MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 40260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21502	NC_018015	TGT	2	6	1049039	1049044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390961240
21503	NC_018015	GAG	2	6	1049121	1049126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961240
21504	NC_018015	ATT	2	6	1049228	1049233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390961241
21505	NC_018015	ACA	2	6	1049237	1049242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390961241
21506	NC_018015	AACAAA	2	12	1049294	1049305	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	390961241
21507	NC_018015	TC	3	6	1049331	1049336	0 %	50 %	0 %	50 %	390961241
21508	NC_018015	GGA	2	6	1049515	1049520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961241
21509	NC_018015	AAG	2	6	1049528	1049533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961241
21510	NC_018015	A	6	6	1049556	1049561	100 %	0 %	0 %	0 %	390961241
21511	NC_018015	CTT	2	6	1049682	1049687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961241
21512	NC_018015	CT	3	6	1049715	1049720	0 %	50 %	0 %	50 %	390961241
21513	NC_018015	A	6	6	1049780	1049785	100 %	0 %	0 %	0 %	390961241
21514	NC_018015	G	6	6	1049961	1049966	0 %	0 %	100 %	0 %	390961241
21515	NC_018015	A	7	7	1049983	1049989	100 %	0 %	0 %	0 %	390961241
21516	NC_018015	ATA	2	6	1050018	1050023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390961241
21517	NC_018015	TAA	2	6	1050133	1050138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390961241
21518	NC_018015	CAA	2	6	1050271	1050276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390961241
21519	NC_018015	CGT	2	6	1050281	1050286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961241
21520	NC_018015	TGA	2	6	1050292	1050297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961241
21521	NC_018015	AGA	2	6	1050365	1050370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961241
21522	NC_018015	TGG	3	9	1050385	1050393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961241
21523	NC_018015	ATG	2	6	1050441	1050446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961241
21524	NC_018015	CA	3	6	1050671	1050676	50 %	0 %	0 %	50 %	390961241
21525	NC_018015	GCA	2	6	1050725	1050730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961241
21526	NC_018015	GAT	2	6	1050761	1050766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961241
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21528	NC_018015	G	6	6	1050829	1050834	0 %	0 %	100 %	0 %	390961241
21529	NC_018015	GAAG	2	8	1050871	1050878	50 %	0 %	50 %	0 %	390961241
21530	NC_018015	AGC	2	6	1050970	1050975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961241
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21532	NC_018015	TGGA	2	8	1051055	1051062	25 %	25 %	50 %	0 %	390961241
21533	NC_018015	ACA	2	6	1051098	1051103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390961242
21534	NC_018015	ATC	2	6	1051108	1051113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961242
21535	NC_018015	TGA	2	6	1051163	1051168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961242
21536	NC_018015	ATA	2	6	1051210	1051215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390961242
21537	NC_018015	A	6	6	1051240	1051245	100 %	0 %	0 %	0 %	390961242
21538	NC_018015	CTT	2	6	1051294	1051299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961242
21539	NC_018015	A	6	6	1051329	1051334	100 %	0 %	0 %	0 %	390961242
21540	NC_018015	A	6	6	1051368	1051373	100 %	0 %	0 %	0 %	390961242
21541	NC_018015	GGA	2	6	1051455	1051460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961242
21542	NC_018015	GAG	2	6	1051566	1051571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21543	NC_018015	G	6	6	1051627	1051632	0 %	0 %	100 %	0 %	390961243
21544	NC_018015	TC	3	6	1051635	1051640	0 %	50 %	0 %	50 %	390961243
21545	NC_018015	AGC	2	6	1051672	1051677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961243
21546	NC_018015	TACAAC	2	12	1051709	1051720	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	390961243
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21550	NC_018015	A	6	6	1051921	1051926	100 %	0 %	0 %	0 %	390961243
21551	NC_018015	GAT	2	6	1052035	1052040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961243
21552	NC_018015	TGA	2	6	1052077	1052082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961243
21553	NC_018015	GCC	2	6	1052147	1052152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961243
21554	NC_018015	AAG	2	6	1052173	1052178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961243
21555	NC_018015	TTG	2	6	1052190	1052195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390961243
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21557	NC_018015	CA	3	6	1052248	1052253	50 %	0 %	0 %	50 %	390961243
21558	NC_018015	TGAT	2	8	1052286	1052293	25 %	50 %	25 %	0 %	390961243
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21568	NC_018015	A	6	6	1052879	1052884	100 %	0 %	0 %	0 %	390961243
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21572	NC_018015	TAT	2	6	1053092	1053097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390961244
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21579	NC_018015	AAT	2	6	1053453	1053458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390961244
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21585	NC_018015	CAT	2	6	1053633	1053638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21586	NC_018015	GAG	2	6	1053733	1053738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21587	NC_018015	ACG	2	6	1053761	1053766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21588	NC_018015	TG	3	6	1053835	1053840	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21589	NC_018015	GGAAT	2	10	1053882	1053891	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
21590	NC_018015	AG	3	6	1053906	1053911	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21591	NC_018015	TGT	2	6	1053919	1053924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21592	NC_018015	TGG	2	6	1053939	1053944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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21601	NC_018015	AC	3	6	1054301	1054306	50 %	0 %	0 %	50 %	390961245
21602	NC_018015	TCC	2	6	1054319	1054324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961245
21603	NC_018015	AGG	2	6	1054335	1054340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961245
21604	NC_018015	CTG	2	6	1054346	1054351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961245
21605	NC_018015	AG	3	6	1054385	1054390	50 %	0 %	50 %	0 %	390961245
21606	NC_018015	GAA	2	6	1054513	1054518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961245
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21610	NC_018015	TAC	2	6	1054760	1054765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961245
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21612	NC_018015	TAC	2	6	1054775	1054780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961245
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21615	NC_018015	AATA	2	8	1055000	1055007	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21616	NC_018015	AAT	2	6	1055050	1055055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21617	NC_018015	CAG	2	6	1055125	1055130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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