MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 40260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_018015	G	7	7	169522	169528	0 %	0 %	100 %	0 %	390960353
3502	NC_018015	GGA	2	6	169539	169544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960353
3503	NC_018015	CTC	3	9	169600	169608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960353
3504	NC_018015	CTT	2	6	169662	169667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960354
3505	NC_018015	CTC	2	6	169696	169701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960354
3506	NC_018015	ACG	2	6	169754	169759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960354
3507	NC_018015	CTT	2	6	169760	169765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960354
3508	NC_018015	CAT	2	6	169795	169800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960354
3509	NC_018015	GTGGA	2	10	169835	169844	20 %	20 %	60 %	0 %	390960354
3510	NC_018015	AGC	2	6	169883	169888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960354
3511	NC_018015	CCG	2	6	169949	169954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960354
3512	NC_018015	ATC	2	6	169961	169966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960354
3513	NC_018015	GTA	2	6	169975	169980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960354
3514	NC_018015	GAG	2	6	169981	169986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960354
3515	NC_018015	AGT	2	6	170139	170144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960354
3516	NC_018015	TTCT	2	8	170183	170190	0 %	75 %	0 %	25 %	390960354
3517	NC_018015	TCCGC	2	10	170285	170294	0 %	20 %	20 %	60 %	390960354
3518	NC_018015	CG	3	6	170430	170435	0 %	0 %	50 %	50 %	390960354
3519	NC_018015	TC	3	6	170509	170514	0 %	50 %	0 %	50 %	390960354
3520	NC_018015	ACCA	2	8	170560	170567	50 %	0 %	0 %	50 %	390960354
3521	NC_018015	GTA	2	6	170569	170574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960354
3522	NC_018015	CATA	2	8	170583	170590	50 %	25 %	0 %	25 %	390960354
3523	NC_018015	GGT	2	6	170623	170628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960354
3524	NC_018015	GAA	2	6	170677	170682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960354
3525	NC_018015	GAG	2	6	170691	170696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960354
3526	NC_018015	CCAC	2	8	170726	170733	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3527	NC_018015	TAC	2	6	170736	170741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_018015	CTT	2	6	170790	170795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_018015	CAT	2	6	170893	170898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3530	NC_018015	CCA	2	6	170977	170982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3531	NC_018015	AGA	2	6	171130	171135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960355
3532	NC_018015	TGT	2	6	171136	171141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960355
3533	NC_018015	CA	3	6	171165	171170	50 %	0 %	0 %	50 %	390960355
3534	NC_018015	CTC	2	6	171194	171199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960355
3535	NC_018015	AGG	2	6	171200	171205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960355
3536	NC_018015	ATA	2	6	171272	171277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390960355
3537	NC_018015	GAC	2	6	171299	171304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960355
3538	NC_018015	GTC	2	6	171377	171382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960355
3539	NC_018015	AG	3	6	171385	171390	50 %	0 %	50 %	0 %	390960355
3540	NC_018015	CAC	2	6	171406	171411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960355
3541	NC_018015	GGA	2	6	171504	171509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960355
3542	NC_018015	CGG	2	6	171544	171549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960355
3543	NC_018015	GTC	2	6	171641	171646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960355
3544	NC_018015	ACCC	2	8	171758	171765	25 %	0 %	0 %	75 %	390960355
3545	NC_018015	GGA	2	6	171850	171855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960355
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3547	NC_018015	GGCCT	2	10	171980	171989	0 %	20 %	40 %	40 %	390960355
3548	NC_018015	CGA	2	6	172003	172008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960355
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3550	NC_018015	GGCA	2	8	172226	172233	25 %	0 %	50 %	25 %	390960355
3551	NC_018015	CCG	2	6	172247	172252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960355
3552	NC_018015	G	6	6	172281	172286	0 %	0 %	100 %	0 %	390960355
3553	NC_018015	ATA	2	6	172327	172332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390960356
3554	NC_018015	GAG	2	6	172360	172365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960356
3555	NC_018015	CTC	2	6	172381	172386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960356
3556	NC_018015	ACTACG	2	12	172403	172414	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	390960356
3557	NC_018015	GAG	2	6	172435	172440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960356
