MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 40260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33009	NC_018015	CGA	2	6	1596264	1596269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961840
33010	NC_018015	GGA	2	6	1596273	1596278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961840
33011	NC_018015	TCG	2	6	1596293	1596298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961840
33012	NC_018015	TCCCAG	2	12	1596317	1596328	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	390961840
33013	NC_018015	GTG	2	6	1596430	1596435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961840
33014	NC_018015	TCCA	2	8	1596482	1596489	25 %	25 %	0 %	50 %	390961840
33015	NC_018015	GCT	2	6	1596495	1596500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961840
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33017	NC_018015	CTG	2	6	1596527	1596532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961840
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33113	NC_018015	AAG	2	6	1601051	1601056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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33350	NC_018015	GTA	3	9	1612435	1612443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961855
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33465	NC_018015	GCG	2	6	1617879	1617884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961861
33466	NC_018015	CTA	2	6	1617892	1617897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961861
33467	NC_018015	CTCC	2	8	1617922	1617929	0 %	25 %	0 %	75 %	390961861
33468	NC_018015	CGG	2	6	1617948	1617953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961861
33469	NC_018015	GAA	2	6	1618049	1618054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961861
33470	NC_018015	CTTC	2	8	1618079	1618086	0 %	50 %	0 %	50 %	390961861
33471	NC_018015	TGA	2	6	1618108	1618113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961861
33472	NC_018015	GGA	2	6	1618135	1618140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961861
33473	NC_018015	TGA	2	6	1618283	1618288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961861
33474	NC_018015	GTC	2	6	1618293	1618298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961862
33475	NC_018015	TGG	2	6	1618328	1618333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961862
33476	NC_018015	TCC	3	9	1618367	1618375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961862
33477	NC_018015	GGT	2	6	1618395	1618400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961862
33478	NC_018015	GGA	2	6	1618463	1618468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961862
33479	NC_018015	CGAG	2	8	1618643	1618650	25 %	0 %	50 %	25 %	390961862
33480	NC_018015	GCGAG	2	10	1618718	1618727	20 %	0 %	60 %	20 %	390961862
33481	NC_018015	GGT	2	6	1618743	1618748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961862
33482	NC_018015	GCCTTC	2	12	1618798	1618809	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	390961862
33483	NC_018015	TGGCGG	2	12	1618850	1618861	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	390961862
33484	NC_018015	CAC	2	6	1618930	1618935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961862
33485	NC_018015	CTC	2	6	1618983	1618988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961862
33486	NC_018015	TCC	2	6	1618995	1619000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961862
33487	NC_018015	CCT	2	6	1619061	1619066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961862
33488	NC_018015	CCG	2	6	1619074	1619079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961862
33489	NC_018015	GAC	2	6	1619089	1619094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961862
33490	NC_018015	CGAGAG	2	12	1619133	1619144	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	390961862
33491	NC_018015	GGGA	2	8	1619251	1619258	25 %	0 %	75 %	0 %	390961862
33492	NC_018015	CTC	2	6	1619260	1619265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961862
33493	NC_018015	GGC	2	6	1619449	1619454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33494	NC_018015	CTGG	2	8	1619621	1619628	0 %	25 %	50 %	25 %	390961863
33495	NC_018015	GGA	2	6	1619671	1619676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961863
33496	NC_018015	GAA	3	9	1619680	1619688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961863
33497	NC_018015	CGA	2	6	1619698	1619703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961863
33498	NC_018015	GAG	2	6	1619750	1619755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961863
33499	NC_018015	AC	3	6	1619845	1619850	50 %	0 %	0 %	50 %	390961863
33500	NC_018015	GAA	2	6	1619865	1619870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961863

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