MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 40260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32003	NC_018015	TCA	2	6	1546792	1546797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961780
32004	NC_018015	AAT	2	6	1546902	1546907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390961780
32005	NC_018015	TAC	2	6	1546916	1546921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961780
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32008	NC_018015	CTC	2	6	1547110	1547115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961781
32009	NC_018015	TCG	2	6	1547123	1547128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961781
32010	NC_018015	CTTC	2	8	1547160	1547167	0 %	50 %	0 %	50 %	390961781
32011	NC_018015	GACGTA	2	12	1547254	1547265	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	390961781
32012	NC_018015	GCCC	2	8	1547269	1547276	0 %	0 %	25 %	75 %	390961781
32013	NC_018015	TTCG	2	8	1547297	1547304	0 %	50 %	25 %	25 %	390961781
32014	NC_018015	GT	3	6	1547407	1547412	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32015	NC_018015	GAA	3	9	1547427	1547435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961782
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32054	NC_018015	TCT	3	9	1549063	1549071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961783
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32101	NC_018015	CTT	3	9	1551067	1551075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961787
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32104	NC_018015	CT	3	6	1551260	1551265	0 %	50 %	0 %	50 %	390961787
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32111	NC_018015	GGCCT	2	10	1551469	1551478	0 %	20 %	40 %	40 %	390961787
32112	NC_018015	CTC	2	6	1551485	1551490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961787
32113	NC_018015	CTGG	2	8	1551508	1551515	0 %	25 %	50 %	25 %	390961787
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32117	NC_018015	CATT	2	8	1551847	1551854	25 %	50 %	0 %	25 %	390961787
32118	NC_018015	CTCC	2	8	1551855	1551862	0 %	25 %	0 %	75 %	390961788
32119	NC_018015	CGA	2	6	1551882	1551887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961788
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32217	NC_018015	CGGG	2	8	1556537	1556544	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32218	NC_018015	ATC	2	6	1556718	1556723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961796
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32221	NC_018015	GAG	2	6	1556850	1556855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961796
32222	NC_018015	GCT	2	6	1556894	1556899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961796
32223	NC_018015	ACT	2	6	1556941	1556946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961796
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32228	NC_018015	ACT	2	6	1557061	1557066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961796
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32232	NC_018015	ATA	2	6	1557240	1557245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390961796
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32339	NC_018015	GAAG	2	8	1563100	1563107	50 %	0 %	50 %	0 %	390961804
32340	NC_018015	GTC	2	6	1563203	1563208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961804
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32345	NC_018015	AGG	2	6	1563492	1563497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961804
32346	NC_018015	CG	3	6	1563513	1563518	0 %	0 %	50 %	50 %	390961804
32347	NC_018015	TAA	2	6	1563534	1563539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390961804
32348	NC_018015	GAC	2	6	1563643	1563648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961804
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32350	NC_018015	GGAGCT	2	12	1563715	1563726	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	390961804
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32468	NC_018015	CTT	2	6	1570134	1570139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961811
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