3558	NC_018015	ACC	3	9	172460	172468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960356
3559	NC_018015	CA	3	6	172485	172490	50 %	0 %	0 %	50 %	390960356
3560	NC_018015	GAT	2	6	172512	172517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960356
3561	NC_018015	GAG	2	6	172650	172655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960356
3562	NC_018015	GGA	2	6	172674	172679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960356
3563	NC_018015	CCGA	2	8	172726	172733	25 %	0 %	25 %	50 %	390960356
3564	NC_018015	CGT	2	6	172782	172787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960356
3565	NC_018015	CGT	2	6	172797	172802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960356
3566	NC_018015	TTC	2	6	172811	172816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960356
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3570	NC_018015	TGG	2	6	172943	172948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960356
3571	NC_018015	GAT	2	6	172968	172973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960356
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3574	NC_018015	CGG	2	6	173220	173225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960356
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3576	NC_018015	AAAGG	2	10	173247	173256	60 %	0 %	40 %	0 %	390960356
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3593	NC_018015	ATT	3	9	173806	173814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390960357
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3601	NC_018015	GAG	2	6	174078	174083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_018015	AGG	2	6	174085	174090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_018015	TC	3	6	174131	174136	0 %	50 %	0 %	50 %	390960358
3604	NC_018015	CAG	2	6	174170	174175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960358
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3608	NC_018015	GAG	2	6	174378	174383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960358
3609	NC_018015	CAC	2	6	174575	174580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960358
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3614	NC_018015	GGC	2	6	174911	174916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960359
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3619	NC_018015	GA	3	6	175008	175013	50 %	0 %	50 %	0 %	390960359
3620	NC_018015	GAC	2	6	175019	175024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960359
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3743	NC_018015	GCTC	2	8	180722	180729	0 %	25 %	25 %	50 %	390960368
3744	NC_018015	GCCGC	2	10	180877	180886	0 %	0 %	40 %	60 %	390960368
3745	NC_018015	TCG	2	6	180914	180919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960368
3746	NC_018015	GCT	2	6	180948	180953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960368
3747	NC_018015	GCT	2	6	180996	181001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960368
3748	NC_018015	ATA	2	6	181003	181008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390960368
3749	NC_018015	TCG	2	6	181028	181033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960368
3750	NC_018015	CCT	2	6	181191	181196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960368
3751	NC_018015	CGG	2	6	181230	181235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960368
3752	NC_018015	GCC	2	6	181312	181317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960368
3753	NC_018015	TCT	2	6	181340	181345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960368
3754	NC_018015	TCC	2	6	181361	181366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960368
3755	NC_018015	CGT	2	6	181422	181427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960368
3756	NC_018015	TGG	2	6	181541	181546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960368
3757	NC_018015	GAGG	2	8	181736	181743	25 %	0 %	75 %	0 %	390960369
3758	NC_018015	ACT	2	6	181822	181827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960369
3759	NC_018015	CTCCAG	2	12	181851	181862	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	390960369
3760	NC_018015	TCGCT	2	10	181894	181903	0 %	40 %	20 %	40 %	390960369
3761	NC_018015	CTT	2	6	182024	182029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960369
3762	NC_018015	ATG	2	6	182064	182069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960369
3763	NC_018015	AGG	2	6	182076	182081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960369
3764	NC_018015	CCA	2	6	182188	182193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960369
3765	NC_018015	CGC	2	6	182216	182221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960369
3766	NC_018015	GAT	2	6	182252	182257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960369
3767	NC_018015	CTT	2	6	182360	182365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960369
3768	NC_018015	TCC	2	6	182401	182406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960369
3769	NC_018015	CGC	2	6	182438	182443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960369
