MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 40260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_018015	TCC	2	6	929052	929057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961126
19002	NC_018015	CGA	2	6	929080	929085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961126
19003	NC_018015	TTC	2	6	929180	929185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961126
19004	NC_018015	GTA	2	6	929207	929212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961126
19005	NC_018015	CCGC	2	8	929300	929307	0 %	0 %	25 %	75 %	390961126
19006	NC_018015	GTC	2	6	929312	929317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961126
19007	NC_018015	GCT	2	6	929329	929334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961126
19008	NC_018015	CCA	2	6	929335	929340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961126
19009	NC_018015	CCT	2	6	929341	929346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961126
19010	NC_018015	CGC	2	6	929347	929352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961126
19011	NC_018015	GTG	2	6	929370	929375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961126
19012	NC_018015	CCT	2	6	929450	929455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961126
19013	NC_018015	CCT	2	6	929526	929531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19014	NC_018015	CGA	2	6	929617	929622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961127
19015	NC_018015	CAT	2	6	929633	929638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961127
19016	NC_018015	GGT	2	6	929693	929698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961127
19017	NC_018015	TGA	2	6	929713	929718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961127
19018	NC_018015	GGT	2	6	929819	929824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961127
19019	NC_018015	GCC	2	6	929868	929873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961127
19020	NC_018015	TTC	2	6	929886	929891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961127
19021	NC_018015	GGA	2	6	930004	930009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961127
19022	NC_018015	TCC	2	6	930102	930107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961127
19023	NC_018015	GGA	2	6	930109	930114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961127
19024	NC_018015	ATG	2	6	930150	930155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961127
19025	NC_018015	TGA	2	6	930283	930288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19026	NC_018015	CAG	2	6	930331	930336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961128
19027	NC_018015	GTC	2	6	930353	930358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961128
19028	NC_018015	GCTATG	2	12	930371	930382	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	390961128
19029	NC_018015	TCGT	2	8	930392	930399	0 %	50 %	25 %	25 %	390961128
19030	NC_018015	AGG	2	6	930506	930511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961128
19031	NC_018015	CGC	2	6	930519	930524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961128
19032	NC_018015	CGA	2	6	930528	930533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961128
19033	NC_018015	CGA	2	6	930540	930545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961128
19034	NC_018015	GAG	2	6	930550	930555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961128
19035	NC_018015	GCCGAC	2	12	930613	930624	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	390961128
19036	NC_018015	GAA	2	6	930640	930645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961128
19037	NC_018015	TCT	2	6	930678	930683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961128
19038	NC_018015	GAC	2	6	930781	930786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961128
19039	NC_018015	CGT	2	6	930796	930801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961128
19040	NC_018015	GGA	2	6	930837	930842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961128
19041	NC_018015	CAG	2	6	930877	930882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961128
19042	NC_018015	GAA	2	6	930883	930888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961128
19043	NC_018015	CGA	2	6	930900	930905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961128
19044	NC_018015	ATT	2	6	930971	930976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390961128
19045	NC_018015	CGT	2	6	930987	930992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961128
19046	NC_018015	CGC	2	6	931015	931020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961128
19047	NC_018015	GAAGG	2	10	931162	931171	40 %	0 %	60 %	0 %	390961128
19048	NC_018015	GAGG	2	8	931180	931187	25 %	0 %	75 %	0 %	390961128
19049	NC_018015	CTC	2	6	931222	931227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961128
19050	NC_018015	ATT	2	6	931262	931267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390961128
19051	NC_018015	AG	3	6	931322	931327	50 %	0 %	50 %	0 %	390961128
19052	NC_018015	TAT	2	6	931348	931353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390961128
19053	NC_018015	TAT	2	6	931498	931503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390961129
19054	NC_018015	CAG	2	6	931516	931521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961129
19055	NC_018015	TGT	2	6	931533	931538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390961129
19056	NC_018015	CGA	2	6	931545	931550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961129
19057	NC_018015	ATT	2	6	931580	931585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390961129
19058	NC_018015	GTC	3	9	931603	931611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961129
19059	NC_018015	TCG	2	6	931656	931661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961129
19060	NC_018015	CAG	2	6	931684	931689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961129
19061	NC_018015	CGA	2	6	931761	931766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961129
19062	NC_018015	ACG	2	6	931784	931789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961129
19063	NC_018015	TCC	2	6	931802	931807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961129
19064	NC_018015	GAC	2	6	931852	931857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961129
