MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 40260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23002	NC_018015	G	6	6	1122747	1122752	0 %	0 %	100 %	0 %	390961321
23003	NC_018015	ATA	2	6	1122785	1122790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390961321
23004	NC_018015	TGG	3	9	1122855	1122863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961321
23005	NC_018015	AGG	2	6	1123060	1123065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961322
23006	NC_018015	TGA	2	6	1123093	1123098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961322
23007	NC_018015	GAGG	2	8	1123109	1123116	25 %	0 %	75 %	0 %	390961322
23008	NC_018015	GCC	2	6	1123158	1123163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961322
23009	NC_018015	CGG	2	6	1123210	1123215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961322
23010	NC_018015	GGC	2	6	1123259	1123264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961322
23011	NC_018015	AG	3	6	1123307	1123312	50 %	0 %	50 %	0 %	390961322
23012	NC_018015	AG	3	6	1123364	1123369	50 %	0 %	50 %	0 %	390961322
23013	NC_018015	GCG	2	6	1123512	1123517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961322
23014	NC_018015	ATG	2	6	1123533	1123538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961322
23015	NC_018015	T	6	6	1123578	1123583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23016	NC_018015	TTC	2	6	1123622	1123627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961323
23017	NC_018015	TCCT	2	8	1123769	1123776	0 %	50 %	0 %	50 %	390961323
23018	NC_018015	TTCT	2	8	1123781	1123788	0 %	75 %	0 %	25 %	390961323
23019	NC_018015	ATA	2	6	1123811	1123816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390961323
23020	NC_018015	TTCC	2	8	1123817	1123824	0 %	50 %	0 %	50 %	390961323
23021	NC_018015	CCG	2	6	1123884	1123889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961323
23022	NC_018015	TGG	2	6	1123893	1123898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961323
23023	NC_018015	CGT	2	6	1123927	1123932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961323
23024	NC_018015	TCT	2	6	1123977	1123982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961323
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23026	NC_018015	CAGG	2	8	1124095	1124102	25 %	0 %	50 %	25 %	390961323
23027	NC_018015	ACCTC	2	10	1124124	1124133	20 %	20 %	0 %	60 %	390961323
23028	NC_018015	CCCG	2	8	1124158	1124165	0 %	0 %	25 %	75 %	390961323
23029	NC_018015	TGG	2	6	1124177	1124182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961323
23030	NC_018015	AG	3	6	1124209	1124214	50 %	0 %	50 %	0 %	390961323
23031	NC_018015	ACT	2	6	1124303	1124308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961323
23032	NC_018015	CTC	2	6	1124315	1124320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961323
23033	NC_018015	GGT	2	6	1124390	1124395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23034	NC_018015	GAT	2	6	1124398	1124403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961324
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23036	NC_018015	CTT	2	6	1124449	1124454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961324
23037	NC_018015	GAGG	2	8	1124533	1124540	25 %	0 %	75 %	0 %	390961324
23038	NC_018015	CCT	2	6	1124554	1124559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961324
23039	NC_018015	CCT	2	6	1124608	1124613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961324
23040	NC_018015	TGG	2	6	1124916	1124921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961324
23041	NC_018015	CGA	2	6	1124944	1124949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961324
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23043	NC_018015	GAC	2	6	1125025	1125030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961324
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23046	NC_018015	GGAA	2	8	1125112	1125119	50 %	0 %	50 %	0 %	390961324
23047	NC_018015	GAG	2	6	1125125	1125130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961324
23048	NC_018015	GCTCC	2	10	1125186	1125195	0 %	20 %	20 %	60 %	390961324
23049	NC_018015	GC	3	6	1125318	1125323	0 %	0 %	50 %	50 %	390961324
23050	NC_018015	GGA	2	6	1125343	1125348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961324
23051	NC_018015	GTG	2	6	1125443	1125448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23052	NC_018015	TA	3	6	1125502	1125507	50 %	50 %	0 %	0 %	390961325
23053	NC_018015	GTGG	2	8	1125516	1125523	0 %	25 %	75 %	0 %	390961325
23054	NC_018015	AG	3	6	1125627	1125632	50 %	0 %	50 %	0 %	390961325
23055	NC_018015	TGA	2	6	1125692	1125697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961325
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23057	NC_018015	T	6	6	1125714	1125719	0 %	100 %	0 %	0 %	390961325
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23061	NC_018015	GTT	2	6	1125921	1125926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390961325
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23068	NC_018015	GCG	2	6	1126159	1126164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961325
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23089	NC_018015	CGA	2	6	1126748	1126753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961325
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23092	NC_018015	GAG	2	6	1126872	1126877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961325
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23101	NC_018015	T	7	7	1127237	1127243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23102	NC_018015	G	6	6	1127256	1127261	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
