MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 40260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24002	NC_018015	TTC	3	9	1168739	1168747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961369
24003	NC_018015	CGC	2	6	1168752	1168757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961369
24004	NC_018015	CTC	2	6	1168868	1168873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961369
24005	NC_018015	ACG	2	6	1168878	1168883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961369
24006	NC_018015	GAG	2	6	1169136	1169141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961369
24007	NC_018015	TCC	2	6	1169157	1169162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961369
24008	NC_018015	CGT	2	6	1169173	1169178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961369
24009	NC_018015	AAT	2	6	1169182	1169187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390961369
24010	NC_018015	CGG	2	6	1169191	1169196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961369
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24018	NC_018015	CGT	2	6	1169533	1169538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961369
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24020	NC_018015	CGATG	2	10	1169650	1169659	20 %	20 %	40 %	20 %	390961369
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24105	NC_018015	GAG	2	6	1173699	1173704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961372
24106	NC_018015	AGC	2	6	1173730	1173735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961372
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24108	NC_018015	T	6	6	1173823	1173828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24109	NC_018015	AG	3	6	1174004	1174009	50 %	0 %	50 %	0 %	390961373
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24114	NC_018015	GAG	2	6	1174179	1174184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961373
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24116	NC_018015	GCC	2	6	1174274	1174279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961373
24117	NC_018015	CAG	2	6	1174407	1174412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961373
24118	NC_018015	TCG	2	6	1174435	1174440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961373
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24121	NC_018015	CAG	2	6	1174521	1174526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961373
24122	NC_018015	GAT	2	6	1174538	1174543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961373
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24128	NC_018015	GC	3	6	1174724	1174729	0 %	0 %	50 %	50 %	390961373
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24146	NC_018015	CA	3	6	1175749	1175754	50 %	0 %	0 %	50 %	390961374
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24148	NC_018015	CGT	2	6	1175837	1175842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961374
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24178	NC_018015	GAC	2	6	1177241	1177246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961375
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24181	NC_018015	TC	3	6	1177403	1177408	0 %	50 %	0 %	50 %	390961375
24182	NC_018015	TAC	2	6	1177412	1177417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961375
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24185	NC_018015	CTT	2	6	1177623	1177628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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24193	NC_018015	TCC	2	6	1178267	1178272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961377
24194	NC_018015	CTG	2	6	1178276	1178281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961377
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24200	NC_018015	TGG	2	6	1178554	1178559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961377
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24204	NC_018015	CGGTG	2	10	1178640	1178649	0 %	20 %	60 %	20 %	390961377
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24211	NC_018015	AGG	2	6	1178938	1178943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961377
24212	NC_018015	CGA	2	6	1178987	1178992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961377
24213	NC_018015	TCC	2	6	1179095	1179100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961377
24214	NC_018015	ACGTTT	2	12	1179164	1179175	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	390961377
24215	NC_018015	CCG	2	6	1179179	1179184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961377
24216	NC_018015	CGTGAA	2	12	1179207	1179218	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	390961377
24217	NC_018015	TGG	2	6	1179260	1179265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961377
24218	NC_018015	G	7	7	1179264	1179270	0 %	0 %	100 %	0 %	390961377
24219	NC_018015	CCGTC	2	10	1179276	1179285	0 %	20 %	20 %	60 %	390961377
24220	NC_018015	AGGG	2	8	1179316	1179323	25 %	0 %	75 %	0 %	390961377
24221	NC_018015	CTC	2	6	1179399	1179404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961378
24222	NC_018015	CAC	2	6	1179414	1179419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961378
24223	NC_018015	TCA	2	6	1179421	1179426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961378
24224	NC_018015	CAC	2	6	1179441	1179446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961378
24225	NC_018015	CCG	2	6	1179668	1179673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961378
24226	NC_018015	CTT	2	6	1179737	1179742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961378
24227	NC_018015	CGG	2	6	1179813	1179818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961378
24228	NC_018015	CGT	2	6	1179851	1179856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961378
24229	NC_018015	C	6	6	1179976	1179981	0 %	0 %	0 %	100 %	390961378
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24338	NC_018015	CCT	2	6	1184775	1184780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24339	NC_018015	A	6	6	1184838	1184843	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24349	NC_018015	CGT	2	6	1185147	1185152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961382
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24460	NC_018015	G	7	7	1190975	1190981	0 %	0 %	100 %	0 %	390961388
24461	NC_018015	AAG	2	6	1190989	1190994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961388
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24467	NC_018015	CCT	2	6	1191264	1191269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961388
24468	NC_018015	GAC	2	6	1191283	1191288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961388
24469	NC_018015	CGT	2	6	1191342	1191347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961388
24470	NC_018015	GC	3	6	1191447	1191452	0 %	0 %	50 %	50 %	390961389
24471	NC_018015	CCT	2	6	1191491	1191496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961389
24472	NC_018015	GTC	2	6	1191520	1191525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961389
24473	NC_018015	TCC	2	6	1191550	1191555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961389
24474	NC_018015	CCA	2	6	1191570	1191575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961389
24475	NC_018015	TC	3	6	1191621	1191626	0 %	50 %	0 %	50 %	390961389
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24479	NC_018015	CGA	2	6	1191919	1191924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961390
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24481	NC_018015	GCG	2	6	1192045	1192050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961390
24482	NC_018015	CT	3	6	1192067	1192072	0 %	50 %	0 %	50 %	390961391
24483	NC_018015	AGT	2	6	1192094	1192099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961391
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24486	NC_018015	CTG	2	6	1192246	1192251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961391
24487	NC_018015	GGGGA	2	10	1192386	1192395	20 %	0 %	80 %	0 %	390961391
24488	NC_018015	TCT	2	6	1192430	1192435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961391
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24491	NC_018015	CAT	2	6	1192623	1192628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961391
24492	NC_018015	AT	3	6	1192648	1192653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24493	NC_018015	TTA	2	6	1192695	1192700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24494	NC_018015	TGG	2	6	1192762	1192767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961392
24495	NC_018015	ATA	2	6	1192791	1192796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390961392
24496	NC_018015	CTC	2	6	1192800	1192805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961392
24497	NC_018015	GAGG	2	8	1192841	1192848	25 %	0 %	75 %	0 %	390961392
24498	NC_018015	TTC	2	6	1192851	1192856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961392
24499	NC_018015	GGCGG	2	10	1192863	1192872	0 %	0 %	80 %	20 %	390961392
24500	NC_018015	GCTC	2	8	1192892	1192899	0 %	25 %	25 %	50 %	390961392

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