MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 40260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_018015	TGG	2	6	608460	608465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960832
12502	NC_018015	CGA	2	6	608523	608528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960832
12503	NC_018015	GAG	2	6	608650	608655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960832
12504	NC_018015	TCAC	2	8	608699	608706	25 %	25 %	0 %	50 %	390960833
12505	NC_018015	CCT	2	6	608716	608721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960833
12506	NC_018015	GCT	2	6	608758	608763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960833
12507	NC_018015	GGA	2	6	608845	608850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960833
12508	NC_018015	TCC	3	9	608910	608918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960833
12509	NC_018015	TTG	2	6	608919	608924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960833
12510	NC_018015	CGC	2	6	608966	608971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960833
12511	NC_018015	GGC	2	6	609017	609022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960833
12512	NC_018015	CG	3	6	609037	609042	0 %	0 %	50 %	50 %	390960833
12513	NC_018015	CTC	2	6	609156	609161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960833
12514	NC_018015	CTT	2	6	609176	609181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960833
12515	NC_018015	CTC	2	6	609185	609190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960833
12516	NC_018015	TGT	2	6	609208	609213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960833
12517	NC_018015	TTC	2	6	609336	609341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960833
12518	NC_018015	CTT	2	6	609380	609385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960833
12519	NC_018015	CAT	2	6	609443	609448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960833
12520	NC_018015	GAG	2	6	609538	609543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960834
12521	NC_018015	CTTC	2	8	609627	609634	0 %	50 %	0 %	50 %	390960834
12522	NC_018015	GACCCA	2	12	609643	609654	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	390960834
12523	NC_018015	TAT	2	6	609670	609675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390960834
12524	NC_018015	CTT	2	6	609691	609696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960834
12525	NC_018015	ATC	2	6	609707	609712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960834
12526	NC_018015	TGG	2	6	609807	609812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960834
12527	NC_018015	CGTAT	2	10	610061	610070	20 %	40 %	20 %	20 %	390960834
12528	NC_018015	CAA	2	6	610083	610088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960834
12529	NC_018015	ACG	2	6	610094	610099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960834
12530	NC_018015	TCC	2	6	610206	610211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960834
12531	NC_018015	CT	3	6	610225	610230	0 %	50 %	0 %	50 %	390960835
12532	NC_018015	CTC	3	9	610284	610292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960835
12533	NC_018015	CTC	2	6	610295	610300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960835
12534	NC_018015	CTC	2	6	610344	610349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960835
12535	NC_018015	TCC	2	6	610528	610533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960835
12536	NC_018015	GGA	2	6	610541	610546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960835
12537	NC_018015	AAT	2	6	610599	610604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390960835
12538	NC_018015	CCT	2	6	610641	610646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960835
12539	NC_018015	GGA	2	6	610679	610684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960835
12540	NC_018015	TCT	2	6	610724	610729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960835
12541	NC_018015	GCTC	2	8	610739	610746	0 %	25 %	25 %	50 %	390960835
12542	NC_018015	CCT	2	6	610811	610816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960835
12543	NC_018015	CCT	2	6	610820	610825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960835
12544	NC_018015	AGT	2	6	610936	610941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960836
12545	NC_018015	AGT	2	6	610957	610962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960836
12546	NC_018015	CTC	2	6	610973	610978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960836
12547	NC_018015	TCC	3	9	610983	610991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960836
12548	NC_018015	CCT	2	6	610996	611001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960836
12549	NC_018015	TCC	2	6	611047	611052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960836
12550	NC_018015	GTC	2	6	611060	611065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960836
12551	NC_018015	CTC	2	6	611105	611110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960836
12552	NC_018015	TCG	2	6	611169	611174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960836
12553	NC_018015	CTC	2	6	611180	611185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960836
12554	NC_018015	TTCC	2	8	611205	611212	0 %	50 %	0 %	50 %	390960836
12555	NC_018015	GTCT	2	8	611258	611265	0 %	50 %	25 %	25 %	390960836
12556	NC_018015	CGCC	2	8	611290	611297	0 %	0 %	25 %	75 %	390960836
12557	NC_018015	GGC	2	6	611306	611311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960836
12558	NC_018015	CCG	2	6	611328	611333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960836
12559	NC_018015	TCT	2	6	611365	611370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960836
12560	NC_018015	TAT	2	6	611465	611470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390960836
12561	NC_018015	GTC	2	6	611495	611500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960836
12562	NC_018015	GCT	2	6	611522	611527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960836
12563	NC_018015	CTG	2	6	611541	611546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960836
12564	NC_018015	AAC	2	6	611570	611575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960836
