MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 40260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_018015	TGG	2	6	679480	679485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14002	NC_018015	GGA	2	6	679545	679550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960910
14003	NC_018015	GAG	2	6	679619	679624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960910
14004	NC_018015	CCT	2	6	679660	679665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960910
14005	NC_018015	AAG	2	6	679715	679720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960910
14006	NC_018015	CTC	2	6	679721	679726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960910
14007	NC_018015	CTT	2	6	679732	679737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960910
14008	NC_018015	ACG	2	6	679782	679787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960910
14009	NC_018015	AGG	2	6	679797	679802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960910
14010	NC_018015	GGT	2	6	679828	679833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960910
14011	NC_018015	TCGC	2	8	679977	679984	0 %	25 %	25 %	50 %	390960910
14012	NC_018015	GAGG	2	8	680041	680048	25 %	0 %	75 %	0 %	390960910
14013	NC_018015	AGT	2	6	680136	680141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960910
14014	NC_018015	AAG	2	6	680213	680218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14015	NC_018015	GTGA	2	8	680232	680239	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14016	NC_018015	GAA	2	6	680291	680296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960911
14017	NC_018015	CTT	2	6	680319	680324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960911
14018	NC_018015	GAA	2	6	680330	680335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960911
14019	NC_018015	AGCG	2	8	680379	680386	25 %	0 %	50 %	25 %	390960911
14020	NC_018015	GCTG	2	8	680455	680462	0 %	25 %	50 %	25 %	390960911
14021	NC_018015	CTACAC	2	12	680465	680476	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	390960911
14022	NC_018015	CT	3	6	680586	680591	0 %	50 %	0 %	50 %	390960912
14023	NC_018015	CCT	2	6	680624	680629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960912
14024	NC_018015	TCT	2	6	680637	680642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960912
14025	NC_018015	CTC	2	6	680657	680662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960912
14026	NC_018015	CTC	2	6	680684	680689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960912
14027	NC_018015	GAGC	2	8	680728	680735	25 %	0 %	50 %	25 %	390960912
14028	NC_018015	CTC	2	6	680765	680770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960912
14029	NC_018015	TC	4	8	680784	680791	0 %	50 %	0 %	50 %	390960912
14030	NC_018015	CCAG	2	8	680833	680840	25 %	0 %	25 %	50 %	390960912
14031	NC_018015	CCA	2	6	680902	680907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960912
14032	NC_018015	CTT	2	6	681002	681007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960912
14033	NC_018015	GAA	2	6	681149	681154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960912
14034	NC_018015	CGT	2	6	681163	681168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960912
14035	NC_018015	GTA	2	6	681263	681268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960912
14036	NC_018015	GAG	2	6	681272	681277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960912
14037	NC_018015	CCA	2	6	681355	681360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960912
14038	NC_018015	TGA	2	6	681370	681375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960912
14039	NC_018015	TAG	2	6	681381	681386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960912
14040	NC_018015	GTA	2	6	681428	681433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960912
14041	NC_018015	CGAAGC	2	12	681454	681465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960912
14042	NC_018015	GTC	2	6	681473	681478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960912
14043	NC_018015	GAG	2	6	681575	681580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960912
14044	NC_018015	GAA	2	6	681619	681624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960912
14045	NC_018015	GCC	2	6	681628	681633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960912
14046	NC_018015	CCG	2	6	681730	681735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960912
14047	NC_018015	GTC	2	6	681755	681760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960912
14048	NC_018015	CTC	2	6	681793	681798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960912
14049	NC_018015	CCT	2	6	681848	681853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960912
14050	NC_018015	TCC	3	9	681912	681920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960912
14051	NC_018015	ACC	2	6	681933	681938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960912
14052	NC_018015	CCG	2	6	681954	681959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960912
14053	NC_018015	AGG	2	6	681978	681983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960912
14054	NC_018015	GATCTC	2	12	682016	682027	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	390960912
14055	NC_018015	CGT	2	6	682084	682089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960912
14056	NC_018015	GA	3	6	682316	682321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14057	NC_018015	GAG	2	6	682349	682354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960913
14058	NC_018015	GAA	2	6	682364	682369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960913
14059	NC_018015	AAC	2	6	682448	682453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960913
14060	NC_018015	GTT	2	6	682550	682555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960913
14061	NC_018015	CCCAG	2	10	682600	682609	20 %	0 %	20 %	60 %	390960913
14062	NC_018015	ACG	2	6	682644	682649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960913
14063	NC_018015	CGA	2	6	682663	682668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960913
14064	NC_018015	CCT	2	6	682801	682806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960913
14065	NC_018015	CCTC	2	8	682888	682895	0 %	25 %	0 %	75 %	390960913
14066	NC_018015	GGC	2	6	682954	682959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960913
14067	NC_018015	GTACCA	2	12	682994	683005	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	390960913
14068	NC_018015	C	7	7	683014	683020	0 %	0 %	0 %	100 %	390960913
14069	NC_018015	CTT	2	6	683059	683064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960913
14070	NC_018015	AGT	2	6	683076	683081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960913
14071	NC_018015	AG	3	6	683174	683179	50 %	0 %	50 %	0 %	390960913