23103	NC_018015	TCA	2	6	1127277	1127282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961326
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23106	NC_018015	TCA	2	6	1127554	1127559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961326
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23108	NC_018015	GGT	2	6	1127618	1127623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23109	NC_018015	C	6	6	1127654	1127659	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
23110	NC_018015	T	7	7	1127718	1127724	0 %	100 %	0 %	0 %	390961327
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23114	NC_018015	CTG	2	6	1127947	1127952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961327
23115	NC_018015	TC	3	6	1127961	1127966	0 %	50 %	0 %	50 %	390961327
23116	NC_018015	TTCGG	2	10	1127971	1127980	0 %	40 %	40 %	20 %	390961327
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23119	NC_018015	GTT	2	6	1128190	1128195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390961327
23120	NC_018015	TCC	2	6	1128209	1128214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961327
23121	NC_018015	CTC	2	6	1128280	1128285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961327
23122	NC_018015	ACT	2	6	1128296	1128301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961327
23123	NC_018015	TCGC	2	8	1128406	1128413	0 %	25 %	25 %	50 %	390961327
23124	NC_018015	GGA	2	6	1128431	1128436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961327
23125	NC_018015	TC	3	6	1128482	1128487	0 %	50 %	0 %	50 %	390961327
23126	NC_018015	TAC	2	6	1128601	1128606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961327
23127	NC_018015	CT	3	6	1128660	1128665	0 %	50 %	0 %	50 %	390961327
23128	NC_018015	TTC	2	6	1128737	1128742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961327
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23130	NC_018015	GAG	2	6	1128756	1128761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961327
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23132	NC_018015	CTG	2	6	1128952	1128957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961327
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23134	NC_018015	TTG	2	6	1129022	1129027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390961327
23135	NC_018015	TCA	2	6	1129040	1129045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961327
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23149	NC_018015	CTG	2	6	1129775	1129780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961328
23150	NC_018015	GT	3	6	1129793	1129798	0 %	50 %	50 %	0 %	390961328
23151	NC_018015	TCC	2	6	1129799	1129804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961328
23152	NC_018015	GGCT	2	8	1129818	1129825	0 %	25 %	50 %	25 %	390961328
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23154	NC_018015	G	6	6	1129920	1129925	0 %	0 %	100 %	0 %	390961328
23155	NC_018015	GGA	2	6	1129945	1129950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961328
23156	NC_018015	ATAG	2	8	1130054	1130061	50 %	25 %	25 %	0 %	390961328
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23159	NC_018015	CT	3	6	1130184	1130189	0 %	50 %	0 %	50 %	390961328
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23161	NC_018015	GGAAA	2	10	1130229	1130238	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
23162	NC_018015	CG	3	6	1130297	1130302	0 %	0 %	50 %	50 %	390961329
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23188	NC_018015	CTTC	2	8	1131429	1131436	0 %	50 %	0 %	50 %	390961330
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23193	NC_018015	CTC	2	6	1131708	1131713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961330
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23200	NC_018015	TGA	2	6	1132030	1132035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961330
23201	NC_018015	ATTCTC	2	12	1132037	1132048	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	390961330
23202	NC_018015	ACG	2	6	1132050	1132055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961330
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23204	NC_018015	TCG	2	6	1132150	1132155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961330
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23209	NC_018015	GTC	2	6	1132419	1132424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961330
23210	NC_018015	GAT	2	6	1132467	1132472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961330
23211	NC_018015	GAA	2	6	1132506	1132511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23212	NC_018015	ATC	2	6	1132534	1132539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961331
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23214	NC_018015	TGA	2	6	1132583	1132588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961331
23215	NC_018015	ACA	2	6	1132627	1132632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390961331
23216	NC_018015	CCT	2	6	1132661	1132666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961331
23217	NC_018015	CTTTC	2	10	1132705	1132714	0 %	60 %	0 %	40 %	390961331
23218	NC_018015	CGG	2	6	1132775	1132780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23219	NC_018015	ACC	2	6	1132811	1132816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961332
23220	NC_018015	A	7	7	1132934	1132940	100 %	0 %	0 %	0 %	390961332
23221	NC_018015	GAGG	2	8	1132989	1132996	25 %	0 %	75 %	0 %	390961332
23222	NC_018015	ATA	2	6	1133002	1133007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390961332
23223	NC_018015	CGC	2	6	1133033	1133038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961332
