MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 40260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34001	NC_018015	CCT	2	6	1643762	1643767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34002	NC_018015	CTC	2	6	1643806	1643811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961882
34003	NC_018015	TCCT	2	8	1643837	1643844	0 %	50 %	0 %	50 %	390961882
34004	NC_018015	CCT	2	6	1643874	1643879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961882
34005	NC_018015	CCT	2	6	1643920	1643925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961882
34006	NC_018015	CCT	2	6	1643997	1644002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961882
34007	NC_018015	CCT	2	6	1644037	1644042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961882
34008	NC_018015	CTC	2	6	1644049	1644054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961882
34009	NC_018015	GTCGAG	2	12	1644064	1644075	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	390961882
34010	NC_018015	CAGG	2	8	1644135	1644142	25 %	0 %	50 %	25 %	390961882
34011	NC_018015	CGC	2	6	1644208	1644213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961882
34012	NC_018015	CTT	2	6	1644238	1644243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961882
34013	NC_018015	GAG	2	6	1644268	1644273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961882
34014	NC_018015	TCC	2	6	1644285	1644290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961882
34015	NC_018015	GTC	2	6	1644323	1644328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961882
34016	NC_018015	TGG	2	6	1644405	1644410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961882
34017	NC_018015	GAA	2	6	1644454	1644459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961882
34018	NC_018015	CGG	2	6	1644514	1644519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961882
34019	NC_018015	GAC	2	6	1644580	1644585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961882
34020	NC_018015	CAT	2	6	1644592	1644597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961882
34021	NC_018015	TCC	2	6	1644686	1644691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961882
34022	NC_018015	TCC	2	6	1644698	1644703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961882
34023	NC_018015	CCTT	2	8	1644728	1644735	0 %	50 %	0 %	50 %	390961882
34024	NC_018015	CGGC	2	8	1644767	1644774	0 %	0 %	50 %	50 %	390961882
34025	NC_018015	CTT	2	6	1644802	1644807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961882
34026	NC_018015	TCG	2	6	1644839	1644844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961882
34027	NC_018015	GCT	2	6	1644855	1644860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961882
34028	NC_018015	T	6	6	1644887	1644892	0 %	100 %	0 %	0 %	390961882
34029	NC_018015	CTT	2	6	1644913	1644918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961882
34030	NC_018015	CAC	2	6	1644997	1645002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34031	NC_018015	AAAAC	2	10	1645034	1645043	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
34032	NC_018015	ACCTC	2	10	1645091	1645100	20 %	20 %	0 %	60 %	390961883
34033	NC_018015	CCTC	2	8	1645105	1645112	0 %	25 %	0 %	75 %	390961883
34034	NC_018015	CCT	2	6	1645171	1645176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961883
34035	NC_018015	TCG	2	6	1645215	1645220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961883
34036	NC_018015	GTC	2	6	1645247	1645252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961883
34037	NC_018015	GCC	2	6	1645257	1645262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961883
34038	NC_018015	CGC	2	6	1645289	1645294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961883
34039	NC_018015	CTT	2	6	1645365	1645370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961883
34040	NC_018015	TTCTCC	2	12	1645404	1645415	0 %	50 %	0 %	50 %	390961883
34041	NC_018015	GGA	2	6	1645441	1645446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961883
34042	NC_018015	CTC	2	6	1645469	1645474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961883
34043	NC_018015	CTT	3	9	1645475	1645483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961883
34044	NC_018015	CTT	2	6	1645514	1645519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961883
34045	NC_018015	CGA	2	6	1645573	1645578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961883
34046	NC_018015	GAG	2	6	1645619	1645624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961883
34047	NC_018015	AGA	2	6	1645630	1645635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961883
34048	NC_018015	TTC	2	6	1645660	1645665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961883
34049	NC_018015	GCT	2	6	1645696	1645701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961883
34050	NC_018015	AG	3	6	1645714	1645719	50 %	0 %	50 %	0 %	390961883
34051	NC_018015	CTC	2	6	1645749	1645754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961883
34052	NC_018015	GAG	2	6	1645808	1645813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961883
34053	NC_018015	GGT	2	6	1645837	1645842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961883
34054	NC_018015	GAT	2	6	1646041	1646046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961883
34055	NC_018015	ACG	2	6	1646059	1646064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961883
34056	NC_018015	GAA	2	6	1646078	1646083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961883
34057	NC_018015	TCT	2	6	1646092	1646097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961883
34058	NC_018015	CGA	2	6	1646122	1646127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961883
34059	NC_018015	GCC	2	6	1646171	1646176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961883
34060	NC_018015	CT	3	6	1646257	1646262	0 %	50 %	0 %	50 %	390961883
34061	NC_018015	GGA	2	6	1646270	1646275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961883
34062	NC_018015	TCC	2	6	1646309	1646314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961883
34063	NC_018015	CTTT	2	8	1646318	1646325	0 %	75 %	0 %	25 %	390961883
34064	NC_018015	GCCC	2	8	1646338	1646345	0 %	0 %	25 %	75 %	390961883
34065	NC_018015	TCC	2	6	1646394	1646399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961883
