MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 40260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23501	NC_018015	GA	3	6	1145124	1145129	50 %	0 %	50 %	0 %	390961341
23502	NC_018015	TCA	2	6	1145133	1145138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961341
23503	NC_018015	ATCTCT	2	12	1145160	1145171	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	390961341
23504	NC_018015	CGT	2	6	1145177	1145182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23505	NC_018015	TTG	2	6	1145223	1145228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23506	NC_018015	ACA	2	6	1145267	1145272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390961342
23507	NC_018015	GCTTAC	2	12	1145335	1145346	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	390961342
23508	NC_018015	GGA	2	6	1145403	1145408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961342
23509	NC_018015	CAC	2	6	1145421	1145426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961342
23510	NC_018015	CCT	2	6	1145448	1145453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961342
23511	NC_018015	CCT	2	6	1145481	1145486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961342
23512	NC_018015	AGG	2	6	1145497	1145502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961342
23513	NC_018015	CGC	2	6	1145510	1145515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961342
23514	NC_018015	CCA	2	6	1145534	1145539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961342
23515	NC_018015	GGCA	2	8	1145632	1145639	25 %	0 %	50 %	25 %	390961342
23516	NC_018015	GGA	2	6	1145774	1145779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961342
23517	NC_018015	CGT	2	6	1145924	1145929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961343
23518	NC_018015	GAC	2	6	1145961	1145966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961343
23519	NC_018015	ACA	2	6	1146094	1146099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390961343
23520	NC_018015	GCCTGG	2	12	1146229	1146240	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	390961343
23521	NC_018015	GAT	2	6	1146241	1146246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961343
23522	NC_018015	GGTA	2	8	1146252	1146259	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23523	NC_018015	TGA	2	6	1146269	1146274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23524	NC_018015	TC	3	6	1146324	1146329	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23525	NC_018015	G	6	6	1146391	1146396	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
23526	NC_018015	TGA	2	6	1146438	1146443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23527	NC_018015	CTG	2	6	1146448	1146453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23528	NC_018015	TGG	2	6	1146473	1146478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23529	NC_018015	GCTT	2	8	1146491	1146498	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23530	NC_018015	CTT	2	6	1146528	1146533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23531	NC_018015	ACTTG	2	10	1146583	1146592	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
23532	NC_018015	T	6	6	1146597	1146602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23533	NC_018015	ACT	2	6	1146607	1146612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23534	NC_018015	G	7	7	1146628	1146634	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
23535	NC_018015	GAA	2	6	1146746	1146751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23536	NC_018015	TGA	2	6	1146763	1146768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23537	NC_018015	GTG	2	6	1146801	1146806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23538	NC_018015	CTC	2	6	1146813	1146818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23539	NC_018015	TCA	2	6	1146845	1146850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23540	NC_018015	TGG	2	6	1146887	1146892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23541	NC_018015	CCCGA	2	10	1146923	1146932	20 %	0 %	20 %	60 %	390961344
23542	NC_018015	ACG	2	6	1147058	1147063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961344
23543	NC_018015	GAG	2	6	1147072	1147077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961344
23544	NC_018015	GTC	2	6	1147099	1147104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961344
23545	NC_018015	TGG	2	6	1147116	1147121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961344
23546	NC_018015	ACG	2	6	1147136	1147141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961344
23547	NC_018015	GGT	2	6	1147164	1147169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961344
23548	NC_018015	ACC	2	6	1147181	1147186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961344
23549	NC_018015	ACGCG	2	10	1147376	1147385	20 %	0 %	40 %	40 %	390961344
23550	NC_018015	CAAAG	2	10	1147419	1147428	60 %	0 %	20 %	20 %	390961344
23551	NC_018015	AAC	2	6	1147467	1147472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390961344
23552	NC_018015	TTC	2	6	1147820	1147825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961345
23553	NC_018015	CGA	2	6	1147888	1147893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961345