3770	NC_018015	CAA	2	6	182456	182461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960369
3771	NC_018015	CAT	2	6	182480	182485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960369
3772	NC_018015	CGT	3	9	182507	182515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960369
3773	NC_018015	AGG	2	6	182539	182544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960369
3774	NC_018015	CTC	2	6	182567	182572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960369
3775	NC_018015	GCA	2	6	182614	182619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960369
3776	NC_018015	TCC	2	6	182704	182709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960369
3777	NC_018015	CGGC	2	8	182818	182825	0 %	0 %	50 %	50 %	390960369
3778	NC_018015	GCA	2	6	182853	182858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960369
3779	NC_018015	TCG	2	6	182878	182883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960369
3780	NC_018015	CGT	2	6	182924	182929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960369
3781	NC_018015	AGG	2	6	182986	182991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960369
3782	NC_018015	CTC	2	6	183003	183008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960369
3783	NC_018015	CAA	2	6	183080	183085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960369
3784	NC_018015	GGC	2	6	183093	183098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960369
3785	NC_018015	GCG	2	6	183109	183114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960369
3786	NC_018015	ACT	2	6	183115	183120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960369
3787	NC_018015	CATCTA	2	12	183203	183214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960369
3788	NC_018015	GCCAGG	2	12	183219	183230	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	390960369
3789	NC_018015	GAG	2	6	183276	183281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960369
3790	NC_018015	GAA	2	6	183299	183304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960369
3791	NC_018015	GTA	2	6	183462	183467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960369
3792	NC_018015	G	6	6	183487	183492	0 %	0 %	100 %	0 %	390960369
3793	NC_018015	GA	3	6	183582	183587	50 %	0 %	50 %	0 %	390960370
3794	NC_018015	GCC	2	6	183620	183625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960370
3795	NC_018015	CAT	2	6	183638	183643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960370
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3797	NC_018015	CAG	2	6	183776	183781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960370
3798	NC_018015	TCG	3	9	183796	183804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960370
3799	NC_018015	CCT	2	6	183809	183814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960370
3800	NC_018015	TGG	2	6	183904	183909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960370
3801	NC_018015	CAG	2	6	183993	183998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960370
3802	NC_018015	GAT	2	6	184040	184045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960370
3803	NC_018015	CGG	2	6	184142	184147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960370
3804	NC_018015	CTT	2	6	184205	184210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960370
3805	NC_018015	CGG	2	6	184226	184231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960370
3806	NC_018015	CCT	2	6	184241	184246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960370
3807	NC_018015	TTC	2	6	184338	184343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960370
3808	NC_018015	AAT	2	6	184367	184372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390960370
3809	NC_018015	CTG	2	6	184380	184385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960370
3810	NC_018015	GAA	2	6	184485	184490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960371
3811	NC_018015	ATG	2	6	184582	184587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960371
3812	NC_018015	TCA	2	6	184622	184627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960371
3813	NC_018015	GAT	2	6	184677	184682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960371
3814	NC_018015	CCCGA	2	10	184684	184693	20 %	0 %	20 %	60 %	390960371
3815	NC_018015	CGG	2	6	184728	184733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960371
3816	NC_018015	AGC	2	6	184763	184768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960371
3817	NC_018015	GAA	2	6	184920	184925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960371
3818	NC_018015	AGG	2	6	184969	184974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960371
3819	NC_018015	TGGC	2	8	184975	184982	0 %	25 %	50 %	25 %	390960371
3820	NC_018015	GGA	2	6	185009	185014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960372
3821	NC_018015	AGG	2	6	185017	185022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960372
3822	NC_018015	AGG	2	6	185059	185064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960372
