MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 40260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_018015	AG	3	6	72531	72536	50 %	0 %	50 %	0 %	390960254
1502	NC_018015	CAG	2	6	72703	72708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960254
1503	NC_018015	CTT	2	6	72726	72731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960254
1504	NC_018015	GGC	2	6	72736	72741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960254
1505	NC_018015	TTC	3	9	72796	72804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960254
1506	NC_018015	ATA	2	6	72937	72942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390960254
1507	NC_018015	GC	3	6	72969	72974	0 %	0 %	50 %	50 %	390960254
1508	NC_018015	GCT	2	6	73065	73070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960254
1509	NC_018015	TGGT	2	8	73087	73094	0 %	50 %	50 %	0 %	390960254
1510	NC_018015	CTA	2	6	73134	73139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960254
1511	NC_018015	A	6	6	73192	73197	100 %	0 %	0 %	0 %	390960254
1512	NC_018015	TTG	2	6	73231	73236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_018015	GA	3	6	73266	73271	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_018015	GGC	2	6	73274	73279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960255
1515	NC_018015	TCG	2	6	73345	73350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960255
1516	NC_018015	GAA	3	9	73385	73393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960255
1517	NC_018015	ACT	2	6	73540	73545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960255
1518	NC_018015	AAGG	2	8	73601	73608	50 %	0 %	50 %	0 %	390960255
1519	NC_018015	GAG	2	6	73623	73628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960255
1520	NC_018015	CTC	2	6	73691	73696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960256
1521	NC_018015	TCA	2	6	73731	73736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960256
1522	NC_018015	A	6	6	73811	73816	100 %	0 %	0 %	0 %	390960256
1523	NC_018015	GGC	2	6	73898	73903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960256
1524	NC_018015	CGT	2	6	73915	73920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960256
1525	NC_018015	GCA	2	6	73940	73945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960256
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1527	NC_018015	TTC	2	6	74122	74127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960257
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1530	NC_018015	CTA	2	6	74266	74271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960257
1531	NC_018015	CTTC	2	8	74297	74304	0 %	50 %	0 %	50 %	390960257
1532	NC_018015	CTG	2	6	74326	74331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960257
1533	NC_018015	TCT	2	6	74369	74374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960257
1534	NC_018015	CCA	2	6	74384	74389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960257
1535	NC_018015	TGCTT	2	10	74407	74416	0 %	60 %	20 %	20 %	390960257
1536	NC_018015	ACC	2	6	74548	74553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1537	NC_018015	TTAT	2	8	74645	74652	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_018015	GGT	2	6	74675	74680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_018015	CTG	2	6	74715	74720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960258
1540	NC_018015	CGG	2	6	74761	74766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960258
1541	NC_018015	ACG	2	6	74769	74774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960258
1542	NC_018015	CGA	2	6	74795	74800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960258
1543	NC_018015	TTA	2	6	74867	74872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390960258
1544	NC_018015	CGA	2	6	75020	75025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960258
1545	NC_018015	GCC	2	6	75066	75071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960258
1546	NC_018015	CAAA	2	8	75106	75113	75 %	0 %	0 %	25 %	390960258
1547	NC_018015	GGT	2	6	75188	75193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960258
1548	NC_018015	CTA	2	6	75296	75301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960258
1549	NC_018015	GTC	2	6	75369	75374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960258
1550	NC_018015	CTT	2	6	75410	75415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960258
1551	NC_018015	CTCC	2	8	75469	75476	0 %	25 %	0 %	75 %	390960258
1552	NC_018015	CGT	2	6	75491	75496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960258
1553	NC_018015	ACC	2	6	75510	75515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960258
1554	NC_018015	GGT	2	6	75560	75565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960258
1555	NC_018015	AGT	2	6	75590	75595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960258
1556	NC_018015	CGA	2	6	75695	75700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960258
1557	NC_018015	ACT	2	6	75724	75729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960258
1558	NC_018015	CAC	2	6	75746	75751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960258
