MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 40260

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20122	NC_018015	CGG	2	6	981401	981406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961178
20123	NC_018015	GAC	3	9	981426	981434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961178
20124	NC_018015	CTC	2	6	981477	981482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961178
20125	NC_018015	GAG	2	6	981486	981491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961178
20126	NC_018015	G	6	6	981491	981496	0 %	0 %	100 %	0 %	390961178
20127	NC_018015	CGG	2	6	981519	981524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961178
20128	NC_018015	TGT	2	6	981566	981571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390961178
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20131	NC_018015	GGC	3	9	981717	981725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961178
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20133	NC_018015	CGA	2	6	981770	981775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961178
20134	NC_018015	GCTC	2	8	981797	981804	0 %	25 %	25 %	50 %	390961178
20135	NC_018015	GGGA	2	8	981931	981938	25 %	0 %	75 %	0 %	390961178
20136	NC_018015	TAT	2	6	981990	981995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390961178
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20139	NC_018015	AGCTC	2	10	982067	982076	20 %	20 %	20 %	40 %	390961178
20140	NC_018015	ACGCGG	2	12	982108	982119	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	390961178
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20142	NC_018015	ATCTCA	2	12	982258	982269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961178
20143	NC_018015	GAA	3	9	982332	982340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961178
20144	NC_018015	CGA	2	6	982346	982351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961178
20145	NC_018015	AGG	3	9	982372	982380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961178
20146	NC_018015	AGG	2	6	982402	982407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961178
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20149	NC_018015	AACGGC	2	12	982674	982685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961179
20150	NC_018015	CGT	2	6	982691	982696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961179
20151	NC_018015	AAG	2	6	982749	982754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961179
20152	NC_018015	CTATCT	2	12	982781	982792	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	390961179
20153	NC_018015	TCC	2	6	982801	982806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961179
20154	NC_018015	TGG	2	6	982808	982813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961179
20155	NC_018015	CCT	2	6	982862	982867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961179
20156	NC_018015	TCC	2	6	982894	982899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961179
20157	NC_018015	TCC	2	6	982927	982932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961179
20158	NC_018015	TATCTC	2	12	982959	982970	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	390961179
20159	NC_018015	CCT	2	6	983048	983053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961179
20160	NC_018015	CGATGA	2	12	983075	983086	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	390961179
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20165	NC_018015	TCC	2	6	983380	983385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961179
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20167	NC_018015	GA	3	6	983470	983475	50 %	0 %	50 %	0 %	390961179
20168	NC_018015	TC	3	6	983498	983503	0 %	50 %	0 %	50 %	390961179
20169	NC_018015	TTCA	2	8	983509	983516	25 %	50 %	0 %	25 %	390961179
20170	NC_018015	CG	3	6	983572	983577	0 %	0 %	50 %	50 %	390961180
20171	NC_018015	TGA	2	6	983607	983612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961180
20172	NC_018015	GTGA	2	8	983613	983620	25 %	25 %	50 %	0 %	390961180
20173	NC_018015	GTC	2	6	983635	983640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961180
20174	NC_018015	TCT	2	6	983667	983672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961180
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20178	NC_018015	GCCA	2	8	983846	983853	25 %	0 %	25 %	50 %	390961180
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20183	NC_018015	CCAG	2	8	984124	984131	25 %	0 %	25 %	50 %	390961181
20184	NC_018015	CAA	2	6	984154	984159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390961181
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20186	NC_018015	TCC	3	9	984250	984258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961181
20187	NC_018015	AGG	2	6	984330	984335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961181
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20189	NC_018015	GGC	2	6	984362	984367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961181
20190	NC_018015	CCGGCG	2	12	984391	984402	0 %	0 %	50 %	50 %	390961181
20191	NC_018015	CGT	2	6	984422	984427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961181
20192	NC_018015	G	6	6	984461	984466	0 %	0 %	100 %	0 %	390961181
20193	NC_018015	GTA	2	6	984488	984493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961181
20194	NC_018015	CAG	2	6	984617	984622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961181
20195	NC_018015	AGC	2	6	984642	984647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961181
20196	NC_018015	GAAG	2	8	984656	984663	50 %	0 %	50 %	0 %	390961181
20197	NC_018015	CAT	2	6	984707	984712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961181
20198	NC_018015	TCA	2	6	984718	984723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961181
20199	NC_018015	CAG	2	6	984731	984736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961181
20200	NC_018015	GGT	2	6	984832	984837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20201	NC_018015	AGG	2	6	984893	984898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961182
20202	NC_018015	CTGG	2	8	984945	984952	0 %	25 %	50 %	25 %	390961182
20203	NC_018015	GAG	2	6	984961	984966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961182
20204	NC_018015	GTGGAG	2	12	984979	984990	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	390961182
20205	NC_018015	AGG	2	6	985010	985015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961182
20206	NC_018015	TTC	2	6	985082	985087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961182
20207	NC_018015	AAG	2	6	985114	985119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961182
20208	NC_018015	GAC	2	6	985120	985125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961182
20209	NC_018015	ATA	2	6	985165	985170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390961182
20210	NC_018015	CGC	2	6	985209	985214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961182
20211	NC_018015	GCC	2	6	985251	985256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961182
20212	NC_018015	GGT	2	6	985269	985274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961182
20213	NC_018015	CTA	2	6	985311	985316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961182
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20215	NC_018015	GAG	2	6	985541	985546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961183
20216	NC_018015	GGGT	2	8	985578	985585	0 %	25 %	75 %	0 %	390961183
20217	NC_018015	CGA	2	6	985603	985608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961183
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20220	NC_018015	ACC	2	6	985824	985829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961183
20221	NC_018015	CAG	2	6	985952	985957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961184
20222	NC_018015	TTA	2	6	985996	986001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390961184
20223	NC_018015	GAA	2	6	986032	986037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961184
20224	NC_018015	GAA	2	6	986165	986170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961184
20225	NC_018015	CTC	2	6	986269	986274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961184
20226	NC_018015	TC	3	6	986273	986278	0 %	50 %	0 %	50 %	390961184
20227	NC_018015	GAT	2	6	986288	986293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961184
20228	NC_018015	ATC	2	6	986295	986300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961184
20229	NC_018015	TCT	2	6	986395	986400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961184
20230	NC_018015	TCG	2	6	986406	986411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961184
20231	NC_018015	GTG	2	6	986433	986438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961184
20232	NC_018015	CTC	2	6	986441	986446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961184
20233	NC_018015	AGA	2	6	986494	986499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961184
20234	NC_018015	TCT	2	6	986515	986520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961184
20235	NC_018015	TCC	2	6	986545	986550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961184
20236	NC_018015	TAC	2	6	986597	986602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961184
20237	NC_018015	AT	3	6	986625	986630	50 %	50 %	0 %	0 %	390961184
20238	NC_018015	GA	3	6	986636	986641	50 %	0 %	50 %	0 %	390961184
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20240	NC_018015	TA	3	6	986709	986714	50 %	50 %	0 %	0 %	390961184
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20480	NC_018015	ACC	2	6	999223	999228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961195
20481	NC_018015	ACC	2	6	999244	999249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961195
20482	NC_018015	CAC	2	6	999272	999277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20483	NC_018015	A	6	6	999304	999309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20484	NC_018015	CAG	2	6	999316	999321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961196
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20488	NC_018015	GTC	2	6	999564	999569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961196
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20491	NC_018015	CG	3	6	999753	999758	0 %	0 %	50 %	50 %	390961196
20492	NC_018015	CGG	2	6	999852	999857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961196
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