MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 40260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17502	NC_018015	CGG	2	6	854944	854949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961056
17503	NC_018015	GTG	2	6	854954	854959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961056
17504	NC_018015	ACG	2	6	854982	854987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961056
17505	NC_018015	GCC	2	6	855014	855019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961056
17506	NC_018015	GAG	2	6	855230	855235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961056
17507	NC_018015	GTT	2	6	855347	855352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390961056
17508	NC_018015	CGA	2	6	855379	855384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961056
17509	NC_018015	GAA	2	6	855436	855441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961056
17510	NC_018015	GCCG	2	8	855489	855496	0 %	0 %	50 %	50 %	390961057
17511	NC_018015	ACC	2	6	855690	855695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17512	NC_018015	TTC	2	6	855739	855744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961058
17513	NC_018015	CCA	2	6	855746	855751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961058
17514	NC_018015	CCT	2	6	855764	855769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961058
17515	NC_018015	CCT	2	6	855815	855820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961058
17516	NC_018015	TCA	2	6	855860	855865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961058
17517	NC_018015	CGT	2	6	855911	855916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961058
17518	NC_018015	GGT	2	6	855926	855931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961058
17519	NC_018015	TAT	2	6	855969	855974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390961058
17520	NC_018015	CGT	2	6	855986	855991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961058
17521	NC_018015	TGG	2	6	856073	856078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961058
17522	NC_018015	CTC	3	9	856113	856121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961058
17523	NC_018015	GGT	2	6	856178	856183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961058
17524	NC_018015	CTT	2	6	856254	856259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961058
17525	NC_018015	CCG	2	6	856267	856272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961058
17526	NC_018015	CGT	2	6	856298	856303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961058
17527	NC_018015	CTC	2	6	856375	856380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961058
17528	NC_018015	GC	3	6	856385	856390	0 %	0 %	50 %	50 %	390961058
17529	NC_018015	TGA	2	6	856466	856471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961058
17530	NC_018015	TA	3	6	856561	856566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17531	NC_018015	TA	3	6	856596	856601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17532	NC_018015	TTGG	2	8	856667	856674	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17533	NC_018015	GTA	2	6	856680	856685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17534	NC_018015	ATA	2	6	856688	856693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17535	NC_018015	A	7	7	856717	856723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17536	NC_018015	TAC	2	6	856765	856770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17537	NC_018015	C	6	6	856772	856777	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17538	NC_018015	CATA	2	8	856807	856814	50 %	25 %	0 %	25 %	390961059
17539	NC_018015	GCC	2	6	856890	856895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961059
17540	NC_018015	CCTA	2	8	856900	856907	25 %	25 %	0 %	50 %	390961059
17541	NC_018015	CGG	3	9	856945	856953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961059
17542	NC_018015	ACA	2	6	857005	857010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390961059
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17544	NC_018015	CCG	2	6	857029	857034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961059
17545	NC_018015	GCG	2	6	857046	857051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961059
17546	NC_018015	TCG	2	6	857077	857082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961059
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17550	NC_018015	GAG	2	6	857174	857179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961059
17551	NC_018015	TCG	2	6	857188	857193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961059
17552	NC_018015	CGG	2	6	857297	857302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961059
17553	NC_018015	CTA	2	6	857378	857383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961059
17554	NC_018015	CT	3	6	857397	857402	0 %	50 %	0 %	50 %	390961059
17555	NC_018015	GTC	2	6	857595	857600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961059
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17558	NC_018015	GAG	2	6	857709	857714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961059
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17564	NC_018015	TCC	2	6	857889	857894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961059
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17573	NC_018015	CCT	2	6	858155	858160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961059
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17577	NC_018015	GAG	2	6	858474	858479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961059
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17587	NC_018015	GGA	2	6	858953	858958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961060
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17590	NC_018015	GGA	2	6	859089	859094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17591	NC_018015	TCG	2	6	859130	859135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961061
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17593	NC_018015	CCCG	2	8	859368	859375	0 %	0 %	25 %	75 %	390961061
17594	NC_018015	GTC	2	6	859417	859422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961061
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17598	NC_018015	CTCGTT	2	12	859630	859641	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	390961061
17599	NC_018015	CGG	2	6	859647	859652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961061
17600	NC_018015	GAG	2	6	859657	859662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961061
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17603	NC_018015	CGGCC	2	10	859881	859890	0 %	0 %	40 %	60 %	390961061
17604	NC_018015	GTC	2	6	859924	859929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961061
17605	NC_018015	AGG	2	6	860126	860131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961061
17606	NC_018015	AGG	2	6	860137	860142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961061
17607	NC_018015	AGG	2	6	860153	860158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961061
17608	NC_018015	CGG	2	6	860166	860171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961061
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17610	NC_018015	TG	3	6	860226	860231	0 %	50 %	50 %	0 %	390961061
17611	NC_018015	CGA	2	6	860241	860246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961061
17612	NC_018015	CCA	2	6	860253	860258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961061
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17614	NC_018015	T	7	7	860341	860347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17615	NC_018015	ACC	2	6	860543	860548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961062
17616	NC_018015	ACT	2	6	860563	860568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961062
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17618	NC_018015	TTC	2	6	860716	860721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961062
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17620	NC_018015	TCA	2	6	860768	860773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961062
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17985	NC_018015	GA	3	6	878869	878874	50 %	0 %	50 %	0 %	390961079
17986	NC_018015	GTA	2	6	878883	878888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961079
17987	NC_018015	CAC	2	6	878889	878894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961079
17988	NC_018015	TGT	2	6	878924	878929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390961079
17989	NC_018015	TCC	2	6	878959	878964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961079
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