1559	NC_018015	AAC	2	6	75918	75923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960258
1560	NC_018015	GTT	2	6	75948	75953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960258
1561	NC_018015	CT	3	6	76026	76031	0 %	50 %	0 %	50 %	390960258
1562	NC_018015	CCGA	2	8	76038	76045	25 %	0 %	25 %	50 %	390960258
1563	NC_018015	TCA	2	6	76075	76080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960258
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1565	NC_018015	TAC	2	6	76167	76172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960258
1566	NC_018015	CTCTA	2	10	76179	76188	20 %	40 %	0 %	40 %	390960258
1567	NC_018015	C	6	6	76207	76212	0 %	0 %	0 %	100 %	390960258
1568	NC_018015	CTC	2	6	76356	76361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960258
1569	NC_018015	CTA	3	9	76388	76396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960258
1570	NC_018015	GCC	2	6	76422	76427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960258
1571	NC_018015	GAG	2	6	76449	76454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960258
1572	NC_018015	GCC	2	6	76482	76487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960258
1573	NC_018015	CCGGCC	2	12	76518	76529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960258
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1575	NC_018015	TAC	2	6	76668	76673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960258
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1582	NC_018015	CGA	2	6	76955	76960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960258
1583	NC_018015	GAC	3	9	76968	76976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960258
1584	NC_018015	TAC	2	6	76995	77000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960258
1585	NC_018015	TCG	2	6	77005	77010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960258
1586	NC_018015	ACA	2	6	77017	77022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960258
1587	NC_018015	ACC	2	6	77026	77031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960258
1588	NC_018015	CGA	2	6	77051	77056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960258
1589	NC_018015	TAC	2	6	77067	77072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960258
1590	NC_018015	TCA	2	6	77113	77118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960258
1591	NC_018015	AACC	2	8	77177	77184	50 %	0 %	0 %	50 %	390960258
1592	NC_018015	ATA	2	6	77187	77192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390960258
1593	NC_018015	GCC	2	6	77193	77198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960258
1594	NC_018015	CTA	2	6	77261	77266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960258
1595	NC_018015	TCA	2	6	77296	77301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960258
1596	NC_018015	CTC	2	6	77310	77315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960258
1597	NC_018015	CCA	2	6	77324	77329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960258
1598	NC_018015	TCT	2	6	77343	77348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_018015	CGG	2	6	77392	77397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960259
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1603	NC_018015	GGCA	2	8	77586	77593	25 %	0 %	50 %	25 %	390960259
1604	NC_018015	CAC	2	6	77623	77628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960259
1605	NC_018015	CG	3	6	77637	77642	0 %	0 %	50 %	50 %	390960259
1606	NC_018015	CTT	3	9	77812	77820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960259
1607	NC_018015	CGCTT	2	10	77918	77927	0 %	40 %	20 %	40 %	390960259
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1611	NC_018015	CTC	2	6	78050	78055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960259
1612	NC_018015	GAG	2	6	78091	78096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960259
1613	NC_018015	AG	3	6	78100	78105	50 %	0 %	50 %	0 %	390960259
1614	NC_018015	GCCA	2	8	78134	78141	25 %	0 %	25 %	50 %	390960259
1615	NC_018015	CGG	2	6	78196	78201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960259
1616	NC_018015	CCT	2	6	78224	78229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1617	NC_018015	TCC	2	6	78304	78309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960260
1618	NC_018015	GAG	2	6	78361	78366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960260
1619	NC_018015	CGAGC	2	10	78468	78477	20 %	0 %	40 %	40 %	390960260
1620	NC_018015	GCG	2	6	78577	78582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960260
1621	NC_018015	CAGG	2	8	78614	78621	25 %	0 %	50 %	25 %	390960260
1622	NC_018015	TCT	2	6	78629	78634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960260
1623	NC_018015	GTC	2	6	78657	78662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960260
1624	NC_018015	CT	3	6	78706	78711	0 %	50 %	0 %	50 %	390960260
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1626	NC_018015	CGT	3	9	78773	78781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960260
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