MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 40260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16502	NC_018015	CGT	2	6	806178	806183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961022
16503	NC_018015	CCA	2	6	806296	806301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961022
16504	NC_018015	CTC	2	6	806313	806318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961022
16505	NC_018015	GAA	2	6	806337	806342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961022
16506	NC_018015	TCG	2	6	806362	806367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961022
16507	NC_018015	TGA	2	6	806477	806482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961022
16508	NC_018015	GAG	2	6	806535	806540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961022
16509	NC_018015	AGC	2	6	806563	806568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961022
16510	NC_018015	GAGCT	2	10	806602	806611	20 %	20 %	40 %	20 %	390961022
16511	NC_018015	TC	3	6	806730	806735	0 %	50 %	0 %	50 %	390961022
16512	NC_018015	CCT	2	6	806745	806750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961022
16513	NC_018015	GAG	2	6	806817	806822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961022
16514	NC_018015	CAT	2	6	806973	806978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961022
16515	NC_018015	TAGG	2	8	807015	807022	25 %	25 %	50 %	0 %	390961022
16516	NC_018015	CCT	2	6	807041	807046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961022
16517	NC_018015	ACC	2	6	807109	807114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961022
16518	NC_018015	TCT	2	6	807137	807142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961022
16519	NC_018015	GCA	2	6	807164	807169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961022
16520	NC_018015	CCT	3	9	807182	807190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961022
16521	NC_018015	TAC	2	6	807207	807212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961022
16522	NC_018015	ACA	2	6	807233	807238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390961023
16523	NC_018015	GTA	2	6	807244	807249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961023
16524	NC_018015	TCC	2	6	807329	807334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961023
16525	NC_018015	TAA	2	6	807340	807345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390961023
16526	NC_018015	TCC	2	6	807393	807398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961023
16527	NC_018015	ACC	2	6	807404	807409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961023
16528	NC_018015	CGA	3	9	807438	807446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961023
16529	NC_018015	GAGG	2	8	807502	807509	25 %	0 %	75 %	0 %	390961023
16530	NC_018015	GGA	2	6	807526	807531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961023
16531	NC_018015	CAC	2	6	807535	807540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961023
16532	NC_018015	CCT	2	6	807549	807554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961023
16533	NC_018015	GTA	2	6	807681	807686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961023
16534	NC_018015	GAG	2	6	807703	807708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961023
16535	NC_018015	CGA	2	6	807741	807746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961023
16536	NC_018015	GGGGT	2	10	807769	807778	0 %	20 %	80 %	0 %	390961023
16537	NC_018015	CCT	2	6	807835	807840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961023
16538	NC_018015	GT	4	8	807861	807868	0 %	50 %	50 %	0 %	390961023
16539	NC_018015	TC	3	6	807910	807915	0 %	50 %	0 %	50 %	390961023
16540	NC_018015	CTC	2	6	807921	807926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961023
16541	NC_018015	C	6	6	807966	807971	0 %	0 %	0 %	100 %	390961023
16542	NC_018015	ACG	2	6	808064	808069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961023
16543	NC_018015	CAG	2	6	808155	808160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961023
16544	NC_018015	CCA	2	6	808216	808221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961023
16545	NC_018015	CGT	2	6	808320	808325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961023
16546	NC_018015	CCG	2	6	808425	808430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16547	NC_018015	TGA	2	6	808501	808506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961024
16548	NC_018015	TCCT	2	8	808519	808526	0 %	50 %	0 %	50 %	390961024
16549	NC_018015	TCA	2	6	808534	808539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961024
16550	NC_018015	TCC	2	6	808549	808554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961024
16551	NC_018015	CAA	2	6	808630	808635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390961024
16552	NC_018015	CTT	2	6	808652	808657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961024
16553	NC_018015	C	6	6	808750	808755	0 %	0 %	0 %	100 %	390961024
16554	NC_018015	GTG	2	6	808797	808802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961024
16555	NC_018015	CGT	2	6	808814	808819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961024
16556	NC_018015	GA	4	8	808854	808861	50 %	0 %	50 %	0 %	390961024
16557	NC_018015	ACT	2	6	808924	808929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961024
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16559	NC_018015	CT	3	6	808992	808997	0 %	50 %	0 %	50 %	390961024
16560	NC_018015	AGG	2	6	809025	809030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961024
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16562	NC_018015	CTA	2	6	809090	809095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961024
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16568	NC_018015	CCT	2	6	809366	809371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961024
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16571	NC_018015	TCC	2	6	809518	809523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961024
16572	NC_018015	CCT	2	6	809597	809602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961024
16573	NC_018015	TTC	2	6	809616	809621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961024
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16583	NC_018015	AGGG	2	8	810240	810247	25 %	0 %	75 %	0 %	390961024
16584	NC_018015	CGC	2	6	810344	810349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961024
16585	NC_018015	TGA	2	6	810433	810438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961024
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16587	NC_018015	CGT	2	6	810563	810568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961024
16588	NC_018015	GGAA	2	8	810575	810582	50 %	0 %	50 %	0 %	390961024
16589	NC_018015	GGT	2	6	810653	810658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961024
16590	NC_018015	CGA	2	6	810689	810694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961024
16591	NC_018015	GATAC	2	10	810731	810740	40 %	20 %	20 %	20 %	390961024
16592	NC_018015	GAC	2	6	810789	810794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961024
16593	NC_018015	GCA	2	6	810800	810805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961024
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16599	NC_018015	GGAA	2	8	811195	811202	50 %	0 %	50 %	0 %	390961025
16600	NC_018015	CGT	3	9	811211	811219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961025
16601	NC_018015	GC	3	6	811284	811289	0 %	0 %	50 %	50 %	390961025
16602	NC_018015	GAG	2	6	811326	811331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961025
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16604	NC_018015	GCG	2	6	811362	811367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961025
16605	NC_018015	ATA	2	6	811398	811403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390961025
16606	NC_018015	GTC	2	6	811431	811436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961025
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16608	NC_018015	GGC	2	6	811526	811531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961025
16609	NC_018015	GGA	2	6	811559	811564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961025
16610	NC_018015	GA	3	6	811569	811574	50 %	0 %	50 %	0 %	390961025
16611	NC_018015	CTGAA	2	10	811612	811621	40 %	20 %	20 %	20 %	390961025
16612	NC_018015	CTG	2	6	811638	811643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961025
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16615	NC_018015	CGA	2	6	811897	811902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961026
16616	NC_018015	GAG	2	6	811925	811930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961026
16617	NC_018015	GAT	2	6	812026	812031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961026
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16619	NC_018015	C	6	6	812112	812117	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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