MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 40260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29502	NC_018015	GAA	2	6	1427254	1427259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961639
29503	NC_018015	TCG	2	6	1427331	1427336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961639
29504	NC_018015	CGA	2	6	1427446	1427451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961639
29505	NC_018015	GCC	2	6	1427632	1427637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961640
29506	NC_018015	CCA	2	6	1427684	1427689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961640
29507	NC_018015	TGA	2	6	1427693	1427698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961640
29508	NC_018015	TCC	2	6	1427719	1427724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961640
29509	NC_018015	CT	3	6	1427730	1427735	0 %	50 %	0 %	50 %	390961640
29510	NC_018015	CTG	2	6	1427738	1427743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961640
29511	NC_018015	AAAGC	2	10	1427785	1427794	60 %	0 %	20 %	20 %	390961640
29512	NC_018015	GAC	2	6	1427829	1427834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961640
29513	NC_018015	GTT	2	6	1427838	1427843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390961640
29514	NC_018015	CT	4	8	1427934	1427941	0 %	50 %	0 %	50 %	390961640
29515	NC_018015	TCA	2	6	1428023	1428028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29516	NC_018015	TCA	2	6	1428049	1428054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29517	NC_018015	CCTC	2	8	1428120	1428127	0 %	25 %	0 %	75 %	390961641
29518	NC_018015	GTTC	2	8	1428132	1428139	0 %	50 %	25 %	25 %	390961641
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29522	NC_018015	CACCGG	2	12	1428267	1428278	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	390961641
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29536	NC_018015	CGA	2	6	1428909	1428914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961641
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29538	NC_018015	TGGGG	2	10	1429038	1429047	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
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29542	NC_018015	TGCTC	2	10	1429250	1429259	0 %	40 %	20 %	40 %	390961642
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29546	NC_018015	TCTGT	2	10	1429447	1429456	0 %	60 %	20 %	20 %	390961643
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29551	NC_018015	GC	3	6	1429535	1429540	0 %	0 %	50 %	50 %	390961643
29552	NC_018015	TGA	2	6	1429564	1429569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961643
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29586	NC_018015	TTCTA	2	10	1431072	1431081	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
29587	NC_018015	GGAA	2	8	1431082	1431089	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29588	NC_018015	TA	3	6	1431094	1431099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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29972	NC_018015	ATC	2	6	1451068	1451073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961670
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