MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 40260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_018015	ACG	2	6	1499430	1499435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961728
31002	NC_018015	CAG	2	6	1499486	1499491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961728
31003	NC_018015	GCG	2	6	1499508	1499513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961728
31004	NC_018015	CGG	2	6	1499536	1499541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961728
31005	NC_018015	CTA	2	6	1499545	1499550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961728
31006	NC_018015	GAA	2	6	1499579	1499584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961728
31007	NC_018015	AGA	2	6	1499610	1499615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961728
31008	NC_018015	ATG	2	6	1499624	1499629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961728
31009	NC_018015	AGG	2	6	1499691	1499696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961728
31010	NC_018015	GAG	2	6	1499699	1499704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961728
31011	NC_018015	AAG	2	6	1499705	1499710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961728
31012	NC_018015	CAT	2	6	1499713	1499718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961728
31013	NC_018015	TCG	2	6	1499739	1499744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961728
31014	NC_018015	AAG	2	6	1499813	1499818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961728
31015	NC_018015	GAG	2	6	1499821	1499826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961728
31016	NC_018015	AAG	2	6	1499840	1499845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961728
31017	NC_018015	GAG	2	6	1499849	1499854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961728
31018	NC_018015	CAT	2	6	1499911	1499916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961728
31019	NC_018015	A	6	6	1500070	1500075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31020	NC_018015	CAT	2	6	1500098	1500103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31021	NC_018015	GAA	2	6	1500149	1500154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961729
31022	NC_018015	GCC	2	6	1500171	1500176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961729
31023	NC_018015	ACCC	2	8	1500234	1500241	25 %	0 %	0 %	75 %	390961729
31024	NC_018015	GTGAG	2	10	1500278	1500287	20 %	20 %	60 %	0 %	390961729
31025	NC_018015	GAT	2	6	1500292	1500297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961730
31026	NC_018015	GAG	2	6	1500308	1500313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961730
31027	NC_018015	TCG	2	6	1500321	1500326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961730
31028	NC_018015	AAG	2	6	1500335	1500340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961730
31029	NC_018015	AAG	2	6	1500344	1500349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961730
31030	NC_018015	AGC	2	6	1500379	1500384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961730
31031	NC_018015	CGA	2	6	1500424	1500429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961730
31032	NC_018015	TCA	2	6	1500432	1500437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961730
31033	NC_018015	GCC	2	6	1500484	1500489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961730
31034	NC_018015	CAA	2	6	1500490	1500495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390961730
31035	NC_018015	GGAAGA	2	12	1500517	1500528	50 %	0 %	50 %	0 %	390961730
31036	NC_018015	TTTAA	2	10	1500568	1500577	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31037	NC_018015	AGGG	2	8	1500671	1500678	25 %	0 %	75 %	0 %	390961731
31038	NC_018015	GAA	2	6	1500688	1500693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961731
31039	NC_018015	GTC	2	6	1500797	1500802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961731
31040	NC_018015	AGA	2	6	1500964	1500969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961731
31041	NC_018015	GTCGAG	2	12	1500998	1501009	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	390961731
31042	NC_018015	GTG	2	6	1501052	1501057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961731
31043	NC_018015	GGGC	2	8	1501066	1501073	0 %	0 %	75 %	25 %	390961731
31044	NC_018015	CGA	2	6	1501093	1501098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961731
31045	NC_018015	GTC	2	6	1501205	1501210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961731
31046	NC_018015	ACC	2	6	1501223	1501228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961731
31047	NC_018015	TGA	2	6	1501274	1501279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961731
31048	NC_018015	GAA	2	6	1501341	1501346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961732
31049	NC_018015	TACTC	2	10	1501400	1501409	20 %	40 %	0 %	40 %	390961732
31050	NC_018015	GCA	2	6	1501418	1501423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961732
31051	NC_018015	GAG	2	6	1501465	1501470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961732
31052	NC_018015	TTTCCT	2	12	1501528	1501539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961733
31053	NC_018015	CTT	2	6	1501568	1501573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961733
31054	NC_018015	CTC	2	6	1501652	1501657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961733
31055	NC_018015	CT	3	6	1501659	1501664	0 %	50 %	0 %	50 %	390961733
31056	NC_018015	GAG	2	6	1501724	1501729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961733
31057	NC_018015	GAG	2	6	1501787	1501792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961733
31058	NC_018015	GTC	2	6	1501802	1501807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961733
31059	NC_018015	GA	3	6	1501844	1501849	50 %	0 %	50 %	0 %	390961733
31060	NC_018015	AGCG	2	8	1501850	1501857	25 %	0 %	50 %	25 %	390961733
31061	NC_018015	GCC	2	6	1501926	1501931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961733
31062	NC_018015	CGG	2	6	1501987	1501992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961733
31063	NC_018015	GAG	2	6	1502018	1502023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961733
31064	NC_018015	TTG	2	6	1502154	1502159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31065	NC_018015	GA	4	8	1502218	1502225	50 %	0 %	50 %	0 %	390961734
31066	NC_018015	TAC	2	6	1502273	1502278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961734
31067	NC_018015	GC	3	6	1502391	1502396	0 %	0 %	50 %	50 %	390961734
31068	NC_018015	GACA	2	8	1502414	1502421	50 %	0 %	25 %	25 %	390961734
31069	NC_018015	AGG	2	6	1502432	1502437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961734
31070	NC_018015	GAG	2	6	1502567	1502572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961734
