MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 40260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_018015	CGA	2	6	729641	729646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15002	NC_018015	GTC	2	6	729700	729705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960960
15003	NC_018015	TCC	2	6	729743	729748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960960
15004	NC_018015	GAG	2	6	729802	729807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960960
15005	NC_018015	CTA	2	6	729810	729815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960960
15006	NC_018015	AGCT	2	8	729862	729869	25 %	25 %	25 %	25 %	390960960
15007	NC_018015	CCTG	2	8	729894	729901	0 %	25 %	25 %	50 %	390960960
15008	NC_018015	GAG	2	6	729931	729936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960960
15009	NC_018015	CCT	2	6	729972	729977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960960
15010	NC_018015	TCCT	2	8	730021	730028	0 %	50 %	0 %	50 %	390960960
15011	NC_018015	GAG	2	6	730051	730056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960960
15012	NC_018015	TTC	2	6	730061	730066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960960
15013	NC_018015	CTC	2	6	730297	730302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960961
15014	NC_018015	CGA	2	6	730368	730373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960961
15015	NC_018015	CAT	2	6	730489	730494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960961
15016	NC_018015	CTC	2	6	730521	730526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960961
15017	NC_018015	GGC	2	6	730551	730556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960961
15018	NC_018015	CTT	2	6	730561	730566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960961
15019	NC_018015	GAG	2	6	730573	730578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960961
15020	NC_018015	TCG	2	6	730736	730741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960961
15021	NC_018015	CGA	2	6	730800	730805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960961
15022	NC_018015	TCC	2	6	730860	730865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960961
15023	NC_018015	GAA	2	6	730933	730938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960961
15024	NC_018015	TCG	2	6	730967	730972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960961
15025	NC_018015	TCT	2	6	731076	731081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960961
15026	NC_018015	TCC	2	6	731168	731173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960961
15027	NC_018015	CGC	2	6	731214	731219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960961
15028	NC_018015	A	7	7	731381	731387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15029	NC_018015	CTC	2	6	731388	731393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15030	NC_018015	A	6	6	731395	731400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15031	NC_018015	GT	3	6	731474	731479	0 %	50 %	50 %	0 %	390960962
15032	NC_018015	TGT	2	6	731632	731637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960962
15033	NC_018015	ACG	2	6	731646	731651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960962
15034	NC_018015	GGC	2	6	731666	731671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960962
15035	NC_018015	CGA	2	6	731707	731712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960962
15036	NC_018015	GGCCCT	2	12	731729	731740	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	390960962
15037	NC_018015	CCT	2	6	731749	731754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960962
15038	NC_018015	GGT	2	6	731773	731778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960962
15039	NC_018015	TC	3	6	731984	731989	0 %	50 %	0 %	50 %	390960962
15040	NC_018015	GAG	2	6	731993	731998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960962
15041	NC_018015	CTT	2	6	732049	732054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960962
15042	NC_018015	GAT	2	6	732149	732154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960962
15043	NC_018015	CTCG	2	8	732191	732198	0 %	25 %	25 %	50 %	390960962
15044	NC_018015	ATC	2	6	732255	732260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960962
15045	NC_018015	AG	3	6	732287	732292	50 %	0 %	50 %	0 %	390960963
15046	NC_018015	T	6	6	732307	732312	0 %	100 %	0 %	0 %	390960963
15047	NC_018015	ATG	2	6	732325	732330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960963
15048	NC_018015	TAT	2	6	732348	732353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390960963
15049	NC_018015	CAG	2	6	732390	732395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960963
15050	NC_018015	CT	3	6	732495	732500	0 %	50 %	0 %	50 %	390960963
15051	NC_018015	AGT	2	6	732518	732523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960963
15052	NC_018015	AGCGA	2	10	732596	732605	40 %	0 %	40 %	20 %	390960963
15053	NC_018015	CCT	2	6	732662	732667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960963
15054	NC_018015	CTT	2	6	732684	732689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960963
15055	NC_018015	CTT	2	6	732710	732715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960963
15056	NC_018015	AGT	2	6	732719	732724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960963
15057	NC_018015	AGG	2	6	732815	732820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960963
15058	NC_018015	GAG	2	6	732825	732830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960963
15059	NC_018015	CAA	2	6	732878	732883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960963
15060	NC_018015	GAA	2	6	732950	732955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960963
15061	NC_018015	GCC	2	6	732969	732974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960963
15062	NC_018015	TC	3	6	733018	733023	0 %	50 %	0 %	50 %	390960963