14072	NC_018015	CAGC	2	8	683224	683231	25 %	0 %	25 %	50 %	390960913
14073	NC_018015	ATC	2	6	683264	683269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960913
14074	NC_018015	GAT	2	6	683276	683281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960913
14075	NC_018015	CTC	2	6	683330	683335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960913
14076	NC_018015	GAT	2	6	683366	683371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960913
14077	NC_018015	GGGC	2	8	683448	683455	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14078	NC_018015	CGG	2	6	683522	683527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14079	NC_018015	CCA	2	6	683530	683535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14080	NC_018015	AGA	2	6	683642	683647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14081	NC_018015	GAA	2	6	683713	683718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14082	NC_018015	ATC	2	6	683846	683851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14083	NC_018015	GTG	2	6	683864	683869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14084	NC_018015	ACC	2	6	683974	683979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14085	NC_018015	C	6	6	684049	684054	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14086	NC_018015	TTC	2	6	684066	684071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14087	NC_018015	GCG	2	6	684075	684080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14088	NC_018015	ACC	2	6	684149	684154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14089	NC_018015	CAA	2	6	684191	684196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14090	NC_018015	AGT	2	6	684294	684299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14091	NC_018015	GGAGGT	2	12	684323	684334	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14092	NC_018015	GAT	2	6	684478	684483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960914
14093	NC_018015	CAG	2	6	684485	684490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960914
14094	NC_018015	AAG	2	6	684491	684496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960914
14095	NC_018015	TGG	2	6	684601	684606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960915
14096	NC_018015	TCC	2	6	684610	684615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960915
14097	NC_018015	AGA	3	9	684616	684624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960915
14098	NC_018015	AGGG	2	8	684747	684754	25 %	0 %	75 %	0 %	390960915
14099	NC_018015	GTA	2	6	684756	684761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960915
14100	NC_018015	CTT	2	6	684918	684923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960915
14101	NC_018015	CAC	2	6	684960	684965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960915
14102	NC_018015	GAA	2	6	684996	685001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14103	NC_018015	CTT	2	6	685011	685016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14104	NC_018015	TA	3	6	685081	685086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14105	NC_018015	GGT	2	6	685137	685142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14106	NC_018015	GA	3	6	685146	685151	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14107	NC_018015	AGG	2	6	685168	685173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14108	NC_018015	GAA	2	6	685184	685189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960916
14109	NC_018015	TGA	2	6	685216	685221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960916
14110	NC_018015	CGG	2	6	685225	685230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960916
14111	NC_018015	CGT	2	6	685295	685300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960916
14112	NC_018015	GAC	2	6	685305	685310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960916
14113	NC_018015	G	6	6	685362	685367	0 %	0 %	100 %	0 %	390960916
14114	NC_018015	AAC	2	6	685392	685397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960916
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14117	NC_018015	GGA	2	6	685538	685543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960916
14118	NC_018015	TCATC	2	10	685564	685573	20 %	40 %	0 %	40 %	390960916
14119	NC_018015	GA	3	6	685606	685611	50 %	0 %	50 %	0 %	390960916
14120	NC_018015	CAA	2	6	685631	685636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960916
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14122	NC_018015	ACG	2	6	685747	685752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960916
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14211	NC_018015	T	7	7	690393	690399	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14480	NC_018015	AGT	2	6	702188	702193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960937
14481	NC_018015	CCAC	2	8	702195	702202	25 %	0 %	0 %	75 %	390960937
14482	NC_018015	AGG	2	6	702230	702235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960937
14483	NC_018015	CGG	2	6	702434	702439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960937
14484	NC_018015	CCT	2	6	702500	702505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960937
14485	NC_018015	ACC	2	6	702556	702561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960937
14486	NC_018015	CAG	2	6	702570	702575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960937
14487	NC_018015	GAC	2	6	702581	702586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960937
14488	NC_018015	TGG	2	6	702603	702608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960937
14489	NC_018015	CAG	2	6	702612	702617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960937
14490	NC_018015	CTACG	2	10	702656	702665	20 %	20 %	20 %	40 %	390960937
14491	NC_018015	ACA	2	6	702685	702690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960937
14492	NC_018015	GAT	2	6	702797	702802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960937
14493	NC_018015	ACG	2	6	702870	702875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960937
14494	NC_018015	CGT	2	6	702923	702928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960937
14495	NC_018015	CGTGG	2	10	702932	702941	0 %	20 %	60 %	20 %	390960937
14496	NC_018015	CGC	2	6	702977	702982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960937
14497	NC_018015	GAG	2	6	702993	702998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960937
14498	NC_018015	CCA	2	6	703003	703008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960937
14499	NC_018015	GTG	2	6	703047	703052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960937
14500	NC_018015	ACT	3	9	703054	703062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960937

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