MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 40260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28002	NC_018015	CTT	2	6	1356917	1356922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28003	NC_018015	TCG	2	6	1357095	1357100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961558
28004	NC_018015	GAA	2	6	1357268	1357273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961558
28005	NC_018015	GTCC	2	8	1357292	1357299	0 %	25 %	25 %	50 %	390961558
28006	NC_018015	CGG	2	6	1357382	1357387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961558
28007	NC_018015	CAG	2	6	1357419	1357424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961558
28008	NC_018015	GCC	2	6	1357514	1357519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961558
28009	NC_018015	CGG	2	6	1357586	1357591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961558
28010	NC_018015	GAGGT	2	10	1357593	1357602	20 %	20 %	60 %	0 %	390961558
28011	NC_018015	ACG	2	6	1357617	1357622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961558
28012	NC_018015	GTC	2	6	1357628	1357633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961558
28013	NC_018015	CCG	2	6	1357686	1357691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961558
28014	NC_018015	GCT	2	6	1357708	1357713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961558
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28016	NC_018015	CAG	2	6	1357841	1357846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961558
28017	NC_018015	A	6	6	1357854	1357859	100 %	0 %	0 %	0 %	390961558
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28019	NC_018015	AT	3	6	1358099	1358104	50 %	50 %	0 %	0 %	390961559
28020	NC_018015	TG	3	6	1358210	1358215	0 %	50 %	50 %	0 %	390961559
28021	NC_018015	TTC	2	6	1358244	1358249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961559
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28023	NC_018015	GTT	2	6	1358495	1358500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390961559
28024	NC_018015	TCC	2	6	1358516	1358521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961559
28025	NC_018015	CTG	2	6	1358584	1358589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961559
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28027	NC_018015	GTCT	2	8	1358606	1358613	0 %	50 %	25 %	25 %	390961559
28028	NC_018015	ATT	3	9	1358619	1358627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390961559
28029	NC_018015	ATT	2	6	1358654	1358659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390961559
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28031	NC_018015	AAT	2	6	1358678	1358683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390961559
28032	NC_018015	ATT	2	6	1358720	1358725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390961559
28033	NC_018015	GTAA	2	8	1358849	1358856	50 %	25 %	25 %	0 %	390961559
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28036	NC_018015	TTG	2	6	1358982	1358987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28037	NC_018015	GTA	2	6	1359053	1359058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28038	NC_018015	GTAA	2	8	1359102	1359109	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28039	NC_018015	TAC	2	6	1359110	1359115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28040	NC_018015	TAT	2	6	1359233	1359238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28041	NC_018015	AC	3	6	1359340	1359345	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28042	NC_018015	TGA	4	12	1359399	1359410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961560
28043	NC_018015	TCT	2	6	1359483	1359488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961560
28044	NC_018015	CTC	2	6	1359518	1359523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961560
28045	NC_018015	CGAGC	2	10	1359529	1359538	20 %	0 %	40 %	40 %	390961560
28046	NC_018015	CGA	2	6	1359559	1359564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961560
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28052	NC_018015	GAT	2	6	1359793	1359798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961560
28053	NC_018015	GAC	2	6	1359821	1359826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961560
28054	NC_018015	CCT	2	6	1359844	1359849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961560
28055	NC_018015	GGA	2	6	1359967	1359972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961560
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28112	NC_018015	ATA	2	6	1362576	1362581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390961563
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