MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 40260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
39001	NC_018015	GTTC	2	8	1888220	1888227	0 %	50 %	25 %	25 %	390962130
39002	NC_018015	GGT	2	6	1888239	1888244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39003	NC_018015	AACC	2	8	1888274	1888281	50 %	0 %	0 %	50 %	390962131
39004	NC_018015	CGA	2	6	1888319	1888324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390962131
39005	NC_018015	GAG	2	6	1888416	1888421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962131
39006	NC_018015	GAGG	2	8	1888448	1888455	25 %	0 %	75 %	0 %	390962131
39007	NC_018015	CTT	2	6	1888457	1888462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390962131
39008	NC_018015	AGG	2	6	1888522	1888527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962131
39009	NC_018015	GAT	2	6	1888535	1888540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390962131
39010	NC_018015	CCG	2	6	1888542	1888547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390962131
39011	NC_018015	GTG	2	6	1888548	1888553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390962131
39012	NC_018015	CTC	2	6	1888805	1888810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390962131
39013	NC_018015	TCA	2	6	1888867	1888872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390962131
39014	NC_018015	AGA	2	6	1888888	1888893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390962131
39015	NC_018015	CGG	2	6	1888928	1888933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390962131
39016	NC_018015	GAG	2	6	1888977	1888982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962131
39017	NC_018015	GTC	2	6	1888983	1888988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962131
39018	NC_018015	CCT	2	6	1888994	1888999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390962131
39019	NC_018015	GACG	2	8	1889006	1889013	25 %	0 %	50 %	25 %	390962131
39020	NC_018015	CGAG	2	8	1889047	1889054	25 %	0 %	50 %	25 %	390962131
39021	NC_018015	AGGG	2	8	1889072	1889079	25 %	0 %	75 %	0 %	390962131
39022	NC_018015	AGA	2	6	1889087	1889092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390962131
39023	NC_018015	GAA	2	6	1889096	1889101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390962131
39024	NC_018015	AACGAC	2	12	1889121	1889132	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	390962131
39025	NC_018015	AGC	2	6	1889183	1889188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390962131
39026	NC_018015	AGG	2	6	1889231	1889236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962132
39027	NC_018015	TCG	2	6	1889415	1889420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962132
39028	NC_018015	CGA	2	6	1889430	1889435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390962132
39029	NC_018015	CGT	2	6	1889440	1889445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962132
39030	NC_018015	TGA	2	6	1889500	1889505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390962132
39031	NC_018015	CTA	2	6	1889545	1889550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390962132
39032	NC_018015	GCCAAG	2	12	1889561	1889572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390962132
39033	NC_018015	GAG	2	6	1889605	1889610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962132
39034	NC_018015	AAC	2	6	1889625	1889630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390962132
39035	NC_018015	AAAT	2	8	1889650	1889657	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39036	NC_018015	GGTGGG	2	12	1889673	1889684	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
39037	NC_018015	GAC	2	6	1889775	1889780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390962133
39038	NC_018015	GCG	2	6	1889800	1889805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390962133
39039	NC_018015	GGC	2	6	1889822	1889827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390962133
39040	NC_018015	CCA	2	6	1889882	1889887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390962133
39041	NC_018015	GGA	2	6	1889952	1889957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962133
39042	NC_018015	CTGA	2	8	1890000	1890007	25 %	25 %	25 %	25 %	390962133
39043	NC_018015	GAA	2	6	1890137	1890142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390962133
39044	NC_018015	ACC	2	6	1890199	1890204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390962133
39045	NC_018015	AGGG	2	8	1890246	1890253	25 %	0 %	75 %	0 %	390962133
39046	NC_018015	CGA	2	6	1890254	1890259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390962133
39047	NC_018015	GAG	2	6	1890294	1890299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962133
39048	NC_018015	GA	3	6	1890369	1890374	50 %	0 %	50 %	0 %	390962133
39049	NC_018015	CCT	2	6	1890377	1890382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390962133
39050	NC_018015	CCGCT	2	10	1890384	1890393	0 %	20 %	20 %	60 %	390962133
39051	NC_018015	GGA	2	6	1890395	1890400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962133
39052	NC_018015	AGG	2	6	1890499	1890504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962133
39053	NC_018015	AAG	2	6	1890522	1890527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390962133