3823	NC_018015	TCG	2	6	185071	185076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960372
3824	NC_018015	GCT	2	6	185081	185086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960372
3825	NC_018015	GAAG	2	8	185106	185113	50 %	0 %	50 %	0 %	390960372
3826	NC_018015	GAG	2	6	185126	185131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960372
3827	NC_018015	AGG	2	6	185155	185160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960372
3828	NC_018015	GAA	2	6	185162	185167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960372
3829	NC_018015	CGT	2	6	185216	185221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960372
3830	NC_018015	GTGA	2	8	185271	185278	25 %	25 %	50 %	0 %	390960372
3831	NC_018015	GA	4	8	185370	185377	50 %	0 %	50 %	0 %	390960372
3832	NC_018015	TTC	2	6	185388	185393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960372
3833	NC_018015	AGGA	2	8	185469	185476	50 %	0 %	50 %	0 %	390960372
3834	NC_018015	ATG	2	6	185530	185535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960372
3835	NC_018015	TGA	2	6	185564	185569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3836	NC_018015	CAGG	2	8	185601	185608	25 %	0 %	50 %	25 %	390960373
3837	NC_018015	AGC	2	6	185615	185620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960373
3838	NC_018015	TTC	2	6	185665	185670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960373
3839	NC_018015	TCC	2	6	185759	185764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960373
3840	NC_018015	GCAGA	2	10	185785	185794	40 %	0 %	40 %	20 %	390960373
3841	NC_018015	CTC	2	6	185821	185826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960373
3842	NC_018015	AG	3	6	185907	185912	50 %	0 %	50 %	0 %	390960373
3843	NC_018015	ACC	2	6	185929	185934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960373
3844	NC_018015	GGC	2	6	186021	186026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960373
3845	NC_018015	GAG	2	6	186058	186063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960373
3846	NC_018015	CGG	2	6	186069	186074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960373
3847	NC_018015	CGA	2	6	186192	186197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960373
3848	NC_018015	AAG	2	6	186256	186261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960373
3849	NC_018015	ACG	2	6	186317	186322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960373
3850	NC_018015	GAC	2	6	186331	186336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960373
3851	NC_018015	CTA	2	6	186339	186344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960373
3852	NC_018015	AAGG	2	8	186382	186389	50 %	0 %	50 %	0 %	390960373
3853	NC_018015	AGG	2	6	186415	186420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960373
3854	NC_018015	AGC	2	6	186452	186457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960373
3855	NC_018015	GCC	2	6	186471	186476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960373
3856	NC_018015	CCGG	2	8	186535	186542	0 %	0 %	50 %	50 %	390960373
3857	NC_018015	GAA	2	6	186670	186675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960373
3858	NC_018015	GC	4	8	186686	186693	0 %	0 %	50 %	50 %	390960373
3859	NC_018015	GCCC	2	8	186734	186741	0 %	0 %	25 %	75 %	390960373
3860	NC_018015	AGT	2	6	186773	186778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960374
3861	NC_018015	TCAAGA	2	12	186793	186804	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	390960374
3862	NC_018015	CGC	2	6	186887	186892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960374
3863	NC_018015	CTGGA	2	10	186918	186927	20 %	20 %	40 %	20 %	390960374
3864	NC_018015	ACG	2	6	187122	187127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960374
3865	NC_018015	ACGGA	2	10	187129	187138	40 %	0 %	40 %	20 %	390960374
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3987	NC_018015	CCCT	2	8	193783	193790	0 %	25 %	0 %	75 %	390960380
3988	NC_018015	CTT	2	6	193857	193862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960380
3989	NC_018015	CCT	2	6	193916	193921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960380
3990	NC_018015	GCTC	2	8	193946	193953	0 %	25 %	25 %	50 %	390960380
3991	NC_018015	AG	3	6	194180	194185	50 %	0 %	50 %	0 %	390960381
3992	NC_018015	CAC	2	6	194270	194275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960381
3993	NC_018015	GCT	2	6	194277	194282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960381
3994	NC_018015	GGA	2	6	194291	194296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960381
3995	NC_018015	A	6	6	194308	194313	100 %	0 %	0 %	0 %	390960381
3996	NC_018015	CGA	2	6	194420	194425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960381
3997	NC_018015	TCA	2	6	194467	194472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960381
3998	NC_018015	GATA	2	8	194486	194493	50 %	25 %	25 %	0 %	390960381
3999	NC_018015	GCC	3	9	194517	194525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960381
4000	NC_018015	GAG	2	6	194628	194633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960381

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