MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 40260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_018015	GTC	2	6	831135	831140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961037
17002	NC_018015	TGG	2	6	831200	831205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961037
17003	NC_018015	GTG	2	6	831211	831216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961037
17004	NC_018015	TCG	2	6	831220	831225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961037
17005	NC_018015	GAG	2	6	831251	831256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961037
17006	NC_018015	CCG	2	6	831280	831285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961037
17007	NC_018015	CTG	2	6	831286	831291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961037
17008	NC_018015	AACA	2	8	831339	831346	75 %	0 %	0 %	25 %	390961037
17009	NC_018015	TCC	2	6	831387	831392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17010	NC_018015	CAT	2	6	831418	831423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17011	NC_018015	CAG	2	6	831438	831443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17012	NC_018015	TTA	2	6	831517	831522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17013	NC_018015	TGGC	2	8	831590	831597	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17014	NC_018015	CAA	2	6	831611	831616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17015	NC_018015	A	6	6	831691	831696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17016	NC_018015	G	6	6	831728	831733	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
17017	NC_018015	AGG	2	6	831784	831789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961038
17018	NC_018015	AGG	2	6	831820	831825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961038
17019	NC_018015	GAA	2	6	831902	831907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961038
17020	NC_018015	CTC	2	6	831948	831953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961038
17021	NC_018015	CAAGAA	2	12	831974	831985	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	390961038
17022	NC_018015	GAG	3	9	832002	832010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961038
17023	NC_018015	GAG	2	6	832014	832019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961038
17024	NC_018015	AGG	2	6	832023	832028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961038
17025	NC_018015	GAG	3	9	832086	832094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961038
17026	NC_018015	CCCTC	2	10	832131	832140	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
17027	NC_018015	G	6	6	832164	832169	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
17028	NC_018015	G	6	6	832259	832264	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
17029	NC_018015	CTTCG	2	10	832276	832285	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
17030	NC_018015	CAT	2	6	832325	832330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17031	NC_018015	TAC	2	6	832480	832485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961039
17032	NC_018015	GCC	2	6	832497	832502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961039
17033	NC_018015	GCAG	2	8	832598	832605	25 %	0 %	50 %	25 %	390961039
17034	NC_018015	CATG	2	8	832617	832624	25 %	25 %	25 %	25 %	390961039
17035	NC_018015	AAG	2	6	832672	832677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961039
17036	NC_018015	TCA	2	6	832709	832714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961039
17037	NC_018015	CAA	2	6	832737	832742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390961039
17038	NC_018015	ATGG	2	8	832782	832789	25 %	25 %	50 %	0 %	390961039
17039	NC_018015	A	6	6	832815	832820	100 %	0 %	0 %	0 %	390961039
17040	NC_018015	GC	3	6	832854	832859	0 %	0 %	50 %	50 %	390961039
17041	NC_018015	TCC	2	6	832895	832900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961039
17042	NC_018015	CCT	2	6	833019	833024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961039
17043	NC_018015	GAC	3	9	833031	833039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961039
17044	NC_018015	GAGTAC	2	12	833083	833094	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	390961039
17045	NC_018015	GAG	2	6	833125	833130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961039
17046	NC_018015	ATA	2	6	833137	833142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390961039
17047	NC_018015	TCG	2	6	833153	833158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961039
17048	NC_018015	GA	3	6	833189	833194	50 %	0 %	50 %	0 %	390961039
17049	NC_018015	TGA	2	6	833199	833204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961039
17050	NC_018015	GAG	2	6	833215	833220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961039
17051	NC_018015	ACGTCC	2	12	833237	833248	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	390961039
17052	NC_018015	GGA	2	6	833334	833339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961039
17053	NC_018015	GAG	2	6	833377	833382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961039
17054	NC_018015	GGTC	2	8	833391	833398	0 %	25 %	50 %	25 %	390961039
17055	NC_018015	TGA	2	6	833430	833435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961039
17056	NC_018015	AAGG	2	8	833438	833445	50 %	0 %	50 %	0 %	390961039
17057	NC_018015	CTG	2	6	833565	833570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961039
17058	NC_018015	CAG	2	6	833625	833630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961039
17059	NC_018015	ACG	2	6	833657	833662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961039
17060	NC_018015	CGT	2	6	833802	833807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961039
17061	NC_018015	TGG	2	6	833825	833830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961039
17062	NC_018015	GA	3	6	833860	833865	50 %	0 %	50 %	0 %	390961039