12565	NC_018015	CCTT	2	8	611577	611584	0 %	50 %	0 %	50 %	390960836
12566	NC_018015	CCTG	2	8	611691	611698	0 %	25 %	25 %	50 %	390960836
12567	NC_018015	TGG	2	6	611699	611704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960836
12568	NC_018015	GGC	2	6	611773	611778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12569	NC_018015	TGCG	2	8	611837	611844	0 %	25 %	50 %	25 %	390960837
12570	NC_018015	CCA	2	6	611864	611869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960837
12571	NC_018015	CTGC	2	8	611901	611908	0 %	25 %	25 %	50 %	390960837
12572	NC_018015	ATC	2	6	611923	611928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960837
12573	NC_018015	AGG	2	6	611929	611934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960837
12574	NC_018015	CTC	2	6	612136	612141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960838
12575	NC_018015	TGG	2	6	612173	612178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960838
12576	NC_018015	GAG	2	6	612183	612188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960838
12577	NC_018015	TGG	2	6	612202	612207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960838
12578	NC_018015	GAA	2	6	612220	612225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960838
12579	NC_018015	GCC	2	6	612322	612327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960838
12580	NC_018015	CACCTC	2	12	612343	612354	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	390960838
12581	NC_018015	CCG	2	6	612366	612371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960838
12582	NC_018015	GGA	2	6	612426	612431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960838
12583	NC_018015	GAGG	2	8	612498	612505	25 %	0 %	75 %	0 %	390960838
12584	NC_018015	AAC	2	6	612512	612517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960838
12585	NC_018015	ATTA	2	8	612561	612568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12586	NC_018015	GAA	2	6	612609	612614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12587	NC_018015	GGT	2	6	612634	612639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12588	NC_018015	TGA	2	6	612642	612647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960839
12589	NC_018015	ACTT	2	8	612652	612659	25 %	50 %	0 %	25 %	390960839
12590	NC_018015	CTC	2	6	612680	612685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960839
12591	NC_018015	C	6	6	612689	612694	0 %	0 %	0 %	100 %	390960839
12592	NC_018015	CAG	2	6	612730	612735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960839
12593	NC_018015	AGA	2	6	612770	612775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960839
12594	NC_018015	ACC	2	6	612778	612783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960839
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12596	NC_018015	ACT	2	6	612860	612865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960839
12597	NC_018015	TGG	2	6	612913	612918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960839
12598	NC_018015	TCC	2	6	612926	612931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960839
12599	NC_018015	CTC	2	6	612960	612965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12600	NC_018015	AGA	2	6	612990	612995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12601	NC_018015	GAC	2	6	613048	613053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12602	NC_018015	GGA	2	6	613159	613164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12603	NC_018015	AGT	2	6	613227	613232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12604	NC_018015	ACC	2	6	613251	613256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12605	NC_018015	ACC	2	6	613261	613266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12606	NC_018015	ACC	2	6	613270	613275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12607	NC_018015	AAG	2	6	613283	613288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12608	NC_018015	AGA	3	9	613352	613360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12609	NC_018015	GTA	2	6	613362	613367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12610	NC_018015	CAA	2	6	613389	613394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12611	NC_018015	GAGGT	2	10	613421	613430	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
12612	NC_018015	TCC	2	6	613469	613474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960840
12613	NC_018015	TCC	2	6	613480	613485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960840
12614	NC_018015	CAC	2	6	613494	613499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960840
12615	NC_018015	CTA	2	6	613662	613667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960840
12616	NC_018015	AT	3	6	613692	613697	50 %	50 %	0 %	0 %	390960840
12617	NC_018015	TAC	2	6	613759	613764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960840
12618	NC_018015	CAT	2	6	613845	613850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960840
12619	NC_018015	ACG	2	6	613886	613891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960840
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12621	NC_018015	ACC	2	6	613944	613949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960840
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12984	NC_018015	CGT	2	6	631777	631782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960860
12985	NC_018015	CCCTCA	2	12	631872	631883	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	390960860
12986	NC_018015	AGG	2	6	631884	631889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960860
12987	NC_018015	CGG	2	6	631927	631932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960860
12988	NC_018015	GA	3	6	631941	631946	50 %	0 %	50 %	0 %	390960860
12989	NC_018015	TCG	2	6	631968	631973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960860
12990	NC_018015	AGAC	2	8	631980	631987	50 %	0 %	25 %	25 %	390960860
12991	NC_018015	TTC	2	6	631994	631999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960860
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12993	NC_018015	CCT	2	6	632098	632103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960860
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