23554	NC_018015	CGA	2	6	1147987	1147992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961345
23555	NC_018015	GGCT	2	8	1148007	1148014	0 %	25 %	50 %	25 %	390961345
23556	NC_018015	TTC	2	6	1148132	1148137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961345
23557	NC_018015	TCC	2	6	1148149	1148154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961345
23558	NC_018015	AGG	3	9	1148161	1148169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961345
23559	NC_018015	TGA	2	6	1148194	1148199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961345
23560	NC_018015	TC	3	6	1148238	1148243	0 %	50 %	0 %	50 %	390961345
23561	NC_018015	CGTTTT	2	12	1148304	1148315	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23562	NC_018015	GTAA	2	8	1148346	1148353	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23563	NC_018015	GTG	2	6	1148433	1148438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23564	NC_018015	CCCGGC	2	12	1148488	1148499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23565	NC_018015	A	6	6	1148623	1148628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23566	NC_018015	GGGAAG	2	12	1148845	1148856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961346
23567	NC_018015	ACC	2	6	1148857	1148862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961346
23568	NC_018015	CGG	2	6	1148898	1148903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961346
23569	NC_018015	TCC	2	6	1148915	1148920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961346
23570	NC_018015	AGA	3	9	1148954	1148962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961346
23571	NC_018015	GCG	2	6	1148972	1148977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961346
23572	NC_018015	AGCCCG	2	12	1149020	1149031	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	390961346
23573	NC_018015	GGC	2	6	1149042	1149047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961346
23574	NC_018015	A	6	6	1149049	1149054	100 %	0 %	0 %	0 %	390961346
23575	NC_018015	GC	3	6	1149063	1149068	0 %	0 %	50 %	50 %	390961346
23576	NC_018015	GAAG	2	8	1149069	1149076	50 %	0 %	50 %	0 %	390961346
23577	NC_018015	CGA	2	6	1149111	1149116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961346
23578	NC_018015	GAT	2	6	1149168	1149173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961346
23579	NC_018015	GAG	2	6	1149226	1149231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961346
23580	NC_018015	GAGG	2	8	1149264	1149271	25 %	0 %	75 %	0 %	390961346
23581	NC_018015	TCCT	2	8	1149330	1149337	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23582	NC_018015	TTAG	2	8	1149366	1149373	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23583	NC_018015	GGA	2	6	1149393	1149398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23584	NC_018015	GAGC	2	8	1149437	1149444	25 %	0 %	50 %	25 %	390961347
23585	NC_018015	CAG	2	6	1149450	1149455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961347
23586	NC_018015	GTC	2	6	1149480	1149485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961347
23587	NC_018015	GTC	2	6	1149495	1149500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961347
23588	NC_018015	GC	3	6	1149515	1149520	0 %	0 %	50 %	50 %	390961347
23589	NC_018015	TCC	2	6	1149541	1149546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961347
23590	NC_018015	CGA	2	6	1149548	1149553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961347
23591	NC_018015	GCCG	2	8	1149563	1149570	0 %	0 %	50 %	50 %	390961347
23592	NC_018015	GAG	2	6	1149600	1149605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961347
23593	NC_018015	CAT	2	6	1149644	1149649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961347
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23595	NC_018015	CCGTG	2	10	1149821	1149830	0 %	20 %	40 %	40 %	390961348
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23602	NC_018015	GGA	2	6	1150077	1150082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961348
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23604	NC_018015	GGC	2	6	1150218	1150223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961348
23605	NC_018015	CAC	2	6	1150295	1150300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961349
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23608	NC_018015	TAT	2	6	1150505	1150510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390961349
23609	NC_018015	CGA	2	6	1150567	1150572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961349
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23614	NC_018015	CTC	2	6	1150769	1150774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961349
23615	NC_018015	TAGCC	2	10	1150942	1150951	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
23616	NC_018015	GCG	3	9	1150957	1150965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23617	NC_018015	ACC	2	6	1151009	1151014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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23619	NC_018015	GAG	2	6	1151122	1151127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961350
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