215909	3215914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392404613
64451	NC_018020	GTG	2	6	3215943	3215948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392404613
64452	NC_018020	AAC	2	6	3216006	3216011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392404613
64453	NC_018020	TGC	2	6	3216014	3216019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392404613
64454	NC_018020	GC	3	6	3216143	3216148	0 %	0 %	50 %	50 %	392404613
64455	NC_018020	GCT	2	6	3216158	3216163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392404613
64456	NC_018020	GCG	2	6	3216186	3216191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392404613
64457	NC_018020	CAC	2	6	3216201	3216206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392404613
64458	NC_018020	TGC	2	6	3216290	3216295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64459	NC_018020	TCT	2	6	3216377	3216382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392404614
64460	NC_018020	AAG	2	6	3216564	3216569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392404614
64461	NC_018020	ACG	2	6	3216666	3216671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392404614
64462	NC_018020	CG	3	6	3216705	3216710	0 %	0 %	50 %	50 %	392404614
64463	NC_018020	CGA	2	6	3216736	3216741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392404614
64464	NC_018020	CAG	2	6	3216761	3216766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392404614
64465	NC_018020	AGA	2	6	3216781	3216786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392404614
64466	NC_018020	ACCG	2	8	3216797	3216804	25 %	0 %	25 %	50 %	392404614
64467	NC_018020	GCGT	2	8	3216870	3216877	0 %	25 %	50 %	25 %	392404614
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64469	NC_018020	TC	3	6	3217006	3217011	0 %	50 %	0 %	50 %	392404614
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