MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 40260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_018015	TGA	2	6	703213	703218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960937
14502	NC_018015	GAG	2	6	703270	703275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960937
14503	NC_018015	GA	3	6	703450	703455	50 %	0 %	50 %	0 %	390960938
14504	NC_018015	GCC	2	6	703462	703467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960938
14505	NC_018015	GGA	2	6	703477	703482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960938
14506	NC_018015	TCA	2	6	703506	703511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960938
14507	NC_018015	ACA	2	6	703514	703519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960938
14508	NC_018015	ATA	2	6	703616	703621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390960938
14509	NC_018015	CAA	2	6	703636	703641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960938
14510	NC_018015	GAT	3	9	703666	703674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960938
14511	NC_018015	CTC	2	6	703717	703722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960938
14512	NC_018015	ATA	2	6	703754	703759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390960938
14513	NC_018015	GAG	2	6	703831	703836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960938
14514	NC_018015	CGC	2	6	703864	703869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960938
14515	NC_018015	GA	3	6	704136	704141	50 %	0 %	50 %	0 %	390960938
14516	NC_018015	ACTC	2	8	704187	704194	25 %	25 %	0 %	50 %	390960938
14517	NC_018015	GAT	2	6	704201	704206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960938
14518	NC_018015	ACA	2	6	704226	704231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960938
14519	NC_018015	CCT	2	6	704260	704265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960938
14520	NC_018015	GTC	2	6	704330	704335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960938
14521	NC_018015	CTA	2	6	704341	704346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960938
14522	NC_018015	CGG	2	6	704353	704358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960938
14523	NC_018015	CCT	2	6	704368	704373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960938
14524	NC_018015	AGA	2	6	704379	704384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960938
14525	NC_018015	GAT	2	6	704447	704452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960938
14526	NC_018015	GAT	3	9	704522	704530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960938
14527	NC_018015	AGC	2	6	704532	704537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960938
14528	NC_018015	CTA	2	6	704542	704547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960938
14529	NC_018015	GTC	2	6	704657	704662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960938
14530	NC_018015	GCG	2	6	704742	704747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960938
14531	NC_018015	CCA	2	6	704844	704849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960938
14532	NC_018015	GAG	2	6	704861	704866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960938
14533	NC_018015	GAG	2	6	704873	704878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960938
14534	NC_018015	GAT	2	6	704941	704946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960938
14535	NC_018015	ACA	2	6	704958	704963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960938
14536	NC_018015	CTT	2	6	705006	705011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960938
14537	NC_018015	AGGG	2	8	705014	705021	25 %	0 %	75 %	0 %	390960938
14538	NC_018015	CCA	2	6	705024	705029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960938
14539	NC_018015	AAT	2	6	705034	705039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390960938
14540	NC_018015	TAC	3	9	705131	705139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960938
14541	NC_018015	CAG	2	6	705145	705150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960938
14542	NC_018015	CCA	2	6	705216	705221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960938
14543	NC_018015	GAC	2	6	705233	705238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960938
14544	NC_018015	CGA	2	6	705289	705294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960938
14545	NC_018015	CGATAA	2	12	705408	705419	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	390960938
14546	NC_018015	TGA	2	6	705443	705448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960938
14547	NC_018015	CAT	2	6	705462	705467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960939
14548	NC_018015	CTC	3	9	705505	705513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960939
14549	NC_018015	TCC	2	6	705532	705537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960939
14550	NC_018015	GA	3	6	705559	705564	50 %	0 %	50 %	0 %	390960939
14551	NC_018015	GA	3	6	705574	705579	50 %	0 %	50 %	0 %	390960939
14552	NC_018015	TCGTA	2	10	705590	705599	20 %	40 %	20 %	20 %	390960939
14553	NC_018015	GAA	2	6	705804	705809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960939
14554	NC_018015	C	6	6	705872	705877	0 %	0 %	0 %	100 %	390960939
14555	NC_018015	TCA	2	6	705923	705928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960939
14556	NC_018015	C	6	6	705950	705955	0 %	0 %	0 %	100 %	390960939
14557	NC_018015	TTAT	2	8	706025	706032	25 %	75 %	0 %	0 %	390960939
14558	NC_018015	ACGGCA	2	12	706196	706207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960939
14559	NC_018015	TCT	2	6	706265	706270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960939
14560	NC_018015	ACG	2	6	706595	706600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960939
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14562	NC_018015	CTAC	2	8	706685	706692	25 %	25 %	0 %	50 %	390960939
14563	NC_018015	CGA	2	6	706707	706712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960939
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14565	NC_018015	GTG	2	6	706852	706857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960939
14566	NC_018015	CCG	2	6	706862	706867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960939
14567	NC_018015	TCC	2	6	706883	706888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960939
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14573	NC_018015	ACATA	2	10	707441	707450	60 %	20 %	0 %	20 %	390960939
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14584	NC_018015	CAA	2	6	707805	707810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960939
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14591	NC_018015	GC	3	6	708160	708165	0 %	0 %	50 %	50 %	390960939
14592	NC_018015	TCC	2	6	708169	708174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960939
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14602	NC_018015	CAGGG	2	10	708719	708728	20 %	0 %	60 %	20 %	390960939
14603	NC_018015	GAC	2	6	708763	708768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960939
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14605	NC_018015	CTG	2	6	708862	708867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960939
14606	NC_018015	TGA	2	6	708993	708998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960940
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14609	NC_018015	AC	3	6	709161	709166	50 %	0 %	0 %	50 %	390960940
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14980	NC_018015	TCC	2	6	728127	728132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960959
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14983	NC_018015	CGA	2	6	728425	728430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960959
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14999	NC_018015	ACC	2	6	729590	729595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15000	NC_018015	A	6	6	729613	729618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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