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31073	NC_018015	GGGA	2	8	1502630	1502637	25 %	0 %	75 %	0 %	390961734
31074	NC_018015	ACG	2	6	1502657	1502662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961735
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31083	NC_018015	GGCT	2	8	1502964	1502971	0 %	25 %	50 %	25 %	390961735
31084	NC_018015	AAG	2	6	1503052	1503057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961735
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31087	NC_018015	T	6	6	1503105	1503110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31088	NC_018015	GCTGT	2	10	1503253	1503262	0 %	40 %	40 %	20 %	390961736
31089	NC_018015	TCC	2	6	1503272	1503277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961736
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31091	NC_018015	TGG	2	6	1503358	1503363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961736
31092	NC_018015	CACC	2	8	1503567	1503574	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
31093	NC_018015	GA	3	6	1503593	1503598	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31094	NC_018015	TCC	2	6	1503654	1503659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961737
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31098	NC_018015	TAC	2	6	1503859	1503864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961737
31099	NC_018015	CAGG	2	8	1503867	1503874	25 %	0 %	50 %	25 %	390961737
31100	NC_018015	CGG	2	6	1503890	1503895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961737
31101	NC_018015	CTA	2	6	1503922	1503927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961737
31102	NC_018015	TCA	2	6	1503937	1503942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961737
31103	NC_018015	ACA	2	6	1503948	1503953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390961737
31104	NC_018015	CGG	2	6	1504003	1504008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961738
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31107	NC_018015	ATT	2	6	1504086	1504091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390961738
31108	NC_018015	CGG	2	6	1504134	1504139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961738
31109	NC_018015	GTCCTG	2	12	1504178	1504189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961738
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31112	NC_018015	GAG	2	6	1504396	1504401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961739
31113	NC_018015	CGA	2	6	1504525	1504530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961739
31114	NC_018015	CGA	2	6	1504645	1504650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961740
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31234	NC_018015	CCT	2	6	1510218	1510223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961747
31235	NC_018015	CTC	2	6	1510261	1510266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961747
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31341	NC_018015	AGAGGT	2	12	1514913	1514924	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	390961749
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31344	NC_018015	TCA	2	6	1514963	1514968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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31346	NC_018015	CTT	2	6	1514992	1514997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31347	NC_018015	AAG	2	6	1515206	1515211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961750
31348	NC_018015	CGAT	2	8	1515222	1515229	25 %	25 %	25 %	25 %	390961750
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31350	NC_018015	GAG	2	6	1515241	1515246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961750
31351	NC_018015	GAG	2	6	1515269	1515274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961750
31352	NC_018015	GAAG	2	8	1515280	1515287	50 %	0 %	50 %	0 %	390961750
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31370	NC_018015	TGTA	2	8	1516448	1516455	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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31374	NC_018015	ATC	2	6	1516629	1516634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961751
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31405	NC_018015	G	6	6	1518439	1518444	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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31467	NC_018015	CCT	2	6	1520960	1520965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961755
31468	NC_018015	ATT	2	6	1521016	1521021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390961755
31469	NC_018015	TCGG	2	8	1521112	1521119	0 %	25 %	50 %	25 %	390961755
31470	NC_018015	CCA	2	6	1521125	1521130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961755
31471	NC_018015	TC	3	6	1521171	1521176	0 %	50 %	0 %	50 %	390961755
31472	NC_018015	ATT	2	6	1521199	1521204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390961755
31473	NC_018015	TC	3	6	1521213	1521218	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31474	NC_018015	GGAC	2	8	1521261	1521268	25 %	0 %	50 %	25 %	390961756
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31476	NC_018015	TCG	2	6	1521395	1521400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961756
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31480	NC_018015	TCC	2	6	1521575	1521580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961756
31481	NC_018015	CAC	2	6	1521649	1521654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961756
31482	NC_018015	CTC	2	6	1521661	1521666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961756
31483	NC_018015	CT	3	6	1521715	1521720	0 %	50 %	0 %	50 %	390961756
31484	NC_018015	CCT	2	6	1521745	1521750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961756
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31491	NC_018015	TCC	2	6	1522059	1522064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961756
31492	NC_018015	GGT	2	6	1522224	1522229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961756
31493	NC_018015	CTC	2	6	1522236	1522241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961756
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31495	NC_018015	A	6	6	1522291	1522296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31496	NC_018015	GGC	2	6	1522347	1522352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961757
31497	NC_018015	TCT	2	6	1522399	1522404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961757
31498	NC_018015	ATC	2	6	1522410	1522415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961757
31499	NC_018015	TGA	2	6	1522429	1522434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961757
31500	NC_018015	AGT	2	6	1522441	1522446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961757

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