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34067	NC_018015	C	6	6	1646486	1646491	0 %	0 %	0 %	100 %	390961883
34068	NC_018015	CGA	2	6	1646572	1646577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961883
34069	NC_018015	CTC	2	6	1646591	1646596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961883
34070	NC_018015	GA	3	6	1646601	1646606	50 %	0 %	50 %	0 %	390961883
34071	NC_018015	TCC	2	6	1646634	1646639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961883
34072	NC_018015	CGG	2	6	1646644	1646649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961883
34073	NC_018015	CTC	2	6	1646660	1646665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961883
34074	NC_018015	GAG	2	6	1646690	1646695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961883
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34076	NC_018015	CCA	2	6	1646885	1646890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961883
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34078	NC_018015	CCGC	2	8	1647071	1647078	0 %	0 %	25 %	75 %	390961884
34079	NC_018015	CTA	2	6	1647080	1647085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961884
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34082	NC_018015	GA	3	6	1647187	1647192	50 %	0 %	50 %	0 %	390961884
34083	NC_018015	CCT	2	6	1647206	1647211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961884
34084	NC_018015	AGG	2	6	1647235	1647240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961884
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34086	NC_018015	GTA	2	6	1647255	1647260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961884
34087	NC_018015	CTC	2	6	1647283	1647288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961884
34088	NC_018015	CTCC	2	8	1647294	1647301	0 %	25 %	0 %	75 %	390961884
34089	NC_018015	CTC	2	6	1647363	1647368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961884
34090	NC_018015	ATT	2	6	1647391	1647396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390961884
34091	NC_018015	CGA	2	6	1647476	1647481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961884
34092	NC_018015	AT	3	6	1647545	1647550	50 %	50 %	0 %	0 %	390961884
34093	NC_018015	GCG	2	6	1647598	1647603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961884
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34095	NC_018015	GTT	2	6	1647628	1647633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390961884
34096	NC_018015	CT	3	6	1647637	1647642	0 %	50 %	0 %	50 %	390961884
34097	NC_018015	AGG	2	6	1647694	1647699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961884
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34101	NC_018015	GAG	2	6	1648054	1648059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961884
34102	NC_018015	CCG	2	6	1648084	1648089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961884
34103	NC_018015	C	6	6	1648115	1648120	0 %	0 %	0 %	100 %	390961884
34104	NC_018015	GGA	2	6	1648364	1648369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961884
34105	NC_018015	CTT	2	6	1648447	1648452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961884
34106	NC_018015	CGGC	2	8	1648466	1648473	0 %	0 %	50 %	50 %	390961884
34107	NC_018015	CCTC	2	8	1648492	1648499	0 %	25 %	0 %	75 %	390961884
34108	NC_018015	GAC	2	6	1648592	1648597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961884
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34112	NC_018015	TCC	2	6	1648790	1648795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961885
34113	NC_018015	GAG	2	6	1648931	1648936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961885
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34115	NC_018015	CCG	2	6	1648990	1648995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961885
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34117	NC_018015	CTC	2	6	1649102	1649107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961885
34118	NC_018015	TCC	2	6	1649313	1649318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961885
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34356	NC_018015	CCT	2	6	1660873	1660878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961892
34357	NC_018015	GAGCA	2	10	1660901	1660910	40 %	0 %	40 %	20 %	390961892
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34419	NC_018015	GTTC	2	8	1663658	1663665	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34420	NC_018015	T	6	6	1663695	1663700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34421	NC_018015	ACT	2	6	1663701	1663706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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34423	NC_018015	G	6	6	1663808	1663813	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
34424	NC_018015	TGT	2	6	1663842	1663847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390961894
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34442	NC_018015	T	7	7	1664605	1664611	0 %	100 %	0 %	0 %	390961895
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34454	NC_018015	TAT	2	6	1665546	1665551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390961895
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34457	NC_018015	GGAT	2	8	1665712	1665719	25 %	25 %	50 %	0 %	390961895
34458	NC_018015	GAT	2	6	1665786	1665791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961895
34459	NC_018015	TAT	2	6	1665804	1665809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390961895
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34461	NC_018015	AG	3	6	1665858	1665863	50 %	0 %	50 %	0 %	390961895
34462	NC_018015	A	6	6	1665869	1665874	100 %	0 %	0 %	0 %	390961895
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34466	NC_018015	GGT	2	6	1666344	1666349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961895
34467	NC_018015	CTC	2	6	1666469	1666474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34468	NC_018015	GA	3	6	1666486	1666491	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34469	NC_018015	TCA	2	6	1666542	1666547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961896
34470	NC_018015	GA	3	6	1666558	1666563	50 %	0 %	50 %	0 %	390961896
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