17063	NC_018015	AGA	2	6	833907	833912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961039
17064	NC_018015	GGA	2	6	833925	833930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961039
17065	NC_018015	TCA	2	6	833957	833962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961039
17066	NC_018015	CGT	2	6	834000	834005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961039
17067	NC_018015	GCC	2	6	834148	834153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961039
17068	NC_018015	CAT	2	6	834252	834257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961039
17069	NC_018015	GGA	2	6	834264	834269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961039
17070	NC_018015	GTC	2	6	834271	834276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961039
17071	NC_018015	AGG	2	6	834281	834286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961039
17072	NC_018015	CGA	2	6	834320	834325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961039
17073	NC_018015	GGA	2	6	834462	834467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961039
17074	NC_018015	TTCCG	2	10	834470	834479	0 %	40 %	20 %	40 %	390961039
17075	NC_018015	GAG	2	6	834481	834486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961039
17076	NC_018015	CAG	2	6	834501	834506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961039
17077	NC_018015	CGA	2	6	834522	834527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961039
17078	NC_018015	GGT	2	6	834608	834613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961039
17079	NC_018015	CGA	2	6	834651	834656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961039
17080	NC_018015	CTG	2	6	834706	834711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961039
17081	NC_018015	GAG	2	6	834745	834750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961039
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17088	NC_018015	TCG	2	6	835028	835033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961039
17089	NC_018015	TCA	2	6	835058	835063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961039
17090	NC_018015	GGTC	2	8	835080	835087	0 %	25 %	50 %	25 %	390961039
17091	NC_018015	GGGA	2	8	835138	835145	25 %	0 %	75 %	0 %	390961039
17092	NC_018015	GGA	2	6	835221	835226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961039
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17094	NC_018015	AGG	2	6	835336	835341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961039
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17099	NC_018015	TC	3	6	835596	835601	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17100	NC_018015	TG	3	6	835603	835608	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17101	NC_018015	GAA	2	6	835618	835623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17102	NC_018015	AC	3	6	835636	835641	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17103	NC_018015	TAG	2	6	835643	835648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17104	NC_018015	GAA	2	6	835679	835684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17105	NC_018015	CAA	2	6	835780	835785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17106	NC_018015	AT	3	6	835856	835861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17107	NC_018015	TCT	2	6	835866	835871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961040
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17113	NC_018015	ACC	2	6	836351	836356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961041
17114	NC_018015	CA	3	6	836357	836362	50 %	0 %	0 %	50 %	390961041
17115	NC_018015	CCAT	2	8	836403	836410	25 %	25 %	0 %	50 %	390961041
17116	NC_018015	CTG	2	6	836435	836440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961041
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17118	NC_018015	AGT	2	6	836566	836571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961041
17119	NC_018015	GA	3	6	836575	836580	50 %	0 %	50 %	0 %	390961041
17120	NC_018015	GCTG	2	8	836591	836598	0 %	25 %	50 %	25 %	390961041
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17122	NC_018015	CTT	2	6	836627	836632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961041
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17243	NC_018015	GAG	2	6	842671	842676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961048
17244	NC_018015	CG	3	6	842782	842787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17245	NC_018015	TCA	2	6	842795	842800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17247	NC_018015	TAC	2	6	843015	843020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961049
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17278	NC_018015	AT	5	10	844850	844859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17279	NC_018015	CGA	2	6	844863	844868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17357	NC_018015	CGG	3	9	848317	848325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961052
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17359	NC_018015	GGT	2	6	848435	848440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961053
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17364	NC_018015	CTA	2	6	848639	848644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961053
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17476	NC_018015	CCTCC	2	10	853639	853648	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
17477	NC_018015	ACG	2	6	853775	853780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961055
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17480	NC_018015	CG	3	6	853891	853896	0 %	0 %	50 %	50 %	390961055
17481	NC_018015	TCAG	2	8	853903	853910	25 %	25 %	25 %	25 %	390961055
17482	NC_018015	GATGC	2	10	853993	854002	20 %	20 %	40 %	20 %	390961055
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