15063	NC_018015	GA	3	6	733027	733032	50 %	0 %	50 %	0 %	390960963
15064	NC_018015	CAT	2	6	733086	733091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960963
15065	NC_018015	CTG	2	6	733135	733140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960963
15066	NC_018015	GAG	3	9	733150	733158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960963
15067	NC_018015	TCG	2	6	733237	733242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960963
15068	NC_018015	TCG	2	6	733258	733263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960963
15069	NC_018015	TCG	2	6	733339	733344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960963
15070	NC_018015	GAA	2	6	733350	733355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960963
15071	NC_018015	CTT	2	6	733423	733428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960963
15072	NC_018015	ATT	2	6	733435	733440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390960963
15073	NC_018015	TCCC	2	8	733590	733597	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
15074	NC_018015	TCT	2	6	733651	733656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960964
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15076	NC_018015	GAC	2	6	733850	733855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960964
15077	NC_018015	GC	3	6	733875	733880	0 %	0 %	50 %	50 %	390960964
15078	NC_018015	GC	3	6	733983	733988	0 %	0 %	50 %	50 %	390960964
15079	NC_018015	CGGGGA	2	12	734038	734049	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	390960964
15080	NC_018015	CTT	2	6	734054	734059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960964
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15087	NC_018015	CT	3	6	734493	734498	0 %	50 %	0 %	50 %	390960964
15088	NC_018015	AGA	2	6	734568	734573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15089	NC_018015	GAA	2	6	734627	734632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960965
15090	NC_018015	TCCT	2	8	734649	734656	0 %	50 %	0 %	50 %	390960965
15091	NC_018015	TCC	2	6	734697	734702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960965
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15093	NC_018015	GGCC	2	8	734782	734789	0 %	0 %	50 %	50 %	390960965
15094	NC_018015	GAG	2	6	734960	734965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960965
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15096	NC_018015	G	6	6	735451	735456	0 %	0 %	100 %	0 %	390960965
15097	NC_018015	AGCGA	2	10	735477	735486	40 %	0 %	40 %	20 %	390960965
15098	NC_018015	TAG	2	6	735505	735510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960965
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15100	NC_018015	TTCC	2	8	735556	735563	0 %	50 %	0 %	50 %	390960965
15101	NC_018015	CTC	2	6	735575	735580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960965
15102	NC_018015	CGA	2	6	735592	735597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960965
15103	NC_018015	CGCC	2	8	735604	735611	0 %	0 %	25 %	75 %	390960965
15104	NC_018015	CGC	2	6	735617	735622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960965
15105	NC_018015	GGA	2	6	735628	735633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960965
15106	NC_018015	GCCC	2	8	735691	735698	0 %	0 %	25 %	75 %	390960965
15107	NC_018015	AAG	2	6	735734	735739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960965
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15109	NC_018015	GAT	2	6	735986	735991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960965
15110	NC_018015	CAC	2	6	736006	736011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15111	NC_018015	TCA	2	6	736058	736063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960966
15112	NC_018015	GCC	2	6	736069	736074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960966
15113	NC_018015	ACC	3	9	736087	736095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960966
15114	NC_018015	AAAG	2	8	736110	736117	75 %	0 %	25 %	0 %	390960966
15115	NC_018015	GGCA	2	8	736134	736141	25 %	0 %	50 %	25 %	390960966
15116	NC_018015	ACG	2	6	736204	736209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960966
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15118	NC_018015	AG	3	6	736451	736456	50 %	0 %	50 %	0 %	390960966
15119	NC_018015	TTCCGT	2	12	736460	736471	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	390960966
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15482	NC_018015	GGA	2	6	754025	754030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960983
15483	NC_018015	CCTT	2	8	754091	754098	0 %	50 %	0 %	50 %	390960983
15484	NC_018015	TCT	2	6	754130	754135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960983
15485	NC_018015	TCC	2	6	754241	754246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960983
15486	NC_018015	TCCT	2	8	754258	754265	0 %	50 %	0 %	50 %	390960983
15487	NC_018015	AGT	2	6	754319	754324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960983
15488	NC_018015	GGCC	2	8	754380	754387	0 %	0 %	50 %	50 %	390960983
15489	NC_018015	TCG	2	6	754397	754402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960983
15490	NC_018015	CCTT	2	8	754511	754518	0 %	50 %	0 %	50 %	390960983
15491	NC_018015	C	6	6	754519	754524	0 %	0 %	0 %	100 %	390960983
15492	NC_018015	CTT	2	6	754556	754561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960983
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15494	NC_018015	TCTT	2	8	754657	754664	0 %	75 %	0 %	25 %	390960983
15495	NC_018015	ACC	2	6	754843	754848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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15497	NC_018015	GTC	2	6	754872	754877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15499	NC_018015	C	6	6	754918	754923	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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