MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 40260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25502	NC_018015	GAG	2	6	1238054	1238059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961440
25503	NC_018015	TGA	2	6	1238080	1238085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961440
25504	NC_018015	GTTAA	2	10	1238142	1238151	40 %	40 %	20 %	0 %	390961440
25505	NC_018015	CAA	2	6	1238206	1238211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390961440
25506	NC_018015	CAC	2	6	1238255	1238260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961440
25507	NC_018015	CCT	2	6	1238422	1238427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961440
25508	NC_018015	CT	3	6	1238517	1238522	0 %	50 %	0 %	50 %	390961440
25509	NC_018015	TAT	2	6	1238546	1238551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390961440
25510	NC_018015	GTA	2	6	1238555	1238560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961440
25511	NC_018015	CTCG	2	8	1238666	1238673	0 %	25 %	25 %	50 %	390961440
25512	NC_018015	TCCCG	2	10	1238702	1238711	0 %	20 %	20 %	60 %	390961440
25513	NC_018015	G	6	6	1238727	1238732	0 %	0 %	100 %	0 %	390961440
25514	NC_018015	AGCC	2	8	1238799	1238806	25 %	0 %	25 %	50 %	390961440
25515	NC_018015	CCA	2	6	1238896	1238901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961440
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25517	NC_018015	ACC	2	6	1238989	1238994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961440
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25519	NC_018015	GAGC	2	8	1239092	1239099	25 %	0 %	50 %	25 %	390961440
25520	NC_018015	GAG	2	6	1239219	1239224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961440
25521	NC_018015	CAC	2	6	1239275	1239280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961440
25522	NC_018015	TCG	2	6	1239304	1239309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961440
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25525	NC_018015	CACC	2	8	1239446	1239453	25 %	0 %	0 %	75 %	390961440
25526	NC_018015	GT	3	6	1239498	1239503	0 %	50 %	50 %	0 %	390961440
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25532	NC_018015	GAG	2	6	1239659	1239664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961440
25533	NC_018015	CTTT	2	8	1239701	1239708	0 %	75 %	0 %	25 %	390961440
25534	NC_018015	ATG	2	6	1239714	1239719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961440
25535	NC_018015	TA	3	6	1239741	1239746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25536	NC_018015	TTG	2	6	1239811	1239816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25537	NC_018015	TGG	3	9	1239820	1239828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25538	NC_018015	GGAA	2	8	1239839	1239846	50 %	0 %	50 %	0 %	390961441
25539	NC_018015	ACG	2	6	1239897	1239902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961441
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25541	NC_018015	TGG	2	6	1239978	1239983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961441
25542	NC_018015	GTTCC	2	10	1239998	1240007	0 %	40 %	20 %	40 %	390961441
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25553	NC_018015	TTA	2	6	1240649	1240654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25554	NC_018015	CTTTT	2	10	1240693	1240702	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
25555	NC_018015	TTG	2	6	1240747	1240752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390961442
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25558	NC_018015	TAC	2	6	1240819	1240824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961442
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25567	NC_018015	GGT	2	6	1241187	1241192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25568	NC_018015	GTC	2	6	1241233	1241238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961443
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25589	NC_018015	GAT	2	6	1242219	1242224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961443
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25603	NC_018015	TGG	2	6	1242841	1242846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961444
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25605	NC_018015	TA	3	6	1242885	1242890	50 %	50 %	0 %	0 %	390961444
25606	NC_018015	AT	3	6	1242994	1242999	50 %	50 %	0 %	0 %	390961444
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25613	NC_018015	GAC	2	6	1243168	1243173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961444
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25615	NC_018015	AG	3	6	1243282	1243287	50 %	0 %	50 %	0 %	390961444
25616	NC_018015	TGAAGT	2	12	1243308	1243319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961444
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25732	NC_018015	C	6	6	1248971	1248976	0 %	0 %	0 %	100 %	390961454
25733	NC_018015	CGG	2	6	1249037	1249042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961454
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25969	NC_018015	CTTC	2	8	1260261	1260268	0 %	50 %	0 %	50 %	390961466
25970	NC_018015	TAC	2	6	1260313	1260318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961466
25971	NC_018015	CTGG	2	8	1260406	1260413	0 %	25 %	50 %	25 %	390961466
25972	NC_018015	ACA	2	6	1260419	1260424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390961466
25973	NC_018015	CGT	2	6	1260429	1260434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961466
25974	NC_018015	CT	3	6	1260490	1260495	0 %	50 %	0 %	50 %	390961466
25975	NC_018015	GGGC	2	8	1260569	1260576	0 %	0 %	75 %	25 %	390961466
25976	NC_018015	CTC	2	6	1260598	1260603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961466
25977	NC_018015	TGA	2	6	1260734	1260739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961466
25978	NC_018015	CGG	2	6	1260789	1260794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961466
25979	NC_018015	ACC	2	6	1260817	1260822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961466
25980	NC_018015	TGGC	2	8	1260825	1260832	0 %	25 %	50 %	25 %	390961466
25981	NC_018015	TAC	2	6	1260835	1260840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961466
25982	NC_018015	CCAGG	2	10	1260849	1260858	20 %	0 %	40 %	40 %	390961466
25983	NC_018015	GGA	2	6	1260921	1260926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961466
25984	NC_018015	GGT	2	6	1261005	1261010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961466
25985	NC_018015	CGG	2	6	1261014	1261019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961466
25986	NC_018015	GAC	2	6	1261138	1261143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961466
25987	NC_018015	TGC	2	6	1261149	1261154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961466
25988	NC_018015	CG	3	6	1261180	1261185	0 %	0 %	50 %	50 %	390961466
25989	NC_018015	GTC	3	9	1261288	1261296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961466
25990	NC_018015	CCT	2	6	1261332	1261337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961466
25991	NC_018015	GGA	2	6	1261386	1261391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961466
25992	NC_018015	GTC	2	6	1261417	1261422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961466
25993	NC_018015	G	6	6	1261432	1261437	0 %	0 %	100 %	0 %	390961466
25994	NC_018015	ACG	2	6	1261448	1261453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961466
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25996	NC_018015	AGG	2	6	1261496	1261501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961466
25997	NC_018015	AGG	2	6	1261516	1261521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961466
25998	NC_018015	GACG	2	8	1261536	1261543	25 %	0 %	50 %	25 %	390961466
25999	NC_018015	GGT	2	6	1261560	1261565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961466
26000	NC_018015	GCT	2	6	1261650	1261655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961466

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