23224	NC_018015	G	6	6	1133202	1133207	0 %	0 %	100 %	0 %	390961332
23225	NC_018015	ATC	2	6	1133218	1133223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961332
23226	NC_018015	GAA	2	6	1133274	1133279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961332
23227	NC_018015	GGCGAT	2	12	1133289	1133300	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	390961332
23228	NC_018015	CGC	2	6	1133329	1133334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961332
23229	NC_018015	AGG	3	9	1133338	1133346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961332
23230	NC_018015	GGA	2	6	1133358	1133363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961332
23231	NC_018015	GAGG	2	8	1133379	1133386	25 %	0 %	75 %	0 %	390961332
23232	NC_018015	CTT	2	6	1133434	1133439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961332
23233	NC_018015	ACC	2	6	1133543	1133548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961333
23234	NC_018015	GCTATC	2	12	1133552	1133563	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	390961333
23235	NC_018015	CGCTAT	2	12	1133656	1133667	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	390961333
23236	NC_018015	GTT	2	6	1133797	1133802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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23352	NC_018015	CTT	2	6	1139692	1139697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961337
23353	NC_018015	CGCCTA	2	12	1139716	1139727	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	390961337
23354	NC_018015	CGA	2	6	1139764	1139769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961337
23355	NC_018015	TCC	2	6	1139781	1139786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961337
23356	NC_018015	CA	3	6	1139794	1139799	50 %	0 %	0 %	50 %	390961337
23357	NC_018015	CTCTTC	2	12	1139891	1139902	0 %	50 %	0 %	50 %	390961337
23358	NC_018015	TTCATG	2	12	1139975	1139986	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	390961337
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23367	NC_018015	CTT	2	6	1140172	1140177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961337
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23374	NC_018015	GGA	2	6	1140335	1140340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961337
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23378	NC_018015	CTA	2	6	1140424	1140429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961337
23379	NC_018015	CTC	2	6	1140446	1140451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961337
23380	NC_018015	CTA	2	6	1140589	1140594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961337
23381	NC_018015	CGT	2	6	1140625	1140630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961337
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23390	NC_018015	CGG	2	6	1140900	1140905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961338
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23412	NC_018015	GA	3	6	1141478	1141483	50 %	0 %	50 %	0 %	390961338
23413	NC_018015	ACA	2	6	1141497	1141502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390961338
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23416	NC_018015	AGG	2	6	1141730	1141735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961338
23417	NC_018015	GTC	2	6	1141757	1141762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961338
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23423	NC_018015	TCC	2	6	1141957	1141962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961338
23424	NC_018015	CGT	2	6	1141975	1141980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961338
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23429	NC_018015	TAG	2	6	1142142	1142147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961338
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23442	NC_018015	GCG	2	6	1142502	1142507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961339
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23447	NC_018015	TCG	2	6	1142847	1142852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961339
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23451	NC_018015	TCCC	2	8	1142998	1143005	0 %	25 %	0 %	75 %	390961339
23452	NC_018015	CTG	2	6	1143023	1143028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961339
23453	NC_018015	G	6	6	1143147	1143152	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
23454	NC_018015	GAG	2	6	1143251	1143256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961340
23455	NC_018015	GTA	2	6	1143317	1143322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961340
23456	NC_018015	ACG	2	6	1143450	1143455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961340
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23458	NC_018015	CGTC	2	8	1143487	1143494	0 %	25 %	25 %	50 %	390961340
23459	NC_018015	GGT	2	6	1143505	1143510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961340
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23462	NC_018015	CCG	2	6	1143666	1143671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961340
23463	NC_018015	TC	3	6	1143677	1143682	0 %	50 %	0 %	50 %	390961340
23464	NC_018015	GAG	2	6	1143761	1143766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961340
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23466	NC_018015	CTCC	2	8	1143793	1143800	0 %	25 %	0 %	75 %	390961340
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23468	NC_018015	TC	3	6	1143847	1143852	0 %	50 %	0 %	50 %	390961340
23469	NC_018015	GCTC	2	8	1143877	1143884	0 %	25 %	25 %	50 %	390961340
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