39054	NC_018015	GAG	2	6	1890614	1890619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962133
39055	NC_018015	GAG	2	6	1890647	1890652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962133
39056	NC_018015	CTC	2	6	1890660	1890665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390962133
39057	NC_018015	AGGA	2	8	1890689	1890696	50 %	0 %	50 %	0 %	390962133
39058	NC_018015	CGGA	2	8	1890784	1890791	25 %	0 %	50 %	25 %	390962133
39059	NC_018015	CGT	2	6	1890794	1890799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962133
39060	NC_018015	GAG	2	6	1890861	1890866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962133
39061	NC_018015	TCG	2	6	1890976	1890981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962133
39062	NC_018015	GAG	2	6	1890984	1890989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962133
39063	NC_018015	GAA	2	6	1891037	1891042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390962133
39064	NC_018015	GCTTAC	2	12	1891059	1891070	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	390962133
39065	NC_018015	AGG	2	6	1891093	1891098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962133
39066	NC_018015	GAG	2	6	1891263	1891268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962133
39067	NC_018015	TCG	2	6	1891300	1891305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962133
39068	NC_018015	GA	3	6	1891308	1891313	50 %	0 %	50 %	0 %	390962133
39069	NC_018015	GTC	2	6	1891314	1891319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962133
39070	NC_018015	ACG	2	6	1891375	1891380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390962133
39071	NC_018015	CGT	2	6	1891403	1891408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962133
39072	NC_018015	GCG	2	6	1891420	1891425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390962133
39073	NC_018015	GAAG	2	8	1891454	1891461	50 %	0 %	50 %	0 %	390962133
39074	NC_018015	ACGGCT	2	12	1891600	1891611	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	390962133
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39076	NC_018015	GAA	2	6	1891635	1891640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390962133
39077	NC_018015	GGC	2	6	1891641	1891646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390962133
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39083	NC_018015	GCGA	2	8	1891860	1891867	25 %	0 %	50 %	25 %	390962133
39084	NC_018015	GAG	2	6	1891953	1891958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962133
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39087	NC_018015	GGA	2	6	1892072	1892077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962133
39088	NC_018015	GAG	2	6	1892127	1892132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962133
39089	NC_018015	GTC	3	9	1892160	1892168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962133
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39091	NC_018015	CGGC	2	8	1892197	1892204	0 %	0 %	50 %	50 %	390962133
39092	NC_018015	GCT	2	6	1892348	1892353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962133
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39098	NC_018015	TCG	2	6	1892530	1892535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962133
39099	NC_018015	CT	3	6	1892577	1892582	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39100	NC_018015	T	6	6	1892582	1892587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39101	NC_018015	GCAT	2	8	1892590	1892597	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39102	NC_018015	AGG	2	6	1892663	1892668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962134
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39104	NC_018015	GTG	2	6	1892785	1892790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390962134
39105	NC_018015	CTT	2	6	1892977	1892982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390962134
39106	NC_018015	GAG	2	6	1892995	1893000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962134
39107	NC_018015	CCA	2	6	1893111	1893116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390962134
39108	NC_018015	CCA	2	6	1893129	1893134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390962134
39109	NC_018015	CCA	2	6	1893147	1893152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390962134
39110	NC_018015	GAG	2	6	1893211	1893216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962134
39111	NC_018015	GCC	2	6	1893269	1893274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390962134
39112	NC_018015	ATC	2	6	1893302	1893307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390962134
39113	NC_018015	G	6	6	1893333	1893338	0 %	0 %	100 %	0 %	390962134
39114	NC_018015	C	6	6	1893360	1893365	0 %	0 %	0 %	100 %	390962134
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39193	NC_018015	T	6	6	1897720	1897725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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39220	NC_018015	CTT	3	9	1899045	1899053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390962140
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39231	NC_018015	A	6	6	1899634	1899639	100 %	0 %	0 %	0 %	390962141
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