MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 40260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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40002	NC_018015	T	6	6	1936005	1936010	0 %	100 %	0 %	0 %	390962180
40003	NC_018015	TAT	2	6	1936041	1936046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390962180
40004	NC_018015	TTG	2	6	1936063	1936068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390962180
40005	NC_018015	GGT	2	6	1936070	1936075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390962180
40006	NC_018015	TCC	2	6	1936132	1936137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390962180
40007	NC_018015	TCA	2	6	1936165	1936170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390962180
40008	NC_018015	CCA	2	6	1936208	1936213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390962180
40009	NC_018015	CCA	2	6	1936313	1936318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390962180
40010	NC_018015	ACG	2	6	1936369	1936374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390962180
40011	NC_018015	TCC	2	6	1936394	1936399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390962180
40012	NC_018015	CTC	2	6	1936428	1936433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390962180
40013	NC_018015	TCT	2	6	1936451	1936456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390962180
40014	NC_018015	CCT	2	6	1936529	1936534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390962180
40015	NC_018015	AAC	2	6	1936554	1936559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390962180
40016	NC_018015	CT	3	6	1936677	1936682	0 %	50 %	0 %	50 %	390962180
40017	NC_018015	AGT	2	6	1936691	1936696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390962180
40018	NC_018015	CAG	2	6	1936701	1936706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390962180
40019	NC_018015	CCTTCT	2	12	1936742	1936753	0 %	50 %	0 %	50 %	390962180
40020	NC_018015	GA	3	6	1936831	1936836	50 %	0 %	50 %	0 %	390962180
40021	NC_018015	CCA	2	6	1936853	1936858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390962180
40022	NC_018015	GCGTAG	2	12	1936870	1936881	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	390962180
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40024	NC_018015	TCT	2	6	1936928	1936933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390962180
40025	NC_018015	CGGG	2	8	1937108	1937115	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40026	NC_018015	GGT	2	6	1937189	1937194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40027	NC_018015	CCGG	2	8	1937247	1937254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40028	NC_018015	TCA	2	6	1937288	1937293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40029	NC_018015	TAG	2	6	1937385	1937390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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40031	NC_018015	TCAAA	2	10	1937425	1937434	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
40032	NC_018015	TGG	2	6	1937475	1937480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40033	NC_018015	A	6	6	1937488	1937493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40034	NC_018015	CAA	2	6	1937521	1937526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40035	NC_018015	ATA	2	6	1937589	1937594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40036	NC_018015	TCG	2	6	1937763	1937768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962181
40037	NC_018015	AAG	2	6	1937780	1937785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390962181
40038	NC_018015	GA	3	6	1937789	1937794	50 %	0 %	50 %	0 %	390962181
40039	NC_018015	GAG	2	6	1937900	1937905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962181
40040	NC_018015	AGGCTC	2	12	1938074	1938085	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	390962181
40041	NC_018015	GA	3	6	1938125	1938130	50 %	0 %	50 %	0 %	390962181
40042	NC_018015	CGT	2	6	1938304	1938309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962181
40043	NC_018015	CGG	2	6	1938351	1938356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390962181
40044	NC_018015	GAGG	2	8	1938400	1938407	25 %	0 %	75 %	0 %	390962181
40045	NC_018015	ACT	2	6	1938441	1938446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390962181
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40047	NC_018015	CGA	2	6	1938538	1938543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390962181
40048	NC_018015	GA	3	6	1938542	1938547	50 %	0 %	50 %	0 %	390962181
40049	NC_018015	GTCC	2	8	1938551	1938558	0 %	25 %	25 %	50 %	390962181
40050	NC_018015	TG	3	6	1938616	1938621	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40051	NC_018015	GA	3	6	1938839	1938844	50 %	0 %	50 %	0 %	390962182
40052	NC_018015	TCG	2	6	1938882	1938887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962182
40053	NC_018015	TAC	2	6	1938926	1938931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390962182
40054	NC_018015	CTC	2	6	1939070	1939075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390962182
40055	NC_018015	GGGCA	2	10	1939102	1939111	20 %	0 %	60 %	20 %	390962182
40056	NC_018015	AG	3	6	1939142	1939147	50 %	0 %	50 %	0 %	390962182
40057	NC_018015	GGT	2	6	1939249	1939254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390962182
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40059	NC_018015	CGT	2	6	1939318	1939323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962182
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40070	NC_018015	AGT	2	6	1939923	1939928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390962182
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40089	NC_018015	CTTC	2	8	1940732	1940739	0 %	50 %	0 %	50 %	390962183
40090	NC_018015	CGA	2	6	1940740	1940745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390962183
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40101	NC_018015	CCCT	2	8	1940955	1940962	0 %	25 %	0 %	75 %	390962183
40102	NC_018015	CTC	2	6	1941059	1941064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390962183
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40104	NC_018015	TCG	2	6	1941213	1941218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962183
40105	NC_018015	GCGTA	2	10	1941231	1941240	20 %	20 %	40 %	20 %	390962183
40106	NC_018015	TCTCCA	2	12	1941247	1941258	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	390962183
40107	NC_018015	AGT	2	6	1941271	1941276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390962184
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40111	NC_018015	CTC	2	6	1941561	1941566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390962184
40112	NC_018015	GGTAGC	2	12	1941620	1941631	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	390962184
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40235	NC_018015	ACA	2	6	1948293	1948298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390962193
40236	NC_018015	AAG	2	6	1948400	1948405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390962193
40237	NC_018015	CTT	2	6	1948426	1948431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390962193
40238	NC_018015	CAGAAC	2	12	1948436	1948447	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	390962193
40239	NC_018015	TTC	2	6	1948449	1948454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390962193
40240	NC_018015	GGAA	2	8	1948498	1948505	50 %	0 %	50 %	0 %	390962193
40241	NC_018015	AGG	2	6	1948541	1948546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962193
40242	NC_018015	ATA	2	6	1948628	1948633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390962193
40243	NC_018015	GGA	2	6	1948672	1948677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962193
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40247	NC_018015	TTC	2	6	1949050	1949055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40248	NC_018015	CCTGC	2	10	1949128	1949137	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
40249	NC_018015	GA	3	6	1949138	1949143	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40250	NC_018015	GAA	2	6	1949207	1949212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40251	NC_018015	GGT	2	6	1949291	1949296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40252	NC_018015	TCA	2	6	1949405	1949410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40253	NC_018015	ATC	2	6	1949553	1949558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40254	NC_018015	CGG	2	6	1949889	1949894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40255	NC_018015	GTT	2	6	1949903	1949908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40256	NC_018015	GT	3	6	1949944	1949949	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40257	NC_018015	CAG	2	6	1950011	1950016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40258	NC_018015	GGC	2	6	1950096	1950101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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40260	NC_018015	AT	3	6	1950152	1950157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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