19065	NC_018015	TGT	2	6	931911	931916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390961129
19066	NC_018015	CTC	2	6	931924	931929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961129
19067	NC_018015	GCTGGA	2	12	931935	931946	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	390961129
19068	NC_018015	TCT	2	6	931977	931982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961129
19069	NC_018015	GAA	2	6	932119	932124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19070	NC_018015	ACG	2	6	932217	932222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961130
19071	NC_018015	GCCGG	2	10	932237	932246	0 %	0 %	60 %	40 %	390961130
19072	NC_018015	CGG	2	6	932398	932403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961130
19073	NC_018015	GGC	2	6	932408	932413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961130
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19078	NC_018015	GGTGAA	2	12	932749	932760	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	390961130
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19088	NC_018015	ACG	2	6	933182	933187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961130
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19093	NC_018015	CGT	2	6	933334	933339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961130
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19097	NC_018015	TAC	2	6	933431	933436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961130
19098	NC_018015	GGTCGA	2	12	933445	933456	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	390961130
19099	NC_018015	CGC	2	6	933490	933495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961130
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19101	NC_018015	CGC	2	6	933553	933558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961130
19102	NC_018015	AAG	2	6	933572	933577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961130
19103	NC_018015	GAA	2	6	933622	933627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961130
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19105	NC_018015	CAGGCC	2	12	933804	933815	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	390961131
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19110	NC_018015	CGA	2	6	934032	934037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961131
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19113	NC_018015	AGT	2	6	934308	934313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961131
19114	NC_018015	GAG	3	9	934351	934359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961131
19115	NC_018015	AGG	2	6	934370	934375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961131
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19117	NC_018015	TGC	2	6	934619	934624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961131
19118	NC_018015	CTG	2	6	934634	934639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961131
19119	NC_018015	TCCAG	2	10	934677	934686	20 %	20 %	20 %	40 %	390961131
19120	NC_018015	AAG	2	6	934789	934794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961131
19121	NC_018015	TCC	3	9	934811	934819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961131
19122	NC_018015	GTTC	2	8	934825	934832	0 %	50 %	25 %	25 %	390961131
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19125	NC_018015	TGG	2	6	934962	934967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961131
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19128	NC_018015	TCG	2	6	935210	935215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961131
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19132	NC_018015	AAG	2	6	935504	935509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19133	NC_018015	TCA	2	6	935528	935533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19135	NC_018015	CGG	2	6	935637	935642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961132
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19228	NC_018015	ATT	2	6	940342	940347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19229	NC_018015	GTA	2	6	940374	940379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19230	NC_018015	C	6	6	940441	940446	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19231	NC_018015	CCAG	2	8	940462	940469	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19232	NC_018015	ATT	2	6	940477	940482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19233	NC_018015	AG	3	6	940570	940575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19234	NC_018015	AG	3	6	940608	940613	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19235	NC_018015	ACC	2	6	940621	940626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19236	NC_018015	CAC	2	6	940662	940667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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19238	NC_018015	A	7	7	940700	940706	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19473	NC_018015	TTA	2	6	952585	952590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19477	NC_018015	TCCT	2	8	952737	952744	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19478	NC_018015	TCA	2	6	952767	952772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19479	NC_018015	G	7	7	952863	952869	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19480	NC_018015	TTAA	2	8	952874	952881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19481	NC_018015	GAG	2	6	952925	952930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961144
19482	NC_018015	AAG	2	6	952931	952936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961144
19483	NC_018015	ACC	2	6	952940	952945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961144
19484	NC_018015	TCC	2	6	953034	953039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961144
19485	NC_018015	AGG	2	6	953064	953069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961144
19486	NC_018015	AGG	3	9	953073	953081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961144
19487	NC_018015	GAG	3	9	953090	953098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961144
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19489	NC_018015	GA	3	6	953220	953225	50 %	0 %	50 %	0 %	390961145
19490	NC_018015	GAGC	2	8	953243	953250	25 %	0 %	50 %	25 %	390961145
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