MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 40260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_018015	GTC	2	6	656638	656643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960881
13502	NC_018015	CGT	2	6	656649	656654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960881
13503	NC_018015	CGA	2	6	656703	656708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960881
13504	NC_018015	CGGAAC	2	12	656709	656720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960881
13505	NC_018015	CGA	2	6	656742	656747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960881
13506	NC_018015	TCA	2	6	656756	656761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960881
13507	NC_018015	GAA	2	6	656769	656774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960881
13508	NC_018015	CGA	2	6	656817	656822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960881
13509	NC_018015	GCAAAG	2	12	656965	656976	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	390960881
13510	NC_018015	GAT	2	6	657039	657044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960881
13511	NC_018015	GAA	2	6	657067	657072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960881
13512	NC_018015	GAG	2	6	657079	657084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960881
13513	NC_018015	GGA	2	6	657093	657098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960881
13514	NC_018015	GAG	2	6	657106	657111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960881
13515	NC_018015	AAG	2	6	657196	657201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960881
13516	NC_018015	GAG	2	6	657232	657237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960881
13517	NC_018015	CTA	2	6	657288	657293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960881
13518	NC_018015	CTCTT	2	10	657308	657317	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
13519	NC_018015	CT	3	6	657323	657328	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13520	NC_018015	TGA	2	6	657373	657378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960882
13521	NC_018015	CCA	2	6	657412	657417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960882
13522	NC_018015	GAA	2	6	657422	657427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960882
13523	NC_018015	TCG	2	6	657429	657434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960882
13524	NC_018015	GAG	2	6	657503	657508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960882
13525	NC_018015	TCT	2	6	657511	657516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960882
13526	NC_018015	TCC	2	6	657521	657526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960882
13527	NC_018015	TGA	2	6	657544	657549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960882
13528	NC_018015	CGG	2	6	657565	657570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960882
13529	NC_018015	CCA	2	6	657572	657577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960882
13530	NC_018015	CGA	2	6	657622	657627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960882
13531	NC_018015	TGA	2	6	657706	657711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960882
13532	NC_018015	CAC	2	6	657734	657739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13533	NC_018015	GTA	2	6	657847	657852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960883
13534	NC_018015	GTA	2	6	657899	657904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960883
13535	NC_018015	GGAA	2	8	657930	657937	50 %	0 %	50 %	0 %	390960883
13536	NC_018015	CTT	2	6	657986	657991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960883
13537	NC_018015	AAG	2	6	658086	658091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960883
13538	NC_018015	GCG	2	6	658150	658155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960883
13539	NC_018015	CCA	2	6	658174	658179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960883
13540	NC_018015	AGGGGC	2	12	658194	658205	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	390960883
13541	NC_018015	GGC	2	6	658232	658237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960883
13542	NC_018015	GAAT	2	8	658255	658262	50 %	25 %	25 %	0 %	390960883
13543	NC_018015	AGT	2	6	658318	658323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960883
13544	NC_018015	TATC	2	8	658384	658391	25 %	50 %	0 %	25 %	390960883
13545	NC_018015	C	7	7	658421	658427	0 %	0 %	0 %	100 %	390960883
13546	NC_018015	CCAG	2	8	658524	658531	25 %	0 %	25 %	50 %	390960883
13547	NC_018015	GAG	2	6	658642	658647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960884
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13549	NC_018015	GC	3	6	658745	658750	0 %	0 %	50 %	50 %	390960884
13550	NC_018015	CAA	2	6	658818	658823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960884
13551	NC_018015	TACTG	2	10	658869	658878	20 %	40 %	20 %	20 %	390960884
13552	NC_018015	CAC	2	6	658906	658911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960884
13553	NC_018015	CCG	2	6	659018	659023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960884
13554	NC_018015	CCT	2	6	659089	659094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960884
13555	NC_018015	CTC	2	6	659107	659112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960884
13556	NC_018015	AGT	2	6	659400	659405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960884
13557	NC_018015	GCTC	2	8	659421	659428	0 %	25 %	25 %	50 %	390960884
13558	NC_018015	G	6	6	659473	659478	0 %	0 %	100 %	0 %	390960884
13559	NC_018015	GTC	2	6	659567	659572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960884
13560	NC_018015	GAG	2	6	659624	659629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960884
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13562	NC_018015	TGT	2	6	659668	659673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960884
13563	NC_018015	GCC	2	6	659678	659683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960884
13564	NC_018015	CG	3	6	659737	659742	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13565	NC_018015	A	6	6	659753	659758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13566	NC_018015	GC	3	6	659774	659779	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13567	NC_018015	TAA	2	6	659830	659835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13568	NC_018015	AGG	2	6	659858	659863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13569	NC_018015	GGA	2	6	659873	659878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960885
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13581	NC_018015	CTT	2	6	660366	660371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960886
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13589	NC_018015	TCA	2	6	661030	661035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960887
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13605	NC_018015	GGA	2	6	661678	661683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960888
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13609	NC_018015	TC	3	6	661821	661826	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13610	NC_018015	A	6	6	661860	661865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13611	NC_018015	GAA	2	6	661872	661877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13612	NC_018015	AGG	2	6	661948	661953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13613	NC_018015	GGA	2	6	661956	661961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13615	NC_018015	CGAG	2	8	662081	662088	25 %	0 %	50 %	25 %	390960889
13616	NC_018015	GAG	2	6	662119	662124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960889
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13623	NC_018015	TCT	2	6	662381	662386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13624	NC_018015	TAA	2	6	662404	662409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13625	NC_018015	GA	3	6	662437	662442	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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