MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 40260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33501	NC_018015	CCT	2	6	1619878	1619883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961863
33502	NC_018015	ACT	2	6	1619904	1619909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961863
33503	NC_018015	GAA	2	6	1619992	1619997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961863
33504	NC_018015	GAC	2	6	1620047	1620052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961863
33505	NC_018015	AAG	2	6	1620056	1620061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961863
33506	NC_018015	AGG	2	6	1620071	1620076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961863
33507	NC_018015	CAT	2	6	1620112	1620117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961863
33508	NC_018015	GAA	3	9	1620136	1620144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961863
33509	NC_018015	GAG	2	6	1620203	1620208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961863
33510	NC_018015	CG	3	6	1620219	1620224	0 %	0 %	50 %	50 %	390961863
33511	NC_018015	GAG	3	9	1620290	1620298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961863
33512	NC_018015	AAG	2	6	1620383	1620388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961863
33513	NC_018015	GTC	2	6	1620401	1620406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961863
33514	NC_018015	CGT	2	6	1620487	1620492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961863
33515	NC_018015	GAG	2	6	1620494	1620499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961863
33516	NC_018015	TAT	2	6	1620545	1620550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390961863
33517	NC_018015	CGA	2	6	1620595	1620600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961863
33518	NC_018015	CAA	2	6	1620640	1620645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390961863
33519	NC_018015	GTT	2	6	1620653	1620658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390961863
33520	NC_018015	CTC	2	6	1620661	1620666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961863
33521	NC_018015	GAA	2	6	1620718	1620723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961863
33522	NC_018015	TCC	2	6	1620816	1620821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961863
33523	NC_018015	AGG	2	6	1620852	1620857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961863
33524	NC_018015	AGGA	2	8	1620875	1620882	50 %	0 %	50 %	0 %	390961863
33525	NC_018015	CGA	2	6	1620907	1620912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961863
33526	NC_018015	CAC	2	6	1621019	1621024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961863
33527	NC_018015	AGG	2	6	1621083	1621088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961863
33528	NC_018015	GAA	2	6	1621099	1621104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961863
33529	NC_018015	ATG	2	6	1621160	1621165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961863
33530	NC_018015	CAC	2	6	1621172	1621177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961863
33531	NC_018015	CCAC	2	8	1621227	1621234	25 %	0 %	0 %	75 %	390961863
33532	NC_018015	GAAG	2	8	1621285	1621292	50 %	0 %	50 %	0 %	390961863
33533	NC_018015	GAGC	2	8	1621332	1621339	25 %	0 %	50 %	25 %	390961863
33534	NC_018015	GGT	2	6	1621378	1621383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961863
33535	NC_018015	GAA	2	6	1621459	1621464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961863
33536	NC_018015	GCCAG	2	10	1621473	1621482	20 %	0 %	40 %	40 %	390961863
33537	NC_018015	CGA	2	6	1621483	1621488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961863
33538	NC_018015	AGA	3	9	1621617	1621625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961863
33539	NC_018015	GGT	2	6	1621666	1621671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961863
33540	NC_018015	GA	3	6	1621736	1621741	50 %	0 %	50 %	0 %	390961863
33541	NC_018015	GGA	2	6	1621786	1621791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961863
33542	NC_018015	ATA	2	6	1621847	1621852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390961863
33543	NC_018015	TAC	3	9	1621865	1621873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961863
33544	NC_018015	CTC	2	6	1621880	1621885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961863
33545	NC_018015	CGA	2	6	1621935	1621940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961864
33546	NC_018015	AGG	2	6	1621964	1621969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961864
33547	NC_018015	GAC	2	6	1622008	1622013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961864
33548	NC_018015	CCT	2	6	1622071	1622076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961864
33549	NC_018015	GTC	2	6	1622146	1622151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961864
33550	NC_018015	TC	3	6	1622157	1622162	0 %	50 %	0 %	50 %	390961864
33551	NC_018015	GCG	2	6	1622171	1622176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961864
33552	NC_018015	GGACTT	2	12	1622254	1622265	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	390961864
33553	NC_018015	GTAG	2	8	1622373	1622380	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33554	NC_018015	ATTC	2	8	1622396	1622403	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33555	NC_018015	GGCA	2	8	1622430	1622437	25 %	0 %	50 %	25 %	390961865
33556	NC_018015	ATA	2	6	1622452	1622457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390961865
33557	NC_018015	GAG	2	6	1622478	1622483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961865
33558	NC_018015	ATG	2	6	1622491	1622496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961865
33559	NC_018015	CTC	2	6	1622530	1622535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961865
33560	NC_018015	GTT	2	6	1622632	1622637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390961865
33561	NC_018015	C	6	6	1622651	1622656	0 %	0 %	0 %	100 %	390961865
33562	NC_018015	GGAA	2	8	1622837	1622844	50 %	0 %	50 %	0 %	390961865
33563	NC_018015	CGC	2	6	1622892	1622897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961865
33564	NC_018015	GTG	2	6	1622927	1622932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961865
33565	NC_018015	TCC	2	6	1622959	1622964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961866
33566	NC_018015	AGG	2	6	1622977	1622982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961866
33567	NC_018015	GGA	2	6	1622987	1622992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961866
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33569	NC_018015	C	6	6	1623148	1623153	0 %	0 %	0 %	100 %	390961866
33570	NC_018015	CGT	2	6	1623170	1623175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961866
33571	NC_018015	ATA	2	6	1623309	1623314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390961866
33572	NC_018015	AAT	2	6	1623487	1623492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390961867
33573	NC_018015	TCA	2	6	1623519	1623524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961867
33574	NC_018015	ACT	2	6	1623534	1623539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961867
33575	NC_018015	TCA	2	6	1623588	1623593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961867
33576	NC_018015	CCA	2	6	1623618	1623623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961867
33577	NC_018015	TCC	2	6	1623653	1623658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961867
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33581	NC_018015	CTA	2	6	1623892	1623897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961867
33582	NC_018015	GAG	2	6	1623923	1623928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961867
33583	NC_018015	GGC	2	6	1623938	1623943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961867
33584	NC_018015	GAG	2	6	1623955	1623960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961867
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33587	NC_018015	CCA	2	6	1624131	1624136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961867
33588	NC_018015	CAT	2	6	1624168	1624173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961867
33589	NC_018015	ACC	2	6	1624385	1624390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961867
33590	NC_018015	TTA	2	6	1624456	1624461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33591	NC_018015	ATT	2	6	1624478	1624483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33592	NC_018015	GGT	2	6	1624507	1624512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33593	NC_018015	GTT	2	6	1624540	1624545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390961868
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33598	NC_018015	ACA	2	6	1624775	1624780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390961868
33599	NC_018015	TCACC	2	10	1624884	1624893	20 %	20 %	0 %	60 %	390961868
33600	NC_018015	TCA	2	6	1624997	1625002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961868
33601	NC_018015	TCC	2	6	1625039	1625044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961868
33602	NC_018015	GAC	2	6	1625068	1625073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961868
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33605	NC_018015	CGG	2	6	1625195	1625200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961868
33606	NC_018015	TTA	2	6	1625208	1625213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390961868
33607	NC_018015	AAC	2	6	1625218	1625223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390961868
33608	NC_018015	AGGG	2	8	1625248	1625255	25 %	0 %	75 %	0 %	390961868
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